EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000009221 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: noc4l
Alias: cb534|sb:cb534|wu:fb78g04|zgc:110429
Full Name: nucleolar complex associated 4 homolog
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 10376 bases
Position: chrCCOE01000999.1:259512-269887
Accession: ZDB-GENE-050522-98
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000012032	CBF	PF03914.17	6.8e-35	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000012373	-	1740	-	ENSACIP00000012032	579 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000009221	noc4l	89	55.837	ENSG00000184967	NOC4L	99	55.837	Homo_sapiens
ENSACIG00000009221	noc4l	91	84.181	ENSAPOG00000007239	noc4l	99	84.181	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000009221	noc4l	83	57.083	ENSAMEG00000013649	NOC4L	94	57.083	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000009221	noc4l	91	82.298	ENSAOCG00000022225	noc4l	99	82.298	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000009221	noc4l	91	82.231	ENSAPEG00000005789	noc4l	99	81.690	Amphiprion_percula
ENSACIG00000009221	noc4l	91	84.121	ENSATEG00000020704	noc4l	99	84.121	Anabas_testudineus
ENSACIG00000009221	noc4l	76	58.145	ENSAPLG00000001340	NOC4L	99	58.145	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000009221	noc4l	91	58.679	ENSACAG00000007479	NOC4L	95	58.679	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000009221	noc4l	90	54.528	ENSANAG00000035196	NOC4L	99	54.528	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000009221	noc4l	91	91.115	ENSACLG00000020832	noc4l	99	91.115	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000009221	noc4l	91	66.919	ENSAMXG00000008720	noc4l	99	66.919	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000009221	noc4l	87	56.548	ENSBTAG00000011889	NOC4L	97	56.548	Bos_taurus
ENSACIG00000009221	noc4l	84	54.397	ENSCJAG00000005405	NOC4L	90	54.397	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000009221	noc4l	86	55.090	ENSCAFG00000006300	NOC4L	97	55.090	Canis_familiaris
ENSACIG00000009221	noc4l	88	53.846	ENSCAFG00020010316	NOC4L	99	53.846	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000009221	noc4l	87	55.796	ENSCHIG00000007775	NOC4L	97	55.796	Capra_hircus
ENSACIG00000009221	noc4l	79	56.427	ENSTSYG00000025452	NOC4L	96	56.427	Carlito_syrichta
ENSACIG00000009221	noc4l	75	56.522	ENSCAPG00000011665	NOC4L	99	56.522	Cavia_aperea
ENSACIG00000009221	noc4l	87	55.754	ENSCPOG00000021166	NOC4L	97	55.754	Cavia_porcellus
ENSACIG00000009221	noc4l	89	52.724	ENSCCAG00000029963	NOC4L	99	52.724	Cebus_capucinus
ENSACIG00000009221	noc4l	89	55.837	ENSCATG00000035699	NOC4L	99	55.837	Cercocebus_atys
ENSACIG00000009221	noc4l	89	54.669	ENSCLAG00000007550	NOC4L	99	54.669	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000009221	noc4l	89	55.447	ENSCSAG00000001865	NOC4L	99	55.447	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000009221	noc4l	86	63.527	ENSCPBG00000024642	NOC4L	98	63.294	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000009221	noc4l	89	37.100	ENSCING00000011753	-	98	37.100	Ciona_intestinalis
ENSACIG00000009221	noc4l	89	52.140	ENSCANG00000037218	NOC4L	99	52.140	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000009221	noc4l	87	55.248	ENSCGRG00001004291	Noc4l	97	55.248	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000009221	noc4l	85	55.714	ENSCGRG00000005706	Noc4l	99	55.714	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000009221	noc4l	92	77.736	ENSCSEG00000003635	noc4l	100	77.736	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000009221	noc4l	91	79.584	ENSCVAG00000000047	noc4l	99	79.584	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000009221	noc4l	91	68.173	ENSDARG00000045565	noc4l	99	68.173	Danio_rerio
ENSACIG00000009221	noc4l	87	64.253	ENSDNOG00000041813	NOC4L	86	64.253	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000009221	noc4l	88	54.990	ENSDORG00000015155	Noc4l	98	54.990	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000009221	noc4l	69	58.209	ENSETEG00000006237	NOC4L	99	58.209	Echinops_telfairi
