EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000008611 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 3689 bases
Position: chrCCOE01000287.1:3994611-3998299
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000011010	zf-C2H2	PF00096.26	3e-15	1	2
ENSACIP00000011010	zf-C2H2	PF00096.26	3e-15	2	2
ENSACIP00000011010	zf-met	PF12874.7	1.8e-09	1	2
ENSACIP00000011010	zf-met	PF12874.7	1.8e-09	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000011329	-	990	-	ENSACIP00000011010	329 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000008611	-	92	39.759	ENSACIG00000017647	-	93	42.143
ENSACIG00000008611	-	62	40.146	ENSACIG00000023313	-	92	40.146
ENSACIG00000008611	-	58	42.143	ENSACIG00000019447	-	66	42.143
ENSACIG00000008611	-	94	43.750	ENSACIG00000022645	-	94	43.750
ENSACIG00000008611	-	50	38.235	ENSACIG00000021986	-	95	38.235
ENSACIG00000008611	-	78	39.881	ENSACIG00000011153	-	98	39.881
ENSACIG00000008611	-	74	43.066	ENSACIG00000004745	-	88	40.580
ENSACIG00000008611	-	64	47.273	ENSACIG00000004626	-	87	47.273
ENSACIG00000008611	-	60	38.158	ENSACIG00000017644	-	85	38.158
ENSACIG00000008611	-	58	42.647	ENSACIG00000022738	-	85	50.877
ENSACIG00000008611	-	60	39.855	ENSACIG00000017013	-	72	39.855
ENSACIG00000008611	-	93	30.503	ENSACIG00000001860	-	76	41.975
ENSACIG00000008611	-	56	40.741	ENSACIG00000022658	-	93	40.741
ENSACIG00000008611	-	59	39.855	ENSACIG00000022625	-	89	39.855
ENSACIG00000008611	-	50	39.130	ENSACIG00000002190	gfi1b	52	39.130
ENSACIG00000008611	-	61	51.667	ENSACIG00000019791	-	91	51.667
ENSACIG00000008611	-	54	52.459	ENSACIG00000018440	-	92	40.678
ENSACIG00000008611	-	75	41.727	ENSACIG00000006172	-	99	41.727
ENSACIG00000008611	-	94	30.769	ENSACIG00000016932	-	97	30.769
ENSACIG00000008611	-	71	42.143	ENSACIG00000011541	-	76	42.143
ENSACIG00000008611	-	78	40.714	ENSACIG00000008448	-	96	40.714
ENSACIG00000008611	-	93	32.686	ENSACIG00000004641	-	86	32.686
ENSACIG00000008611	-	50	37.391	ENSACIG00000015411	-	71	37.391
ENSACIG00000008611	-	51	48.624	ENSACIG00000003754	-	78	48.624
ENSACIG00000008611	-	50	44.595	ENSACIG00000017653	-	96	44.595
ENSACIG00000008611	-	60	40.299	ENSACIG00000003515	-	90	40.299
ENSACIG00000008611	-	72	38.849	ENSACIG00000016182	-	98	38.849
ENSACIG00000008611	-	51	38.060	ENSACIG00000009809	si:dkey-77f5.14	95	38.060
ENSACIG00000008611	-	71	36.567	ENSACIG00000009717	-	92	36.567
ENSACIG00000008611	-	59	35.965	ENSACIG00000007855	-	88	40.385
ENSACIG00000008611	-	50	37.415	ENSACIG00000020938	zbtb47b	61	37.762
ENSACIG00000008611	-	51	34.483	ENSACIG00000012263	znf319b	65	34.483
ENSACIG00000008611	-	61	40.580	ENSACIG00000011515	-	77	40.580
ENSACIG00000008611	-	57	53.659	ENSACIG00000019804	-	82	53.659
ENSACIG00000008611	-	60	33.721	ENSACIG00000017683	-	81	33.721
ENSACIG00000008611	-	59	46.789	ENSACIG00000022293	-	95	46.789
ENSACIG00000008611	-	51	47.368	ENSACIG00000019534	-	73	47.368
ENSACIG00000008611	-	60	33.816	ENSACIG00000009755	-	81	33.816
ENSACIG00000008611	-	50	41.228	ENSACIG00000001369	-	78	41.228
ENSACIG00000008611	-	64	47.706	ENSACIG00000004666	-	93	47.706
ENSACIG00000008611	-	53	49.123	ENSACIG00000007096	-	73	49.123
ENSACIG00000008611	-	61	42.029	ENSACIG00000004041	-	98	42.029
ENSACIG00000008611	-	50	42.657	ENSACIG00000015429	-	80	54.386
ENSACIG00000008611	-	91	44.444	ENSACIG00000006806	-	91	44.444
ENSACIG00000008611	-	64	48.214	ENSACIG00000017050	-	95	48.214
ENSACIG00000008611	-	52	38.854	ENSACIG00000018404	-	73	38.854
ENSACIG00000008611	-	67	35.862	ENSACIG00000012636	ZNF319	93	35.862
ENSACIG00000008611	-	51	40.187	ENSACIG00000000360	si:ch211-241b2.1	87	40.187
ENSACIG00000008611	-	57	40.580	ENSACIG00000013604	-	99	40.580
ENSACIG00000008611	-	73	38.776	ENSACIG00000010647	-	95	49.153
ENSACIG00000008611	-	87	40.000	ENSACIG00000003556	-	92	40.000
ENSACIG00000008611	-	55	43.478	ENSACIG00000023212	-	74	43.478
ENSACIG00000008611	-	97	38.889	ENSACIG00000007000	-	83	38.889

