EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000008088 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: sbno1
Alias: -
Full Name: strawberry notch homolog 1 (Drosophila)
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 11782 bases
Position: chrCCOE01000797.1:205429-217210
Accession: ZDB-GENE-080522-2
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000010393	ResIII	PF04851.15	3.6e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000010691	-	4056	-	ENSACIP00000010393	1351 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSACIG00000008088's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSACIG00000008088's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000008088	sbno1	99	74.489	ENSG00000139697	SBNO1	99	74.577	Homo_sapiens
ENSACIG00000008088	sbno1	85	94.536	ENSAPOG00000003196	sbno1	98	94.102	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000008088	sbno1	99	74.175	ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	74.438	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000008088	sbno1	100	88.857	ENSAOCG00000014859	sbno1	99	89.212	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000008088	sbno1	100	88.786	ENSAPEG00000006069	sbno1	99	89.141	Amphiprion_percula
ENSACIG00000008088	sbno1	99	88.489	ENSATEG00000006667	sbno1	100	88.277	Anabas_testudineus
ENSACIG00000008088	sbno1	98	75.377	ENSAPLG00000015674	SBNO1	99	75.372	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000008088	sbno1	98	76.350	ENSACAG00000015441	SBNO1	88	75.738	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000008088	sbno1	94	82.353	ENSANAG00000029958	-	99	76.118	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000008088	sbno1	99	89.941	ENSACLG00000024913	sbno1	100	89.868	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000008088	sbno1	99	79.040	ENSAMXG00000019473	sbno1	100	79.323	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000008088	sbno1	99	76.424	ENSBTAG00000020505	SBNO1	99	76.657	Bos_taurus
ENSACIG00000008088	sbno1	99	74.437	ENSCJAG00000016599	SBNO1	99	74.384	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000008088	sbno1	99	74.228	ENSCAFG00000007503	SBNO1	97	83.463	Canis_familiaris
ENSACIG00000008088	sbno1	95	79.649	ENSCAFG00020015363	SBNO1	99	79.649	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000008088	sbno1	95	81.961	ENSCHIG00000008382	SBNO1	99	81.961	Capra_hircus
ENSACIG00000008088	sbno1	99	76.245	ENSTSYG00000012749	SBNO1	99	76.739	Carlito_syrichta
ENSACIG00000008088	sbno1	98	76.236	ENSCAPG00000000384	SBNO1	99	82.105	Cavia_aperea
ENSACIG00000008088	sbno1	95	82.105	ENSCPOG00000008109	SBNO1	99	82.105	Cavia_porcellus
ENSACIG00000008088	sbno1	99	71.625	ENSCCAG00000035316	SBNO1	99	73.020	Cebus_capucinus
ENSACIG00000008088	sbno1	93	81.754	ENSCATG00000008239	SBNO1	98	81.754	Cercocebus_atys
ENSACIG00000008088	sbno1	95	82.105	ENSCLAG00000008995	SBNO1	99	82.105	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000008088	sbno1	86	80.743	ENSCSAG00000002064	SBNO1	99	80.811	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000008088	sbno1	94	72.185	ENSCHOG00000008814	SBNO1	96	72.306	Choloepus_hoffmanni
