EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000008886 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: znf1164
Alias: -
Full Name: zinc finger protein 1164
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 3570 bases
Position: chrCCOE01001107.1:65490-69059
Accession: ZDB-GENE-050208-802
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000011376	zf-C2H2	PF00096.26	7.4e-20	1	4
ENSACIP00000011376	zf-C2H2	PF00096.26	7.4e-20	2	4
ENSACIP00000011376	zf-C2H2	PF00096.26	7.4e-20	3	4
ENSACIP00000011376	zf-C2H2	PF00096.26	7.4e-20	4	4
ENSACIP00000011376	zf-met	PF12874.7	1.1e-09	1	2
ENSACIP00000011376	zf-met	PF12874.7	1.1e-09	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000011697	-	564	-	ENSACIP00000011376	187 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000008886	znf1164	86	43.411	ENSACIG00000022658	-	89	43.411
ENSACIG00000008886	znf1164	81	46.000	ENSACIG00000010637	-	53	46.000
ENSACIG00000008886	znf1164	93	39.091	ENSACIG00000019815	-	82	39.091
ENSACIG00000008886	znf1164	90	36.184	ENSACIG00000017683	-	77	36.184
ENSACIG00000008886	znf1164	95	37.580	ENSACIG00000015835	-	70	42.105
ENSACIG00000008886	znf1164	78	41.905	ENSACIG00000007464	-	53	41.905
ENSACIG00000008886	znf1164	92	44.667	ENSACIG00000003556	-	72	44.667
ENSACIG00000008886	znf1164	90	41.727	ENSACIG00000017013	-	56	41.727
ENSACIG00000008886	znf1164	86	43.165	ENSACIG00000023212	-	76	43.165
ENSACIG00000008886	znf1164	94	43.820	ENSACIG00000009755	-	81	43.820
ENSACIG00000008886	znf1164	80	39.456	ENSACIG00000018404	-	74	39.456
ENSACIG00000008886	znf1164	80	44.667	ENSACIG00000019447	-	65	44.667
ENSACIG00000008886	znf1164	87	38.710	ENSACIG00000023049	znf646	95	40.385
ENSACIG00000008886	znf1164	80	35.172	ENSACIG00000016133	-	53	35.172
ENSACIG00000008886	znf1164	96	42.424	ENSACIG00000023313	-	88	42.424
ENSACIG00000008886	znf1164	80	32.394	ENSACIG00000012604	scrt2	51	32.394
ENSACIG00000008886	znf1164	92	44.318	ENSACIG00000006755	-	79	40.541
ENSACIG00000008886	znf1164	80	37.956	ENSACIG00000002180	-	97	37.956
ENSACIG00000008886	znf1164	85	43.919	ENSACIG00000000360	si:ch211-241b2.1	87	43.919
ENSACIG00000008886	znf1164	96	44.565	ENSACIG00000004745	-	90	44.565
ENSACIG00000008886	znf1164	81	67.857	ENSACIG00000021986	-	92	67.857
ENSACIG00000008886	znf1164	99	37.674	ENSACIG00000019534	-	90	37.674
ENSACIG00000008886	znf1164	80	50.000	ENSACIG00000007855	-	88	50.000
ENSACIG00000008886	znf1164	80	39.815	ENSACIG00000020938	zbtb47b	51	39.815
ENSACIG00000008886	znf1164	80	38.017	ENSACIG00000006228	-	64	38.017
ENSACIG00000008886	znf1164	82	41.216	ENSACIG00000019102	-	51	41.216
ENSACIG00000008886	znf1164	86	42.254	ENSACIG00000016182	-	80	42.963
ENSACIG00000008886	znf1164	96	43.333	ENSACIG00000004666	-	98	43.972
ENSACIG00000008886	znf1164	80	46.774	ENSACIG00000009780	-	61	46.774
ENSACIG00000008886	znf1164	89	38.947	ENSACIG00000018952	-	80	38.947
ENSACIG00000008886	znf1164	81	37.063	ENSACIG00000007000	-	57	37.063