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000008611	-	57	41.379	ENSBTAG00000053591	-	99	41.379	Bos_taurus
ENSACIG00000008611	-	50	35.099	ENSCSAVG00000009217	-	97	35.099	Ciona_savignyi
ENSACIG00000008611	-	89	45.872	ENSCVAG00000000227	-	91	45.872	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000008611	-	50	40.441	ENSCVAG00000003428	-	96	40.441	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000008611	-	51	50.000	ENSCVAG00000011469	-	76	50.000	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000008611	-	53	40.000	ENSCVAG00000002488	-	72	40.000	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000008611	-	58	43.860	ENSCVAG00000002305	-	74	43.860	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000008611	-	52	40.714	ENSCVAG00000009103	-	92	40.714	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000008611	-	60	48.624	ENSCVAG00000012216	-	80	48.624	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000008611	-	74	39.286	ENSCVAG00000020119	-	84	40.000	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000008611	-	51	39.200	ENSCVAG00000000419	-	64	39.200	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000008611	-	62	42.029	ENSCVAG00000006460	-	88	42.029	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000008611	-	55	38.562	ENSEBUG00000004839	-	76	38.562	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000008611	-	58	42.143	ENSEBUG00000007563	-	82	42.143	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000008611	-	68	42.754	ENSEBUG00000008229	-	61	42.754	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000008611	-	51	46.914	ENSEBUG00000007054	-	50	46.914	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000008611	-	63	54.386	ENSEBUG00000003512	-	74	54.386	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000008611	-	75	43.165	ENSEBUG00000010031	-	80	43.165	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000008611	-	54	43.284	ENSEBUG00000009436	-	93	43.284	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000008611	-	60	35.211	ENSEBUG00000003842	-	90	35.211	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000008611	-	57	42.857	ENSEBUG00000011331	-	80	42.857	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000008611	-	68	45.652	ENSEBUG00000015110	-	73	45.652	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000008611	-	54	44.203	ENSEBUG00000007386	-	70	44.203	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000008611	-	51	42.143	ENSEBUG00000007143	-	58	42.143	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000008611	-	53	43.066	ENSEBUG00000014388	-	83	43.066	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000008611	-	61	45.631	ENSEBUG00000011751	-	73	45.000	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000008611	-	50	50.943	ENSEBUG00000011837	-	56	50.943	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000008611	-	53	42.553	ENSEBUG00000012502	-	83	42.553	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000008611	-	52	43.939	ENSEBUG00000003954	-	74	43.939	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000008611	-	51	41.667	ENSEBUG00000008039	-	68	41.667	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000008611	-	54	40.559	ENSEBUG00000006212	-	83	41.026	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000008611	-	50	44.444	ENSEBUG00000004026	-	64	44.444	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000008611	-	60	38.255	ENSEBUG00000005131	-	69	38.255	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000008611	-	50	42.202	ENSEBUG00000011728	-	69	42.202	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000008611	-	68	40.000	ENSEBUG00000010357	-	66	40.000	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000008611	-	64	35.766	ENSEEUG00000008150	-	96	35.766	Erinaceus_europaeus
ENSACIG00000008611	-	51	45.070	ENSELUG00000013311	-	78	45.070	Esox_lucius
