EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000008448 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 1458 bases
Position: chrCCOE01003086.1:348-1805
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000010794	zf-C2H2	PF00096.26	4.5e-38	1	6
ENSACIP00000010794	zf-C2H2	PF00096.26	4.5e-38	2	6
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ENSACIP00000010794	zf-C2H2	PF00096.26	4.5e-38	5	6
ENSACIP00000010794	zf-C2H2	PF00096.26	4.5e-38	6	6
ENSACIP00000010794	zf-met	PF12874.7	6.3e-11	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000011105	-	984	-	ENSACIP00000010794	327 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000008448	-	70	47.619	ENSACIG00000022330	-	82	47.619
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ENSACIG00000008448	-	69	44.715	ENSACIG00000019815	-	82	46.000
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ENSACIG00000008448	-	68	50.602	ENSACIG00000007034	-	70	50.602
ENSACIG00000008448	-	94	52.586	ENSACIG00000018952	-	80	52.586
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ENSACIG00000008448	-	97	53.285	ENSACIG00000015835	-	87	53.285
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ENSACIG00000008448	-	71	38.636	ENSACIG00000009128	-	92	38.119
ENSACIG00000008448	-	68	41.985	ENSACIG00000006377	-	56	39.759
ENSACIG00000008448	-	87	53.636	ENSACIG00000019791	-	93	56.502
ENSACIG00000008448	-	70	43.503	ENSACIG00000013149	-	81	43.503
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ENSACIG00000008448	-	87	61.836	ENSACIG00000003754	-	84	61.836
ENSACIG00000008448	-	92	40.625	ENSACIG00000013750	-	78	42.718
ENSACIG00000008448	-	86	55.814	ENSACIG00000000311	-	80	55.814
ENSACIG00000008448	-	84	41.060	ENSACIG00000017166	-	88	41.060
ENSACIG00000008448	-	98	52.899	ENSACIG00000006172	-	98	54.198
ENSACIG00000008448	-	96	59.756	ENSACIG00000016932	-	75	59.756
ENSACIG00000008448	-	82	42.661	ENSACIG00000003515	-	88	48.673
ENSACIG00000008448	-	96	54.795	ENSACIG00000011541	-	95	54.795
ENSACIG00000008448	-	69	50.515	ENSACIG00000004626	-	81	50.515
ENSACIG00000008448	-	73	34.694	ENSACIG00000009443	-	59	34.694
ENSACIG00000008448	-	97	47.712	ENSACIG00000004641	-	55	47.712
ENSACIG00000008448	-	69	53.299	ENSACIG00000010637	-	53	53.299
ENSACIG00000008448	-	67	42.211	ENSACIG00000017653	-	93	42.211
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ENSACIG00000008448	-	69	42.424	ENSACIG00000016180	znf341	51	42.424
ENSACIG00000008448	-	73	40.000	ENSACIG00000023049	znf646	99	40.201
ENSACIG00000008448	-	79	45.455	ENSACIG00000007855	-	90	45.455
ENSACIG00000008448	-	69	36.170	ENSACIG00000002944	-	94	36.170
ENSACIG00000008448	-	98	47.022	ENSACIG00000013604	-	98	52.410
ENSACIG00000008448	-	94	49.115	ENSACIG00000010647	-	97	54.321
ENSACIG00000008448	-	96	49.107	ENSACIG00000013470	-	93	49.107
ENSACIG00000008448	-	73	43.506	ENSACIG00000019804	-	82	43.791
ENSACIG00000008448	-	94	39.935	ENSACIG00000022645	-	71	39.286
ENSACIG00000008448	-	72	48.555	ENSACIG00000009755	-	77	48.555
ENSACIG00000008448	-	71	41.905	ENSACIG00000017683	-	76	38.532
ENSACIG00000008448	-	70	42.105	ENSACIG00000013163	-	79	42.105
ENSACIG00000008448	-	69	37.037	ENSACIG00000012604	scrt2	51	40.541
ENSACIG00000008448	-	78	57.143	ENSACIG00000018440	-	95	57.143
ENSACIG00000008448	-	86	54.091	ENSACIG00000022293	-	96	54.091
ENSACIG00000008448	-	65	51.974	ENSACIG00000007096	-	73	51.974
ENSACIG00000008448	-	67	40.455	ENSACIG00000020938	zbtb47b	68	40.455
ENSACIG00000008448	-	66	40.606	ENSACIG00000019534	-	85	40.606
ENSACIG00000008448	-	68	35.814	ENSACIG00000011516	-	77	35.814
ENSACIG00000008448	-	69	39.320	ENSACIG00000001369	-	78	39.320
ENSACIG00000008448	-	91	44.271	ENSACIG00000009717	-	89	52.657

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000008448	-	80	50.505	ENSAPOG00000021959	-	70	50.505	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000008448	-	96	47.917	ENSAPOG00000019061	-	78	47.917	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000008448	-	72	46.789	ENSAPOG00000013982	-	86	46.789	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000008448	-	70	45.714	ENSAPOG00000021991	-	69	47.727	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000008448	-	95	55.046	ENSAPOG00000021383	-	89	55.046	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000008448	-	85	50.220	ENSAPOG00000005195	-	83	50.220	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000008448	-	73	36.364	ENSAPOG00000010200	-	58	38.326	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000008448	-	70	48.636	ENSAOCG00000002795	-	57	48.636	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000008448	-	73	55.046	ENSAOCG00000017595	-	90	55.046	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000008448	-	69	50.679	ENSAOCG00000010471	-	75	50.679	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000008448	-	69	51.269	ENSAOCG00000017602	-	67	51.269	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000008448	-	69	50.254	ENSAOCG00000002430	-	60	50.254	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000008448	-	95	35.185	ENSAOCG00000007134	-	84	35.093	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000008448	-	96	48.980	ENSAOCG00000016905	-	91	47.917	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000008448	-	95	40.989	ENSAOCG00000012813	-	92	40.989	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000008448	-	69	48.858	ENSAPEG00000013097	-	72	48.858	Amphiprion_percula
ENSACIG00000008448	-	91	48.837	ENSAPEG00000001546	-	86	48.837	Amphiprion_percula
ENSACIG00000008448	-	70	40.201	ENSAPEG00000019106	-	53	40.909	Amphiprion_percula
ENSACIG00000008448	-	69	51.269	ENSAPEG00000012470	-	68	51.269	Amphiprion_percula
ENSACIG00000008448	-	73	54.587	ENSAPEG00000012443	-	90	54.587	Amphiprion_percula
ENSACIG00000008448	-	93	56.219	ENSAPEG00000015337	-	96	55.263	Amphiprion_percula
ENSACIG00000008448	-	70	50.254	ENSAPEG00000013044	-	72	50.254	Amphiprion_percula
ENSACIG00000008448	-	93	51.852	ENSATEG00000008674	-	81	51.852	Anabas_testudineus
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