EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000007737 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 869 bases
Position: chrCCOE01000691.1:1221014-1221882
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000009863	MMR_HSR1	PF01926.23	2.6e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000010152	-	714	-	ENSACIP00000009863	237 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000007737	-	69	37.569	ENSACIG00000015088	-	70	38.857
ENSACIG00000007737	-	69	31.892	ENSACIG00000005223	-	68	32.584
ENSACIG00000007737	-	70	32.065	ENSACIG00000002263	-	63	32.768
ENSACIG00000007737	-	70	32.065	ENSACIG00000012707	-	68	33.146
ENSACIG00000007737	-	69	33.880	ENSACIG00000020225	-	59	34.091
ENSACIG00000007737	-	69	30.601	ENSACIG00000016502	-	73	31.977
ENSACIG00000007737	-	71	36.508	ENSACIG00000022355	-	62	36.264
ENSACIG00000007737	-	75	31.313	ENSACIG00000019509	-	82	32.584
ENSACIG00000007737	-	69	31.868	ENSACIG00000016888	-	57	32.571
ENSACIG00000007737	-	72	30.964	ENSACIG00000014670	-	69	30.108
ENSACIG00000007737	-	71	42.162	ENSACIG00000007725	-	66	42.697
ENSACIG00000007737	-	70	35.106	ENSACIG00000012648	-	61	34.807
ENSACIG00000007737	-	71	31.183	ENSACIG00000008045	-	66	32.000
ENSACIG00000007737	-	70	32.065	ENSACIG00000022362	-	63	32.768
ENSACIG00000007737	-	70	34.066	ENSACIG00000022366	-	63	34.857
ENSACIG00000007737	-	67	30.688	ENSACIG00000014737	-	84	30.851
ENSACIG00000007737	-	61	32.919	ENSACIG00000000631	-	56	32.919
ENSACIG00000007737	-	59	33.540	ENSACIG00000012761	-	70	33.540
ENSACIG00000007737	-	70	34.409	ENSACIG00000014680	-	76	35.429
ENSACIG00000007737	-	71	35.165	ENSACIG00000000893	-	71	36.000
ENSACIG00000007737	-	70	33.690	ENSACIG00000005780	-	54	34.270
ENSACIG00000007737	-	72	32.447	ENSACIG00000012714	-	60	32.044
ENSACIG00000007737	-	69	31.868	ENSACIG00000012718	-	74	32.386
ENSACIG00000007737	-	69	34.615	ENSACIG00000020234	-	61	34.857
ENSACIG00000007737	-	69	31.148	ENSACIG00000006503	-	54	30.682
ENSACIG00000007737	-	72	32.984	ENSACIG00000022222	-	58	32.418
ENSACIG00000007737	-	66	36.994	ENSACIG00000004040	-	67	37.209
ENSACIG00000007737	-	59	33.544	ENSACIG00000000976	-	79	33.544
ENSACIG00000007737	-	76	35.354	ENSACIG00000014662	-	80	35.354
ENSACIG00000007737	-	71	30.159	ENSACIG00000014703	-	69	30.588
ENSACIG00000007737	-	69	36.216	ENSACIG00000016635	-	67	35.955
ENSACIG00000007737	-	69	32.222	ENSACIG00000014634	zgc:113625	70	32.370
ENSACIG00000007737	-	78	31.500	ENSACIG00000003050	-	79	32.768
ENSACIG00000007737	-	67	33.333	ENSACIG00000003582	-	59	32.990
ENSACIG00000007737	-	70	31.016	ENSACIG00000019149	-	54	32.584
ENSACIG00000007737	-	70	32.620	ENSACIG00000006484	-	54	32.584
ENSACIG00000007737	-	73	35.079	ENSACIG00000008001	-	78	34.239
ENSACIG00000007737	-	72	30.108	ENSACIG00000007466	-	56	30.387
ENSACIG00000007737	-	86	31.390	ENSACIG00000014646	zgc:113625	86	31.390
ENSACIG00000007737	-	70	34.426	ENSACIG00000022370	-	62	34.659
ENSACIG00000007737	-	69	33.702	ENSACIG00000022377	-	63	34.483
ENSACIG00000007737	-	59	31.875	ENSACIG00000022374	-	82	31.875
ENSACIG00000007737	-	78	30.693	ENSACIG00000014690	-	68	31.667
ENSACIG00000007737	-	70	32.065	ENSACIG00000019524	-	73	32.571
ENSACIG00000007737	-	66	31.609	ENSACIG00000008666	-	84	31.609
ENSACIG00000007737	-	70	37.368	ENSACIG00000009811	-	73	36.464
ENSACIG00000007737	-	70	32.275	ENSACIG00000006478	-	66	33.333

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000007737	-	88	67.308	ENSAPOG00000019154	-	54	67.308	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000007737	-	78	36.932	ENSAOCG00000004579	-	77	37.640	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000007737	-	89	66.355	ENSAOCG00000003425	-	88	66.355	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000007737	-	78	37.356	ENSAPEG00000014403	-	59	37.288	Amphiprion_percula
ENSACIG00000007737	-	98	61.864	ENSAPEG00000001491	-	63	61.864	Amphiprion_percula
ENSACIG00000007737	-	72	38.919	ENSATEG00000015654	-	65	38.764	Anabas_testudineus
ENSACIG00000007737	-	84	32.407	ENSATEG00000023053	-	93	32.407	Anabas_testudineus
ENSACIG00000007737	-	78	38.587	ENSACLG00000014795	-	66	38.418	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000007737	-	68	34.054	ENSAMXG00000026085	-	62	33.918	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000007737	-	81	36.893	ENSAMXG00000006064	-	66	38.857	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000007737	-	69	37.079	ENSAMXG00000009216	-	84	37.791	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000007737	-	71	43.243	ENSAMXG00000021387	-	58	42.614	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000007737	-	72	36.066	ENSAMXG00000019109	-	80	35.795	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000007737	-	78	37.624	ENSAMXG00000033117	-	75	30.857	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000007737	-	73	40.741	ENSAMXG00000030744	-	73	41.011	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000007737	-	88	59.716	ENSCSEG00000021519	-	87	59.716	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000007737	-	73	34.375	ENSCVAG00000005778	-	63	35.912	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000007737	-	70	39.362	ENSCVAG00000012268	-	60	38.462	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000007737	-	71	43.784	ENSCVAG00000003054	-	62	44.382	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000007737	-	71	35.484	ENSDARG00000102683	CR626941.1	67	35.393	Danio_rerio
