EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000009586 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 7267 bases
Position: chrCCOE01001430.1:1025698-1032964
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000012326	IBN_N	PF03810.19	1.1e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000012672	-	2319	-	ENSACIP00000012326	772 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSACIG00000009586's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSACIG00000009586's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000009586	-	99	86.494	ENSACIG00000003711	tnpo1	99	86.494
ENSACIG00000009586	-	99	95.979	ENSACIG00000007518	tnpo2	98	95.979

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000009586	-	100	92.358	ENSG00000105576	TNPO2	100	92.448	Homo_sapiens
ENSACIG00000009586	-	94	94.483	ENSAPOG00000013185	-	96	94.483	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000009586	-	100	99.741	ENSAPOG00000009339	TNPO2	87	99.741	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000009586	-	99	90.532	ENSAMEG00000012123	TNPO2	85	90.532	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000009586	-	100	99.741	ENSAOCG00000010152	-	87	99.741	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000009586	-	100	95.855	ENSAOCG00000010374	tnpo2	96	92.218	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000009586	-	100	95.855	ENSAPEG00000008429	tnpo2	87	95.855	Amphiprion_percula
ENSACIG00000009586	-	100	99.741	ENSAPEG00000013268	-	87	99.741	Amphiprion_percula
ENSACIG00000009586	-	100	99.741	ENSATEG00000019171	-	87	99.741	Anabas_testudineus
ENSACIG00000009586	-	100	95.078	ENSATEG00000024761	TNPO2	87	95.078	Anabas_testudineus
ENSACIG00000009586	-	100	93.005	ENSACAG00000003576	TNPO2	87	92.617	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000009586	-	100	92.228	ENSANAG00000036645	TNPO2	87	92.228	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000009586	-	100	95.596	ENSACLG00000001853	tnpo2	87	95.596	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000009586	-	100	92.617	ENSACLG00000020672	-	86	92.617	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000009586	-	100	93.631	ENSAMXG00000010246	tnpo2	88	95.238	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000009586	-	100	92.098	ENSBTAG00000011811	TNPO2	99	90.600	Bos_taurus
ENSACIG00000009586	-	99	92.477	ENSCJAG00000005096	TNPO2	86	92.477	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000009586	-	100	92.358	ENSCAFG00000017226	TNPO2	73	92.358	Canis_familiaris
ENSACIG00000009586	-	100	92.358	ENSCAFG00020005115	TNPO2	87	92.358	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000009586	-	99	88.067	ENSCHIG00000011718	TNPO2	86	87.938	Capra_hircus
ENSACIG00000009586	-	100	92.228	ENSTSYG00000003828	TNPO2	87	92.228	Carlito_syrichta
ENSACIG00000009586	-	92	90.884	ENSCAPG00000015700	TNPO2	82	90.884	Cavia_aperea
ENSACIG00000009586	-	100	91.969	ENSCPOG00000007033	TNPO2	87	91.969	Cavia_porcellus
ENSACIG00000009586	-	100	92.358	ENSCCAG00000024574	TNPO2	87	92.358	Cebus_capucinus
ENSACIG00000009586	-	99	92.477	ENSCATG00000042599	TNPO2	86	92.477	Cercocebus_atys
