EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000007464 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 5616 bases
Position: chrCCOE01001554.1:397237-402852
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000009512	zf-C2H2	PF00096.26	2.2e-21	1	4
ENSACIP00000009512	zf-C2H2	PF00096.26	2.2e-21	2	4
ENSACIP00000009512	zf-C2H2	PF00096.26	2.2e-21	3	4
ENSACIP00000009512	zf-C2H2	PF00096.26	2.2e-21	4	4
ENSACIP00000009512	zf-met	PF12874.7	2.8e-07	1	2
ENSACIP00000009512	zf-met	PF12874.7	2.8e-07	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000009797	-	939	-	ENSACIP00000009512	312 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000007464	-	56	43.624	ENSACIG00000010739	-	78	43.624
ENSACIG00000007464	-	85	52.991	ENSACIG00000004041	-	99	52.991
ENSACIG00000007464	-	52	47.656	ENSACIG00000006228	-	66	47.656
ENSACIG00000007464	-	55	43.243	ENSACIG00000003720	-	62	43.243
ENSACIG00000007464	-	61	45.161	ENSACIG00000013163	-	79	45.161
ENSACIG00000007464	-	50	43.077	ENSACIG00000007000	-	54	41.860
ENSACIG00000007464	-	61	35.833	ENSACIG00000018641	snai2	67	35.833
ENSACIG00000007464	-	61	36.036	ENSACIG00000013946	-	63	32.195
ENSACIG00000007464	-	83	48.344	ENSACIG00000019710	-	90	48.344
ENSACIG00000007464	-	83	43.333	ENSACIG00000022645	-	78	43.590
ENSACIG00000007464	-	53	45.270	ENSACIG00000012084	-	97	45.270
ENSACIG00000007464	-	74	48.454	ENSACIG00000004641	-	70	48.454
ENSACIG00000007464	-	62	34.862	ENSACIG00000002944	-	77	34.862
ENSACIG00000007464	-	51	43.537	ENSACIG00000000406	prdm5	80	43.537
ENSACIG00000007464	-	80	58.140	ENSACIG00000004666	-	92	58.140
ENSACIG00000007464	-	77	52.033	ENSACIG00000016182	-	99	50.413
ENSACIG00000007464	-	65	44.056	ENSACIG00000003515	-	90	45.536
ENSACIG00000007464	-	54	48.780	ENSACIG00000013149	-	80	48.780
ENSACIG00000007464	-	52	54.667	ENSACIG00000007855	-	90	54.667
ENSACIG00000007464	-	83	36.296	ENSACIG00000018022	-	89	36.296
ENSACIG00000007464	-	74	37.600	ENSACIG00000009717	-	93	50.893
ENSACIG00000007464	-	56	50.000	ENSACIG00000008448	-	59	50.000
ENSACIG00000007464	-	56	37.000	ENSACIG00000017683	-	80	39.844
ENSACIG00000007464	-	55	43.919	ENSACIG00000007882	-	82	43.919
ENSACIG00000007464	-	90	52.874	ENSACIG00000016932	-	82	52.874
ENSACIG00000007464	-	66	34.518	ENSACIG00000017166	-	86	32.143
ENSACIG00000007464	-	56	47.552	ENSACIG00000022293	-	96	47.917
ENSACIG00000007464	-	84	52.143	ENSACIG00000010647	-	99	52.143
ENSACIG00000007464	-	78	40.171	ENSACIG00000020982	znf710b	58	40.171
ENSACIG00000007464	-	75	36.400	ENSACIG00000006826	-	91	36.400
ENSACIG00000007464	-	67	45.045	ENSACIG00000014123	znf236	56	45.045
ENSACIG00000007464	-	63	43.651	ENSACIG00000018952	-	67	43.651
ENSACIG00000007464	-	63	48.175	ENSACIG00000019791	-	95	50.820
ENSACIG00000007464	-	75	42.857	ENSACIG00000022625	-	98	42.857
ENSACIG00000007464	-	87	45.385	ENSACIG00000015835	-	84	45.385
ENSACIG00000007464	-	80	52.137	ENSACIG00000011515	-	98	52.137
ENSACIG00000007464	-	53	42.308	ENSACIG00000011516	-	79	42.308
ENSACIG00000007464	-	60	45.082	ENSACIG00000013750	-	71	45.082
ENSACIG00000007464	-	53	41.905	ENSACIG00000008886	znf1164	78	41.905
ENSACIG00000007464	-	88	48.795	ENSACIG00000013470	-	99	49.333
ENSACIG00000007464	-	56	50.676	ENSACIG00000003754	-	89	50.676
ENSACIG00000007464	-	63	52.273	ENSACIG00000016944	-	93	52.273
ENSACIG00000007464	-	62	42.975	ENSACIG00000015429	-	77	44.667
ENSACIG00000007464	-	69	45.714	ENSACIG00000023794	-	62	45.714
ENSACIG00000007464	-	59	53.846	ENSACIG00000010637	-	74	53.846
ENSACIG00000007464	-	71	50.000	ENSACIG00000022738	-	90	50.000
ENSACIG00000007464	-	58	44.643	ENSACIG00000015411	-	81	44.643
ENSACIG00000007464	-	82	34.737	ENSACIG00000024444	-	84	34.173
ENSACIG00000007464	-	82	53.846	ENSACIG00000011541	-	94	54.054
