EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000007855 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 13569 bases
Position: chrCCOE01000105.1:795454-809022
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000010029	zf-C2H2	PF00096.26	3.5e-21	1	5
ENSACIP00000010029	zf-C2H2	PF00096.26	3.5e-21	2	5
ENSACIP00000010029	zf-C2H2	PF00096.26	3.5e-21	3	5
ENSACIP00000010029	zf-C2H2	PF00096.26	3.5e-21	4	5
ENSACIP00000010029	zf-C2H2	PF00096.26	3.5e-21	5	5
ENSACIP00000010015	zf-C2H2	PF00096.26	6e-14	1	2
ENSACIP00000010015	zf-C2H2	PF00096.26	6e-14	2	2
ENSACIP00000010029	zf-met	PF12874.7	1.2e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000010325	-	789	-	ENSACIP00000010029	262 (aa)	-	-
ENSACIT00000010310	-	393	-	ENSACIP00000010015	130 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000007855	-	94	53.247	ENSACIG00000006755	-	71	53.247
ENSACIG00000007855	-	93	50.704	ENSACIG00000024444	-	61	50.704
ENSACIG00000007855	-	91	59.740	ENSACIG00000011541	-	67	59.740
ENSACIG00000007855	-	89	40.299	ENSACIG00000002944	-	82	31.538
ENSACIG00000007855	-	95	50.649	ENSACIG00000009809	si:dkey-77f5.14	83	50.649
ENSACIG00000007855	-	89	48.421	ENSACIG00000009780	-	69	48.421
ENSACIG00000007855	-	95	47.436	ENSACIG00000006172	-	84	46.835
ENSACIG00000007855	-	90	35.294	ENSACIG00000001296	-	51	30.172
ENSACIG00000007855	-	94	55.844	ENSACIG00000004666	-	92	51.087
ENSACIG00000007855	-	95	36.434	ENSACIG00000017892	-	78	36.434
ENSACIG00000007855	-	88	43.966	ENSACIG00000018404	-	89	33.333
ENSACIG00000007855	-	95	44.538	ENSACIG00000016182	-	90	39.766
ENSACIG00000007855	-	88	46.939	ENSACIG00000016180	znf341	50	30.851
ENSACIG00000007855	-	95	51.316	ENSACIG00000017647	-	89	47.899
ENSACIG00000007855	-	94	45.263	ENSACIG00000003515	-	91	45.263
ENSACIG00000007855	-	94	51.351	ENSACIG00000018440	-	94	51.351
ENSACIG00000007855	-	91	49.351	ENSACIG00000017653	-	93	49.351
ENSACIG00000007855	-	97	46.479	ENSACIG00000018952	-	52	46.479
ENSACIG00000007855	-	98	47.826	ENSACIG00000000311	-	62	47.826
ENSACIG00000007855	-	88	46.269	ENSACIG00000001369	-	78	46.269
ENSACIG00000007855	-	95	43.956	ENSACIG00000022658	-	95	43.956
ENSACIG00000007855	-	88	39.130	ENSACIG00000018641	snai2	78	32.308
ENSACIG00000007855	-	89	38.571	ENSACIG00000017683	-	77	38.571
ENSACIG00000007855	-	95	45.570	ENSACIG00000000286	-	68	45.570
ENSACIG00000007855	-	90	54.667	ENSACIG00000007464	-	52	54.667
ENSACIG00000007855	-	88	46.154	ENSACIG00000010966	-	50	46.154
ENSACIG00000007855	-	88	49.296	ENSACIG00000009755	-	78	42.636
ENSACIG00000007855	-	87	48.718	ENSACIG00000015835	-	91	38.384
ENSACIG00000007855	-	84	44.776	ENSACIG00000010660	-	96	44.776
ENSACIG00000007855	-	95	47.619	ENSACIG00000000360	si:ch211-241b2.1	87	47.619
ENSACIG00000007855	-	95	56.164	ENSACIG00000010647	-	96	56.164
ENSACIG00000007855	-	88	43.434	ENSACIG00000015411	-	82	40.884
ENSACIG00000007855	-	95	42.553	ENSACIG00000014123	znf236	63	38.532
ENSACIG00000007855	-	93	34.146	ENSACIG00000012604	scrt2	62	31.897
ENSACIG00000007855	-	87	46.970	ENSACIG00000023049	znf646	96	40.299
ENSACIG00000007855	-	92	37.179	ENSACIG00000002180	-	95	37.179
ENSACIG00000007855	-	91	49.275	ENSACIG00000019791	-	87	47.222
ENSACIG00000007855	-	91	49.275	ENSACIG00000022625	-	78	48.684
ENSACIG00000007855	-	95	40.816	ENSACIG00000007096	-	75	40.816
ENSACIG00000007855	-	93	43.902	ENSACIG00000018059	-	58	43.902
ENSACIG00000007855	-	88	44.538	ENSACIG00000017013	-	53	44.538
ENSACIG00000007855	-	88	50.000	ENSACIG00000008886	znf1164	80	50.000
ENSACIG00000007855	-	94	52.564	ENSACIG00000019710	-	71	52.564
ENSACIG00000007855	-	95	55.882	ENSACIG00000022738	-	88	55.882
