EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000008246 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 5999 bases
Position: chrCCOE01000483.1:46883-52881
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000010515	MMR_HSR1	PF01926.23	2.8e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000010817	-	1593	-	ENSACIP00000010515	530 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000008246	-	90	62.231	ENSACIG00000010569	-	94	62.231
ENSACIG00000008246	-	89	60.200	ENSACIG00000021882	-	93	60.200
ENSACIG00000008246	-	92	64.648	ENSACIG00000021889	-	92	64.648
ENSACIG00000008246	-	94	59.465	ENSACIG00000014982	-	99	59.465
ENSACIG00000008246	-	90	58.614	ENSACIG00000008585	-	98	58.614
ENSACIG00000008246	-	94	61.394	ENSACIG00000003168	-	98	61.394
ENSACIG00000008246	-	95	30.582	ENSACIG00000022269	-	90	30.582
ENSACIG00000008246	-	85	32.996	ENSACIG00000009923	-	79	33.806
ENSACIG00000008246	-	94	57.854	ENSACIG00000002240	-	98	57.854
ENSACIG00000008246	-	69	64.416	ENSACIG00000023712	-	96	64.416
ENSACIG00000008246	-	91	61.355	ENSACIG00000012148	-	94	61.554
ENSACIG00000008246	-	93	58.046	ENSACIG00000014961	-	95	58.046
ENSACIG00000008246	-	93	58.621	ENSACIG00000003888	-	98	58.621
ENSACIG00000008246	-	91	62.768	ENSACIG00000023726	-	95	62.768
ENSACIG00000008246	-	91	61.341	ENSACIG00000021449	-	93	61.341
ENSACIG00000008246	-	93	60.612	ENSACIG00000008256	-	96	61.759
ENSACIG00000008246	-	92	58.915	ENSACIG00000001022	-	96	58.915
ENSACIG00000008246	-	91	57.730	ENSACIG00000014898	-	96	57.306
ENSACIG00000008246	-	81	33.475	ENSACIG00000022228	-	78	33.475
ENSACIG00000008246	-	83	33.766	ENSACIG00000009814	-	84	33.836
ENSACIG00000008246	-	96	60.305	ENSACIG00000014973	-	99	60.305

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000008246	-	92	55.273	ENSAPOG00000021040	-	85	55.273	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000008246	-	93	52.299	ENSAPOG00000005749	-	95	52.299	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000008246	-	80	30.603	ENSAPOG00000016636	-	92	30.603	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000008246	-	92	55.273	ENSAPOG00000005726	-	94	55.273	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000008246	-	91	53.529	ENSAPEG00000000062	-	95	53.529	Amphiprion_percula
ENSACIG00000008246	-	91	56.615	ENSATEG00000012558	-	95	56.809	Anabas_testudineus
ENSACIG00000008246	-	89	58.266	ENSATEG00000023346	-	91	59.073	Anabas_testudineus
ENSACIG00000008246	-	91	57.422	ENSATEG00000019965	-	95	57.422	Anabas_testudineus
ENSACIG00000008246	-	95	51.044	ENSATEG00000017635	-	97	51.044	Anabas_testudineus
ENSACIG00000008246	-	88	67.865	ENSACLG00000006543	-	92	67.404	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000008246	-	88	68.439	ENSACLG00000006538	-	94	69.103	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000008246	-	91	65.029	ENSACLG00000009261	-	97	65.029	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000008246	-	91	55.952	ENSACLG00000010007	-	76	56.349	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000008246	-	89	65.966	ENSACLG00000018599	-	95	65.966	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000008246	-	68	58.947	ENSACLG00000015361	-	94	58.947	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000008246	-	90	32.882	ENSACLG00000023126	-	97	33.205	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000008246	-	78	68.350	ENSACLG00000006285	-	93	68.350	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000008246	-	64	35.215	ENSACLG00000023033	-	92	35.215	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000008246	-	92	52.242	ENSACLG00000018271	-	94	52.242	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000008246	-	79	67.340	ENSACLG00000009330	-	82	68.013	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000008246	-	87	67.003	ENSACLG00000017259	-	94	67.003	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000008246	-	92	31.073	ENSACLG00000023468	-	91	31.262	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000008246	-	86	55.372	ENSACLG00000021761	-	89	55.372	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000008246	-	89	49.767	ENSAMXG00000030535	-	93	49.767	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000008246	-	84	42.558	ENSAMXG00000029346	-	91	43.299	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000008246	-	91	37.903	ENSAMXG00000037920	-	99	38.508	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000008246	-	88	30.891	ENSAMXG00000035937	-	90	30.375	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000008246	-	86	39.709	ENSAMXG00000033407	-	92	40.249	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000008246	-	92	34.104	ENSAMXG00000041770	-	95	34.297	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000008246	-	96	36.216	ENSAMXG00000034407	-	96	35.856	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000008246	-	88	30.452	ENSAMXG00000036353	-	88	