EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000007725 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 5070 bases
Position: chrCCOE01000691.1:1217532-1222601
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000009851	MMR_HSR1	PF01926.23	1.3e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000010140	-	813	-	ENSACIP00000009851	270 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000007725	-	71	37.438	ENSACIG00000001596	-	80	37.438
ENSACIG00000007725	-	78	34.123	ENSACIG00000000893	-	84	34.123
ENSACIG00000007725	-	66	42.697	ENSACIG00000007737	-	71	42.162
ENSACIG00000007725	-	73	38.235	ENSACIG00000008001	-	83	36.957
ENSACIG00000007725	-	70	31.034	ENSACIG00000005587	-	69	31.034
ENSACIG00000007725	-	78	34.247	ENSACIG00000014680	-	89	34.247
ENSACIG00000007725	-	66	34.409	ENSACIG00000015088	-	72	34.409
ENSACIG00000007725	-	71	33.166	ENSACIG00000007191	-	54	33.166
ENSACIG00000007725	-	77	33.484	ENSACIG00000003582	-	69	33.484
ENSACIG00000007725	-	59	37.059	ENSACIG00000022374	-	83	37.059
ENSACIG00000007725	-	75	32.394	ENSACIG00000022377	-	75	32.864
ENSACIG00000007725	-	79	32.877	ENSACIG00000022370	-	74	32.870
ENSACIG00000007725	-	71	35.784	ENSACIG00000019149	-	55	36.702
ENSACIG00000007725	-	69	35.025	ENSACIG00000006484	-	57	35.025
ENSACIG00000007725	-	70	34.343	ENSACIG00000014662	-	78	34.343
ENSACIG00000007725	-	77	33.937	ENSACIG00000014716	-	86	33.937
ENSACIG00000007725	-	81	30.837	ENSACIG00000012718	-	94	30.837
ENSACIG00000007725	-	79	31.364	ENSACIG00000012714	-	72	31.364
ENSACIG00000007725	-	68	31.746	ENSACIG00000007178	-	64	31.746
ENSACIG00000007725	-	87	31.818	ENSACIG00000005573	-	91	31.818
ENSACIG00000007725	-	59	34.568	ENSACIG00000000976	-	79	34.568
ENSACIG00000007725	-	74	33.649	ENSACIG00000014745	-	92	33.649
ENSACIG00000007725	-	74	34.466	ENSACIG00000014690	-	76	34.466
ENSACIG00000007725	-	75	30.986	ENSACIG00000001070	-	75	30.986
ENSACIG00000007725	-	79	31.081	ENSACIG00000004245	-	77	31.081
ENSACIG00000007725	-	70	39.500	ENSACIG00000022355	-	66	39.500
ENSACIG00000007725	-	74	32.195	ENSACIG00000020244	-	85	32.195
ENSACIG00000007725	-	67	35.106	ENSACIG00000003050	-	81	35.106
ENSACIG00000007725	-	70	41.089	ENSACIG00000012648	-	65	41.089
ENSACIG00000007725	-	74	34.742	ENSACIG00000001455	-	76	34.742
ENSACIG00000007725	-	79	33.333	ENSACIG00000014646	zgc:113625	84	33.333
ENSACIG00000007725	-	74	31.250	ENSACIG00000016888	-	66	31.250
ENSACIG00000007725	-	66	34.973	ENSACIG00000022222	-	57	35.519
ENSACIG00000007725	-	67	37.097	ENSACIG00000006503	-	56	37.097
ENSACIG00000007725	-	77	33.784	ENSACIG00000005780	-	65	33.784
ENSACIG00000007725	-	59	32.727	ENSACIG00000000631	-	56	32.727
ENSACIG00000007725	-	70	32.292	ENSACIG00000007158	-	61	32.292
ENSACIG00000007725	-	61	33.918	ENSACIG00000012204	-	72	33.918
ENSACIG00000007725	-	72	31.000	ENSACIG00000016313	-	61	31.500
ENSACIG00000007725	-	78	35.484	ENSACIG00000008045	-	74	36.318
ENSACIG00000007725	-	83	31.513	ENSACIG00000007466	-	69	31.513
ENSACIG00000007725	-	72	31.343	ENSACIG00000014670	-	76	31.343
ENSACIG00000007725	-	80	33.333	ENSACIG00000019524	-	89	33.333
ENSACIG00000007725	-	65	32.044	ENSACIG00000008666	-	85	32.044
ENSACIG00000007725	-	77	33.023	ENSACIG00000014703	-	85	33.023
ENSACIG00000007725	-	69	40.722	ENSACIG00000016635	-	71	40.722
ENSACIG00000007725	-	67	34.946	ENSACIG00000012707	-	69	34.946
ENSACIG00000007725	-	74	33.171	ENSACIG00000020225	-	68	33.171
ENSACIG00000007725	-	70	36.224	ENSACIG00000002263	-	68	36.224
ENSACIG00000007725	-	71	30.303	ENSACIG00000016502	-	83	30.303
ENSACIG00000007725	-	69	34.197	ENSACIG00000023381	-	74	34.197
