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Description

Ensembl ID: ENSACIG00000009080 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: zmat4a
Alias: si:dkey-173g15.1
Full Name: zinc finger%2C matrin-type 4a
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 105749 bases
Position: chrCCOE01001524.1:751016-856764
Accession: ZDB-GENE-081104-333
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000011630	zf-met	PF12874.7	8.7e-32	1	4
ENSACIP00000011630	zf-met	PF12874.7	8.7e-32	2	4
ENSACIP00000011630	zf-met	PF12874.7	8.7e-32	3	4
ENSACIP00000011630	zf-met	PF12874.7	8.7e-32	4	4
ENSACIP00000011630	zf-C2H2_jaz	PF12171.8	1.2e-24	1	2
ENSACIP00000011630	zf-C2H2_jaz	PF12171.8	1.2e-24	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000011961	-	639	-	ENSACIP00000011630	212 (aa)	-	-

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000009080	zmat4a	96	46.377	ENSACIG00000024439	znf346	98	42.953
ENSACIG00000009080	zmat4a	72	68.504	ENSACIG00000021512	zgc:171482	95	68.504

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000009080	zmat4a	99	76.233	ENSG00000165061	ZMAT4	99	75.714	Homo_sapiens
ENSACIG00000009080	zmat4a	93	76.923	ENSAPOG00000007448	zmat4a	98	76.923	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000009080	zmat4a	99	75.336	ENSAMEG00000002758	ZMAT4	99	75.336	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000009080	zmat4a	99	93.243	ENSAOCG00000004416	zmat4a	85	93.243	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000009080	zmat4a	99	92.793	ENSAPEG00000018565	zmat4a	85	92.793	Amphiprion_percula
ENSACIG00000009080	zmat4a	100	92.342	ENSATEG00000012630	zmat4a	87	93.496	Anabas_testudineus
ENSACIG00000009080	zmat4a	100	78.222	ENSAPLG00000006106	ZMAT4	98	78.222	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000009080	zmat4a	85	79.793	ENSACAG00000005388	ZMAT4	92	79.793	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000009080	zmat4a	99	76.233	ENSANAG00000027926	ZMAT4	98	76.233	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000009080	zmat4a	99	94.144	ENSACLG00000005038	zmat4a	85	94.144	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000009080	zmat4a	100	87.727	ENSAMXG00000035337	zmat4a	100	88.636	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000009080	zmat4a	99	75.336	ENSBTAG00000017420	ZMAT4	97	75.336	Bos_taurus
ENSACIG00000009080	zmat4a	99	74.888	ENSCAFG00000005744	ZMAT4	97	74.888	Canis_familiaris
ENSACIG00000009080	zmat4a	72	68.675	ENSCAFG00020002716	ZMAT4	97	68.675	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000009080	zmat4a	100	75.556	ENSCHIG00000022017	ZMAT4	99	75.785	Capra_hircus
ENSACIG00000009080	zmat4a	69	71.698	ENSTSYG00000031413	ZMAT4	96	71.698	Carlito_syrichta
ENSACIG00000009080	zmat4a	99	74.554	ENSCAPG00000014401	ZMAT4	98	74.554	Cavia_aperea
ENSACIG00000009080	zmat4a	99	74.554	ENSCPOG00000015224	ZMAT4	98	74.554	Cavia_porcellus
ENSACIG00000009080	zmat4a	99	76.233	ENSCCAG00000027437	ZMAT4	98	76.233	Cebus_capucinus
ENSACIG00000009080	zmat4a	100	76.000	ENSCATG00000044978	ZMAT4	98	76.233	Cercocebus_atys
ENSACIG00000009080	zmat4a	99	75.000	ENSCLAG00000000923	ZMAT4	98	75.000	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000009080	zmat4a	99	75.893	ENSCSAG00000015108	ZMAT4	100	75.893	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000009080	zmat4a	99	63.514	ENSCHOG00000003755	ZMAT4	97	63.514	Choloepus_hoffmanni
ENSACIG00000009080	zmat4a	53	88.496	ENSCPBG00000002781	ZMAT4	77	84.167	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000009080	zmat4a	83	74.074	ENSCANG00000032136	ZMAT4	97	74.074	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000009080	zmat4a	99	75.000	ENSCGRG00001016583	Zmat4	98	75.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000009080	zmat4a	99	75.000	ENSCGRG00000002696	Zmat4	98	75.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000009080	zmat4a	99	90.991	ENSCSEG00000013707	zmat4a	94	90.991	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000009080	zmat4a	99	90.090	ENSCVAG00000000113	zmat4a	86	90.090	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000009080	zmat4a	100	79.295	ENSDARG00000061419	zmat4b	100	79.295	Danio_rerio
