EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000008317 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 8043 bases
Position: chrCCOE01000484.1:30163-38205
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000010621	Endonuclease_NS	PF01223.23	4.7e-20	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000010927	-	777	-	ENSACIP00000010621	258 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000008317	-	78	33.740	ENSACIG00000009432	-	85	33.740
ENSACIG00000008317	-	91	86.561	ENSACIG00000008299	-	87	86.561
ENSACIG00000008317	-	87	54.667	ENSACIG00000023177	-	80	54.667
ENSACIG00000008317	-	82	58.962	ENSACIG00000023171	-	82	58.962
ENSACIG00000008317	-	98	50.725	ENSACIG00000007813	-	91	50.725
ENSACIG00000008317	-	82	30.962	ENSACIG00000014265	-	79	30.962
ENSACIG00000008317	-	76	31.602	ENSACIG00000015751	-	78	31.602
ENSACIG00000008317	-	84	35.600	ENSACIG00000001431	-	84	35.600
ENSACIG00000008317	-	73	34.529	ENSACIG00000022595	-	82	34.529
ENSACIG00000008317	-	77	35.319	ENSACIG00000006055	-	71	35.319
ENSACIG00000008317	-	60	37.705	ENSACIG00000012712	-	58	37.705
ENSACIG00000008317	-	75	33.182	ENSACIG00000022027	-	78	32.365
ENSACIG00000008317	-	74	30.472	ENSACIG00000022024	si:dkey-85k7.11	70	30.472

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000008317	-	81	31.120	ENSAPOG00000010299	-	78	31.120	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000008317	-	90	58.798	ENSAPOG00000022953	-	85	58.798	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000008317	-	81	33.197	ENSAPOG00000008666	-	80	33.197	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000008317	-	60	37.705	ENSAPOG00000023293	-	59	37.705	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000008317	-	87	53.017	ENSAPOG00000012244	-	82	53.017	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000008317	-	62	38.830	ENSAPOG00000022205	-	58	38.830	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000008317	-	79	33.971	ENSAPOG00000006928	si:dkey-243k1.3	75	33.971	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000008317	-	91	57.872	ENSAPOG00000013654	-	82	57.872	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000008317	-	83	57.209	ENSAPOG00000022923	-	79	57.209	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000008317	-	80	33.051	ENSAOCG00000015199	-	79	33.051	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000008317	-	78	31.858	ENSAOCG00000005015	-	72	31.858	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000008317	-	82	32.661	ENSAOCG00000013137	-	82	32.661	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000008317	-	86	32.806	ENSAOCG00000002456	si:dkey-243k1.3	83	32.806	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000008317	-	81	31.120	ENSAOCG00000021294	-	76	31.120	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000008317	-	99	51.172	ENSAOCG00000008016	si:ch211-133n4.4	91	51.172	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000008317	-	64	34.021	ENSAOCG00000021283	si:dkey-85k7.10	63	34.021	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000008317	-	64	37.563	ENSAOCG00000007227	-	64	37.563	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000008317	-	74	35.780	ENSAOCG00000000850	-	65	35.780	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000008317	-	74	32.444	ENSAOCG00000021316	si:dkey-85k7.11	72	32.444	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000008317	-	58	63.758	ENSAPEG00000017445	-	87	63.758	Amphiprion_percula
ENSACIG00000008317	-	86	33.202	ENSAPEG00000024409	si:dkey-243k1.3	86	33.202	Amphiprion_percula
ENSACIG00000008317	-	80	32.203	ENSAPEG00000024402	-	79	32.203	Amphiprion_percula
ENSACIG00000008317	-	93	50.769	ENSAPEG00000023828	-	88	54.425	Amphiprion_percula