ENSACIG00000007725	-	71	34.848	ENSACIG00000014634	zgc:113625	85	33.028
ENSACIG00000007725	-	78	31.019	ENSACIG00000022366	-	75	31.481
ENSACIG00000007725	-	74	35.849	ENSACIG00000022362	-	74	35.849
ENSACIG00000007725	-	71	33.005	ENSACIG00000002950	-	52	33.005
ENSACIG00000007725	-	78	31.963	ENSACIG00000014655	-	79	31.963
ENSACIG00000007725	-	69	38.889	ENSACIG00000006478	-	72	38.889
ENSACIG00000007725	-	68	30.570	ENSACIG00000019509	-	86	30.570
ENSACIG00000007725	-	68	35.567	ENSACIG00000005223	-	71	35.567
ENSACIG00000007725	-	74	33.810	ENSACIG00000004040	-	81	33.810
ENSACIG00000007725	-	58	35.976	ENSACIG00000012761	-	70	35.976
ENSACIG00000007725	-	71	42.784	ENSACIG00000009811	-	82	42.784

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000007725	-	77	75.238	ENSAPOG00000019154	-	53	75.238	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000007725	-	84	43.781	ENSAOCG00000004579	-	83	45.213	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000007725	-	69	38.503	ENSAOCG00000003425	-	70	38.503	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000007725	-	71	45.213	ENSAPEG00000014403	-	63	45.213	Amphiprion_percula
ENSACIG00000007725	-	77	77.778	ENSAPEG00000001491	-	63	77.778	Amphiprion_percula
ENSACIG00000007725	-	73	39.286	ENSATEG00000023053	-	86	39.286	Anabas_testudineus
ENSACIG00000007725	-	79	40.541	ENSATEG00000015654	-	68	40.541	Anabas_testudineus
ENSACIG00000007725	-	84	41.791	ENSACLG00000014795	-	70	41.791	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000007725	-	81	42.564	ENSAMXG00000033117	-	85	42.500	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000007725	-	75	42.938	ENSAMXG00000019109	-	83	42.938	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000007725	-	80	46.602	ENSAMXG00000030744	-	81	46.602	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000007725	-	66	33.898	ENSAMXG00000009216	-	85	33.898	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000007725	-	69	42.703	ENSAMXG00000021387	-	60	43.169	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000007725	-	67	37.766	ENSAMXG00000026085	-	71	36.923	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000007725	-	77	41.500	ENSAMXG00000006064	-	74	41.500	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000007725	-	78	70.476	ENSCSEG00000021519	-	83	61.628	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000007725	-	75	37.681	ENSCVAG00000005778	-	72	37.681	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000007725	-	77	71.292	ENSCVAG00000003054	-	72	71.292	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000007725	-	81	41.126	ENSCVAG00000012268	-	76	41.126	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000007725	-	83	55.981	ENSDARG00000063481	si:ch211-214j24.15	64	55.981	Danio_rerio
ENSACIG00000007725	-	75	46.305	ENSDARG00000102683	CR626941.1	76	46.305	Danio_rerio
ENSACIG00000007725	-	70	53.723	ENSELUG00000024502	-	69	53.723	Esox_lucius
ENSACIG00000007725	-	69	54.545	ENSELUG00000018192	-	88	54.545	Esox_lucius
ENSACIG00000007725	-	67	38.919	ENSELUG00000018709	-	56	40.000	Esox_lucius
ENSACIG00000007725	-	77	31.963	ENSELUG00000003217	-	91	31.963	Esox_lucius
ENSACIG00000007725	-	67	40.000	ENSFHEG00000020783	-	79	40.000	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000007725	-	69	77.957	ENSFHEG00000023334	-	73	77.957	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000007725	-	70	47.692	ENSGMOG00000001626	-	100	45.000	Gadus_morhua
ENSACIG00000007725	-	67	36.667	ENSGAFG00000020826	-	81	36.667	Gambusia_affinis