ENSACIG00000009221	noc4l	75	48.970	ENSEBUG00000001980	noc4l	95	48.970	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000009221	noc4l	87	56.496	ENSEASG00005016651	NOC4L	97	56.496	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000009221	noc4l	87	56.947	ENSECAG00000024217	NOC4L	97	56.947	Equus_caballus
ENSACIG00000009221	noc4l	91	71.751	ENSELUG00000010483	noc4l	99	71.751	Esox_lucius
ENSACIG00000009221	noc4l	87	57.822	ENSFCAG00000010783	NOC4L	97	57.822	Felis_catus
ENSACIG00000009221	noc4l	74	60.094	ENSFALG00000008259	NOC4L	99	60.094	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000009221	noc4l	85	55.781	ENSFDAG00000001178	NOC4L	98	55.668	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000009221	noc4l	91	81.474	ENSFHEG00000010492	noc4l	99	81.474	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000009221	noc4l	91	71.834	ENSGMOG00000003087	noc4l	99	71.834	Gadus_morhua
ENSACIG00000009221	noc4l	87	59.127	ENSGALG00000002272	NOC4L	99	59.127	Gallus_gallus
ENSACIG00000009221	noc4l	91	79.017	ENSGAFG00000006565	noc4l	97	79.017	Gambusia_affinis
ENSACIG00000009221	noc4l	91	78.343	ENSGACG00000017577	noc4l	97	81.535	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000009221	noc4l	86	59.557	ENSGAGG00000016459	NOC4L	98	61.734	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000009221	noc4l	87	56.349	ENSGGOG00000010266	NOC4L	99	55.642	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000009221	noc4l	91	90.548	ENSHBUG00000001312	noc4l	99	90.548	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000009221	noc4l	87	54.960	ENSHGLG00000011672	NOC4L	97	54.960	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000009221	noc4l	87	54.960	ENSHGLG00100017890	NOC4L	97	54.960	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000009221	noc4l	91	78.261	ENSHCOG00000014284	noc4l	99	78.261	Hippocampus_comes
ENSACIG00000009221	noc4l	91	67.108	ENSIPUG00000010363	noc4l	99	67.108	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000009221	noc4l	87	55.777	ENSSTOG00000022612	NOC4L	97	55.777	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000009221	noc4l	87	55.952	ENSJJAG00000020377	Noc4l	97	55.952	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000009221	noc4l	91	81.853	ENSKMAG00000012718	noc4l	99	81.853	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000009221	noc4l	91	80.151	ENSLBEG00000002825	noc4l	99	80.151	Labrus_bergylta
ENSACIG00000009221	noc4l	89	63.148	ENSLACG00000018559	NOC4L	99	63.148	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000009221	noc4l	91	67.797	ENSLOCG00000006060	noc4l	99	68.623	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000009221	noc4l	87	54.762	ENSLAFG00000027295	NOC4L	97	54.762	Loxodonta_africana
ENSACIG00000009221	noc4l	87	56.349	ENSMFAG00000046313	NOC4L	99	55.642	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000009221	noc4l	87	56.151	ENSMMUG00000006735	NOC4L	99	55.447	Macaca_mulatta
ENSACIG00000009221	noc4l	87	56.151	ENSMNEG00000043745	NOC4L	99	55.447	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000009221	noc4l	83	56.067	ENSMLEG00000032574	NOC4L	99	56.067	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000009221	noc4l	91	83.743	ENSMAMG00000007207	noc4l	99	83.743	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000009221	noc4l	91	91.115	ENSMZEG00005017749	noc4l	99	91.115	Maylandia_zebra
ENSACIG00000009221	noc4l	63	61.749	ENSMGAG00000001901	NOC4L	99	61.749	Meleagris_gallopavo
ENSACIG00000009221	noc4l	87	55.248	ENSMAUG00000018153	Noc4l	97	55.248	Mesocricetus_auratus
ENSACIG00000009221	noc4l	91	53.220	ENSMICG00000011789	NOC4L	97	53.220	Microcebus_murinus
