EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000009111 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: nanos3
Alias: cb725|nanos|nanos1|nos1
Full Name: nanos homolog 3
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 805 bases
Position: chrCCOE01001430.1:905626-906430
Accession: ZDB-GENE-011221-1
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000011665	zf-nanos	PF05741.13	5.8e-24	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000011996	-	690	-	ENSACIP00000011665	229 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000009111	nanos3	96	62.443	ENSAPOG00000009762	nanos3	98	61.991	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000009111	nanos3	92	63.850	ENSAOCG00000009870	nanos3	99	63.850	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000009111	nanos3	92	63.850	ENSAPEG00000013733	nanos3	99	63.850	Amphiprion_percula
ENSACIG00000009111	nanos3	92	53.271	ENSATEG00000007052	-	89	53.271	Anabas_testudineus
ENSACIG00000009111	nanos3	98	60.088	ENSATEG00000019463	nanos3	99	60.088	Anabas_testudineus
ENSACIG00000009111	nanos3	98	77.876	ENSACLG00000020332	nanos3	99	77.876	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000009111	nanos3	54	45.968	ENSCGRG00001023851	Nanos3	67	45.968	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000009111	nanos3	54	45.968	ENSCGRG00000017734	Nanos3	66	45.968	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000009111	nanos3	93	46.512	ENSCSEG00000008032	nanos3	95	46.512	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000009111	nanos3	83	30.435	ENSCSEG00000012772	-	79	30.435	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000009111	nanos3	95	43.363	ENSCVAG00000011987	nanos3	97	43.805	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000009111	nanos3	93	41.395	ENSELUG00000016082	nanos3	96	41.395	Esox_lucius
ENSACIG00000009111	nanos3	87	41.000	ENSELUG00000016582	-	81	41.000	Esox_lucius
ENSACIG00000009111	nanos3	83	31.220	ENSELUG00000022032	nanos1	81	31.220	Esox_lucius
ENSACIG00000009111	nanos3	93	38.636	ENSFHEG00000017084	-	89	41.589	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000009111	nanos3	98	53.712	ENSGAFG00000010617	nanos3	99	55.217	Gambusia_affinis
ENSACIG00000009111	nanos3	77	76.378	ENSGACG00000019003	nanos3	100	76.378	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000009111	nanos3	98	77.876	ENSHBUG00000018730	nanos3	99	77.876	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000009111	nanos3	63	69.620	ENSHCOG00000014790	nanos3	81	69.620	Hippocampus_comes
ENSACIG00000009111	nanos3	98	55.882	ENSKMAG00000018767	nanos3	99	56.723	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000009111	nanos3	98	63.793	ENSLBEG00000004936	nanos3	99	63.793	Labrus_bergylta
ENSACIG00000009111	nanos3	98	67.105	ENSMAMG00000011660	nanos3	99	67.105	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000009111	nanos3	98	77.434	ENSMZEG00005007690	nanos3	99	77.434	Maylandia_zebra
ENSACIG00000009111	nanos3	54	46.774	ENSMAUG00000008396	Nanos3	66	46.774	Mesocricetus_auratus
ENSACIG00000009111	nanos3	98	52.521	ENSMMOG00000021368	-	67	52.500	Mola_mola
ENSACIG00000009111	nanos3	68	76.923	ENSMALG00000005945	nanos3	95	76.923	Monopterus_albus
ENSACIG00000009111	nanos3	90	31.336	ENSMALG00000002316	-	85	31.336	Monopterus_albus
ENSACIG00000009111	nanos3	98	77.876	ENSNBRG00000023737	nanos3	99	77.876	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000009111	nanos3	98	77.876	ENSONIG00000020588	nanos3	99	77.876	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000009111	nanos3	96	49.091	ENSORLG00000012018	nanos3	97	49.091	Oryzias_latipes
ENSACIG00000009111	nanos3	83	30.366	ENSORLG00000027849	nanos1a	82	30.366	Oryzias_latipes
ENSACIG00000009111	nanos3	83	30.366	ENSORLG00020008713	-	82	30.366	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000009111	nanos3	96	49.091	ENSORLG00020004967	nanos3	97	49.091	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000009111	nanos3	96	45.575	ENSORLG00015003631	nanos3	97	45.575	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000009111	nanos3	93	47.170	ENSOMEG00000000922	nanos3	94	47.170	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000009111	nanos3	90	39.320	ENSPKIG00000009354	nanos3	77	39.320	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000009111	nanos3	89	30.516	ENSPKIG00000019945	nanos1	84	30.516	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000009111	nanos3	96	58.904	ENSPMGG00000016412	nanos3	96	58.904	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000009111	nanos3	83	31.553	ENSPFOG00000020008	-	84	31.553	Poecilia_formosa
ENSACIG00000009111	nanos3	98	52.402	ENSPFOG00000020123	nanos3	99	53.478	Poecilia_formosa
ENSACIG00000009111	nanos3	97	51.982	ENSPLAG00000010871	nanos3	100	53.070	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000009111	nanos3	83	31.553	ENSPLAG00000022525	-	80	31.553	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000009111	nanos3	97	52.423	ENSPMEG00000014135	nanos3	100	52.423	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000009111	nanos3	83	31.553	ENSPMEG00000015568	-	81	31.553	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000009111	nanos3	98	51.528	ENSPREG00000000425	nanos3	99	52.609	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000009111	nanos3	90	34.466	ENSPPYG00000009627	NANOS3	74	34.951	Pongo_abelii
ENSACIG00000009111	nanos3	98	77.434	ENSPNYG00000001788	nanos3	99	77.434	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000009111	nanos3	83	31.863	ENSSDUG00000003196	-	82	31.863	Seriola_dumerili
ENSACIG00000009111	nanos3	98	64.103	ENSSDUG00000002131	nanos3	99	64.530	Seriola_dumerili
ENSACIG00000009111	nanos3	83	31.863	ENSSLDG00000009413	-	80	31.863	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACIG00000009111	nanos3	98	64.224	ENSSLDG00000012674	nanos3	99	64.655	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACIG00000009111	nanos3	83	30.047	ENSSPAG00000011053	-	78	30.047	Stegastes_partitus
ENSACIG00000009111	nanos3	98	62.832	ENSSPAG00000008183	nanos3	99	63.274	Stegastes_partitus
ENSACIG00000009111	nanos3	55	40.000	ENSSSCG00000003096	NANOS2	82	40.000	Sus_scrofa
ENSACIG00000009111	nanos3	83	31.034	ENSTRUG00000021804	-	79	31.034	Takifugu_rubripes
ENSACIG00000009111	nanos3	54	48.387	ENSTBEG00000013729	NANOS3	77	48.387	Tupaia_belangeri
ENSACIG00000009111	nanos3	98	52.155	ENSXCOG00000014426	nanos3	99	53.648	Xiphophorus_couchianus
ENSACIG00000009111	nanos3	83	31.373	ENSXMAG00000019985	NANOS1	82	31.373	Xiphophorus_maculatus
ENSACIG00000009111	nanos3	98	52.155	ENSXMAG00000023751	nanos3	99	53.648	Xiphophorus_maculatus