EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSACIG00000008055 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: xpo6
Alias: Ranbp20|fi24f12|wu:fi24f12
Full Name: exportin 6
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 20218 bases
Position: chrCCOE01001675.1:1628783-1649000
Accession: ZDB-GENE-030131-5912
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000010327	Xpo1	PF08389.12	3.3e-23	1	1
ENSACIP00000010327	IBN_N	PF03810.19	5.5e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000010623	-	3393	-	ENSACIP00000010327	1130 (aa)	-	-

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000008055	xpo6	99	76.862	ENSG00000169180	XPO6	100	94.118	Homo_sapiens
ENSACIG00000008055	xpo6	99	93.728	ENSAPOG00000012873	xpo6	99	94.164	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000008055	xpo6	99	76.684	ENSAMEG00000011014	XPO6	99	76.596	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000008055	xpo6	99	94.770	ENSAOCG00000001326	xpo6	99	94.770	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000008055	xpo6	99	94.681	ENSAPEG00000016304	xpo6	99	94.681	Amphiprion_percula
ENSACIG00000008055	xpo6	99	94.149	ENSATEG00000002273	xpo6	99	94.149	Anabas_testudineus
ENSACIG00000008055	xpo6	99	78.280	ENSAPLG00000007480	XPO6	99	78.280	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000008055	xpo6	99	68.756	ENSACAG00000016883	XPO6	99	68.756	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000008055	xpo6	99	76.507	ENSANAG00000031761	XPO6	99	76.418	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000008055	xpo6	100	94.872	ENSACLG00000007048	xpo6	100	94.872	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000008055	xpo6	99	77.340	ENSAMXG00000032539	xpo6	99	76.990	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000008055	xpo6	99	76.241	ENSBTAG00000010309	XPO6	99	76.152	Bos_taurus
ENSACIG00000008055	xpo6	99	76.684	ENSCJAG00000006014	XPO6	99	76.596	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000008055	xpo6	99	76.773	ENSCAFG00000017356	XPO6	99	76.684	Canis_familiaris
ENSACIG00000008055	xpo6	99	76.773	ENSCAFG00020011808	XPO6	100	75.992	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000008055	xpo6	99	76.330	ENSCHIG00000022341	XPO6	99	76.241	Capra_hircus
ENSACIG00000008055	xpo6	99	73.670	ENSTSYG00000012249	XPO6	100	73.582	Carlito_syrichta
ENSACIG00000008055	xpo6	99	76.418	ENSCPOG00000012824	XPO6	99	76.330	Cavia_porcellus
ENSACIG00000008055	xpo6	99	76.507	ENSCCAG00000036360	XPO6	99	76.418	Cebus_capucinus
ENSACIG00000008055	xpo6	99	76.862	ENSCATG00000034030	XPO6	99	76.773	Cercocebus_atys
ENSACIG00000008055	xpo6	99	76.507	ENSCLAG00000012270	XPO6	99	76.418	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000008055	xpo6	91	75.899	ENSCHOG00000004369	XPO6	91	75.779	Choloepus_hoffmanni
ENSACIG00000008055	xpo6	89	76.318	ENSCPBG00000024660	XPO6	99	82.353	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000008055	xpo6	99	45.550	ENSCING00000006884	-	99	45.550	Ciona_intestinalis
ENSACIG00000008055	xpo6	99	44.531	ENSCSAVG00000000850	-	99	44.531	Ciona_savignyi
ENSACIG00000008055	xpo6	99	76.684	ENSCANG00000041578	XPO6	99	76.596	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000008055	xpo6	99	76.507	ENSCGRG00001013173	Xpo6	99	76.418	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000008055	xpo6	99	91.489	ENSCSEG00000013622	xpo6	99	91.489	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000008055	xpo6	99	92.308	ENSCVAG00000017399	xpo6	100	92.308	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000008055	xpo6	97	76.054	ENSDARG00000041217	xpo6	99	76.054	Danio_rerio
ENSACIG00000008055	xpo6	99	76.684	ENSDNOG00000012449	XPO6	99	76.596	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000008055	xpo6	99	76.418	ENSDORG00000000919	Xpo6	99	76.330	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000008055	xpo6	82	75.676	ENSETEG00000018768	XPO6	85	75.676	Echinops_telfairi