ENSACIG00000009586	-	100	91.969	ENSCLAG00000013442	TNPO2	87	91.969	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000009586	-	100	92.358	ENSCSAG00000006597	TNPO2	87	92.358	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000009586	-	100	93.264	ENSCPBG00000023892	TNPO2	87	93.005	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000009586	-	96	92.432	ENSCANG00000027834	TNPO2	85	92.432	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000009586	-	99	92.477	ENSCGRG00001015917	Tnpo2	86	92.477	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000009586	-	100	92.358	ENSCGRG00000012601	Tnpo2	87	92.358	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000009586	-	100	90.933	ENSCSEG00000012923	tnpo2	87	90.933	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000009586	-	100	96.891	ENSCSEG00000011477	-	99	96.891	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000009586	-	100	99.611	ENSCVAG00000001908	TNPO2	87	99.611	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000009586	-	100	93.402	ENSCVAG00000002750	tnpo2	87	93.402	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000009586	-	100	90.415	ENSDARG00000038239	tnpo2	87	90.415	Danio_rerio
ENSACIG00000009586	-	100	83.333	ENSDNOG00000043264	TNPO2	83	83.333	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000009586	-	99	92.218	ENSDORG00000014993	Tnpo2	100	91.241	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000009586	-	100	72.844	FBgn0024921	Tnpo	87	72.587	Drosophila_melanogaster
ENSACIG00000009586	-	90	82.222	ENSETEG00000014785	TNPO2	77	82.222	Echinops_telfairi
ENSACIG00000009586	-	100	92.228	ENSEASG00005004160	TNPO2	87	92.228	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000009586	-	100	92.228	ENSECAG00000013673	TNPO2	87	92.228	Equus_caballus
ENSACIG00000009586	-	99	88.129	ENSELUG00000016542	-	98	88.129	Esox_lucius
ENSACIG00000009586	-	100	94.515	ENSELUG00000008680	tnpo2	87	94.515	Esox_lucius
ENSACIG00000009586	-	99	92.348	ENSFCAG00000000467	TNPO2	86	92.348	Felis_catus
ENSACIG00000009586	-	100	91.969	ENSFDAG00000021543	TNPO2	87	91.969	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000009586	-	100	93.790	ENSFHEG00000016501	tnpo2	87	93.790	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000009586	-	100	99.611	ENSFHEG00000009734	TNPO2	88	99.611	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000009586	-	89	98.148	ENSGMOG00000014237	-	86	98.148	Gadus_morhua
ENSACIG00000009586	-	100	85.881	ENSGMOG00000009021	tnpo2	86	85.881	Gadus_morhua
ENSACIG00000009586	-	100	99.611	ENSGAFG00000010401	TNPO2	87	99.611	Gambusia_affinis
ENSACIG00000009586	-	100	94.179	ENSGAFG00000018993	tnpo2	87	94.179	Gambusia_affinis
ENSACIG00000009586	-	100	93.264	ENSGAGG00000010150	TNPO2	87	93.005	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000009586	-	100	95.596	ENSHBUG00000014849	tnpo2	87	95.596	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000009586	-	100	99.741	ENSHBUG00000018317	-	87	99.741	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000009586	-	100	91.839	ENSHGLG00000016928	TNPO2	87	91.839	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000009586	-	99	91.310	ENSHGLG00100009938	TNPO2	100	88.321	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000009586	-	100	93.135	ENSHCOG00000005914	tnpo2	87	93.135	Hippocampus_comes
ENSACIG00000009586	-	100	98.964	ENSHCOG00000020440	-	87	98.964	Hippocampus_comes