ENSACIG00000007725	-	72	42.857	ENSHBUG00000016284	-	90	42.857	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000007725	-	75	72.362	ENSHBUG00000008326	-	95	67.421	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000007725	-	87	37.037	ENSHBUG00000001242	-	60	37.037	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000007725	-	69	37.696	ENSIPUG00000013342	-	71	34.685	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000007725	-	78	73.333	ENSKMAG00000009600	-	74	73.333	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000007725	-	66	41.892	ENSKMAG00000014764	-	76	41.892	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000007725	-	83	41.096	ENSKMAG00000004774	-	71	41.096	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000007725	-	76	42.180	ENSKMAG00000014605	-	69	42.180	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000007725	-	70	42.328	ENSLBEG00000019652	-	65	42.328	Labrus_bergylta
ENSACIG00000007725	-	70	47.619	ENSLOCG00000000082	-	70	47.368	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000007725	-	71	47.396	ENSLOCG00000000460	-	50	41.379	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000007725	-	75	43.842	ENSLOCG00000000517	-	63	43.842	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000007725	-	76	43.689	ENSLOCG00000000385	-	66	43.689	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000007725	-	81	45.000	ENSLOCG00000018072	-	89	45.000	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000007725	-	67	47.283	ENSLOCG00000017852	-	68	47.283	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000007725	-	70	42.632	ENSLOCG00000016496	-	54	42.632	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000007725	-	75	41.429	ENSLOCG00000012075	-	96	42.857	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000007725	-	59	42.405	ENSMAMG00000021970	-	70	42.405	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000007725	-	78	71.707	ENSMAMG00000021969	-	56	71.707	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000007725	-	74	42.487	ENSMAMG00000015600	-	73	40.000	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000007725	-	69	42.188	ENSMMOG00000012876	-	59	42.188	Mola_mola
ENSACIG00000007725	-	66	34.807	ENSMMOG00000016860	-	56	34.807	Mola_mola
ENSACIG00000007725	-	71	37.374	ENSMMOG00000016864	-	75	38.384	Mola_mola
ENSACIG00000007725	-	74	41.206	ENSNBRG00000002136	-	68	41.206	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000007725	-	79	73.364	ENSORLG00000002537	-	62	73.364	Oryzias_latipes
ENSACIG00000007725	-	70	43.850	ENSORLG00000002031	-	58	43.850	Oryzias_latipes
ENSACIG00000007725	-	86	43.850	ENSORLG00020008286	-	79	43.850	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000007725	-	79	73.239	ENSORLG00020011284	-	82	63.158	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000007725	-	67	34.066	ENSORLG00020017387	-	78	34.066	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000007725	-	73	42.781	ENSORLG00020008323	-	59	42.781	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000007725	-	73	43.316	ENSORLG00015004522	-	58	43.316	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000007725	-	64	33.526	ENSORLG00015023234	-	89	33.526	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000007725	-	79	73.239	ENSORLG00015004110	-	61	73.239	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000007725	-	79	72.300	ENSOMEG00000020433	-	81	72.300	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000007725	-	80	43.590	ENSOMEG00000010594	-	88	43.590	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000007725	-	75	50.000	ENSPKIG00000017193	-	88	50.000	Paramormyrops_kingsleyae
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