ENSACIG00000008088	sbno1	98	76.419	ENSCPBG00000025968	SBNO1	98	76.163	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000008088	sbno1	99	70.704	ENSCANG00000042688	-	99	70.795	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000008088	sbno1	95	80.736	ENSCGRG00001017470	Sbno1	99	80.736	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000008088	sbno1	95	80.736	ENSCGRG00000004756	Sbno1	99	80.736	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000008088	sbno1	99	85.897	ENSCSEG00000011919	sbno1	100	85.826	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000008088	sbno1	99	86.248	ENSCVAG00000007038	sbno1	100	86.107	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000008088	sbno1	99	78.820	ENSDARG00000099080	sbno1	100	79.462	Danio_rerio
ENSACIG00000008088	sbno1	99	76.636	ENSDNOG00000017147	SBNO1	96	76.636	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000008088	sbno1	99	69.472	ENSDORG00000015261	Sbno1	99	69.565	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000008088	sbno1	91	71.746	ENSETEG00000005620	SBNO1	93	71.746	Echinops_telfairi
ENSACIG00000008088	sbno1	73	65.098	ENSEBUG00000013823	sbno1	93	64.016	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000008088	sbno1	99	75.270	ENSECAG00000006127	SBNO1	99	75.270	Equus_caballus
ENSACIG00000008088	sbno1	83	76.503	ENSEEUG00000003793	SBNO1	80	76.503	Erinaceus_europaeus
ENSACIG00000008088	sbno1	99	80.761	ENSELUG00000002886	sbno1	99	80.409	Esox_lucius
ENSACIG00000008088	sbno1	99	74.402	ENSFCAG00000015331	SBNO1	99	74.666	Felis_catus
ENSACIG00000008088	sbno1	98	75.090	ENSFALG00000009273	SBNO1	99	75.212	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000008088	sbno1	94	80.071	ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	79.541	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000008088	sbno1	99	86.704	ENSFHEG00000007360	sbno1	100	86.563	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000008088	sbno1	96	83.333	ENSGMOG00000018229	sbno1	99	83.033	Gadus_morhua
ENSACIG00000008088	sbno1	88	75.000	ENSGALG00000003392	SBNO1	99	75.100	Gallus_gallus
ENSACIG00000008088	sbno1	99	89.075	ENSGAFG00000003960	sbno1	99	88.929	Gambusia_affinis
ENSACIG00000008088	sbno1	96	87.509	ENSGACG00000015633	sbno1	99	87.285	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000008088	sbno1	95	83.764	ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	82.149	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000008088	sbno1	95	81.930	ENSGGOG00000015000	SBNO1	99	81.930	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000008088	sbno1	99	83.297	ENSHBUG00000011910	sbno1	95	95.283	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000008088	sbno1	94	82.888	ENSHGLG00000014165	-	99	74.489	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000008088	sbno1	91	90.769	ENSHCOG00000003246	sbno1	95	90.769	Hippocampus_comes
ENSACIG00000008088	sbno1	99	78.914	ENSIPUG00000015830	Sbno1	98	79.408	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000008088	sbno1	95	82.105	ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	82.105	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000008088	sbno1	99	74.384	ENSJJAG00000001741	Sbno1	99	77.700	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000008088	sbno1	99	89.213	ENSKMAG00000009696	sbno1	100	88.994	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000008088	sbno1	99	85.976	ENSLBEG00000007623	sbno1	100	85.624	Labrus_bergylta
ENSACIG00000008088	sbno1	99	71.358	ENSLACG00000017227	SBNO1	98	74.233	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000008088	sbno1	99	79.178	ENSLOCG00000005725	sbno1	97	78.683	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000008088	sbno1	99	73.892	ENSLAFG00000002135	SBNO1	99	74.243	Loxodonta_africana