ENSACIG00000009586	-	100	95.078	ENSIPUG00000005768	tnpo2	87	95.078	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000009586	-	100	97.280	ENSIPUG00000006884	TNPO2	86	97.280	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000009586	-	100	92.358	ENSSTOG00000006952	TNPO2	87	92.358	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000009586	-	99	92.477	ENSJJAG00000016820	Tnpo2	86	92.477	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000009586	-	100	91.839	ENSKMAG00000021274	TNPO2	87	91.839	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000009586	-	100	99.482	ENSKMAG00000018430	TNPO2	87	99.482	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000009586	-	100	99.482	ENSLBEG00000005301	-	87	99.482	Labrus_bergylta
ENSACIG00000009586	-	100	95.596	ENSLBEG00000026241	tnpo2	89	95.596	Labrus_bergylta
ENSACIG00000009586	-	100	90.155	ENSLACG00000012322	TNPO2	86	90.155	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000009586	-	100	95.984	ENSLOCG00000006178	tnpo2	86	95.984	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000009586	-	99	92.348	ENSLAFG00000003661	TNPO2	86	92.348	Loxodonta_africana
ENSACIG00000009586	-	99	92.477	ENSMFAG00000037531	TNPO2	86	92.477	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000009586	-	100	92.358	ENSMMUG00000005684	TNPO2	87	92.358	Macaca_mulatta
ENSACIG00000009586	-	100	92.358	ENSMNEG00000041024	TNPO2	87	92.358	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000009586	-	96	92.558	ENSMLEG00000018391	TNPO2	83	92.558	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000009586	-	100	93.367	ENSMAMG00000023658	tnpo2	98	93.830	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000009586	-	100	99.741	ENSMAMG00000011862	-	87	99.741	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000009586	-	100	99.741	ENSMZEG00005007408	-	87	99.741	Maylandia_zebra
ENSACIG00000009586	-	100	90.710	ENSMZEG00005011298	TNPO2	87	91.074	Maylandia_zebra
ENSACIG00000009586	-	100	95.596	ENSMZEG00005023965	tnpo2	87	95.596	Maylandia_zebra
ENSACIG00000009586	-	100	92.358	ENSMICG00000016153	TNPO2	87	92.358	Microcebus_murinus
ENSACIG00000009586	-	100	92.358	ENSMOCG00000016489	Tnpo2	87	92.358	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000009586	-	99	90.310	ENSMMOG00000005063	TNPO2	93	90.310	Mola_mola
ENSACIG00000009586	-	100	99.352	ENSMMOG00000021390	TNPO2	99	99.352	Mola_mola
ENSACIG00000009586	-	99	93.774	ENSMODG00000006888	TNPO2	86	93.774	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000009586	-	100	94.171	ENSMALG00000004721	tnpo2	87	94.171	Monopterus_albus
ENSACIG00000009586	-	100	99.223	ENSMALG00000006232	TNPO2	87	99.223	Monopterus_albus
ENSACIG00000009586	-	100	92.358	MGP_CAROLIEiJ_G0031326	Tnpo2	87	92.358	Mus_caroli
ENSACIG00000009586	-	100	92.358	ENSMUSG00000031691	Tnpo2	100	91.241	Mus_musculus
ENSACIG00000009586	-	100	92.358	MGP_PahariEiJ_G0022931	Tnpo2	87	92.358	Mus_pahari
ENSACIG00000009586	-	100	92.358	MGP_SPRETEiJ_G0032445	Tnpo2	87	92.358	Mus_spretus
ENSACIG00000009586	-	100	92.358	ENSMPUG00000004663	TNPO2	87	92.358	Mustela_putorius_furo
ENSACIG00000009586	-	96	92.297	ENSMLUG00000012669	TNPO2	86	92.297	Myotis_lucifugus
ENSACIG00000009586	-	100	92.358	ENSNGAG00000000650	Tnpo2	87	92.358	Nannospalax_galili
ENSACIG00000009586	-	100	99.741	ENSNBRG00000023849	TNPO2	87	99.741	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000009586	-	100	89.508	ENSNBRG00000006242	TNPO2	86	89.508	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000009586	-	99	81.995	ENSNLEG00000012758	TNPO2	87	81.995	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000009586	-	99	88.067	ENSMEUG00000016658	TNPO2	86	88.067	Notamacropus_eugenii
ENSACIG00000009586	-	100	91.969	ENSODEG00000009670	TNPO2	87	91.969	Octodon_degus
