EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000007882 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 4424 bases
Position: chrCCOE01000105.1:802749-807172
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000010045	zf-C2H2	PF00096.26	3.4e-21	1	4
ENSACIP00000010045	zf-C2H2	PF00096.26	3.4e-21	2	4
ENSACIP00000010045	zf-C2H2	PF00096.26	3.4e-21	3	4
ENSACIP00000010045	zf-C2H2	PF00096.26	3.4e-21	4	4
ENSACIP00000010045	zf-met	PF12874.7	5.8e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000010341	-	774	-	ENSACIP00000010045	257 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000007882	-	80	44.910	ENSACIG00000023162	-	52	44.910
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ENSACIG00000007882	-	77	43.114	ENSACIG00000022330	-	81	41.615
ENSACIG00000007882	-	75	39.823	ENSACIG00000017653	-	93	39.823
ENSACIG00000007882	-	84	39.831	ENSACIG00000022625	-	96	39.831
ENSACIG00000007882	-	84	37.759	ENSACIG00000011153	-	78	47.761
ENSACIG00000007882	-	84	36.574	ENSACIG00000004641	-	65	36.574
ENSACIG00000007882	-	91	38.764	ENSACIG00000023313	-	88	38.764
ENSACIG00000007882	-	82	44.037	ENSACIG00000006228	-	76	44.037
ENSACIG00000007882	-	76	47.727	ENSACIG00000007034	-	71	47.727
ENSACIG00000007882	-	84	49.618	ENSACIG00000004666	-	99	47.872
ENSACIG00000007882	-	79	34.659	ENSACIG00000006377	-	69	34.659
ENSACIG00000007882	-	81	45.989	ENSACIG00000016182	-	82	46.111
ENSACIG00000007882	-	88	45.455	ENSACIG00000023212	-	85	45.455
ENSACIG00000007882	-	74	41.420	ENSACIG00000002190	gfi1b	59	41.420
ENSACIG00000007882	-	73	39.394	ENSACIG00000013613	scrt1b	51	39.394
ENSACIG00000007882	-	74	42.647	ENSACIG00000017892	-	81	42.647
ENSACIG00000007882	-	81	45.133	ENSACIG00000006755	-	72	45.133
ENSACIG00000007882	-	83	35.606	ENSACIG00000017166	-	82	35.821
ENSACIG00000007882	-	75	39.306	ENSACIG00000019804	-	83	39.306
ENSACIG00000007882	-	86	43.011	ENSACIG00000023794	-	73	43.011
ENSACIG00000007882	-	83	46.061	ENSACIG00000009755	-	75	46.061
ENSACIG00000007882	-	83	36.702	ENSACIG00000001767	zbtb41	66	36.702
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ENSACIG00000007882	-	81	45.399	ENSACIG00000022738	-	99	45.399
ENSACIG00000007882	-	82	47.826	ENSACIG00000000286	-	79	47.826
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ENSACIG00000007882	-	81	44.615	ENSACIG00000017013	-	53	44.615
ENSACIG00000007882	-	78	38.849	ENSACIG00000001369	-	82	37.600
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ENSACIG00000007882	-	91	44.311	ENSACIG00000006172	-	89	47.126
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ENSACIG00000007882	-	73	47.514	ENSACIG00000003754	-	86	47.514
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ENSACIG00000007882	-	82	43.919	ENSACIG00000007464	-	55	43.919
ENSACIG00000007882	-	94	38.323	ENSACIG00000012636	ZNF319	86	38.830
ENSACIG00000007882	-	85	43.704	ENSACIG00000007096	-	86	43.704
ENSACIG00000007882	-	93	41.361	ENSACIG00000003515	-	93	40.625
ENSACIG00000007882	-	86	38.788	ENSACIG00000012263	znf319b	96	39.264
ENSACIG00000007882	-	93	43.316	ENSACIG00000017644	-	94	43.316
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ENSACIG00000007882	-	79	36.538	ENSACIG00000007000	-	58	36.538
ENSACIG00000007882	-	81	40.580	ENSACIG00000021986	-	97	40.580
ENSACIG00000007882	-	73	48.876	ENSACIG00000000311	-	57	48.876
ENSACIG00000007882	-	81	40.909	ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	58	40.909
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ENSACIG00000007882	-	81	49.390	ENSACIG00000016944	-	79	49.390
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ENSACIG00000007882	-	73	38.931	ENSACIG00000016133	-	53	38.931
ENSACIG00000007882	-	87	43.678	ENSACIG00000019791	-	96	43.678
ENSACIG00000007882	-	81	44.099	ENSACIG00000009809	si:dkey-77f5.14	80	44.099
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ENSACIG00000007882	-	86	45.213	ENSACIG00000010647	-	96	48.000
