EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000008666 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 3751 bases
Position: chrCCOE01000300.1:29991-33741
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000011082	MMR_HSR1	PF01926.23	1.3e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000011401	-	618	-	ENSACIP00000011082	205 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000008666	-	84	49.432	ENSACIG00000012648	-	59	49.432
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ENSACIG00000008666	-	85	46.067	ENSACIG00000014662	-	72	46.067
ENSACIG00000008666	-	85	46.629	ENSACIG00000019149	-	54	47.753
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ENSACIG00000008666	-	93	41.667	ENSACIG00000014745	-	87	41.667
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ENSACIG00000008666	-	86	45.810	ENSACIG00000022222	-	57	45.810
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ENSACIG00000008666	-	85	57.955	ENSACIG00000001596	-	70	57.955
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Orthologs

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ENSACIG00000008666	-	59	47.541	ENSAPOG00000007361	-	69	47.541	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000008666	-	84	45.763	ENSAPOG00000008344	zgc:113625	62	45.763	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000008666	-	85	44.318	ENSAPOG00000007333	-	51	44.318	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000008666	-	84	52.601	ENSAPOG00000006488	-	67	52.601	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000008666	-	84	47.674	ENSAPOG00000020897	-	65	47.674	Acanthochromis_polyacanthus
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ENSACIG00000008666	-	86	67.232	ENSAPOG00000008063	-	57	67.232	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000008666	-	85	44.318	ENSAPOG00000022240	-	50	44.318	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000008666	-	84	48.571	ENSAPOG00000007322	-	60	48.571	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000008666	-	86	50.282	ENSAPOG00000001262	-	84	50.282	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000008666	-	87	45.856	ENSAPOG00000001315	-	56	45.856	Acanthochromis_polyacanthus
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ENSACIG00000008666	-	87	60.556	ENSAPOG00000012716	-	61	60.556	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000008666	-	85	48.851	ENSAPOG00000014759	-	58	48.851	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000008666	-	82	51.479	ENSAPOG00000011509	-	58	51.479	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000008666	-	87	47.191	ENSAOCG00000001993	-	69	47.191	Amphiprion_ocellaris
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ENSACIG00000008666	-	84	53.757	ENSAOCG00000023255	-	61	53.757	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000008666	-	84	52.601	ENSAOCG00000023240	-	64	52.601	Amphiprion_ocellaris
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ENSACIG00000008666	-	87	59.444	ENSATEG00000014085	-	61	60.556	Anabas_testudineus
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ENSACIG00000008666	-	85	44.886	ENSATEG00000017193	-	51	44.886	Anabas_testudineus
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