ENSACIG00000009586	-	100	99.741	ENSONIG00000017706	-	86	99.741	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000009586	-	100	95.725	ENSONIG00000002147	tnpo2	87	95.725	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000009586	-	100	92.876	ENSOANG00000010051	TNPO2	87	92.876	Ornithorhynchus_anatinus
ENSACIG00000009586	-	90	92.442	ENSOCUG00000008251	TNPO2	77	92.442	Oryctolagus_cuniculus
ENSACIG00000009586	-	65	98.800	ENSORLG00000011763	TNPO2	99	98.800	Oryzias_latipes
ENSACIG00000009586	-	100	95.466	ENSORLG00000010363	tnpo2	87	95.466	Oryzias_latipes
ENSACIG00000009586	-	65	98.600	ENSORLG00020001020	TNPO2	99	98.600	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000009586	-	100	95.466	ENSORLG00020015785	tnpo2	87	95.466	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000009586	-	100	94.819	ENSORLG00015005489	tnpo2	87	94.819	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000009586	-	65	98.800	ENSORLG00015003941	TNPO2	99	98.800	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000009586	-	100	95.207	ENSOMEG00000014877	TNPO2	87	95.207	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000009586	-	100	98.964	ENSOMEG00000013440	TNPO2	87	98.964	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000009586	-	100	92.098	ENSOARG00000011717	TNPO2	90	92.098	Ovis_aries
ENSACIG00000009586	-	99	92.477	ENSPPAG00000019494	TNPO2	86	92.477	Pan_paniscus
ENSACIG00000009586	-	99	92.477	ENSPPRG00000003075	TNPO2	86	92.477	Panthera_pardus
ENSACIG00000009586	-	98	86.207	ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	86.207	Panthera_tigris_altaica
ENSACIG00000009586	-	99	92.477	ENSPTRG00000010535	TNPO2	86	92.477	Pan_troglodytes
ENSACIG00000009586	-	99	92.477	ENSPANG00000016857	TNPO2	86	92.477	Papio_anubis
ENSACIG00000009586	-	100	94.430	ENSPKIG00000004824	tnpo2	87	94.430	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000009586	-	97	92.696	ENSPKIG00000002899	-	86	93.277	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000009586	-	99	90.452	ENSPSIG00000010215	TNPO2	86	90.065	Pelodiscus_sinensis
ENSACIG00000009586	-	65	94.600	ENSPMGG00000022850	tnpo2	99	93.600	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000009586	-	99	98.833	ENSPMGG00000016459	TNPO2	98	98.833	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000009586	-	99	92.477	ENSPEMG00000018702	Tnpo2	86	92.477	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACIG00000009586	-	98	91.721	ENSPCIG00000015327	TNPO2	82	93.514	Phascolarctos_cinereus
ENSACIG00000009586	-	100	99.611	ENSPFOG00000005417	TNPO2	87	99.611	Poecilia_formosa
ENSACIG00000009586	-	100	94.179	ENSPFOG00000012466	tnpo2	87	94.179	Poecilia_formosa
ENSACIG00000009586	-	100	99.611	ENSPLAG00000010687	TNPO2	90	99.611	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000009586	-	100	94.049	ENSPLAG00000018842	tnpo2	87	94.049	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000009586	-	100	94.049	ENSPMEG00000006069	tnpo2	87	94.049	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000009586	-	100	99.611	ENSPMEG00000014011	-	87	99.611	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000009586	-	100	99.611	ENSPREG00000000415	TNPO2	86	99.611	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000009586	-	100	93.790	ENSPREG00000001121	TNPO2	87	93.790	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000009586	-	100	92.358	ENSPPYG00000009602	TNPO2	87	92.358	Pongo_abelii