ENSACIG00000009080	zmat4a	100	88.393	ENSDARG00000092987	zmat4a	100	87.946	Danio_rerio
ENSACIG00000009080	zmat4a	99	74.554	ENSDNOG00000001045	ZMAT4	100	74.554	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000009080	zmat4a	99	75.785	ENSDORG00000009300	Zmat4	97	75.785	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000009080	zmat4a	68	74.051	ENSETEG00000010474	ZMAT4	81	74.051	Echinops_telfairi
ENSACIG00000009080	zmat4a	99	75.785	ENSEASG00005010447	ZMAT4	97	75.785	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000009080	zmat4a	99	75.785	ENSECAG00000021550	ZMAT4	97	75.785	Equus_caballus
ENSACIG00000009080	zmat4a	99	64.286	ENSEEUG00000002565	ZMAT4	100	64.286	Erinaceus_europaeus
ENSACIG00000009080	zmat4a	99	93.119	ENSELUG00000005097	zmat4a	100	89.732	Esox_lucius
ENSACIG00000009080	zmat4a	100	76.000	ENSFCAG00000012775	ZMAT4	100	76.000	Felis_catus
ENSACIG00000009080	zmat4a	99	79.909	ENSFALG00000006455	ZMAT4	97	79.909	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000009080	zmat4a	99	73.214	ENSFDAG00000015258	ZMAT4	95	73.214	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000009080	zmat4a	100	91.589	ENSFHEG00000022872	zmat4b	100	91.589	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000009080	zmat4a	99	89.189	ENSGMOG00000007950	zmat4a	100	89.189	Gadus_morhua
ENSACIG00000009080	zmat4a	99	78.378	ENSGALG00000003470	ZMAT4	97	78.378	Gallus_gallus
ENSACIG00000009080	zmat4a	100	92.925	ENSGAFG00000013149	zmat4a	99	92.925	Gambusia_affinis
ENSACIG00000009080	zmat4a	99	92.793	ENSGACG00000005515	zmat4a	98	92.793	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000009080	zmat4a	99	79.821	ENSGAGG00000004799	ZMAT4	97	79.821	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000009080	zmat4a	99	76.233	ENSGGOG00000006633	ZMAT4	98	76.233	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000009080	zmat4a	99	94.595	ENSHBUG00000012634	zmat4a	85	94.595	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000009080	zmat4a	99	74.554	ENSHGLG00000003246	ZMAT4	98	74.554	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000009080	zmat4a	68	72.785	ENSHGLG00100000081	ZMAT4	100	72.785	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000009080	zmat4a	55	94.828	ENSHCOG00000006516	zmat4b	93	94.828	Hippocampus_comes
ENSACIG00000009080	zmat4a	99	85.780	ENSIPUG00000022248	zmat4	100	82.143	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000009080	zmat4a	99	74.439	ENSJJAG00000013484	Zmat4	97	74.439	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000009080	zmat4a	99	75.336	ENSLACG00000006206	-	97	75.336	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000009080	zmat4a	60	55.072	ENSLACG00000005109	-	92	55.072	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000009080	zmat4a	100	89.686	ENSLOCG00000015435	zmat4b	99	89.686	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000009080	zmat4a	99	76.000	ENSLAFG00000014753	ZMAT4	100	76.000	Loxodonta_africana
ENSACIG00000009080	zmat4a	99	76.233	ENSMFAG00000043475	ZMAT4	98	76.233	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000009080	zmat4a	92	70.048	ENSMMUG00000000776	ZMAT4	97	74.074	Macaca_mulatta
ENSACIG00000009080	zmat4a	99	76.233	ENSMNEG00000042102	ZMAT4	98	76.233	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000009080	zmat4a	99	76.233	ENSMLEG00000034448	ZMAT4	98	76.233	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000009080	zmat4a	99	90.950	ENSMAMG00000019914	zmat4a	81	90.984	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000009080	zmat4a	99	94.595	ENSMZEG00005004946	zmat4a	85	94.595	Maylandia_zebra
ENSACIG00000009080	zmat4a	99	77.130	ENSMGAG00000002288	ZMAT4	97	77.130	Meleagris_gallopavo
ENSACIG00000009080	zmat4a	83	72.487	ENSMICG00000047837	ZMAT4	97	72.487	Microcebus_murinus
ENSACIG00000009080	zmat4a	99	74.888	ENSMOCG00000015996	Zmat4	97	74.888	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000009080	zmat4a	99	92.308	ENSMMOG00000012619	zmat4a	85	96.552	Mola_mola