ENSACIG00000008055	xpo6	99	60.053	ENSEBUG00000015560	xpo6	99	60.106	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000008055	xpo6	99	76.773	ENSEASG00005017296	XPO6	99	76.684	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000008055	xpo6	99	76.773	ENSECAG00000008601	XPO6	99	76.684	Equus_caballus
ENSACIG00000008055	xpo6	97	70.594	ENSEEUG00000014587	XPO6	99	70.502	Erinaceus_europaeus
ENSACIG00000008055	xpo6	99	86.602	ENSELUG00000009159	xpo6	99	86.424	Esox_lucius
ENSACIG00000008055	xpo6	99	76.862	ENSFCAG00000010309	XPO6	99	76.773	Felis_catus
ENSACIG00000008055	xpo6	99	77.601	ENSFALG00000004441	XPO6	98	78.053	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000008055	xpo6	99	76.684	ENSFDAG00000012689	XPO6	99	76.596	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000008055	xpo6	99	92.996	ENSFHEG00000021190	xpo6	99	92.908	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000008055	xpo6	99	78.103	ENSGALG00000035360	XPO6	99	78.014	Gallus_gallus
ENSACIG00000008055	xpo6	99	91.346	ENSGAFG00000004044	xpo6	99	91.171	Gambusia_affinis
ENSACIG00000008055	xpo6	95	77.726	ENSGAGG00000022738	XPO6	100	77.726	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000008055	xpo6	99	76.773	ENSGGOG00000005609	XPO6	99	76.684	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000008055	xpo6	99	94.861	ENSHBUG00000019504	xpo6	99	94.861	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000008055	xpo6	93	58.898	ENSHGLG00000003865	-	99	58.898	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000008055	xpo6	99	76.773	ENSHGLG00000009679	-	99	76.684	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000008055	xpo6	99	76.773	ENSHGLG00100003673	-	99	76.684	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000008055	xpo6	93	63.150	ENSHGLG00100001081	-	99	63.150	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000008055	xpo6	99	91.092	ENSHCOG00000004987	xpo6	99	91.092	Hippocampus_comes
ENSACIG00000008055	xpo6	99	76.599	ENSIPUG00000006516	xpo6	99	76.599	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000008055	xpo6	99	76.241	ENSSTOG00000012161	XPO6	99	76.152	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000008055	xpo6	99	75.709	ENSJJAG00000019392	Xpo6	99	75.709	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000008055	xpo6	100	92.927	ENSKMAG00000010403	xpo6	100	92.927	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000008055	xpo6	99	92.940	ENSLBEG00000023039	xpo6	99	92.940	Labrus_bergylta
ENSACIG00000008055	xpo6	99	76.664	ENSLACG00000017930	XPO6	99	76.460	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000008055	xpo6	94	82.369	ENSLOCG00000003304	xpo6	100	81.937	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000008055	xpo6	99	76.152	ENSLAFG00000011960	XPO6	99	76.064	Loxodonta_africana
ENSACIG00000008055	xpo6	99	76.862	ENSMFAG00000045067	XPO6	99	76.773	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000008055	xpo6	99	76.862	ENSMMUG00000018623	XPO6	99	76.773	Macaca_mulatta
ENSACIG00000008055	xpo6	99	76.862	ENSMNEG00000028587	XPO6	99	76.773	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000008055	xpo6	99	76.862	ENSMLEG00000029685	XPO6	99	76.773	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000008055	xpo6	99	93.226	ENSMAMG00000001351	xpo6	100	93.048	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000008055	xpo6	100	94.960	ENSMZEG00005010620	xpo6	100	94.960	Maylandia_zebra
ENSACIG00000008055	xpo6	97	77.264	ENSMGAG00000009566	XPO6	100	76.902	Meleagris_gallopavo
ENSACIG00000008055	xpo6	99	67.996	ENSMAUG00000012539	Xpo6	100	67.642	Mesocricetus_auratus
ENSACIG00000008055	xpo6	99	76.773	ENSMICG00000001923	XPO6	99	76.684	Microcebus_murinus
ENSACIG00000008055	xpo6	99	76.507	ENSMOCG00000008015	Xpo6	99	76.418	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000008055	xpo6	99	93.174	ENSMMOG00000011992	xpo6	99	93.174	Mola_mola