ENSACIG00000007855	-	95	48.101	ENSACIG00000016944	-	76	48.101
ENSACIG00000007855	-	89	40.187	ENSACIG00000001767	zbtb41	62	40.187
ENSACIG00000007855	-	93	45.714	ENSACIG00000004641	-	58	45.714
ENSACIG00000007855	-	95	44.595	ENSACIG00000013149	-	80	44.595
ENSACIG00000007855	-	95	46.067	ENSACIG00000015429	-	88	41.420
ENSACIG00000007855	-	95	52.778	ENSACIG00000019804	-	84	33.951
ENSACIG00000007855	-	91	43.697	ENSACIG00000023794	-	75	34.066
ENSACIG00000007855	-	95	53.750	ENSACIG00000010637	-	57	53.750
ENSACIG00000007855	-	85	33.043	ENSACIG00000014233	znf407	60	36.464
ENSACIG00000007855	-	93	36.585	ENSACIG00000013613	scrt1b	56	31.818
ENSACIG00000007855	-	94	37.805	ENSACIG00000012636	ZNF319	80	34.574
ENSACIG00000007855	-	95	42.105	ENSACIG00000013163	-	93	42.105
ENSACIG00000007855	-	96	46.250	ENSACIG00000011153	-	68	46.250
ENSACIG00000007855	-	93	52.113	ENSACIG00000013470	-	76	39.773
ENSACIG00000007855	-	96	46.429	ENSACIG00000004745	-	87	46.429
ENSACIG00000007855	-	82	36.634	ENSACIG00000011318	snai1a	73	32.692
ENSACIG00000007855	-	88	40.385	ENSACIG00000008611	-	59	35.965
ENSACIG00000007855	-	95	38.462	ENSACIG00000023313	-	94	33.871
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ENSACIG00000007855	-	89	40.659	ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	64	33.333
ENSACIG00000007855	-	90	45.378	ENSACIG00000003754	-	86	45.378
ENSACIG00000007855	-	91	56.410	ENSACIG00000013604	-	84	56.410
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ENSACIG00000007855	-	94	51.899	ENSACIG00000022293	-	91	51.899
ENSACIG00000007855	-	91	50.704	ENSACIG00000012084	-	93	50.704
ENSACIG00000007855	-	91	50.725	ENSACIG00000004626	-	76	50.725
ENSACIG00000007855	-	95	45.588	ENSACIG00000023212	-	82	39.205
ENSACIG00000007855	-	90	44.872	ENSACIG00000019534	-	84	44.872
ENSACIG00000007855	-	93	34.959	ENSACIG00000006586	-	62	31.915
ENSACIG00000007855	-	95	44.000	ENSACIG00000002190	gfi1b	53	44.000
ENSACIG00000007855	-	70	41.860	ENSACIG00000007034	-	81	41.860
ENSACIG00000007855	-	95	41.000	ENSACIG00000007882	-	83	48.000
ENSACIG00000007855	-	89	42.857	ENSACIG00000017644	-	83	42.857
ENSACIG00000007855	-	94	40.171	ENSACIG00000013750	-	81	38.547
ENSACIG00000007855	-	91	50.725	ENSACIG00000009717	-	92	46.610
ENSACIG00000007855	-	90	45.455	ENSACIG00000008448	-	79	45.455
ENSACIG00000007855	-	96	49.474	ENSACIG00000019447	-	80	49.474
ENSACIG00000007855	-	88	49.296	ENSACIG00000023162	-	70	34.426
ENSACIG00000007855	-	91	38.793	ENSACIG00000000406	prdm5	76	38.793
ENSACIG00000007855	-	93	44.086	ENSACIG00000016117	-	87	46.429
ENSACIG00000007855	-	90	46.809	ENSACIG00000019815	-	91	46.809
ENSACIG00000007855	-	95	48.649	ENSACIG00000017050	-	96	48.649
ENSACIG00000007855	-	93	40.351	ENSACIG00000009128	-	93	33.690
ENSACIG00000007855	-	91	44.444	ENSACIG00000014282	znf526	58	31.973
ENSACIG00000007855	-	95	40.945	ENSACIG00000010739	-	90	35.519
ENSACIG00000007855	-	93	54.054	ENSACIG00000004041	-	94	44.167
ENSACIG00000007855	-	91	40.385	ENSACIG00000006228	-	69	40.385
ENSACIG00000007855	-	88	56.757	ENSACIG00000003556	-	71	56.757
ENSACIG00000007855	-	93	46.341	ENSACIG00000003720	-	63	46.341
ENSACIG00000007855	-	95	49.020	ENSACIG00000011515	-	81	37.912
ENSACIG00000007855	-	96	33.673	ENSACIG00000011516	-	80	33.673
ENSACIG00000007855	-	93	47.368	ENSACIG00000021986	-	92	47.368
ENSACIG00000007855	-	91	43.478	ENSACIG00000012263	znf319b	88	32.883
ENSACIG00000007855	-	89	40.496	ENSACIG00000020982	znf710b	56	35.165

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000007855	-	88	36.134	FBgn0030008	CG2129	67	31.395	Drosophila_melanogaster
ENSACIG00000007855	-	88	42.424	ENSORLG00000028028	-	83	36.458	Oryzias_latipes