30.059	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000008246	-	87	38.604	ENSAMXG00000039672	-	94	38.934	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000008246	-	88	37.938	ENSAMXG00000032695	-	94	37.938	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000008246	-	89	54.400	ENSCVAG00000007251	-	98	54.400	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000008246	-	89	52.800	ENSCVAG00000007256	-	93	52.800	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000008246	-	90	48.000	ENSCVAG00000006308	-	90	47.800	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000008246	-	85	31.174	ENSCVAG00000015205	-	86	31.174	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000008246	-	91	55.403	ENSCVAG00000008127	-	95	55.424	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000008246	-	91	53.649	ENSCVAG00000009446	-	97	54.438	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000008246	-	85	45.361	ENSCVAG00000013384	-	97	45.625	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000008246	-	92	53.953	ENSCVAG00000008134	-	96	53.953	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000008246	-	88	30.417	ENSCVAG00000011261	-	92	30.417	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000008246	-	94	49.615	ENSCVAG00000000224	-	89	50.000	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000008246	-	93	57.225	ENSCVAG00000007794	-	99	57.225	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000008246	-	93	55.344	ENSCVAG00000007803	-	98	56.262	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000008246	-	82	55.699	ENSCVAG00000005819	-	99	55.699	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000008246	-	60	58.308	ENSCVAG00000022676	-	98	58.308	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000008246	-	92	53.831	ENSCVAG00000004690	-	95	55.319	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000008246	-	86	55.602	ENSCVAG00000007831	-	98	53.620	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000008246	-	92	55.361	ENSCVAG00000007269	-	96	55.361	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000008246	-	66	59.128	ENSCVAG00000014791	-	100	59.128	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000008246	-	88	32.016	ENSCVAG00000008633	-	93	32.016	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000008246	-	94	55.621	ENSCVAG00000008146	-	98	55.621	Cyprinodon_variegatus
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ENSACIG00000008246	-	88	39.721	ENSDARG00000105145	si:ch211-282j17.12	93	39.721	Danio_rerio
ENSACIG00000008246	-	81	46.882	ENSELUG00000009611	-	96	46.835	Esox_lucius
ENSACIG00000008246	-	91	45.866	ENSELUG00000022148	-	88	45.866	Esox_lucius
ENSACIG00000008246	-	91	45.010	ENSELUG00000008430	-	95	45.010	Esox_lucius
ENSACIG00000008246	-	85	45.996	ENSELUG00000010967	-	96	45.924	Esox_lucius
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ENSACIG00000008246	-	92	53.877	ENSFHEG00000006430	-	98	53.877	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000008246	-	91	51.172	ENSFHEG00000016342	-	99	51.172	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000008246	-	93	56.974	ENSFHEG00000006411	-	97	56.974	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000008246	-	90	56.349	ENSFHEG00000006425	-	98	56.944	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000008246	-	91	56.634	ENSFHEG00000006385	-	93	56.634	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000008246	-	89	48.207	ENSFHEG00000012343	-	97	48.207	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000008246	-	90	51.287	ENSFHEG00000023034	-	97	51.287	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000008246	-	85	31.515	ENSFHEG00000021963	-	91	30.909	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000008246	-	82	31.347	ENSGMOG00000008232	-	98	31.347	Gadus_morhua
ENSACIG00000008246	-	85	30.943	ENSGMOG00000017552	-	82	30.533	Gadus_morhua
ENSACIG00000008246	-	87	30.181	ENSGMOG00000019330	-	84	30.181	Gadus_morhua
ENSACIG00000008246	-	91	54.921	ENSGAFG00000005032	-	93	54.921	Gambusia_affinis
ENSACIG00000008246	-	91	55.870	ENSGAFG00000005023	-	97	55.336	Gambusia_affinis
ENSACIG00000008246	-	69	57.031	ENSGACG00000015437	-	97	57.031	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000008246	-	87	53.673	ENSGACG00000013484	-	97	53.673	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000008246	-	83	31.027	ENSGACG00000015788	-	80	31.027	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000008246	-	69	57.068	ENSGACG00000005035	-	96	57.068	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000008246	-	89	31.853	ENSHBUG00000004854	-	53	32.563	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000008246	-	91	61.933	ENSHBUG00000008531	-	92	61.933	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000008246	-	92	61.034	ENSHBUG00000012793	-	98	61.392	Haplochromis_burtoni
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