ENSACIG00000008088	sbno1	95	78.993	ENSMFAG00000031429	SBNO1	99	78.993	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000008088	sbno1	95	78.993	ENSMMUG00000011496	SBNO1	99	78.993	Macaca_mulatta
ENSACIG00000008088	sbno1	95	81.930	ENSMLEG00000033260	SBNO1	99	81.930	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000008088	sbno1	99	88.003	ENSMAMG00000005473	sbno1	100	87.862	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000008088	sbno1	98	75.413	ENSMGAG00000003274	SBNO1	99	75.248	Meleagris_gallopavo
ENSACIG00000008088	sbno1	99	74.711	ENSMICG00000006573	-	99	79.049	Microcebus_murinus
ENSACIG00000008088	sbno1	95	81.436	ENSMOCG00000009390	Sbno1	99	81.436	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000008088	sbno1	100	86.819	ENSMMOG00000008691	sbno1	99	86.829	Mola_mola
ENSACIG00000008088	sbno1	99	73.880	ENSMODG00000012470	SBNO1	98	74.471	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000008088	sbno1	99	88.101	ENSMALG00000001056	sbno1	100	88.322	Monopterus_albus
ENSACIG00000008088	sbno1	99	74.205	MGP_CAROLIEiJ_G0027749	Sbno1	95	90.789	Mus_caroli
ENSACIG00000008088	sbno1	99	74.332	ENSMUSG00000038095	Sbno1	94	90.789	Mus_musculus
ENSACIG00000008088	sbno1	99	74.090	MGP_PahariEiJ_G0024329	Sbno1	95	90.789	Mus_pahari
ENSACIG00000008088	sbno1	99	74.262	MGP_SPRETEiJ_G0028747	Sbno1	95	90.789	Mus_spretus
ENSACIG00000008088	sbno1	99	74.402	ENSMPUG00000001658	SBNO1	99	74.666	Mustela_putorius_furo
ENSACIG00000008088	sbno1	99	73.840	ENSMLUG00000017159	SBNO1	99	74.314	Myotis_lucifugus
ENSACIG00000008088	sbno1	92	82.857	ENSNGAG00000012620	Sbno1	98	82.857	Nannospalax_galili
ENSACIG00000008088	sbno1	99	91.263	ENSNBRG00000019189	sbno1	100	91.189	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000008088	sbno1	99	73.232	ENSNLEG00000001502	SBNO1	99	74.035	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000008088	sbno1	60	70.186	ENSMEUG00000008768	-	93	73.125	Notamacropus_eugenii
ENSACIG00000008088	sbno1	99	73.810	ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	74.364	Ochotona_princeps
ENSACIG00000008088	sbno1	95	82.281	ENSODEG00000009997	SBNO1	99	82.281	Octodon_degus
ENSACIG00000008088	sbno1	99	89.577	ENSONIG00000015348	sbno1	100	89.437	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000008088	sbno1	99	72.944	ENSOCUG00000002441	SBNO1	96	73.145	Oryctolagus_cuniculus
ENSACIG00000008088	sbno1	99	85.261	ENSORLG00000001593	sbno1	100	85.331	Oryzias_latipes
ENSACIG00000008088	sbno1	99	85.321	ENSORLG00020015216	sbno1	100	85.462	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000008088	sbno1	99	85.533	ENSORLG00015002726	sbno1	100	85.674	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000008088	sbno1	99	86.870	ENSOMEG00000019313	sbno1	99	86.861	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000008088	sbno1	99	74.040	ENSOARG00000004404	SBNO1	99	74.701	Ovis_aries
ENSACIG00000008088	sbno1	95	81.930	ENSPPAG00000024635	SBNO1	99	81.930	Pan_paniscus
ENSACIG00000008088	sbno1	99	74.402	ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	74.666	Panthera_pardus
ENSACIG00000008088	sbno1	99	74.366	ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	74.542	Panthera_tigris_altaica
ENSACIG00000008088	sbno1	95	81.930	ENSPTRG00000005597	SBNO1	99	81.930	Pan_troglodytes
ENSACIG00000008088	sbno1	95	81.930	ENSPANG00000011640	SBNO1	99	81.930	Papio_anubis
