EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000007325 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: tyw1
Alias: im:6898509|wu:fb74d01|zgc:153368
Full Name: tRNA-yW synthesizing protein 1 homolog (S. cerevisiae)
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 52870 bases
Position: chrCCOE01000105.1:63135-116004
Accession: ZDB-GENE-060929-688
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000009358	Wyosine_form	PF08608.12	1.6e-27	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000009640	-	2130	-	ENSACIP00000009358	709 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000007325	tyw1	99	64.979	ENSG00000198874	TYW1	98	65.560	Homo_sapiens
ENSACIG00000007325	tyw1	89	64.177	ENSG00000277149	TYW1B	93	64.660	Homo_sapiens
ENSACIG00000007325	tyw1	100	82.158	ENSAPOG00000014391	tyw1	99	79.716	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000007325	tyw1	100	81.843	ENSAOCG00000016792	tyw1	96	81.906	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000007325	tyw1	100	82.256	ENSAPEG00000015939	tyw1	97	82.931	Amphiprion_percula
ENSACIG00000007325	tyw1	90	81.040	ENSATEG00000006856	tyw1	91	81.011	Anabas_testudineus
ENSACIG00000007325	tyw1	99	64.039	ENSANAG00000037051	-	98	64.039	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000007325	tyw1	100	86.667	ENSACLG00000018688	tyw1	96	86.667	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000007325	tyw1	99	73.296	ENSAMXG00000004157	tyw1	98	74.444	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000007325	tyw1	99	65.145	ENSBTAG00000008446	TYW1	98	64.966	Bos_taurus
ENSACIG00000007325	tyw1	99	63.885	ENSCJAG00000004295	-	98	64.177	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000007325	tyw1	99	66.527	ENSCAFG00000010867	-	98	66.760	Canis_familiaris
ENSACIG00000007325	tyw1	94	63.063	ENSCAFG00020005367	-	94	64.427	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000007325	tyw1	99	65.235	ENSCHIG00000019510	-	98	65.097	Capra_hircus
ENSACIG00000007325	tyw1	89	64.516	ENSTSYG00000008236	-	98	64.516	Carlito_syrichta
ENSACIG00000007325	tyw1	89	64.075	ENSCAPG00000013569	-	100	64.752	Cavia_aperea
ENSACIG00000007325	tyw1	99	63.288	ENSCPOG00000011182	-	99	63.179	Cavia_porcellus
ENSACIG00000007325	tyw1	99	64.869	ENSCCAG00000026643	-	98	65.007	Cebus_capucinus
ENSACIG00000007325	tyw1	99	64.432	ENSCATG00000043677	-	98	65.007	Cercocebus_atys
ENSACIG00000007325	tyw1	99	63.100	ENSCLAG00000006321	-	98	63.786	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000007325	tyw1	99	64.038	ENSCSAG00000018274	-	98	64.696	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000007325	tyw1	51	81.197	ENSCHOG00000003801	-	56	81.197	Choloepus_hoffmanni
ENSACIG00000007325	tyw1	99	65.447	ENSCPBG00000014896	-	96	65.672	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000007325	tyw1	82	58.773	ENSCING00000004125	-	97	59.796	Ciona_intestinalis
ENSACIG00000007325	tyw1	89	55.039	ENSCSAVG00000005712	-	99	55.832	Ciona_savignyi
ENSACIG00000007325	tyw1	99	64.159	ENSCANG00000033209	-	98	64.730	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000007325	tyw1	61	76.690	ENSCGRG00001003679	Tyw1	76	74.779	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000007325	tyw1	99	77.080	ENSCSEG00000005810	tyw1	94	78.641	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000007325	tyw1	90	79.353	ENSCVAG00000001054	tyw1	92	79.815	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000007325	tyw1	99	71.607	ENSDARG00000062987	tyw1	95	73.204	Danio_rerio
ENSACIG00000007325	tyw1	99	65.789	ENSDNOG00000024165	-	98	66.205	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000007325	tyw1	86	63.578	ENSDORG00000014772	Tyw1	91	63.738	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000007325	tyw1	60	73.148	ENSEBUG00000004494	tyw1	92	73.148	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000007325	tyw1	99	65.928	ENSEASG00005008818	-	98	65.789	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000007325	tyw1	99	61.150	ENSECAG00000023164	-	98	61.150	Equus_caballus
