EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000007867 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: si:dkey-86e18.1
Alias: im:6912651
Full Name: si:dkey-86e18.1
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 3694 bases
Position: chrCCOE01000084.1:1076832-1080525
Accession: ZDB-GENE-041014-18
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000010036	Isy1	PF06246.12	9.8e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000010332	-	753	-	ENSACIP00000010036	250 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSACIG00000007867's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSACIG00000007867's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000007867	si:dkey-86e18.1	99	64.650	ENSAPOG00000002792	si:dkey-86e18.1	99	64.650	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000007867	si:dkey-86e18.1	99	75.494	ENSAOCG00000014440	si:dkey-86e18.1	99	75.494	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000007867	si:dkey-86e18.1	99	65.347	ENSAPEG00000011831	si:dkey-86e18.1	99	65.347	Amphiprion_percula
ENSACIG00000007867	si:dkey-86e18.1	99	62.963	ENSATEG00000018061	si:dkey-86e18.1	100	62.963	Anabas_testudineus
ENSACIG00000007867	si:dkey-86e18.1	96	71.119	ENSACLG00000012308	si:dkey-86e18.1	100	71.329	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000007867	si:dkey-86e18.1	99	53.409	ENSAMXG00000038638	si:dkey-86e18.1	99	53.409	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000007867	si:dkey-86e18.1	99	58.188	ENSCSEG00000007482	-	99	58.188	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000007867	si:dkey-86e18.1	100	57.705	ENSCVAG00000020099	si:dkey-86e18.1	99	57.705	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000007867	si:dkey-86e18.1	99	54.475	ENSDARG00000043536	si:dkey-86e18.1	99	54.475	Danio_rerio
ENSACIG00000007867	si:dkey-86e18.1	100	52.174	ENSELUG00000007229	si:dkey-86e18.1	100	52.174	Esox_lucius
ENSACIG00000007867	si:dkey-86e18.1	100	57.792	ENSFHEG00000023250	si:dkey-86e18.1	100	57.792	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000007867	si:dkey-86e18.1	82	66.525	ENSGAFG00000006609	si:dkey-86e18.1	78	66.525	Gambusia_affinis
ENSACIG00000007867	si:dkey-86e18.1	96	72.202	ENSHBUG00000018237	si:dkey-86e18.1	100	72.378	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000007867	si:dkey-86e18.1	99	54.580	ENSIPUG00000012213	si:dkey-86e18.1	99	54.580	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000007867	si:dkey-86e18.1	99	60.458	ENSKMAG00000008387	si:dkey-86e18.1	99	60.458	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000007867	si:dkey-86e18.1	96	58.868	ENSLBEG00000008055	si:dkey-86e18.1	98	59.410	Labrus_bergylta
ENSACIG00000007867	si:dkey-86e18.1	98	43.463	ENSLACG00000003926	si:dkey-86e18.1	99	43.463	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000007867	si:dkey-86e18.1	99	50.570	ENSLOCG00000008902	si:dkey-86e18.1	99	50.951	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000007867	si:dkey-86e18.1	100	60.317	ENSMAMG00000016989	si:dkey-86e18.1	100	60.317	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000007867	si:dkey-86e18.1	96	71.119	ENSMZEG00005019446	si:dkey-86e18.1	100	71.329	Maylandia_zebra
ENSACIG00000007867	si:dkey-86e18.1	100	70.039	ENSMMOG00000002257	si:dkey-86e18.1	100	70.039	Mola_mola
ENSACIG00000007867	si:dkey-86e18.1	100	70.916	ENSMALG00000004349	si:dkey-86e18.1	100	70.916	Monopterus_albus
ENSACIG00000007867	si:dkey-86e18.1	96	74.603	ENSNBRG00000023611	si:dkey-86e18.1	100	74.713	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000007867	si:dkey-86e18.1	96	77.689	ENSONIG00000002738	si:dkey-86e18.1	100	77.606	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000007867	si:dkey-86e18.1	100	53.922	ENSORLG00000028970	si:dkey-86e18.1	100	53.746	Oryzias_latipes
ENSACIG00000007867	si:dkey-86e18.1	100	55.000	ENSORLG00020021835	si:dkey-86e18.1	100	55.000	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000007867	si:dkey-86e18.1	100	54.397	ENSORLG00015018600	si:dkey-86e18.1	100	54.397	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000007867	si:dkey-86e18.1	99	57.566	ENSOMEG00000001778	si:dkey-86e18.1	100	57.895	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000007867	si:dkey-86e18.1	99	49.200	ENSPKIG00000009550	si:dkey-86e18.1	100	49.200	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000007867	si:dkey-86e18.1	99	61.660	ENSPMGG00000008481	si:dkey-86e18.1	98	61.660	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000007867	si:dkey-86e18.1	99	64.925	ENSPFOG00000014484	si:dkey-86e18.1	100	64.925	Poecilia_formosa
ENSACIG00000007867	si:dkey-86e18.1	100	58.442	ENSPLAG00000009910	si:dkey-86e18.1	100	58.442	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000007867	si:dkey-86e18.1	100	58.766	ENSPMEG00000003114	si:dkey-86e18.1	100	58.766	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000007867	si:dkey-86e18.1	100	70.000	ENSPREG00000002081	si:dkey-86e18.1	100	70.000	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000007867	si:dkey-86e18.1	96	71.119	ENSPNYG00000007473	si:dkey-86e18.1	100	71.329	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000007867	si:dkey-86e18.1	99	54.307	ENSPNAG00000008048	si:dkey-86e18.1	99	54.307	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000007867	si:dkey-86e18.1	99	46.570	ENSSFOG00015002284	si:dkey-86e18.1	99	46.570	Scleropages_formosus
ENSACIG00000007867	si:dkey-86e18.1	95	61.745	ENSSMAG00000017672	si:dkey-86e18.1	100	62.500	Scophthalmus_maximus
ENSACIG00000007867	si:dkey-86e18.1	100	64.151	ENSSDUG00000000818	si:dkey-86e18.1	100	64.151	Seriola_dumerili
ENSACIG00000007867	si:dkey-86e18.1	100	63.950	ENSSLDG00000000289	si:dkey-86e18.1	100	63.950	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACIG00000007867	si:dkey-86e18.1	100	62.338	ENSSPAG00000014712	si:dkey-86e18.1	100	62.338	Stegastes_partitus
ENSACIG00000007867	si:dkey-86e18.1	100	59.786	ENSTRUG00000024468	si:dkey-86e18.1	100	60.854	Takifugu_rubripes
ENSACIG00000007867	si:dkey-86e18.1	100	66.000	ENSXCOG00000008851	si:dkey-86e18.1	100	66.000	Xiphophorus_couchianus
ENSACIG00000007867	si:dkey-86e18.1	100	57.468	ENSXMAG00000011403	si:dkey-86e18.1	100	57.468	Xiphophorus_maculatus