ENSACIG00000007882	-	83	45.930	ENSACIG00000013604	-	97	44.848
ENSACIG00000007882	-	79	34.934	ENSACIG00000013163	-	81	34.934
ENSACIG00000007882	-	84	50.649	ENSACIG00000015411	-	87	50.649
ENSACIG00000007882	-	84	40.625	ENSACIG00000000406	prdm5	70	40.625
ENSACIG00000007882	-	86	46.243	ENSACIG00000013750	-	77	46.243
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ENSACIG00000007882	-	81	44.920	ENSACIG00000011515	-	76	44.920
ENSACIG00000007882	-	74	33.621	ENSACIG00000011516	-	85	33.621
ENSACIG00000007882	-	73	42.771	ENSACIG00000021378	gfi1aa	60	42.771
ENSACIG00000007882	-	85	32.895	ENSACIG00000009443	-	61	32.895
ENSACIG00000007882	-	83	45.989	ENSACIG00000019102	-	53	45.989
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ENSACIG00000007882	-	94	48.128	ENSACIG00000017647	-	99	48.128
ENSACIG00000007882	-	88	41.772	ENSACIG00000019534	-	93	41.772
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ENSACIG00000007882	-	90	47.407	ENSACIG00000017050	-	99	47.568
ENSACIG00000007882	-	74	39.535	ENSACIG00000002180	-	99	39.535
ENSACIG00000007882	-	67	45.614	ENSACIG00000010660	-	88	45.614
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ENSACIG00000007882	-	80	48.663	ENSACIG00000004041	-	94	48.663
ENSACIG00000007882	-	81	45.989	ENSACIG00000022293	-	96	45.989
ENSACIG00000007882	-	80	44.503	ENSACIG00000009717	-	90	44.503
ENSACIG00000007882	-	88	47.977	ENSACIG00000003556	-	74	47.977
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ENSACIG00000007882	-	80	45.963	ENSACIG00000008448	-	72	45.963
ENSACIG00000007882	-	84	32.515	ENSACIG00000018641	snai2	62	32.515
ENSACIG00000007882	-	81	40.513	ENSACIG00000018404	-	85	40.513
ENSACIG00000007882	-	86	41.441	ENSACIG00000001860	-	61	41.441
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ENSACIG00000007882	-	84	43.750	ENSACIG00000019447	-	70	43.750
ENSACIG00000007882	-	79	37.681	ENSACIG00000017683	-	76	33.990

Orthologs

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ENSACIG00000007882	-	79	37.805	ENSACLG00000000521	-	99	37.805	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000007882	-	77	45.361	ENSACLG00000024670	-	82	44.000	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000007882	-	73	37.079	ENSACLG00000017449	-	58	37.226	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000007882	-	75	44.920	ENSAMXG00000029660	-	59	44.920	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000007882	-	74	47.368	ENSAMXG00000043291	-	69	47.368	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000007882	-	75	45.596	ENSAMXG00000041650	-	86	45.596	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000007882	-	73	39.752	ENSCSEG00000015585	-	75	39.752	Cynoglossus_semilaevis
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ENSACIG00000007882	-	78	43.216	ENSDARG00000078159	zgc:175284	86	43.216	Danio_rerio
ENSACIG00000007882	-	75	44.845	ENSDARG00000088507	znf982	93	45.545	Danio_rerio
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ENSACIG00000007882	-	80	44.503	ENSDARG00000092605	znf1003	73	44.503	Danio_rerio
ENSACIG00000007882	-	80	44.444	ENSDARG00000103530	zgc:113102	99	44.444	Danio_rerio
ENSACIG00000007882	-	79	47.059	ENSDARG00000100803	zgc:173517	94	47.059	Danio_rerio
ENSACIG00000007882	-	79	43.350	ENSDARG00000101694	znf1184	85	43.350	Danio_rerio
ENSACIG00000007882	-	75	49.112	ENSDARG00000105056	znf45l	93	49.112	Danio_rerio
ENSACIG00000007882	-	81	45.161	ENSDARG00000104904	si:ch73-221f6.1	65	45.161	Danio_rerio
ENSACIG00000007882	-	73	48.108	ENSDARG00000101044	si:ch73-138e16.6	89	48.108	Danio_rerio
ENSACIG00000007882	-	81	47.594	ENSDARG00000099890	CU207221.2	99	47.594	Danio_rerio
ENSACIG00000007882	-	80	46.012	ENSDARG00000078814	si:dkey-34m19.3	81	46.012	Danio_rerio
ENSACIG00000007882	-	73	45.946	ENSDARG00000111614	znf1183	84	45.946	Danio_rerio
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