ENSACIG00000008055	xpo6	99	77.571	ENSMODG00000015516	XPO6	99	77.571	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000008055	xpo6	99	84.383	ENSMALG00000020612	xpo6	99	85.004	Monopterus_albus
ENSACIG00000008055	xpo6	99	76.507	MGP_CAROLIEiJ_G0030439	Xpo6	99	77.112	Mus_caroli
ENSACIG00000008055	xpo6	99	76.418	ENSMUSG00000000131	Xpo6	99	76.330	Mus_musculus
ENSACIG00000008055	xpo6	99	76.418	MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	99	76.330	Mus_pahari
ENSACIG00000008055	xpo6	99	76.241	MGP_SPRETEiJ_G0031553	Xpo6	99	76.152	Mus_spretus
ENSACIG00000008055	xpo6	99	76.418	ENSMPUG00000012920	XPO6	98	76.330	Mustela_putorius_furo
ENSACIG00000008055	xpo6	99	76.064	ENSMLUG00000012970	XPO6	99	75.975	Myotis_lucifugus
ENSACIG00000008055	xpo6	99	76.507	ENSNGAG00000012740	Xpo6	99	76.418	Nannospalax_galili
ENSACIG00000008055	xpo6	99	95.035	ENSNBRG00000007275	xpo6	99	95.035	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000008055	xpo6	99	76.862	ENSNLEG00000011518	XPO6	99	76.773	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000008055	xpo6	87	78.149	ENSOPRG00000009278	XPO6	86	77.892	Ochotona_princeps
ENSACIG00000008055	xpo6	99	76.684	ENSODEG00000012917	XPO6	99	76.304	Octodon_degus
ENSACIG00000008055	xpo6	99	95.209	ENSONIG00000019366	xpo6	99	95.209	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000008055	xpo6	99	76.684	ENSOCUG00000002727	XPO6	99	76.596	Oryctolagus_cuniculus
ENSACIG00000008055	xpo6	99	90.489	ENSORLG00000011231	xpo6	100	89.692	Oryzias_latipes
ENSACIG00000008055	xpo6	100	91.150	ENSORLG00020000386	xpo6	100	91.150	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000008055	xpo6	99	90.663	ENSORLG00015003636	xpo6	99	90.576	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000008055	xpo6	99	91.274	ENSOMEG00000016505	xpo6	99	91.099	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000008055	xpo6	99	76.862	ENSOGAG00000012844	XPO6	99	76.773	Otolemur_garnettii
ENSACIG00000008055	xpo6	99	76.241	ENSOARG00000000960	XPO6	99	76.152	Ovis_aries
ENSACIG00000008055	xpo6	99	76.862	ENSPPAG00000033668	XPO6	99	76.773	Pan_paniscus
ENSACIG00000008055	xpo6	99	76.834	ENSPPRG00000001454	XPO6	100	76.744	Panthera_pardus
ENSACIG00000008055	xpo6	97	76.121	ENSPTIG00000016663	XPO6	99	76.029	Panthera_tigris_altaica
ENSACIG00000008055	xpo6	99	76.862	ENSPTRG00000007919	XPO6	99	76.773	Pan_troglodytes
ENSACIG00000008055	xpo6	99	76.862	ENSPANG00000017103	XPO6	99	76.773	Papio_anubis
ENSACIG00000008055	xpo6	99	82.004	ENSPKIG00000022550	xpo6	99	82.004	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000008055	xpo6	99	76.765	ENSPSIG00000018225	XPO6	100	76.765	Pelodiscus_sinensis
ENSACIG00000008055	xpo6	99	90.966	ENSPMGG00000014436	xpo6	100	90.966	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000008055	xpo6	99	76.507	ENSPEMG00000012100	Xpo6	99	76.418	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACIG00000008055	xpo6	99	68.486	ENSPMAG00000003127	xpo6	99	68.546	Petromyzon_marinus
ENSACIG00000008055	xpo6	97	77.078	ENSPCIG00000003863	XPO6	100	76.772	Phascolarctos_cinereus
ENSACIG00000008055	xpo6	99	91.965	ENSPFOG00000008763	xpo6	99	91.790	Poecilia_formosa
ENSACIG00000008055	xpo6	99	91.958	ENSPLAG00000014054	xpo6	99	91.783	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000008055	xpo6	99	92.045	ENSPMEG00000018994	xpo6	99	91.871	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000008055	xpo6	97	91.943	ENSPREG00000016421	xpo6	96	91.764	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000008055	xpo6	99	76.773	ENSPPYG00000007218	XPO6	99	76.684	Pongo_abelii
ENSACIG00000008055	xpo6	90	76.163	ENSPCAG00000008918	XPO6	90	76.163	Procavia_capensis
ENSACIG00000008055	xpo6	99	76.862	ENSPCOG00000017886	XPO6	99	76.773	Propithecus_coquereli
ENSACIG00000008055	xpo6	80	89.231	ENSPVAG00000012234	XPO6	80	89.231	Pteropus_vampyrus
ENSACIG00000008055	xpo6	99	95.124	ENSPNYG00000008375	xpo6	99	95.124	Pundamilia_nyererei
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