ENSACIG00000008317	-	74	35.780	ENSAPEG00000018986	-	65	35.780	Amphiprion_percula
ENSACIG00000008317	-	66	31.795	ENSAPEG00000018889	si:dkey-85k7.11	70	31.795	Amphiprion_percula
ENSACIG00000008317	-	74	35.780	ENSAPEG00000012445	-	65	35.780	Amphiprion_percula
ENSACIG00000008317	-	64	37.056	ENSAPEG00000013928	-	64	37.056	Amphiprion_percula
ENSACIG00000008317	-	78	31.858	ENSAPEG00000008708	-	72	31.858	Amphiprion_percula
ENSACIG00000008317	-	64	34.021	ENSAPEG00000018856	si:dkey-85k7.10	63	34.021	Amphiprion_percula
ENSACIG00000008317	-	82	32.661	ENSAPEG00000007291	-	82	32.661	Amphiprion_percula
ENSACIG00000008317	-	80	31.250	ENSAPEG00000018878	-	77	31.250	Amphiprion_percula
ENSACIG00000008317	-	90	49.796	ENSATEG00000014652	-	98	49.796	Anabas_testudineus
ENSACIG00000008317	-	90	46.610	ENSATEG00000014380	-	70	47.059	Anabas_testudineus
ENSACIG00000008317	-	91	48.276	ENSATEG00000014514	-	78	47.619	Anabas_testudineus
ENSACIG00000008317	-	93	53.101	ENSATEG00000014512	-	70	53.516	Anabas_testudineus
ENSACIG00000008317	-	60	36.757	ENSATEG00000009957	-	59	36.757	Anabas_testudineus
ENSACIG00000008317	-	76	33.624	ENSATEG00000019243	-	75	33.624	Anabas_testudineus
ENSACIG00000008317	-	88	45.852	ENSATEG00000014466	-	77	45.852	Anabas_testudineus
ENSACIG00000008317	-	90	54.762	ENSATEG00000014701	-	63	54.762	Anabas_testudineus
ENSACIG00000008317	-	90	57.082	ENSATEG00000014542	-	78	56.838	Anabas_testudineus
ENSACIG00000008317	-	89	46.800	ENSATEG00000014635	-	85	46.429	Anabas_testudineus
ENSACIG00000008317	-	93	30.000	ENSATEG00000008791	-	84	30.000	Anabas_testudineus
ENSACIG00000008317	-	90	49.805	ENSATEG00000014430	-	65	49.805	Anabas_testudineus
ENSACIG00000008317	-	93	49.388	ENSATEG00000014579	-	80	50.420	Anabas_testudineus
ENSACIG00000008317	-	89	46.000	ENSATEG00000014573	-	75	46.000	Anabas_testudineus
ENSACIG00000008317	-	86	31.250	ENSATEG00000022068	si:dkey-243k1.3	83	31.225	Anabas_testudineus
ENSACIG00000008317	-	87	50.439	ENSATEG00000014488	-	79	50.439	Anabas_testudineus
ENSACIG00000008317	-	90	49.012	ENSATEG00000014484	-	76	49.012	Anabas_testudineus
ENSACIG00000008317	-	82	32.800	ENSATEG00000017521	-	81	32.800	Anabas_testudineus
ENSACIG00000008317	-	90	49.027	ENSATEG00000014526	-	71	49.027	Anabas_testudineus
ENSACIG00000008317	-	91	50.758	ENSATEG00000014459	-	55	50.758	Anabas_testudineus
ENSACIG00000008317	-	90	51.452	ENSATEG00000014621	-	92	51.452	Anabas_testudineus
ENSACIG00000008317	-	72	36.321	ENSATEG00000011941	-	65	36.321	Anabas_testudineus
ENSACIG00000008317	-	90	47.541	ENSATEG00000014589	-	88	47.541	Anabas_testudineus
ENSACIG00000008317	-	89	48.996	ENSATEG00000014502	-	59	48.996	Anabas_testudineus
ENSACIG00000008317	-	76	33.493	ENSATEG00000021350	-	62	33.493	Anabas_testudineus
ENSACIG00000008317	-	91	45.385	ENSATEG00000014672	-	82	45.736	Anabas_testudineus
ENSACIG00000008317	-	91	49.808	ENSATEG00000014520	-	74	49.808	Anabas_testudineus
ENSACIG00000008317	-	91	48.062	ENSATEG00000014477	-	66	48.062	Anabas_testudineus
ENSACIG00000008317	-	98	52.344	ENSATEG00000014686	-	71	52.344	Anabas_testudineus
ENSACIG00000008317	-	74	33.333	ENSAPLG00000004064	-	74	33.333	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000008317	-	89	33.716	ENSACAG00000005411	-	86	33.716	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000008317	-	91	31.022	ENSACAG00000005752	-	92	31.022	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000008317	-	90	52.941	ENSACLG00000017733	-	67	52.549	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000008317	-	91	51.362	ENSACLG00000017798	-	81	51.362	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000008317	-	64	37.056	ENSACLG00000021771	-	59	37.056	