EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000008045 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 10529 bases
Position: chrCCOE01001033.1:215057-225585
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000010279	MMR_HSR1	PF01926.23	5.3e-08	1	1
ENSACIP00000010289	MMR_HSR1	PF01926.23	7.2e-08	1	1

Transcripts

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Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000008045	-	73	46.701	ENSACIG00000007178	-	67	46.701
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ENSACIG00000008045	-	86	57.709	ENSACIG00000004245	-	80	57.333
ENSACIG00000008045	-	75	54.726	ENSACIG00000022355	-	73	53.555
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ENSACIG00000008045	-	79	57.277	ENSACIG00000022366	-	86	51.899
ENSACIG00000008045	-	77	59.901	ENSACIG00000022362	-	74	59.420
ENSACIG00000008045	-	78	49.289	ENSACIG00000002950	-	58	48.624
ENSACIG00000008045	-	76	43.500	ENSACIG00000014745	-	91	43.284
ENSACIG00000008045	-	78	53.365	ENSACIG00000012707	-	79	53.365
ENSACIG00000008045	-	75	48.241	ENSACIG00000014662	-	84	46.602
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ENSACIG00000008045	-	69	50.543	ENSACIG00000005223	-	70	50.543
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ENSACIG00000008045	-	66	32.000	ENSACIG00000007737	-	71	31.183
ENSACIG00000008045	-	89	41.880	ENSACIG00000014690	-	78	46.040
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ENSACIG00000008045	-	75	51.961	ENSACIG00000006478	-	77	50.718
ENSACIG00000008045	-	88	55.172	ENSACIG00000001070	-	83	54.783
ENSACIG00000008045	-	89	56.962	ENSACIG00000001455	-	84	58.772
ENSACIG00000008045	-	71	36.232	ENSACIG00000009149	-	70	36.232
ENSACIG00000008045	-	65	48.295	ENSACIG00000012761	-	70	51.534
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ENSACIG00000008045	-	75	48.756	ENSACIG00000016313	-	66	48.341
ENSACIG00000008045	-	75	36.000	ENSACIG00000014670	-	78	36.000
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ENSACIG00000008045	-	77	63.861	ENSACIG00000008001	-	95	58.182
ENSACIG00000008045	-	76	47.500	ENSACIG00000020234	-	72	48.039

Orthologs

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ENSACIG00000008045	-	75	50.254	ENSAPOG00000020897	-	79	49.524	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000008045	-	77	52.709	ENSAPOG00000011509	-	70	53.140	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000008045	-	79	53.623	ENSAPOG00000006488	-	81	54.028	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000008045	-	85	43.049	ENSAPOG00000001268	-	51	45.146	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000008045	-	92	54.656	ENSAPOG00000008063	-	80	54.251	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000008045	-	90	55.785	ENSAPOG00000021159	-	70	60.465	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000008045	-	82	45.872	ENSAPOG00000007322	-	71	46.860	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000008045	-	75	45.000	ENSAPOG00000007333	-	60	44.712	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000008045	-	79	49.275	ENSAPOG00000014759	-	74	47.321	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000008045	-	80	61.429	ENSAPOG00000012716	-	71	61.137	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000008045	-	79	53.365	ENSAPOG00000006169	-	58	53.774	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000008045	-	75	44.162	ENSAPOG00000022240	-	57	44.388	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000008045	-	82	40.741	ENSAPOG00000001315	-	65	40.845	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000008045	-	79	44.762	ENSAPOG00000008344	zgc:113625	73	44.928	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000008045	-	77	43.689	ENSAPOG00000014243	-	83	43.842	Acanthochromis_polyacanthus
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ENSACIG00000008045	-	80	52.995	ENSAOCG00000023255	-	74	52.830	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000008045	-	75	44.000	ENSAOCG00000012651	-	86	44.498	Amphiprion_ocellaris
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ENSACIG00000008045	-	80	51.613	ENSAOCG00000008525	-	61	52.358	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000008045	-	82	44.954	ENSAOCG00000011167	-	67	47.264	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000008045	-	85	50.450	ENSAOCG00000014702	-	68	53.140	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000008045	-	75	45.000	ENSAOCG00000011155	-	60	44.712	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000008045	-	75	51.010	ENSAOCG00000021905	-	67	47.768	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000008045	-	80	51.852	ENSAOCG00000023240	-	77	52.582	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000008045	-	75	42.211	ENSAOCG00000011794	-	62	41.148	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000008045	-	87	50.661	ENSAPEG00000003884	-	74	50.661	Amphiprion_percula
ENSACIG00000008045	-	83	58.065	ENSAPEG00000022374	-	75	59.174	Amphiprion_percula
ENSACIG00000008045	-	79	59.420	ENSAPEG00000022386	-	79	59.906	Amphiprion_percula
ENSACIG00000008045	-	75	42.211	ENSAPEG00000000770	-	62	41.148	Amphiprion_percula
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ENSACIG00000008045	-	81	51.174	ENSAPEG00000004217	-	72	51.887	Amphiprion_percula
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ENSACIG00000008045	-	80	41.232	ENSATEG00000005844	-	63	40.566	Anabas_testudineus
ENSACIG00000008045	-	84	47.945	ENSATEG00000014013	si:ch211-113e8.5	82	48.387	Anabas_testudineus
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ENSACIG00000008045	-	87	55.172	ENSATEG00000013008	-	73	58.491	Anabas_testudineus
ENSACIG00000008045	-	81	58.824	ENSATEG00000014028	-	78	53.672	Anabas_testudineus
ENSACIG00000008045	-	77	43.781	ENSATEG00000020431	zgc:113625	78	45.226	Anabas_testudineus
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ENSACIG00000008045	-	76	46.766	ENSACLG00000023766	zgc:113625	86	46.602	Astatotilapia_calliptera
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