EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000007876 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: prpf3
Alias: HPRP3|wu:fa11f05
Full Name: PRP3 pre-mRNA processing factor 3 homolog (yeast)
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 8736 bases
Position: chrCCOE01000998.1:1064637-1073372
Accession: ZDB-GENE-040823-3
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000010071	PRP3	PF08572.10	8e-76	1	1
ENSACIP00000010071	PWI	PF01480.17	1.7e-11	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000010367	-	2079	-	ENSACIP00000010071	692 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000007876	prpf3	99	71.004	ENSG00000117360	PRPF3	100	71.994	Homo_sapiens
ENSACIG00000007876	prpf3	100	89.489	ENSAPOG00000015584	prpf3	100	89.205	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000007876	prpf3	99	71.146	ENSAMEG00000001630	PRPF3	100	72.136	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000007876	prpf3	100	89.205	ENSAOCG00000011449	prpf3	100	88.920	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000007876	prpf3	100	89.773	ENSATEG00000023583	prpf3	100	89.062	Anabas_testudineus
ENSACIG00000007876	prpf3	99	71.610	ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	72.175	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000007876	prpf3	99	70.845	ENSACAG00000003176	PRPF3	100	71.831	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000007876	prpf3	99	71.004	ENSANAG00000026138	PRPF3	100	71.994	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000007876	prpf3	100	90.741	ENSACLG00000020127	prpf3	100	90.171	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000007876	prpf3	100	81.767	ENSAMXG00000007306	prpf3	100	81.767	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000007876	prpf3	99	71.004	ENSBTAG00000013946	PRPF3	100	71.994	Bos_taurus
ENSACIG00000007876	prpf3	80	39.367	WBGene00010844	prp-3	95	35.234	Caenorhabditis_elegans
ENSACIG00000007876	prpf3	99	71.004	ENSCJAG00000009926	PRPF3	100	71.994	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000007876	prpf3	99	71.004	ENSCAFG00000011820	PRPF3	100	71.994	Canis_familiaris
ENSACIG00000007876	prpf3	82	70.753	ENSCAFG00020019653	PRPF3	100	71.278	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000007876	prpf3	99	71.004	ENSCHIG00000015434	PRPF3	100	71.994	Capra_hircus
ENSACIG00000007876	prpf3	99	71.146	ENSTSYG00000001383	PRPF3	100	72.136	Carlito_syrichta
ENSACIG00000007876	prpf3	93	61.562	ENSCAPG00000017812	PRPF3	95	62.481	Cavia_aperea
ENSACIG00000007876	prpf3	99	71.004	ENSCPOG00000008068	PRPF3	100	71.994	Cavia_porcellus
ENSACIG00000007876	prpf3	99	71.004	ENSCCAG00000026380	PRPF3	100	71.994	Cebus_capucinus
ENSACIG00000007876	prpf3	99	58.567	ENSCATG00000041778	PRPF3	100	59.551	Cercocebus_atys
ENSACIG00000007876	prpf3	99	71.146	ENSCLAG00000015009	PRPF3	100	72.136	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000007876	prpf3	77	81.022	ENSCHOG00000011645	PRPF3	76	82.482	Choloepus_hoffmanni
ENSACIG00000007876	prpf3	99	71.469	ENSCPBG00000008216	PRPF3	100	72.458	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000007876	prpf3	58	60.732	ENSCING00000003312	-	99	60.732	Ciona_intestinalis
ENSACIG00000007876	prpf3	82	52.650	ENSCSAVG00000008720	-	97	52.650	Ciona_savignyi
ENSACIG00000007876	prpf3	99	70.438	ENSCANG00000036769	PRPF3	100	71.429	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000007876	prpf3	99	71.004	ENSCGRG00001019100	Prpf3	100	71.994	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000007876	prpf3	99	71.004	ENSCGRG00000007322	Prpf3	100	71.994	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000007876	prpf3	100	86.056	ENSCSEG00000002532	prpf3	100	85.915	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000007876	prpf3	100	86.932	ENSCVAG00000009318	prpf3	100	86.932	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000007876	prpf3	100	80.398	ENSDARG00000086425	prpf3	100	80.398	Danio_rerio