ENSACIG00000007737	-	78	44.670	ENSDARG00000063481	si:ch211-214j24.15	59	44.199	Danio_rerio
ENSACIG00000007737	-	70	44.565	ENSELUG00000018192	-	84	44.068	Esox_lucius
ENSACIG00000007737	-	73	33.854	ENSELUG00000018709	-	50	34.940	Esox_lucius
ENSACIG00000007737	-	76	47.208	ENSELUG00000024502	-	69	46.277	Esox_lucius
ENSACIG00000007737	-	70	38.983	ENSFHEG00000020783	-	78	38.728	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000007737	-	84	43.439	ENSFHEG00000023334	-	71	47.253	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000007737	-	69	42.778	ENSGMOG00000001626	-	96	41.618	Gadus_morhua
ENSACIG00000007737	-	78	35.025	ENSGAFG00000020826	-	81	35.052	Gambusia_affinis
ENSACIG00000007737	-	75	80.000	ENSHBUG00000008326	-	83	80.357	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000007737	-	80	36.364	ENSHBUG00000001242	-	56	35.545	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000007737	-	80	34.615	ENSHBUG00000016284	-	82	37.853	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000007737	-	78	30.583	ENSIPUG00000013342	-	60	32.447	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000007737	-	73	43.229	ENSKMAG00000009600	-	64	43.243	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000007737	-	71	39.785	ENSKMAG00000014605	-	58	40.113	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000007737	-	69	36.364	ENSKMAG00000014764	-	74	36.620	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000007737	-	82	41.081	ENSKMAG00000004774	-	64	41.011	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000007737	-	70	40.000	ENSLBEG00000019652	-	61	39.326	Labrus_bergylta
ENSACIG00000007737	-	71	41.848	ENSLOCG00000012075	-	81	41.143	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000007737	-	70	40.449	ENSLOCG00000000385	-	57	40.351	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000007737	-	70	40.782	ENSLOCG00000000517	-	54	40.698	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000007737	-	72	40.860	ENSLOCG00000016496	-	51	40.678	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000007737	-	70	43.243	ENSLOCG00000000082	-	66	43.258	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000007737	-	72	40.761	ENSLOCG00000017852	-	66	40.230	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000007737	-	70	45.109	ENSLOCG00000018072	-	71	45.198	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000007737	-	79	37.363	ENSMAMG00000015600	-	67	36.872	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000007737	-	99	62.393	ENSMAMG00000021969	-	59	62.393	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000007737	-	89	60.092	ENSMMOG00000016864	-	90	60.092	Mola_mola
ENSACIG00000007737	-	72	40.000	ENSMMOG00000012876	-	55	40.782	Mola_mola
ENSACIG00000007737	-	68	39.344	ENSNBRG00000002136	-	60	39.326	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000007737	-	76	37.374	ENSORLG00000002031	-	55	37.853	Oryzias_latipes
ENSACIG00000007737	-	95	62.667	ENSORLG00000002537	-	61	62.667	Oryzias_latipes
ENSACIG00000007737	-	67	35.632	ENSORLG00020017387	-	74	35.294	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000007737	-	72	68.293	ENSORLG00020011284	-	71	68.354	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000007737	-	77	37.374	ENSORLG00020008323	-	55	37.853	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000007737	-	84	38.043	ENSORLG00020008286	-	73	37.853	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000007737	-	72	34.595	ENSORLG00015023234	-	92	34.857	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000007737	-	95	61.778	ENSORLG00015004110	-	61	61.778	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000007737	-	77	36.869	ENSORLG00015004522	-	54	37.288	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000007737	-	80	38.919	ENSOMEG00000010594	-	81	39.106	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000007737	-	72	42.246	ENSOMEG00000020433	-	66	42.778	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000007737	-	70	45.946	ENSPKIG00000017193	-	76	46.067	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000007737	-	71	47.312	ENSPKIG00000017688	-	63	47.191	Paramormyrops_kingsleyae
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ENSACIG00000007737	-	73	39.791	ENSPMGG00000014055	-	75	39.674	Periophthalmus_magnuspinnatus
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