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000008317	-	81	56.398	ENSACLG00000017724	-	80	56.398	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000008317	-	84	35.271	ENSACLG00000026586	-	82	35.271	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000008317	-	85	30.303	ENSACLG00000016915	-	80	30.303	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000008317	-	78	31.624	ENSACLG00000018914	si:dkey-85k7.10	75	32.000	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000008317	-	72	35.545	ENSACLG00000013353	-	71	35.217	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000008317	-	82	30.417	ENSACLG00000008439	-	79	30.417	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000008317	-	90	53.175	ENSACLG00000015425	-	72	53.175	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000008317	-	80	31.250	ENSACLG00000018928	-	80	31.535	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000008317	-	80	30.932	ENSACLG00000011404	si:dkey-243k1.3	83	30.204	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000008317	-	71	31.579	ENSACLG00000018957	si:dkey-85k7.11	65	31.579	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000008317	-	78	54.054	ENSACLG00000017744	-	79	54.054	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000008317	-	76	33.628	ENSACLG00000001104	-	76	33.628	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000008317	-	74	32.068	ENSAMXG00000035215	-	79	32.068	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000008317	-	76	31.140	ENSAMXG00000029128	-	76	31.140	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000008317	-	74	32.579	ENSAMXG00000032585	-	63	34.759	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000008317	-	69	39.706	ENSAMXG00000038214	-	67	39.706	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000008317	-	73	35.681	ENSAMXG00000030013	-	85	35.681	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000008317	-	89	32.841	ENSAMXG00000010981	-	90	32.270	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000008317	-	68	36.813	ENSAMXG00000037387	-	67	36.813	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000008317	-	75	37.662	ENSAMXG00000019466	-	74	37.662	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000008317	-	81	30.488	ENSAMXG00000040657	-	83	30.488	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000008317	-	85	31.154	ENSAMXG00000003411	-	84	31.154	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000008317	-	74	33.636	ENSAMXG00000040929	-	79	33.333	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000008317	-	71	33.173	ENSAMXG00000040926	-	72	32.727	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000008317	-	74	32.243	ENSAMXG00000019995	zgc:172339	69	32.243	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000008317	-	64	33.333	ENSAMXG00000037726	si:dkey-85k7.10	64	33.333	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000008317	-	78	31.441	ENSAMXG00000034695	-	79	31.441	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000008317	-	60	34.615	ENSAMXG00000037172	-	59	34.043	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000008317	-	86	31.621	ENSAMXG00000007611	si:dkey-243k1.3	83	31.621	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000008317	-	75	30.493	ENSAMXG00000036738	si:dkey-85k7.11	71	30.493	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000008317	-	93	31.690	ENSAMXG00000036403	-	93	31.690	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000008317	-	74	35.160	ENSCPBG00000019841	-	74	35.160	Chrysemys_picta_bellii
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ENSACIG00000008317	-	72	34.579	ENSCSEG00000006632	-	64	34.579	Cynoglossus_semilaevis
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