EuRBPDB

Description

RBDs

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000009617 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: rab18a
Alias: fc62e07|wu:fc62e07|zgc:77145
Full Name: RAB18A%2C member RAS oncogene family
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 9089 bases
Position: chrCCOE01000253.1:189388-198476
Accession: ZDB-GENE-030131-3980
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000012328	MMR_HSR1	PF01926.23	6.8e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000012674	-	543	-	ENSACIP00000012328	180 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000009617	rab18a	81	36.686	ENSACIG00000006949	RAB17	74	36.686
ENSACIG00000009617	rab18a	69	36.000	ENSACIG00000014094	rab6bb	73	36.000
ENSACIG00000009617	rab18a	67	36.486	ENSACIG00000022520	rab33a	65	36.486
ENSACIG00000009617	rab18a	77	31.737	ENSACIG00000022381	-	81	31.737
ENSACIG00000009617	rab18a	77	35.758	ENSACIG00000003102	rab42a	76	35.758
ENSACIG00000009617	rab18a	77	31.928	ENSACIG00000007739	rab9b	82	31.928
ENSACIG00000009617	rab18a	92	38.579	ENSACIG00000014625	-	95	38.579
ENSACIG00000009617	rab18a	51	32.759	ENSACIG00000008620	rab34a	52	32.759
ENSACIG00000009617	rab18a	78	36.364	ENSACIG00000014012	rab22a	84	36.364
ENSACIG00000009617	rab18a	77	31.737	ENSACIG00000013630	RAB7A	81	31.737
ENSACIG00000009617	rab18a	82	34.104	ENSACIG00000000154	RAB39B	81	34.104
ENSACIG00000009617	rab18a	71	38.158	ENSACIG00000003157	-	80	38.158
ENSACIG00000009617	rab18a	76	38.272	ENSACIG00000017414	rab25b	78	38.272
ENSACIG00000009617	rab18a	79	35.714	ENSACIG00000010619	rab15	77	35.714
ENSACIG00000009617	rab18a	80	38.462	ENSACIG00000017403	rab11al	78	38.462
ENSACIG00000009617	rab18a	68	36.184	ENSACIG00000013119	-	75	36.184
ENSACIG00000009617	rab18a	94	38.776	ENSACIG00000019049	rab1ab	98	38.000
ENSACIG00000009617	rab18a	69	32.283	ENSACIG00000000100	kras	59	30.168
ENSACIG00000009617	rab18a	86	32.402	ENSACIG00000014605	rab6a	84	32.402
ENSACIG00000009617	rab18a	81	36.047	ENSACIG00000023837	-	81	36.047
ENSACIG00000009617	rab18a	80	32.143	ENSACIG00000000670	rabl2	74	32.143
ENSACIG00000009617	rab18a	77	40.244	ENSACIG00000020616	rab12	67	40.854
ENSACIG00000009617	rab18a	92	35.567	ENSACIG00000019251	rab5aa	91	35.567
ENSACIG00000009617	rab18a	78	30.357	ENSACIG00000006558	-	84	30.357
ENSACIG00000009617	rab18a	81	33.333	ENSACIG00000010914	RAB41	79	33.333
ENSACIG00000009617	rab18a	83	31.638	ENSACIG00000011024	si:dkey-13a21.4	84	31.638
ENSACIG00000009617	rab18a	52	41.880	ENSACIG00000019631	rab11bb	61	41.880
ENSACIG00000009617	rab18a	87	31.868	ENSACIG00000007154	rab6ba	85	31.868
ENSACIG00000009617	rab18a	78	38.788	ENSACIG00000010896	rab5c	76	38.788
ENSACIG00000009617	rab18a	76	38.889	ENSACIG00000024376	-	74	38.889
ENSACIG00000009617	rab18a	74	39.623	ENSACIG00000024374	rab11ba	65	39.623
ENSACIG00000009617	rab18a	76	38.272	ENSACIG00000003092	rab11a	75	38.272
ENSACIG00000009617	rab18a	77	36.527	ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	75	36.527
ENSACIG00000009617	rab18a	76	41.975	ENSACIG00000009006	zgc:171927	75	41.975
ENSACIG00000009617	rab18a	86	36.464	ENSACIG00000008584	rab13	87	36.464
ENSACIG00000009617	rab18a	63	34.286	ENSACIG00000022208	-	65	34.286
ENSACIG00000009617	rab18a	94	32.394	ENSACIG00000021855	rab33ba	88	32.394
ENSACIG00000009617	rab18a	67	33.333	ENSACIG00000021459	zgc:101559	64	33.333
ENSACIG00000009617	rab18a	68	35.714	ENSACIG00000020496	rab23	75	30.519
ENSACIG00000009617	rab18a	81	34.857	ENSACIG00000023222	-	76	34.857
ENSACIG00000009617	rab18a	76	38.272	ENSACIG00000019803	rab25a	76	38.272
ENSACIG00000009617	rab18a	77	30.120	ENSACIG00000018043	rab9a	82	30.120
ENSACIG00000009617	rab18a	99	74.510	ENSACIG00000008102	rab18b	99	74.510
ENSACIG00000009617	rab18a	61	33.945	ENSACIG00000000699	hrasb	87	30.909
ENSACIG00000009617	rab18a	74	33.582	ENSACIG00000017824	rras	93	31.551
ENSACIG00000009617	rab18a	77	34.146	ENSACIG00000009306	RAB15	77	34.146

