EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000009139 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: dnajc27
Alias: rbj|zgc:194263|zgc:194279
Full Name: DnaJ (Hsp40) homolog%2C subfamily C%2C member 27
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 2857 bases
Position: chrCCOE01000829.1:183140-185996
Accession: ZDB-GENE-081022-93
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000011803	MMR_HSR1	PF01926.23	8.3e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000012136	-	813	-	ENSACIP00000011803	271 (aa)	-	-
ENSACIT00000012092	-	747	-	ENSACIP00000011759	248 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSACIG00000009139's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSACIG00000009139's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000009139	dnajc27	61	34.731	ENSACIG00000007739	rab9b	81	34.731
ENSACIG00000009139	dnajc27	62	33.721	ENSACIG00000011024	si:dkey-13a21.4	82	33.721
ENSACIG00000009139	dnajc27	61	34.731	ENSACIG00000013630	RAB7A	80	34.731
ENSACIG00000009139	dnajc27	61	32.941	ENSACIG00000018043	rab9a	82	32.941
ENSACIG00000009139	dnajc27	61	31.138	ENSACIG00000021459	zgc:101559	71	31.138
ENSACIG00000009139	dnajc27	61	34.731	ENSACIG00000022381	-	80	34.731
ENSACIG00000009139	dnajc27	57	30.128	ENSACIG00000003157	-	80	30.128
ENSACIG00000009139	dnajc27	58	30.864	ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	71	30.864
ENSACIG00000009139	dnajc27	54	30.137	ENSACIG00000019631	rab11bb	74	30.137
ENSACIG00000009139	dnajc27	59	30.864	ENSACIG00000014605	rab6a	75	30.864
ENSACIG00000009139	dnajc27	59	36.810	ENSACIG00000014012	rab22a	81	36.810
ENSACIG00000009139	dnajc27	55	32.000	ENSACIG00000022520	rab33a	65	32.000
ENSACIG00000009139	dnajc27	59	32.919	ENSACIG00000008102	rab18b	76	32.919
ENSACIG00000009139	dnajc27	61	33.728	ENSACIG00000006558	-	82	33.728
ENSACIG00000009139	dnajc27	59	33.540	ENSACIG00000023837	-	74	33.540
ENSACIG00000009139	dnajc27	52	30.070	ENSACIG00000019049	rab1ab	93	30.070
ENSACIG00000009139	dnajc27	59	32.530	ENSACIG00000013119	-	74	33.548
ENSACIG00000009139	dnajc27	61	36.527	ENSACIG00000022208	-	80	36.527
ENSACIG00000009139	dnajc27	66	30.556	ENSACIG00000008584	rab13	82	30.556
ENSACIG00000009139	dnajc27	55	30.921	ENSACIG00000021855	rab33ba	61	30.921
ENSACIG00000009139	dnajc27	62	30.357	ENSACIG00000003092	rab11a	76	30.357
ENSACIG00000009139	dnajc27	60	34.146	ENSACIG00000006949	RAB17	70	34.146
ENSACIG00000009139	dnajc27	58	30.625	ENSACIG00000000642	rab36	59	30.625
ENSACIG00000009139	dnajc27	62	30.357	ENSACIG00000024374	rab11ba	67	30.357
ENSACIG00000009139	dnajc27	58	33.333	ENSACIG00000000154	RAB39B	73	33.333
ENSACIG00000009139	dnajc27	58	31.646	ENSACIG00000009306	RAB15	73	31.646

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	80.952	ENSG00000115137	DNAJC27	99	80.952	Homo_sapiens
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	97.802	ENSAPOG00000020278	dnajc27	99	97.802	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	82.784	ENSAMEG00000002554	DNAJC27	99	82.784	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	97.802	ENSAOCG00000006604	dnajc27	99	97.802	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	97.802	ENSAPEG00000009586	dnajc27	99	97.802	Amphiprion_percula
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	98.535	ENSATEG00000008796	dnajc27	99	98.535	Anabas_testudineus
ENSACIG00000009139	dnajc27	98	82.772	ENSACAG00000010248	DNAJC27	99	82.772	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	80.586	ENSANAG00000032274	DNAJC27	99	80.586	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	98.168	ENSACLG00000004019	dnajc27	99	98.168	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	93.040	ENSAMXG00000041488	dnajc27	99	93.040	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	80.952	ENSBTAG00000018239	DNAJC27	99	80.952	Bos_taurus
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	80.586	ENSCJAG00000008094	DNAJC27	99	80.586	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	82.784	ENSCAFG00000004098	DNAJC27	99	82.784	Canis_familiaris
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	82.051	ENSCAFG00020025277	DNAJC27	99	82.051	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	80.220	ENSCHIG00000013821	DNAJC27	99	80.220	Capra_hircus
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	80.952	ENSTSYG00000014096	DNAJC27	99	80.952	Carlito_syrichta
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	83.516	ENSCPOG00000006843	DNAJC27	99	83.516	Cavia_porcellus
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	80.220	ENSCCAG00000021410	DNAJC27	99	80.220	Cebus_capucinus
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	80.586	ENSCATG00000029231	DNAJC27	99	80.586	Cercocebus_atys
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	83.150	ENSCLAG00000008212	DNAJC27	99	83.150	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	80.952	ENSCSAG00000008536	DNAJC27	99	80.952	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	83.516	ENSCPBG00000022284	DNAJC27	99	83.516	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000009139	dnajc27	97	64.151	ENSCING00000000917	rbj	99	64.151	Ciona_intestinalis