ENSACIG00000009221	noc4l	81	53.617	ENSMOCG00000022696	-	92	53.617	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000009221	noc4l	87	54.653	ENSMOCG00000015072	-	97	54.653	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000009221	noc4l	83	59.167	ENSMODG00000015342	NOC4L	99	59.167	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000009221	noc4l	92	84.528	ENSMALG00000013174	noc4l	99	84.528	Monopterus_albus
ENSACIG00000009221	noc4l	88	55.227	MGP_CAROLIEiJ_G0027548	Noc4l	98	55.227	Mus_caroli
ENSACIG00000009221	noc4l	88	56.016	ENSMUSG00000033294	Noc4l	98	56.016	Mus_musculus
ENSACIG00000009221	noc4l	88	55.621	MGP_PahariEiJ_G0024130	Noc4l	98	55.621	Mus_pahari
ENSACIG00000009221	noc4l	88	55.819	MGP_SPRETEiJ_G0028546	Noc4l	98	55.819	Mus_spretus
ENSACIG00000009221	noc4l	76	55.329	ENSMPUG00000002415	NOC4L	99	55.329	Mustela_putorius_furo
ENSACIG00000009221	noc4l	87	55.030	ENSMLUG00000028195	NOC4L	97	55.030	Myotis_lucifugus
ENSACIG00000009221	noc4l	89	54.669	ENSNGAG00000002758	Noc4l	99	54.864	Nannospalax_galili
ENSACIG00000009221	noc4l	91	90.737	ENSNBRG00000020542	noc4l	99	90.737	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000009221	noc4l	89	48.218	ENSNLEG00000008553	NOC4L	99	48.218	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000009221	noc4l	74	60.383	ENSMEUG00000004020	NOC4L	84	60.383	Notamacropus_eugenii
ENSACIG00000009221	noc4l	53	60.261	ENSOPRG00000012976	-	100	60.261	Ochotona_princeps
ENSACIG00000009221	noc4l	87	55.159	ENSODEG00000007796	NOC4L	99	55.159	Octodon_degus
ENSACIG00000009221	noc4l	91	89.981	ENSONIG00000003800	noc4l	99	89.981	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000009221	noc4l	74	59.122	ENSOANG00000007306	NOC4L	99	59.122	Ornithorhynchus_anatinus
ENSACIG00000009221	noc4l	91	79.811	ENSORLG00000010804	noc4l	99	79.811	Oryzias_latipes
ENSACIG00000009221	noc4l	91	79.811	ENSORLG00020000286	noc4l	99	79.811	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000009221	noc4l	91	74.624	ENSORLG00015023020	noc4l	99	74.624	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000009221	noc4l	91	80.943	ENSOMEG00000022646	noc4l	99	80.943	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000009221	noc4l	87	56.944	ENSOGAG00000001727	NOC4L	96	56.944	Otolemur_garnettii
ENSACIG00000009221	noc4l	87	56.944	ENSOARG00000011688	NOC4L	92	56.944	Ovis_aries
ENSACIG00000009221	noc4l	87	56.746	ENSPPAG00000042504	NOC4L	99	56.660	Pan_paniscus
ENSACIG00000009221	noc4l	87	57.426	ENSPPRG00000014742	NOC4L	97	57.426	Panthera_pardus
ENSACIG00000009221	noc4l	89	56.031	ENSPTRG00000050596	NOC4L	99	56.031	Pan_troglodytes
ENSACIG00000009221	noc4l	89	55.837	ENSPANG00000011004	NOC4L	99	55.837	Papio_anubis
ENSACIG00000009221	noc4l	91	63.396	ENSPKIG00000017628	noc4l	99	63.396	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000009221	noc4l	74	63.615	ENSPSIG00000007614	NOC4L	99	63.615	Pelodiscus_sinensis
ENSACIG00000009221	noc4l	91	74.102	ENSPMGG00000004587	noc4l	99	74.102	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000009221	noc4l	87	54.743	ENSPEMG00000011021	Noc4l	97	54.743	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACIG00000009221	noc4l	89	54.440	ENSPCIG00000004756	NOC4L	98	55.992	Phascolarctos_cinereus
ENSACIG00000009221	noc4l	91	78.261	ENSPFOG00000019666	noc4l	99	78.261	Poecilia_formosa
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ENSACIG00000009221	noc4l	88	55.819	ENSPCOG00000020675	NOC4L	98	55.819	Propithecus_coquereli
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ENSACIG00000009221	noc4l	88	55.030	ENSRNOG00000037478	Noc4l	98	55.030	Rattus_norvegicus
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ENSACIG00000009221	noc4l	89	55.447	ENSRROG00000033324	NOC4L	99	55.447	Rhinopithecus_roxellana
ENSACIG00000009221	noc4l	63	35.088	YPR144C	NOC4	70	35.088	Saccharomyces_cerevisiae
ENSACIG00000009221	noc4l	80	55.724	ENSSBOG00000031768	NOC4L	99	55.724	Saimiri_boliviensis_boliviensis
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ENSACIG00000009221	noc4l	91	80.151	ENSXCOG00000004716	noc4l	99	80.151	Xiphophorus_couchianus
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