ENSACIG00000009080	zmat4a	85	74.872	ENSMODG00000010499	ZMAT4	98	74.872	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000009080	zmat4a	99	90.090	ENSMALG00000015056	zmat4a	85	90.090	Monopterus_albus
ENSACIG00000009080	zmat4a	100	74.667	MGP_CAROLIEiJ_G0030909	Zmat4	100	86.458	Mus_caroli
ENSACIG00000009080	zmat4a	100	74.667	ENSMUSG00000037492	Zmat4	100	86.458	Mus_musculus
ENSACIG00000009080	zmat4a	100	74.667	MGP_PahariEiJ_G0021380	Zmat4	100	86.458	Mus_pahari
ENSACIG00000009080	zmat4a	100	74.667	MGP_SPRETEiJ_G0032028	Zmat4	100	86.458	Mus_spretus
ENSACIG00000009080	zmat4a	100	75.111	ENSMPUG00000005832	ZMAT4	80	75.111	Mustela_putorius_furo
ENSACIG00000009080	zmat4a	57	69.173	ENSMLUG00000014209	ZMAT4	100	69.173	Myotis_lucifugus
ENSACIG00000009080	zmat4a	99	73.991	ENSNGAG00000015545	Zmat4	97	73.991	Nannospalax_galili
ENSACIG00000009080	zmat4a	100	95.045	ENSNBRG00000011844	zmat4a	100	95.045	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000009080	zmat4a	99	76.233	ENSNLEG00000012564	ZMAT4	98	76.233	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000009080	zmat4a	99	76.106	ENSMEUG00000000558	ZMAT4	100	76.106	Notamacropus_eugenii
ENSACIG00000009080	zmat4a	99	75.785	ENSOPRG00000009257	ZMAT4	97	75.785	Ochotona_princeps
ENSACIG00000009080	zmat4a	99	75.000	ENSODEG00000006439	ZMAT4	98	75.000	Octodon_degus
ENSACIG00000009080	zmat4a	78	91.620	ENSONIG00000016086	zmat4a	96	91.620	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000009080	zmat4a	96	36.653	ENSONIG00000020374	-	51	36.653	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000009080	zmat4a	97	70.861	ENSOANG00000022431	ZMAT4	88	85.000	Ornithorhynchus_anatinus
ENSACIG00000009080	zmat4a	99	75.785	ENSOCUG00000000977	ZMAT4	97	75.785	Oryctolagus_cuniculus
ENSACIG00000009080	zmat4a	55	96.552	ENSORLG00000016169	zmat4b	79	96.552	Oryzias_latipes
ENSACIG00000009080	zmat4a	99	90.667	ENSORLG00020019602	zmat4a	96	90.667	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000009080	zmat4a	99	90.667	ENSORLG00015009006	zmat4a	96	90.667	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000009080	zmat4a	100	91.150	ENSOMEG00000003441	zmat4a	77	91.150	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000009080	zmat4a	99	74.107	ENSOGAG00000012558	ZMAT4	100	74.107	Otolemur_garnettii
ENSACIG00000009080	zmat4a	100	75.556	ENSOARG00000002354	ZMAT4	85	75.556	Ovis_aries
ENSACIG00000009080	zmat4a	100	76.000	ENSPPAG00000042573	ZMAT4	100	76.000	Pan_paniscus
ENSACIG00000009080	zmat4a	99	75.785	ENSPPRG00000007023	ZMAT4	97	75.785	Panthera_pardus
ENSACIG00000009080	zmat4a	99	75.785	ENSPTIG00000019738	ZMAT4	97	75.785	Panthera_tigris_altaica
ENSACIG00000009080	zmat4a	99	76.233	ENSPTRG00000020191	ZMAT4	97	76.233	Pan_troglodytes
ENSACIG00000009080	zmat4a	99	76.233	ENSPANG00000014196	ZMAT4	98	76.233	Papio_anubis
ENSACIG00000009080	zmat4a	100	68.153	ENSPKIG00000021792	zmat4b	100	68.153	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000009080	zmat4a	100	86.099	ENSPKIG00000000048	zmat4a	85	86.036	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000009080	zmat4a	99	79.821	ENSPSIG00000004847	ZMAT4	97	79.821	Pelodiscus_sinensis
ENSACIG00000009080	zmat4a	100	89.720	ENSPMGG00000001436	zmat4b	100	89.720	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000009080	zmat4a	98	53.846	ENSPMAG00000004582	zmat4a	96	53.846	Petromyzon_marinus
ENSACIG00000009080	zmat4a	99	76.106	ENSPCIG00000028706	ZMAT4	90	77.434	Phascolarctos_cinereus
ENSACIG00000009080	zmat4a	99	90.541	ENSPFOG00000006742	zmat4a	86	90.541	Poecilia_formosa
ENSACIG00000009080	zmat4a	100	90.583	ENSPLAG00000019268	zmat4a	88	90.583	Poecilia_latipinna
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ENSACIG00000009080	zmat4a	99	41.410	ENSXCOG00000010189	-	99	41.850	Xiphophorus_couchianus
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ENSACIG00000009080	zmat4a	99	90.541	ENSXMAG00000010461	zmat4a	86	90.541	Xiphophorus_maculatus