ENSACIG00000007876	prpf3	99	64.873	ENSDNOG00000005904	PRPF3	100	67.564	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000007876	prpf3	93	70.821	ENSDORG00000008664	Prpf3	100	71.884	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000007876	prpf3	80	52.373	FBgn0036915	Prp3	99	52.688	Drosophila_melanogaster
ENSACIG00000007876	prpf3	99	71.146	ENSETEG00000019124	PRPF3	100	72.136	Echinops_telfairi
ENSACIG00000007876	prpf3	100	61.930	ENSEBUG00000011680	prpf3	100	61.528	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000007876	prpf3	99	70.863	ENSEASG00005001566	PRPF3	100	71.853	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000007876	prpf3	99	71.004	ENSECAG00000019840	PRPF3	100	71.994	Equus_caballus
ENSACIG00000007876	prpf3	83	72.500	ENSEEUG00000007338	PRPF3	85	73.409	Erinaceus_europaeus
ENSACIG00000007876	prpf3	100	74.893	ENSELUG00000013624	prpf3	100	76.034	Esox_lucius
ENSACIG00000007876	prpf3	99	71.004	ENSFCAG00000013940	PRPF3	100	71.994	Felis_catus
ENSACIG00000007876	prpf3	99	71.429	ENSFDAG00000010365	PRPF3	100	72.419	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000007876	prpf3	100	86.648	ENSFHEG00000021746	prpf3	100	86.364	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000007876	prpf3	100	83.523	ENSGMOG00000008535	prpf3	100	83.523	Gadus_morhua
ENSACIG00000007876	prpf3	99	71.751	ENSGALG00000028205	PRPF3	100	72.316	Gallus_gallus
ENSACIG00000007876	prpf3	100	86.790	ENSGAFG00000012671	prpf3	100	85.938	Gambusia_affinis
ENSACIG00000007876	prpf3	100	86.790	ENSGACG00000011792	prpf3	100	86.506	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000007876	prpf3	99	71.469	ENSGAGG00000013765	PRPF3	100	75.221	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000007876	prpf3	86	76.627	ENSGGOG00000013174	PRPF3	100	77.811	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000007876	prpf3	100	89.831	ENSHBUG00000003493	prpf3	100	89.266	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000007876	prpf3	99	53.210	ENSHGLG00000016033	-	100	53.780	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000007876	prpf3	99	71.146	ENSHGLG00000016569	PRPF3	100	72.136	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000007876	prpf3	99	71.146	ENSHGLG00100007590	PRPF3	100	72.136	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000007876	prpf3	99	52.924	ENSHGLG00100008951	-	100	53.638	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000007876	prpf3	100	80.791	ENSHCOG00000014058	prpf3	100	80.932	Hippocampus_comes
ENSACIG00000007876	prpf3	100	80.791	ENSIPUG00000000902	PRPF3	100	80.791	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000007876	prpf3	99	71.004	ENSSTOG00000001889	PRPF3	100	71.994	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000007876	prpf3	100	87.216	ENSKMAG00000001390	prpf3	100	86.932	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000007876	prpf3	100	89.773	ENSLBEG00000026310	prpf3	100	96.739	Labrus_bergylta
ENSACIG00000007876	prpf3	93	67.121	ENSLACG00000010541	PRPF3	100	67.727	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000007876	prpf3	99	71.004	ENSLAFG00000004713	PRPF3	100	71.994	Loxodonta_africana
ENSACIG00000007876	prpf3	99	71.004	ENSMFAG00000039791	PRPF3	100	71.994	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000007876	prpf3	92	70.479	ENSMMUG00000016301	PRPF3	99	70.943	Macaca_mulatta
ENSACIG00000007876	prpf3	99	71.004	ENSMNEG00000038161	PRPF3	100	71.994	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000007876	prpf3	86	76.627	ENSMLEG00000040609	PRPF3	100	77.811	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000007876	prpf3	98	48.994	ENSMLEG00000041065	-	97	49.282	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000007876	prpf3	100	89.078	ENSMAMG00000014968	prpf3	100	89.078	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000007876	prpf3	100	92.045	ENSMZEG00005015970	prpf3	100	92.045	Maylandia_zebra
ENSACIG00000007876	prpf3	99	71.751	ENSMGAG00000000707	PRPF3	100	72.316	Meleagris_gallopavo