ENSACIG00000007325	tyw1	99	72.376	ENSELUG00000008449	tyw1	99	69.394	Esox_lucius
ENSACIG00000007325	tyw1	99	66.480	ENSFCAG00000014262	-	98	66.480	Felis_catus
ENSACIG00000007325	tyw1	99	62.188	ENSFALG00000013810	-	98	63.209	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000007325	tyw1	99	63.245	ENSFDAG00000013270	-	98	64.177	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000007325	tyw1	85	81.331	ENSFHEG00000020824	tyw1	81	81.331	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000007325	tyw1	99	63.411	ENSGALG00000001110	-	97	64.649	Gallus_gallus
ENSACIG00000007325	tyw1	100	77.092	ENSGACG00000012692	tyw1	99	77.092	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000007325	tyw1	99	65.075	ENSGAGG00000022393	-	98	65.668	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000007325	tyw1	89	56.839	ENSGGOG00000001473	TYW1	97	57.385	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000007325	tyw1	100	86.389	ENSHBUG00000002640	tyw1	96	86.389	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000007325	tyw1	89	67.823	ENSHGLG00000012093	-	100	67.823	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000007325	tyw1	99	62.881	ENSHGLG00100011743	TYW1	98	63.398	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000007325	tyw1	99	68.785	ENSHCOG00000019949	tyw1	96	68.644	Hippocampus_comes
ENSACIG00000007325	tyw1	99	72.067	ENSIPUG00000016330	tyw1	96	73.574	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000007325	tyw1	99	62.963	ENSSTOG00000004067	-	90	63.850	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000007325	tyw1	99	63.534	ENSJJAG00000022959	Tyw1	98	64.227	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000007325	tyw1	99	81.302	ENSKMAG00000018599	tyw1	96	80.946	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000007325	tyw1	99	64.099	ENSLACG00000018917	tyw1	95	64.560	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000007325	tyw1	99	70.458	ENSLOCG00000004035	tyw1	95	70.458	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000007325	tyw1	99	64.706	ENSMFAG00000035457	-	98	65.284	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000007325	tyw1	99	64.706	ENSMMUG00000030374	-	98	65.284	Macaca_mulatta
ENSACIG00000007325	tyw1	99	64.569	ENSMNEG00000041992	-	98	70.492	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000007325	tyw1	99	64.569	ENSMLEG00000039741	-	98	65.145	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000007325	tyw1	100	82.345	ENSMAMG00000016089	tyw1	95	82.133	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000007325	tyw1	92	89.160	ENSMZEG00005024386	tyw1	97	89.160	Maylandia_zebra
ENSACIG00000007325	tyw1	99	63.085	ENSMGAG00000002176	-	98	64.148	Meleagris_gallopavo
ENSACIG00000007325	tyw1	99	64.306	ENSMAUG00000002959	Tyw1	98	64.722	Mesocricetus_auratus
ENSACIG00000007325	tyw1	99	65.289	ENSMICG00000014374	-	99	64.869	Microcebus_murinus
ENSACIG00000007325	tyw1	99	63.836	ENSMOCG00000017720	Tyw1	98	64.771	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000007325	tyw1	99	77.496	ENSMMOG00000005064	tyw1	98	77.279	Mola_mola
ENSACIG00000007325	tyw1	99	63.885	ENSMODG00000025697	-	98	64.120	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000007325	tyw1	100	81.981	ENSMALG00000010238	tyw1	96	82.158	Monopterus_albus
ENSACIG00000007325	tyw1	99	64.146	MGP_CAROLIEiJ_G0027801	Tyw1	98	64.895	Mus_caroli
ENSACIG00000007325	tyw1	99	64.706	ENSMUSG00000056310	Tyw1	98	65.594	Mus_musculus
ENSACIG00000007325	tyw1	99	65.120	MGP_PahariEiJ_G0024383	Tyw1	98	65.449	Mus_pahari
ENSACIG00000007325	tyw1	99	64.286	MGP_SPRETEiJ_G0028799	Tyw1	99	65.000	Mus_spretus
ENSACIG00000007325	tyw1	91	70.108	ENSMPUG00000016191	-	94	70.108	Mustela_putorius_furo
ENSACIG00000007325	tyw1	99	63.029	ENSMLUG00000013582	-	98	63.462	Myotis_lucifugus
ENSACIG00000007325	tyw1	99	64.714	ENSNGAG00000002742	Tyw1	99	64.993	Nannospalax_galili