ENSACIG00000008088	sbno1	99	78.279	ENSPKIG00000001441	sbno1	100	77.927	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000008088	sbno1	91	71.059	ENSPSIG00000009256	-	99	71.450	Pelodiscus_sinensis
ENSACIG00000008088	sbno1	98	76.748	ENSPSIG00000009572	-	99	76.235	Pelodiscus_sinensis
ENSACIG00000008088	sbno1	95	81.261	ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	81.261	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACIG00000008088	sbno1	99	75.323	ENSPCIG00000010985	SBNO1	99	76.245	Phascolarctos_cinereus
ENSACIG00000008088	sbno1	99	87.227	ENSPFOG00000005069	sbno1	100	87.015	Poecilia_formosa
ENSACIG00000008088	sbno1	99	87.297	ENSPLAG00000015015	sbno1	100	87.085	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000008088	sbno1	99	87.165	ENSPMEG00000021212	sbno1	100	86.953	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000008088	sbno1	99	86.389	ENSPREG00000017746	sbno1	100	86.178	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000008088	sbno1	99	74.560	ENSPPYG00000005084	SBNO1	99	74.664	Pongo_abelii
ENSACIG00000008088	sbno1	88	68.349	ENSPCAG00000008634	SBNO1	88	67.989	Procavia_capensis
ENSACIG00000008088	sbno1	95	81.802	ENSPCOG00000024277	SBNO1	99	81.802	Propithecus_coquereli
ENSACIG00000008088	sbno1	86	82.456	ENSPVAG00000015304	SBNO1	87	82.456	Pteropus_vampyrus
ENSACIG00000008088	sbno1	99	89.422	ENSPNYG00000004291	sbno1	100	89.281	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000008088	sbno1	99	79.070	ENSPNAG00000015622	sbno1	100	78.929	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000008088	sbno1	95	81.436	ENSRNOG00000001064	Sbno1	99	81.579	Rattus_norvegicus
ENSACIG00000008088	sbno1	95	81.930	ENSRROG00000034230	SBNO1	99	81.930	Rhinopithecus_roxellana
ENSACIG00000008088	sbno1	97	72.620	ENSSBOG00000015422	SBNO1	99	72.949	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSACIG00000008088	sbno1	99	80.753	ENSSFOG00015019025	sbno1	100	81.114	Scleropages_formosus
ENSACIG00000008088	sbno1	99	87.562	ENSSMAG00000013640	sbno1	100	87.350	Scophthalmus_maximus
ENSACIG00000008088	sbno1	99	88.701	ENSSDUG00000023480	sbno1	100	88.489	Seriola_dumerili
ENSACIG00000008088	sbno1	99	88.489	ENSSLDG00000007928	sbno1	100	88.277	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACIG00000008088	sbno1	88	78.673	ENSSARG00000002594	SBNO1	88	80.296	Sorex_araneus
ENSACIG00000008088	sbno1	98	76.561	ENSSPUG00000012640	SBNO1	99	76.266	Sphenodon_punctatus
ENSACIG00000008088	sbno1	99	88.858	ENSSPAG00000016244	sbno1	100	88.646	Stegastes_partitus
ENSACIG00000008088	sbno1	99	76.263	ENSSSCG00000009776	SBNO1	99	76.424	Sus_scrofa
ENSACIG00000008088	sbno1	98	75.018	ENSTGUG00000005380	SBNO1	99	75.142	Taeniopygia_guttata
ENSACIG00000008088	sbno1	99	86.850	ENSTRUG00000018490	sbno1	99	86.776	Takifugu_rubripes
ENSACIG00000008088	sbno1	54	80.923	ENSTNIG00000013506	sbno1	99	80.928	Tetraodon_nigroviridis
ENSACIG00000008088	sbno1	99	74.402	ENSUAMG00000019671	SBNO1	99	74.666	Ursus_americanus
ENSACIG00000008088	sbno1	99	74.402	ENSUMAG00000004002	SBNO1	99	74.666	Ursus_maritimus
ENSACIG00000008088	sbno1	95	73.333	ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	73.333	Vicugna_pacos
ENSACIG00000008088	sbno1	99	74.332	ENSVVUG00000027807	SBNO1	99	74.595	Vulpes_vulpes
ENSACIG00000008088	sbno1	99	72.477	ENSXETG00000031930	SBNO1	99	72.265	Xenopus_tropicalis
ENSACIG00000008088	sbno1	87	86.364	ENSXCOG00000011607	sbno1	99	83.452	Xiphophorus_couchianus
ENSACIG00000008088	sbno1	99	87.545	ENSXMAG00000002140	sbno1	100	86.742	Xiphophorus_maculatus