ENSACIG00000007876	prpf3	99	71.004	ENSMAUG00000017112	Prpf3	100	71.853	Mesocricetus_auratus
ENSACIG00000007876	prpf3	99	70.863	ENSMICG00000015386	PRPF3	100	74.645	Microcebus_murinus
ENSACIG00000007876	prpf3	99	71.004	ENSMOCG00000000242	Prpf3	100	71.994	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000007876	prpf3	100	83.404	ENSMMOG00000016131	prpf3	100	83.121	Mola_mola
ENSACIG00000007876	prpf3	99	71.429	ENSMODG00000018774	PRPF3	100	72.419	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000007876	prpf3	100	85.917	ENSMALG00000007257	prpf3	100	86.060	Monopterus_albus
ENSACIG00000007876	prpf3	99	71.004	MGP_CAROLIEiJ_G0025354	Prpf3	100	71.994	Mus_caroli
ENSACIG00000007876	prpf3	99	71.004	ENSMUSG00000015748	Prpf3	100	71.994	Mus_musculus
ENSACIG00000007876	prpf3	99	70.704	MGP_PahariEiJ_G0026798	Prpf3	100	71.549	Mus_pahari
ENSACIG00000007876	prpf3	99	71.004	MGP_SPRETEiJ_G0026298	Prpf3	100	71.994	Mus_spretus
ENSACIG00000007876	prpf3	99	69.590	ENSMPUG00000005080	PRPF3	100	70.621	Mustela_putorius_furo
ENSACIG00000007876	prpf3	99	71.328	ENSMLUG00000004646	-	100	72.316	Myotis_lucifugus
ENSACIG00000007876	prpf3	99	71.004	ENSNGAG00000000910	Prpf3	100	71.994	Nannospalax_galili
ENSACIG00000007876	prpf3	100	91.983	ENSNBRG00000003462	prpf3	100	91.983	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000007876	prpf3	91	71.451	ENSNLEG00000009841	PRPF3	99	71.924	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000007876	prpf3	83	63.018	ENSMEUG00000008733	PRPF3	89	64.201	Notamacropus_eugenii
ENSACIG00000007876	prpf3	99	70.863	ENSOPRG00000010139	PRPF3	100	71.853	Ochotona_princeps
ENSACIG00000007876	prpf3	99	71.004	ENSODEG00000011363	-	100	71.994	Octodon_degus
ENSACIG00000007876	prpf3	99	54.062	ENSODEG00000014412	-	100	54.622	Octodon_degus
ENSACIG00000007876	prpf3	100	92.472	ENSONIG00000006394	prpf3	100	92.472	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000007876	prpf3	99	55.021	ENSOANG00000015441	PRPF3	100	55.021	Ornithorhynchus_anatinus
ENSACIG00000007876	prpf3	99	71.004	ENSOCUG00000011760	PRPF3	100	71.994	Oryctolagus_cuniculus
ENSACIG00000007876	prpf3	100	85.491	ENSORLG00000010330	prpf3	100	85.206	Oryzias_latipes
ENSACIG00000007876	prpf3	100	85.349	ENSORLG00020009054	prpf3	100	85.064	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000007876	prpf3	100	85.206	ENSORLG00015015016	prpf3	100	84.922	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000007876	prpf3	100	86.364	ENSOMEG00000000940	prpf3	100	86.080	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000007876	prpf3	99	67.422	ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	68.414	Otolemur_garnettii
ENSACIG00000007876	prpf3	99	71.004	ENSOARG00000020798	PRPF3	100	71.994	Ovis_aries
ENSACIG00000007876	prpf3	98	54.310	ENSPPAG00000043769	-	99	54.167	Pan_paniscus
ENSACIG00000007876	prpf3	99	70.863	ENSPPAG00000030983	PRPF3	100	71.853	Pan_paniscus
ENSACIG00000007876	prpf3	99	71.004	ENSPPRG00000000731	PRPF3	100	71.994	Panthera_pardus
ENSACIG00000007876	prpf3	99	71.004	ENSPTIG00000005516	PRPF3	100	71.994	Panthera_tigris_altaica
ENSACIG00000007876	prpf3	98	53.448	ENSPTRG00000047819	-	99	53.305	Pan_troglodytes
ENSACIG00000007876	prpf3	99	71.004	ENSPTRG00000001254	PRPF3	100	71.994	Pan_troglodytes
ENSACIG00000007876	prpf3	99	70.863	ENSPANG00000000499	PRPF3	100	71.853	Papio_anubis
ENSACIG00000007876	prpf3	100	81.895	ENSPKIG00000010501	prpf3	100	81.895	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000007876	prpf3	99	72.136	ENSPSIG00000014877	PRPF3	100	72.560	Pelodiscus_sinensis
ENSACIG00000007876	prpf3	100	73.782	ENSPMGG00000007776	prpf3	100	73.782	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000007876	prpf3	99	71.004	ENSPEMG00000011672	Prpf3	100	71.994	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACIG00000007876	prpf3	60	73.516	ENSPMAG00000005588	prpf3	99	72.185	Petromyzon_marinus
ENSACIG00000007876	prpf3	99	71.429	ENSPCIG00000008795	PRPF3	100	72.419	Phascolarctos_cinereus
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