ENSACIG00000008886	znf1164	80	43.363	ENSACIG00000011515	-	65	43.363
ENSACIG00000008886	znf1164	88	36.957	ENSACIG00000012263	znf319b	88	36.957
ENSACIG00000008886	znf1164	94	44.898	ENSACIG00000013604	-	99	42.667
ENSACIG00000008886	znf1164	97	59.184	ENSACIG00000017644	-	90	59.184
ENSACIG00000008886	znf1164	81	43.860	ENSACIG00000003720	-	60	43.860
ENSACIG00000008886	znf1164	95	31.609	ENSACIG00000009128	-	69	35.948
ENSACIG00000008886	znf1164	90	36.842	ENSACIG00000017892	-	87	36.842
ENSACIG00000008886	znf1164	83	39.333	ENSACIG00000023162	-	56	39.333
ENSACIG00000008886	znf1164	89	48.039	ENSACIG00000022738	-	92	40.458
ENSACIG00000008886	znf1164	83	41.481	ENSACIG00000015411	-	84	41.791
ENSACIG00000008886	znf1164	86	43.709	ENSACIG00000013470	-	54	43.709
ENSACIG00000008886	znf1164	83	42.568	ENSACIG00000016944	-	74	42.568
ENSACIG00000008886	znf1164	94	37.069	ENSACIG00000002944	-	77	37.069
ENSACIG00000008886	znf1164	90	32.787	ENSACIG00000018641	snai2	52	32.787
ENSACIG00000008886	znf1164	80	43.299	ENSACIG00000013149	-	78	43.299
ENSACIG00000008886	znf1164	84	41.270	ENSACIG00000007034	-	97	41.270
ENSACIG00000008886	znf1164	82	40.164	ENSACIG00000013750	-	64	40.164
ENSACIG00000008886	znf1164	95	39.850	ENSACIG00000007882	-	84	39.850
ENSACIG00000008886	znf1164	87	35.862	ENSACIG00000012636	ZNF319	88	35.862
ENSACIG00000008886	znf1164	96	42.857	ENSACIG00000017647	-	88	43.571
ENSACIG00000008886	znf1164	85	42.000	ENSACIG00000000286	-	71	42.000
ENSACIG00000008886	znf1164	90	44.554	ENSACIG00000011153	-	74	41.333
ENSACIG00000008886	znf1164	95	44.554	ENSACIG00000019791	-	92	44.554
ENSACIG00000008886	znf1164	82	40.000	ENSACIG00000010739	-	77	40.000
ENSACIG00000008886	znf1164	98	42.857	ENSACIG00000017050	-	95	46.154
ENSACIG00000008886	znf1164	85	39.333	ENSACIG00000012084	-	97	39.333
ENSACIG00000008886	znf1164	81	42.424	ENSACIG00000009717	-	82	42.424
ENSACIG00000008886	znf1164	97	45.918	ENSACIG00000003515	-	93	45.918
ENSACIG00000008886	znf1164	91	42.466	ENSACIG00000018440	-	96	42.466
ENSACIG00000008886	znf1164	80	40.909	ENSACIG00000008448	-	67	40.909
ENSACIG00000008886	znf1164	92	39.333	ENSACIG00000022625	-	90	39.333
ENSACIG00000008886	znf1164	93	41.259	ENSACIG00000010647	-	96	41.176
ENSACIG00000008886	znf1164	77	43.636	ENSACIG00000017166	-	56	43.636
ENSACIG00000008886	znf1164	82	46.000	ENSACIG00000022293	-	94	46.000
ENSACIG00000008886	znf1164	81	43.165	ENSACIG00000022330	-	87	43.165
ENSACIG00000008886	znf1164	87	34.783	ENSACIG00000006826	-	57	34.783
ENSACIG00000008886	znf1164	95	43.333	ENSACIG00000006172	-	89	43.333
ENSACIG00000008886	znf1164	90	40.000	ENSACIG00000004626	-	80	39.855
ENSACIG00000008886	znf1164	80	38.000	ENSACIG00000016117	-	89	38.000
ENSACIG00000008886	znf1164	80	34.532	ENSACIG00000014233	znf407	54	34.532
ENSACIG00000008886	znf1164	99	45.614	ENSACIG00000015429	-	78	45.055
ENSACIG00000008886	znf1164	80	42.667	ENSACIG00000009809	si:dkey-77f5.14	82	42.667
ENSACIG00000008886	znf1164	95	37.079	ENSACIG00000007096	-	84	37.079