ENSACIG00000009139	dnajc27	97	65.038	ENSCSAVG00000006409	-	99	65.038	Ciona_savignyi
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	80.952	ENSCANG00000029144	-	99	80.952	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	82.784	ENSCGRG00001023794	Dnajc27	99	82.784	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	82.784	ENSCGRG00000007127	Dnajc27	99	82.784	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	97.802	ENSCSEG00000014284	dnajc27	99	97.802	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	93.773	ENSDARG00000070916	dnajc27	99	93.773	Danio_rerio
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	82.051	ENSDNOG00000040043	DNAJC27	99	82.051	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	82.051	ENSDORG00000015134	Dnajc27	99	82.051	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	81.319	ENSEASG00005010598	DNAJC27	99	81.319	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	81.685	ENSECAG00000024595	DNAJC27	99	81.685	Equus_caballus
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	95.604	ENSELUG00000019264	dnajc27	99	95.604	Esox_lucius
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	82.051	ENSFCAG00000038919	DNAJC27	99	82.051	Felis_catus
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	70.182	ENSFALG00000012658	DNAJC27	99	70.182	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	84.615	ENSGALG00000028967	DNAJC27	99	84.615	Gallus_gallus
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	97.436	ENSGACG00000015457	dnajc27	99	97.436	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	80.586	ENSGGOG00000004081	DNAJC27	99	80.586	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	98.168	ENSHBUG00000001491	dnajc27	99	98.168	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	82.051	ENSHGLG00000013756	DNAJC27	99	82.051	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	82.051	ENSHGLG00100009434	DNAJC27	99	82.051	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	97.070	ENSHCOG00000002948	dnajc27	99	97.070	Hippocampus_comes
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	93.040	ENSIPUG00000015086	dnajc27	99	93.040	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	83.150	ENSSTOG00000006080	DNAJC27	99	83.150	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	82.418	ENSJJAG00000016683	Dnajc27	99	82.418	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	98.168	ENSKMAG00000011954	dnajc27	99	98.168	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	97.070	ENSLBEG00000028391	dnajc27	99	97.070	Labrus_bergylta
ENSACIG00000009139	dnajc27	94	76.119	ENSLBEG00000018738	-	95	76.296	Labrus_bergylta
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	83.516	ENSLACG00000012994	DNAJC27	99	83.516	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	91.209	ENSLOCG00000016679	dnajc27	99	91.209	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	81.319	ENSLAFG00000002742	DNAJC27	99	81.319	Loxodonta_africana
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	80.586	ENSMFAG00000043229	DNAJC27	99	80.586	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	80.586	ENSMMUG00000009603	DNAJC27	99	80.586	Macaca_mulatta
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	98.168	ENSMAMG00000022707	dnajc27	99	98.168	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	98.168	ENSMZEG00005012058	dnajc27	99	98.168	Maylandia_zebra
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	81.685	ENSMAUG00000000099	Dnajc27	99	81.685	Mesocricetus_auratus
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	81.685	ENSMICG00000027424	DNAJC27	99	81.685	Microcebus_murinus
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	81.752	ENSMOCG00000015357	Dnajc27	99	81.752	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	78.388	ENSMODG00000015869	DNAJC27	99	78.388	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	98.168	ENSMALG00000001189	dnajc27	99	98.168	Monopterus_albus
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	81.685	MGP_CAROLIEiJ_G0017579	Dnajc27	99	81.685	Mus_caroli
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	82.051	ENSMUSG00000020657	Dnajc27	99	82.051	Mus_musculus
ENSACIG00000009139	dnajc27	65	81.250	MGP_PahariEiJ_G0029339	-	80	81.250	Mus_pahari
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	81.685	MGP_SPRETEiJ_G0018423	Dnajc27	99	81.685	Mus_spretus
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	81.685	ENSMPUG00000014032	DNAJC27	99	81.685	Mustela_putorius_furo
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	80.586	ENSMLUG00000014143	DNAJC27	99	80.586	Myotis_lucifugus
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	98.168	ENSNBRG00000022552	dnajc27	99	98.168	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	80.952	ENSNLEG00000001103	DNAJC27	99	80.952	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	78.022	ENSOPRG00000008650	DNAJC27	99	78.022	Ochotona_princeps
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	82.784	ENSODEG00000007488	DNAJC27	99	82.784	Octodon_degus
ENSACIG00000009139	dnajc27	96	98.099	ENSONIG00000009008	dnajc27	97	98.099	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	82.051	ENSOCUG00000011260	DNAJC27	99	82.051	Oryctolagus_cuniculus