ENSACIG00000009586	-	99	82.687	ENSPCAG00000014916	TNPO2	86	82.558	Procavia_capensis
ENSACIG00000009586	-	100	92.358	ENSPCOG00000018386	TNPO2	87	92.358	Propithecus_coquereli
ENSACIG00000009586	-	96	92.818	ENSPVAG00000013411	TNPO2	82	92.818	Pteropus_vampyrus
ENSACIG00000009586	-	100	92.617	ENSPNYG00000001235	-	86	92.617	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000009586	-	100	95.596	ENSPNYG00000013748	tnpo2	87	95.596	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000009586	-	100	98.187	ENSPNAG00000026208	-	87	98.187	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000009586	-	100	95.596	ENSPNAG00000024491	tnpo2	87	95.596	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000009586	-	100	92.358	ENSRNOG00000003970	Tnpo2	84	92.358	Rattus_norvegicus
ENSACIG00000009586	-	100	92.358	ENSRBIG00000036652	TNPO2	87	92.358	Rhinopithecus_bieti
ENSACIG00000009586	-	100	92.358	ENSRROG00000040402	TNPO2	87	92.358	Rhinopithecus_roxellana
ENSACIG00000009586	-	100	92.358	ENSSBOG00000019551	TNPO2	87	92.358	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSACIG00000009586	-	96	93.784	ENSSHAG00000015858	TNPO2	86	93.784	Sarcophilus_harrisii
ENSACIG00000009586	-	100	96.373	ENSSFOG00015018955	TNPO2	87	96.373	Scleropages_formosus
ENSACIG00000009586	-	100	94.171	ENSSFOG00015010934	tnpo2	87	94.171	Scleropages_formosus
ENSACIG00000009586	-	100	95.855	ENSSMAG00000012008	tnpo2	87	95.855	Scophthalmus_maximus
ENSACIG00000009586	-	100	99.093	ENSSMAG00000004050	-	100	95.619	Scophthalmus_maximus
ENSACIG00000009586	-	100	99.741	ENSSDUG00000002607	TNPO2	87	99.741	Seriola_dumerili
ENSACIG00000009586	-	100	95.984	ENSSDUG00000001767	tnpo2	87	95.984	Seriola_dumerili
ENSACIG00000009586	-	100	99.611	ENSSLDG00000013107	-	87	99.611	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACIG00000009586	-	100	95.984	ENSSLDG00000025629	tnpo2	99	92.866	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACIG00000009586	-	79	94.853	ENSSARG00000003825	TNPO2	71	94.853	Sorex_araneus
ENSACIG00000009586	-	99	92.857	ENSSPUG00000000736	TNPO2	86	92.468	Sphenodon_punctatus
ENSACIG00000009586	-	100	97.154	ENSSPAG00000008511	-	87	97.154	Stegastes_partitus
ENSACIG00000009586	-	100	95.855	ENSSPAG00000008512	tnpo2	87	95.855	Stegastes_partitus
ENSACIG00000009586	-	100	92.358	ENSSSCG00000013726	TNPO2	87	92.358	Sus_scrofa
ENSACIG00000009586	-	100	93.264	ENSTRUG00000012698	tnpo2	86	93.264	Takifugu_rubripes
ENSACIG00000009586	-	100	98.705	ENSTRUG00000009453	TNPO2	87	98.705	Takifugu_rubripes
ENSACIG00000009586	-	100	95.466	ENSTNIG00000014071	TNPO2	87	95.466	Tetraodon_nigroviridis
ENSACIG00000009586	-	100	83.938	ENSTNIG00000003295	TNPO2	84	93.372	Tetraodon_nigroviridis
ENSACIG00000009586	-	99	92.477	ENSTTRG00000005443	TNPO2	86	92.477	Tursiops_truncatus
ENSACIG00000009586	-	99	92.348	ENSUAMG00000019621	TNPO2	86	92.348	Ursus_americanus
ENSACIG00000009586	-	100	88.092	ENSUMAG00000006504	TNPO2	86	87.964	Ursus_maritimus
ENSACIG00000009586	-	100	83.938	ENSVVUG00000023860	TNPO2	92	89.908	Vulpes_vulpes
ENSACIG00000009586	-	100	91.451	ENSXETG00000004771	tnpo2	86	91.192	Xenopus_tropicalis
ENSACIG00000009586	-	100	99.611	ENSXCOG00000014460	TNPO2	88	99.611	Xiphophorus_couchianus
ENSACIG00000009586	-	100	99.611	ENSXMAG00000012793	TNPO2	87	99.611	Xiphophorus_maculatus
ENSACIG00000009586	-	100	94.049	ENSXMAG00000014217	TNPO2	87	94.049	Xiphophorus_maculatus