ENSACIG00000007325	tyw1	92	84.115	ENSNBRG00000016996	tyw1	95	84.115	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000007325	tyw1	99	64.099	ENSNLEG00000013210	-	96	64.779	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000007325	tyw1	91	52.833	ENSOPRG00000008734	-	86	52.833	Ochotona_princeps
ENSACIG00000007325	tyw1	89	64.706	ENSODEG00000014729	-	93	64.706	Octodon_degus
ENSACIG00000007325	tyw1	100	85.814	ENSONIG00000005872	tyw1	96	86.092	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000007325	tyw1	99	64.355	ENSOCUG00000003173	-	98	64.374	Oryctolagus_cuniculus
ENSACIG00000007325	tyw1	99	79.184	ENSORLG00000001393	tyw1	99	75.627	Oryzias_latipes
ENSACIG00000007325	tyw1	99	78.762	ENSORLG00020019361	tyw1	96	78.732	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000007325	tyw1	99	78.822	ENSORLG00015008095	tyw1	95	78.711	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000007325	tyw1	92	69.265	ENSOGAG00000016555	-	90	69.565	Otolemur_garnettii
ENSACIG00000007325	tyw1	99	65.021	ENSOARG00000010673	-	98	65.021	Ovis_aries
ENSACIG00000007325	tyw1	99	66.667	ENSPPRG00000004945	-	98	66.667	Panthera_pardus
ENSACIG00000007325	tyw1	99	66.667	ENSPTIG00000019545	-	98	66.667	Panthera_tigris_altaica
ENSACIG00000007325	tyw1	99	60.328	ENSPTRG00000023076	TYW1B	96	60.581	Pan_troglodytes
ENSACIG00000007325	tyw1	99	64.432	ENSPANG00000019053	-	98	65.007	Papio_anubis
ENSACIG00000007325	tyw1	99	67.313	ENSPKIG00000006545	tyw1	96	68.106	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000007325	tyw1	97	75.391	ENSPMGG00000004240	tyw1	100	74.684	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000007325	tyw1	99	65.284	ENSPEMG00000008274	Tyw1	99	65.470	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACIG00000007325	tyw1	100	78.099	ENSPFOG00000015855	tyw1	99	77.870	Poecilia_formosa
ENSACIG00000007325	tyw1	100	78.237	ENSPLAG00000000838	tyw1	96	78.285	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000007325	tyw1	100	77.961	ENSPMEG00000019437	tyw1	100	75.389	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000007325	tyw1	100	73.066	ENSPREG00000018773	tyw1	97	74.583	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000007325	tyw1	99	65.007	ENSPPYG00000017514	TYW1	98	65.145	Pongo_abelii
ENSACIG00000007325	tyw1	75	62.659	ENSPCOG00000015294	-	86	59.745	Propithecus_coquereli
ENSACIG00000007325	tyw1	99	86.648	ENSPNYG00000022381	tyw1	96	86.648	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000007325	tyw1	99	72.276	ENSPNAG00000009001	tyw1	98	73.823	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000007325	tyw1	99	64.615	ENSRNOG00000024352	Tyw1	98	65.223	Rattus_norvegicus
ENSACIG00000007325	tyw1	99	64.295	ENSRBIG00000039619	-	98	64.869	Rhinopithecus_bieti
ENSACIG00000007325	tyw1	99	64.295	ENSRROG00000039780	-	98	64.869	Rhinopithecus_roxellana
ENSACIG00000007325	tyw1	88	41.941	YPL207W	-	69	41.941	Saccharomyces_cerevisiae
ENSACIG00000007325	tyw1	99	64.177	ENSSBOG00000025873	-	98	64.177	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSACIG00000007325	tyw1	99	65.465	ENSSHAG00000010346	-	98	65.235	Sarcophilus_harrisii
ENSACIG00000007325	tyw1	99	69.643	ENSSFOG00015001054	tyw1	96	71.667	Scleropages_formosus
ENSACIG00000007325	tyw1	100	81.969	ENSSMAG00000020514	tyw1	96	81.755	Scophthalmus_maximus
ENSACIG00000007325	tyw1	100	83.288	ENSSDUG00000001552	tyw1	93	87.652	Seriola_dumerili
ENSACIG00000007325	tyw1	100	83.151	ENSSLDG00000003554	tyw1	96	83.081	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACIG00000007325	tyw1	99	62.721	ENSSPUG00000002715	-	98	63.179	Sphenodon_punctatus
ENSACIG00000007325	tyw1	99	65.374	ENSSSCG00000007733	-	98	65.331	Sus_scrofa
ENSACIG00000007325	tyw1	89	64.472	ENSTGUG00000003428	-	97	65.138	Taeniopygia_guttata
ENSACIG00000007325	tyw1	99	80.501	ENSTRUG00000016107	tyw1	93	80.501	Takifugu_rubripes
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ENSACIG00000007325	tyw1	99	65.826	ENSVVUG00000016457	-	98	66.480	Vulpes_vulpes
ENSACIG00000007325	tyw1	99	65.757	ENSXETG00000010094	tyw1	99	66.530	Xenopus_tropicalis
ENSACIG00000007325	tyw1	100	76.731	ENSXMAG00000013125	tyw1	98	79.141	Xiphophorus_maculatus