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	96.703	ENSORLG00000001134	dnajc27	99	96.703	Oryzias_latipes
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	96.703	ENSORLG00020006790	dnajc27	99	96.703	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	96.703	ENSORLG00015010005	dnajc27	99	96.703	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	97.070	ENSOMEG00000017890	dnajc27	99	97.070	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	82.051	ENSOGAG00000015168	DNAJC27	99	82.051	Otolemur_garnettii
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	80.586	ENSOARG00000018127	DNAJC27	99	80.586	Ovis_aries
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	80.952	ENSPPAG00000031678	DNAJC27	99	80.952	Pan_paniscus
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	82.051	ENSPPRG00000022920	DNAJC27	99	82.051	Panthera_pardus
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	82.051	ENSPTIG00000013443	DNAJC27	99	82.051	Panthera_tigris_altaica
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	80.952	ENSPTRG00000011719	DNAJC27	99	80.952	Pan_troglodytes
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	80.952	ENSPANG00000023972	DNAJC27	99	80.952	Papio_anubis
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	89.011	ENSPKIG00000005931	DNAJC27	99	89.011	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000009139	dnajc27	68	86.486	ENSPKIG00000005039	dnajc27	99	86.486	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	82.784	ENSPSIG00000009930	DNAJC27	99	82.784	Pelodiscus_sinensis
ENSACIG00000009139	dnajc27	99	72.263	ENSPMAG00000005573	dnajc27	98	72.263	Petromyzon_marinus
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	81.319	ENSPCIG00000025239	DNAJC27	99	81.319	Phascolarctos_cinereus
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	97.802	ENSPFOG00000006335	dnajc27	99	97.802	Poecilia_formosa
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	97.436	ENSPLAG00000008845	dnajc27	99	97.436	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	97.802	ENSPMEG00000018256	dnajc27	99	97.802	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000009139	dnajc27	65	97.727	ENSPREG00000010228	dnajc27	90	97.727	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	80.952	ENSPPYG00000012594	DNAJC27	99	80.952	Pongo_abelii
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	82.051	ENSPCOG00000025665	DNAJC27	99	82.051	Propithecus_coquereli
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	82.418	ENSPVAG00000017520	DNAJC27	99	82.418	Pteropus_vampyrus
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	98.168	ENSPNYG00000023681	dnajc27	99	98.168	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	93.407	ENSPNAG00000025619	dnajc27	99	93.407	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	80.952	ENSRNOG00000003988	Dnajc27	99	80.952	Rattus_norvegicus
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	80.586	ENSRBIG00000041935	-	99	80.586	Rhinopithecus_bieti
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	80.952	ENSRROG00000031027	-	99	80.952	Rhinopithecus_roxellana
ENSACIG00000009139	dnajc27	50	77.941	ENSSHAG00000002151	-	93	77.941	Sarcophilus_harrisii
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	89.744	ENSSFOG00015020074	DNAJC27	99	89.744	Scleropages_formosus
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	88.278	ENSSFOG00015017512	dnajc27	99	88.278	Scleropages_formosus
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	97.436	ENSSMAG00000000032	dnajc27	99	97.436	Scophthalmus_maximus
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	98.535	ENSSDUG00000003036	dnajc27	99	98.535	Seriola_dumerili
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	98.535	ENSSLDG00000015143	dnajc27	99	98.535	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	97.802	ENSSPAG00000009154	dnajc27	99	97.802	Stegastes_partitus
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	80.586	ENSSSCG00000008577	DNAJC27	99	80.682	Sus_scrofa
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	97.070	ENSTRUG00000023427	dnajc27	99	97.070	Takifugu_rubripes
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	97.070	ENSTNIG00000006596	dnajc27	99	97.070	Tetraodon_nigroviridis
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	81.319	ENSTBEG00000005463	DNAJC27	99	81.319	Tupaia_belangeri
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	80.952	ENSTTRG00000015163	DNAJC27	99	80.952	Tursiops_truncatus
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	82.051	ENSUAMG00000009585	DNAJC27	99	82.051	Ursus_americanus
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	82.051	ENSUMAG00000022558	DNAJC27	99	82.051	Ursus_maritimus
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	75.458	ENSVPAG00000006953	DNAJC27	99	75.458	Vicugna_pacos
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	81.685	ENSVVUG00000015241	DNAJC27	99	81.685	Vulpes_vulpes
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	97.436	ENSXCOG00000010812	dnajc27	99	97.436	Xiphophorus_couchianus
ENSACIG00000009139	dnajc27	100	97.436	ENSXMAG00000003407	dnajc27	99	97.436	Xiphophorus_maculatus