ENSACIG00000007464	-	67	40.594	ENSACIG00000001369	-	80	40.594
ENSACIG00000007464	-	56	42.553	ENSACIG00000023313	-	90	42.553
ENSACIG00000007464	-	84	50.407	ENSACIG00000006806	-	83	53.846
ENSACIG00000007464	-	73	40.678	ENSACIG00000006377	-	82	40.678
ENSACIG00000007464	-	55	50.000	ENSACIG00000018440	-	98	50.676
ENSACIG00000007464	-	79	37.671	ENSACIG00000016133	-	81	37.671
ENSACIG00000007464	-	79	51.240	ENSACIG00000011153	-	98	51.240
ENSACIG00000007464	-	52	39.344	ENSACIG00000021986	-	89	39.394
ENSACIG00000007464	-	85	50.806	ENSACIG00000003556	-	87	51.351
ENSACIG00000007464	-	85	50.676	ENSACIG00000023212	-	94	50.676
ENSACIG00000007464	-	88	45.946	ENSACIG00000004745	-	97	45.946
ENSACIG00000007464	-	87	45.270	ENSACIG00000013604	-	98	60.000
ENSACIG00000007464	-	66	38.462	ENSACIG00000022330	-	85	47.059
ENSACIG00000007464	-	67	39.316	ENSACIG00000023049	znf646	99	39.316
ENSACIG00000007464	-	53	43.609	ENSACIG00000016117	-	84	41.250
ENSACIG00000007464	-	79	52.448	ENSACIG00000004626	-	93	55.056
ENSACIG00000007464	-	65	53.788	ENSACIG00000000286	-	79	53.788
ENSACIG00000007464	-	81	52.083	ENSACIG00000010966	-	70	52.083
ENSACIG00000007464	-	83	47.973	ENSACIG00000006172	-	99	47.973
ENSACIG00000007464	-	62	42.623	ENSACIG00000009755	-	82	48.993
ENSACIG00000007464	-	80	50.000	ENSACIG00000019102	-	60	53.378
ENSACIG00000007464	-	66	47.863	ENSACIG00000019815	-	99	47.863
ENSACIG00000007464	-	63	45.745	ENSACIG00000022658	-	97	48.299
ENSACIG00000007464	-	81	43.220	ENSACIG00000000360	si:ch211-241b2.1	99	43.220
ENSACIG00000007464	-	51	42.308	ENSACIG00000010275	si:ch211-236k19.4	63	41.176
ENSACIG00000007464	-	84	52.586	ENSACIG00000017050	-	99	52.857
ENSACIG00000007464	-	82	38.776	ENSACIG00000018059	-	86	43.333
ENSACIG00000007464	-	79	49.664	ENSACIG00000017647	-	97	49.664
ENSACIG00000007464	-	55	43.137	ENSACIG00000017644	-	85	43.137
ENSACIG00000007464	-	57	36.000	ENSACIG00000012263	znf319b	92	35.714
ENSACIG00000007464	-	69	63.291	ENSACIG00000006755	-	95	58.904
ENSACIG00000007464	-	52	44.853	ENSACIG00000007096	-	73	44.853
ENSACIG00000007464	-	70	46.104	ENSACIG00000019447	-	70	50.000
ENSACIG00000007464	-	85	35.689	ENSACIG00000023162	-	79	35.689
ENSACIG00000007464	-	59	43.165	ENSACIG00000001767	zbtb41	62	43.165
ENSACIG00000007464	-	65	38.889	ENSACIG00000012636	ZNF319	86	38.889
ENSACIG00000007464	-	56	47.581	ENSACIG00000009128	-	92	47.581
ENSACIG00000007464	-	78	35.556	ENSACIG00000014282	znf526	52	35.556

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000007464	-	84	60.366	ENSAPOG00000019138	-	85	60.366	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000007464	-	89	43.750	ENSAPOG00000018429	-	76	38.321	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000007464	-	85	57.831	ENSAOCG00000016897	-	88	57.831	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000007464	-	54	40.385	ENSAOCG00000006744	-	84	40.385	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000007464	-	85	57.831	ENSAPEG00000001556	-	88	57.831	Amphiprion_percula
ENSACIG00000007464	-	54	43.902	ENSAPEG00000010013	-	59	43.902	Amphiprion_percula
ENSACIG00000007464	-	89	51.818	ENSAPEG00000018762	-	75	51.818	Amphiprion_percula
ENSACIG00000007464	-	86	38.182	ENSATEG00000018931	-	97	40.972	Anabas_testudineus
ENSACIG00000007464	-	50	39.683	ENSCING00000002128	zf(c2h2)-35	62	39.683	Ciona_intestinalis