ENSACIG00000008611	-	75	42.857	ENSFHEG00000013114	-	87	42.857	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000008611	-	58	42.553	ENSFHEG00000014071	-	58	42.553	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000008611	-	51	42.727	ENSFHEG00000016699	-	65	42.727	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000008611	-	58	41.304	ENSFHEG00000013735	-	89	41.304	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000008611	-	52	41.964	ENSFHEG00000019953	-	81	41.964	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000008611	-	61	42.143	ENSFHEG00000013045	-	70	42.143	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000008611	-	50	40.714	ENSFHEG00000011068	-	95	40.714	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000008611	-	51	41.429	ENSFHEG00000012468	-	95	40.714	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000008611	-	74	39.855	ENSFHEG00000013064	-	86	39.855	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000008611	-	58	40.136	ENSFHEG00000000322	-	76	40.136	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000008611	-	50	43.571	ENSFHEG00000000627	-	70	43.571	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000008611	-	52	44.248	ENSFHEG00000017761	-	75	44.248	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000008611	-	61	51.111	ENSFHEG00000011944	-	85	51.111	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000008611	-	59	47.458	ENSFHEG00000021772	-	73	47.458	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000008611	-	62	40.146	ENSFHEG00000007350	-	90	40.146	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000008611	-	58	36.806	ENSFHEG00000013087	-	73	36.806	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000008611	-	50	56.250	ENSFHEG00000000851	-	98	47.126	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000008611	-	50	43.590	ENSFHEG00000013460	-	60	43.590	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000008611	-	74	42.143	ENSFHEG00000013554	-	94	42.143	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000008611	-	61	44.681	ENSFHEG00000012558	-	84	50.794	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000008611	-	50	39.716	ENSGAFG00000012035	-	85	39.716	Gambusia_affinis
ENSACIG00000008611	-	75	36.765	ENSGAFG00000014097	-	87	36.765	Gambusia_affinis
ENSACIG00000008611	-	75	39.855	ENSGAFG00000013420	-	81	39.855	Gambusia_affinis
ENSACIG00000008611	-	75	42.029	ENSGAFG00000013677	-	98	41.429	Gambusia_affinis
ENSACIG00000008611	-	74	39.286	ENSGAFG00000013471	-	86	39.286	Gambusia_affinis
ENSACIG00000008611	-	59	41.429	ENSGAFG00000013396	-	73	41.429	Gambusia_affinis
ENSACIG00000008611	-	58	40.000	ENSGAFG00000013408	-	93	37.952	Gambusia_affinis
ENSACIG00000008611	-	74	37.121	ENSGAFG00000013462	-	85	37.121	Gambusia_affinis
ENSACIG00000008611	-	76	41.606	ENSGAFG00000014085	-	85	41.606	Gambusia_affinis
ENSACIG00000008611	-	54	35.971	ENSGAFG00000013430	-	96	35.971	Gambusia_affinis
ENSACIG00000008611	-	55	40.000	ENSHBUG00000014494	-	68	40.000	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000008611	-	51	52.083	ENSHCOG00000007990	-	74	50.000	Hippocampus_comes
ENSACIG00000008611	-	50	40.714	ENSHCOG00000019438	-	85	40.714	Hippocampus_comes
ENSACIG00000008611	-	52	45.833	ENSHCOG00000015476	-	91	43.972	Hippocampus_comes
ENSACIG00000008611	-	56	38.571	ENSHCOG00000007485	-	92	44.444	Hippocampus_comes
ENSACIG00000008611	-	85	38.690	ENSHCOG00000020848	-	97	41.429	Hippocampus_comes
ENSACIG00000008611	-	91	32.895	ENSHCOG00000000947	-	83	32.895	Hippocampus_comes
ENSACIG00000008611	-	76	40.000	ENSHCOG00000008168	-	99	40.426	Hippocampus_comes
ENSACIG00000008611	-	52	39.437	ENSHCOG00000021073	-	98	38.571	Hippocampus_comes
ENSACIG00000008611	-	93	43.571	ENSHCOG00000007664	-	94	56.818	Hippocampus_comes
ENSACIG00000008611	-	78	49.020	ENSHCOG00000000517	-	91	49.020	Hippocampus_comes
ENSACIG00000008611	-	80	40.000	ENSHCOG00000015005	-	79	40.000	Hippocampus_comes