ENSACIG00000008886	znf1164	93	40.116	ENSACIG00000024444	-	69	40.116
ENSACIG00000008886	znf1164	83	37.931	ENSACIG00000006377	-	56	37.931
ENSACIG00000008886	znf1164	82	40.141	ENSACIG00000002190	gfi1b	53	40.141
ENSACIG00000008886	znf1164	91	39.310	ENSACIG00000023794	-	65	39.310
ENSACIG00000008886	znf1164	95	35.593	ENSACIG00000011516	-	80	35.593
ENSACIG00000008886	znf1164	85	45.652	ENSACIG00000014123	znf236	57	45.652
ENSACIG00000008886	znf1164	82	36.306	ENSACIG00000001767	zbtb41	68	36.306
ENSACIG00000008886	znf1164	88	71.429	ENSACIG00000017653	-	91	71.429
ENSACIG00000008886	znf1164	90	43.590	ENSACIG00000000311	-	67	43.590
ENSACIG00000008886	znf1164	94	46.429	ENSACIG00000003754	-	90	46.429
ENSACIG00000008886	znf1164	74	43.056	ENSACIG00000010660	-	96	43.056
ENSACIG00000008886	znf1164	80	43.210	ENSACIG00000013163	-	77	43.210
ENSACIG00000008886	znf1164	84	45.000	ENSACIG00000004041	-	90	45.000
ENSACIG00000008886	znf1164	82	74.257	ENSACIG00000001369	-	78	74.257
ENSACIG00000008886	znf1164	78	36.842	ENSACIG00000009443	-	55	36.364
ENSACIG00000008886	znf1164	94	45.000	ENSACIG00000011541	-	73	45.000
ENSACIG00000008886	znf1164	91	41.447	ENSACIG00000019710	-	76	41.447
ENSACIG00000008886	znf1164	81	39.597	ENSACIG00000000406	prdm5	80	39.597
ENSACIG00000008886	znf1164	83	38.462	ENSACIG00000006806	-	56	38.462

Orthologs

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ENSACIG00000008886	znf1164	84	41.447	ENSACLG00000024670	-	76	41.447	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000008886	znf1164	94	60.227	ENSACLG00000017449	-	57	60.227	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000008886	znf1164	77	50.562	ENSACLG00000000521	-	91	50.562	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000008886	znf1164	83	47.059	ENSAMXG00000041650	-	85	47.059	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000008886	znf1164	86	48.413	ENSAMXG00000043291	-	69	48.413	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000008886	znf1164	80	40.000	ENSCSEG00000015585	-	72	40.000	Cynoglossus_semilaevis
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ENSACIG00000008886	znf1164	80	49.007	ENSDARG00000094736	znf1157	85	49.007	Danio_rerio
ENSACIG00000008886	znf1164	81	46.535	ENSDARG00000104065	znf1154	83	46.535	Danio_rerio
ENSACIG00000008886	znf1164	80	50.000	ENSDARG00000103827	znf1144	95	57.500	Danio_rerio
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ENSACIG00000008886	znf1164	80	46.897	ENSDARG00000101044	si:ch73-138e16.6	90	45.033	Danio_rerio
ENSACIG00000008886	znf1164	91	44.000	ENSDARG00000104904	si:ch73-221f6.1	65	44.000	Danio_rerio
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ENSACIG00000008886	znf1164	81	47.020	ENSDARG00000097521	si:dkey-111k8.5	87	47.020	Danio_rerio
ENSACIG00000008886	znf1164	80	46.358	ENSDARG00000098613	si:dkey-15h8.16	79	46.358	Danio_rerio
ENSACIG00000008886	znf1164	82	51.485	ENSDARG00000071833	znf1162	88	51.485	Danio_rerio
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