EuRBPDB

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000009149 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 7864 bases
Position: chrCCOE01000043.1:4336-12199
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000011721	MMR_HSR1	PF01926.23	5.5e-08	1	1

Transcripts

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
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ENSACIG00000009149	-	69	36.139	ENSACIG00000004040	-	72	36.139
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ENSACIG00000009149	-	69	35.784	ENSACIG00000014680	-	80	35.784
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ENSACIG00000009149	-	60	30.939	ENSACIG00000022374	-	81	30.939
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ENSACIG00000009149	-	73	34.259	ENSACIG00000014745	-	88	34.259

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000009149	-	73	33.182	ENSAPOG00000018915	-	85	33.182	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000009149	-	74	31.441	ENSAPOG00000002517	-	72	31.441	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000009149	-	68	33.824	ENSAPOG00000009059	-	50	33.333	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000009149	-	73	33.028	ENSAPOG00000002337	-	64	33.182	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000009149	-	71	33.649	ENSAPOG00000007123	-	70	33.649	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000009149	-	73	34.545	ENSAPOG00000000066	-	55	34.545	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000009149	-	62	31.915	ENSAPOG00000007631	-	77	31.915	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000009149	-	66	34.872	ENSAPOG00000022321	-	54	34.872	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000009149	-	72	32.432	ENSAPOG00000002527	-	65	32.287	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000009149	-	73	32.719	ENSAPOG00000001075	-	90	32.719	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000009149	-	70	31.944	ENSAPOG00000009288	-	74	31.944	Acanthochromis_polyacanthus
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ENSACIG00000009149	-	61	35.359	ENSAOCG00000007815	-	60	35.359	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000009149	-	74	30.909	ENSAOCG00000013326	-	70	30.909	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000009149	-	71	31.532	ENSAOCG00000016099	-	88	31.532	Amphiprion_ocellaris
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