ENSACIG00000008611	-	71	35.507	ENSKMAG00000000668	-	89	35.507	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000008611	-	74	33.333	ENSKMAG00000000689	-	92	50.000	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000008611	-	78	40.789	ENSKMAG00000011111	-	98	49.254	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000008611	-	67	56.250	ENSLBEG00000008320	-	70	37.410	Labrus_bergylta
ENSACIG00000008611	-	51	58.974	ENSMALG00000012056	-	81	58.974	Monopterus_albus
ENSACIG00000008611	-	52	47.143	ENSONIG00000002024	-	99	47.143	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000008611	-	93	33.500	ENSORLG00020017483	-	97	37.931	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000008611	-	64	40.000	ENSORLG00015014015	-	99	40.000	Oryzias_latipes_hsok
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ENSACIG00000008611	-	58	43.011	ENSOMEG00000022915	-	89	42.754	Oryzias_melastigma
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ENSACIG00000008611	-	50	40.288	ENSPMGG00000022526	-	71	40.288	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000008611	-	78	38.710	ENSPMGG00000004360	-	94	43.210	Periophthalmus_magnuspinnatus
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ENSACIG00000008611	-	71	35.714	ENSPMGG00000022430	-	84	35.714	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000008611	-	52	40.714	ENSPMGG00000017657	-	56	40.714	Periophthalmus_magnuspinnatus
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ENSACIG00000008611	-	51	47.619	ENSPMGG00000017333	-	62	47.619	Periophthalmus_magnuspinnatus
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ENSACIG00000008611	-	51	49.091	ENSPMGG00000004183	-	98	36.257	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000008611	-	51	41.667	ENSPMGG00000010022	-	89	41.667	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000008611	-	61	42.029	ENSPMAG00000001294	-	99	42.029	Petromyzon_marinus
ENSACIG00000008611	-	78	44.604	ENSPFOG00000018784	-	98	43.571	Poecilia_formosa
ENSACIG00000008611	-	74	42.029	ENSPFOG00000018776	-	100	45.763	Poecilia_formosa
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ENSACIG00000008611	-	78	41.606	ENSPFOG00000023528	-	86	41.606	Poecilia_formosa
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ENSACIG00000008611	-	50	41.007	ENSPFOG00000000624	-	99	40.741	Poecilia_formosa
ENSACIG00000008611	-	75	37.143	ENSPLAG00000016585	-	83	37.143	Poecilia_latipinna
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ENSACIG00000008611	-	89	39.161	ENSPLAG00000010230	-	69	45.745	Poecilia_latipinna
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ENSACIG00000008611	-	50	41.007	ENSPMEG00000018072	-	86	41.007	Poecilia_mexicana
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ENSACIG00000008611	-	50	47.368	ENSPMEG00000011756	-	84	42.857	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000008611	-	74	40.141	ENSPMEG00000021130	-	93	45.763	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000008611	-	53	44.086	ENSPREG00000003393	-	77	44.086	Poecilia_reticulata
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ENSACIG00000008611	-	74	44.444	ENSPREG00000014477	-	100	41.667	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000008611	-	93	38.621	ENSSLDG00000001850	-	98	38.621	Seriola_lalandi_dorsalis
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ENSACIG00000008611	-	85	36.986	ENSXCOG00000003472	-	94	40.714	Xiphophorus_couchianus
ENSACIG00000008611	-	57	35.079	ENSXMAG00000024945	-	77	36.691	Xiphophorus_maculatus
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ENSACIG00000008611	-	75	40.876	ENSXMAG00000027682	-	90	40.876	Xiphophorus_maculatus
ENSACIG00000008611	-	74	39.189	ENSXMAG00000014585	-	92	39.189	Xiphophorus_maculatus
ENSACIG00000008611	-	51	39.474	ENSXMAG00000021578	-	81	39.474	Xiphophorus_maculatus
ENSACIG00000008611	-	51	54.237	ENSXMAG00000027705	-	85	54.237	Xiphophorus_maculatus