ENSACIG00000007464	-	63	37.500	ENSCSEG00000010264	-	77	37.500	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000007464	-	83	55.963	ENSCSEG00000010453	-	89	56.481	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000007464	-	54	52.326	ENSCSEG00000015593	-	77	52.326	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000007464	-	77	50.820	ENSCSEG00000008525	-	66	50.820	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000007464	-	74	46.552	ENSCSEG00000008528	-	66	52.482	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000007464	-	51	48.438	ENSCVAG00000006653	-	65	48.438	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000007464	-	64	51.220	ENSCVAG00000006484	-	59	51.220	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000007464	-	59	40.881	ENSCVAG00000003250	-	68	40.881	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000007464	-	72	45.455	ENSEBUG00000007931	-	77	43.571	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000007464	-	62	40.964	ENSEBUG00000014432	-	89	40.964	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000007464	-	60	42.308	ENSELUG00000001909	-	82	41.892	Esox_lucius
ENSACIG00000007464	-	52	40.000	ENSELUG00000024007	-	60	48.387	Esox_lucius
ENSACIG00000007464	-	79	48.315	ENSELUG00000012088	-	74	43.919	Esox_lucius
ENSACIG00000007464	-	54	45.588	ENSGAFG00000007528	-	60	45.588	Gambusia_affinis
ENSACIG00000007464	-	85	44.444	ENSGAFG00000008204	-	91	44.444	Gambusia_affinis
ENSACIG00000007464	-	79	35.915	ENSGAFG00000012545	-	65	35.915	Gambusia_affinis
ENSACIG00000007464	-	80	45.055	ENSGAFG00000001879	-	98	45.055	Gambusia_affinis
ENSACIG00000007464	-	52	48.864	ENSHBUG00000006656	-	59	41.007	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000007464	-	88	52.459	ENSHCOG00000008227	-	78	52.459	Hippocampus_comes
ENSACIG00000007464	-	54	51.064	ENSHCOG00000015497	-	90	50.000	Hippocampus_comes
ENSACIG00000007464	-	85	36.396	ENSHCOG00000019389	-	76	48.624	Hippocampus_comes
ENSACIG00000007464	-	85	48.315	ENSHCOG00000008550	-	76	51.429	Hippocampus_comes
ENSACIG00000007464	-	95	50.000	ENSHCOG00000013489	-	99	50.350	Hippocampus_comes
ENSACIG00000007464	-	82	40.074	ENSHCOG00000008213	-	73	34.098	Hippocampus_comes
ENSACIG00000007464	-	85	48.315	ENSHCOG00000001873	-	76	51.429	Hippocampus_comes
ENSACIG00000007464	-	53	33.702	ENSIPUG00000024004	-	78	33.702	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000007464	-	66	35.345	ENSKMAG00000014184	-	62	35.345	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000007464	-	69	35.659	ENSKMAG00000007699	-	73	35.659	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000007464	-	76	51.163	ENSLBEG00000011210	-	71	51.163	Labrus_bergylta
ENSACIG00000007464	-	58	42.384	ENSLBEG00000001132	-	76	42.384	Labrus_bergylta
ENSACIG00000007464	-	65	41.958	ENSLOCG00000004208	-	99	41.958	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000007464	-	86	41.129	ENSMAMG00000017939	-	86	41.129	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000007464	-	52	39.437	ENSMZEG00005013907	-	72	39.437	Maylandia_zebra
ENSACIG00000007464	-	83	49.451	ENSMMOG00000017592	-	72	49.451	Mola_mola
ENSACIG00000007464	-	64	40.940	ENSMALG00000004279	-	89	40.940	Monopterus_albus
ENSACIG00000007464	-	81	45.946	ENSNBRG00000006112	-	63	45.946	Neolamprologus_brichardi
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ENSACIG00000007464	-	75	35.000	ENSPREG00000008907	-	66	35.000	Poecilia_reticulata
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ENSACIG00000007464	-	60	42.000	ENSPNAG00000005946	-	86	34.228	Pygocentrus_nattereri
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ENSACIG00000007464	-	76	44.681	ENSSMAG00000013291	-	93	46.377	Scophthalmus_maximus
ENSACIG00000007464	-	82	40.000	ENSSDUG00000020774	-	87	40.000	Seriola_dumerili
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ENSACIG00000007464	-	85	36.713	ENSSPAG00000005770	-	83	36.713	Stegastes_partitus
ENSACIG00000007464	-	85	34.118	ENSXCOG00000014360	-	83	34.118	Xiphophorus_couchianus
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ENSACIG00000007464	-	50	43.704	ENSXMAG00000012936	-	74	43.704	Xiphophorus_maculatus