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000009617	rab18a	100	85.784	ENSAPOG00000010760	rab18a	100	85.784	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000009617	rab18a	100	86.275	ENSAOCG00000016233	rab18a	100	86.275	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000009617	rab18a	100	86.275	ENSAPEG00000005392	rab18a	100	86.275	Amphiprion_percula
ENSACIG00000009617	rab18a	100	95.556	ENSATEG00000021911	rab18a	100	95.556	Anabas_testudineus
ENSACIG00000009617	rab18a	100	75.610	ENSACAG00000005463	-	100	75.610	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000009617	rab18a	100	98.333	ENSACLG00000011484	rab18a	100	98.333	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000009617	rab18a	100	74.757	ENSCPBG00000015839	-	100	74.757	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000009617	rab18a	96	62.189	ENSCPBG00000027619	-	98	62.189	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000009617	rab18a	97	65.829	ENSCING00000006838	-	99	65.829	Ciona_intestinalis
ENSACIG00000009617	rab18a	97	64.824	ENSCSAVG00000010348	-	99	64.824	Ciona_savignyi
ENSACIG00000009617	rab18a	100	95.556	ENSCSEG00000011816	rab18a	100	95.556	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000009617	rab18a	93	84.896	ENSCVAG00000015451	rab18a	100	84.804	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000009617	rab18a	100	71.220	ENSDARG00000055291	rab18a	100	71.220	Danio_rerio
ENSACIG00000009617	rab18a	100	80.000	ENSELUG00000003805	rab18a	100	80.000	Esox_lucius
ENSACIG00000009617	rab18a	100	85.294	ENSFHEG00000019455	rab18a	100	85.294	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000009617	rab18a	93	84.817	ENSGAFG00000002790	rab18a	100	84.314	Gambusia_affinis
ENSACIG00000009617	rab18a	100	74.272	ENSGAGG00000015642	-	100	74.272	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000009617	rab18a	100	98.333	ENSHBUG00000001518	rab18a	100	98.333	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000009617	rab18a	99	85.222	ENSLBEG00000005861	rab18a	95	85.222	Labrus_bergylta
ENSACIG00000009617	rab18a	92	76.316	ENSLACG00000009310	rab18a	100	75.243	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000009617	rab18a	100	77.561	ENSLOCG00000007491	rab18a	100	77.561	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000009617	rab18a	100	93.333	ENSMAMG00000014320	rab18a	100	93.333	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000009617	rab18a	100	97.778	ENSMZEG00005017235	rab18a	100	97.778	Maylandia_zebra
ENSACIG00000009617	rab18a	100	96.111	ENSMALG00000009813	rab18a	100	96.111	Monopterus_albus
ENSACIG00000009617	rab18a	100	98.333	ENSNBRG00000013507	rab18a	100	98.333	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000009617	rab18a	100	85.294	ENSORLG00000004624	rab18a	100	85.294	Oryzias_latipes
ENSACIG00000009617	rab18a	100	85.784	ENSORLG00020008333	rab18a	100	85.784	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000009617	rab18a	93	84.375	ENSORLG00015004739	rab18a	100	84.804	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000009617	rab18a	100	85.784	ENSOMEG00000020605	rab18a	100	85.784	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000009617	rab18a	100	77.073	ENSPKIG00000009825	rab18a	100	77.073	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000009617	rab18a	100	82.353	ENSPMGG00000020409	-	100	82.353	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000009617	rab18a	93	84.817	ENSPFOG00000007571	rab18a	100	84.314	Poecilia_formosa
ENSACIG00000009617	rab18a	93	84.817	ENSPLAG00000010104	rab18a	100	84.314	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000009617	rab18a	93	84.817	ENSPMEG00000013085	rab18a	100	84.314	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000009617	rab18a	93	84.817	ENSPREG00000005923	rab18a	83	84.314	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000009617	rab18a	100	86.765	ENSPNYG00000007064	rab18a	100	86.765	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000009617	rab18a	98	71.144	ENSPNAG00000011548	rab18a	100	71.144	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000009617	rab18a	100	79.512	ENSSFOG00015017444	rab18a	84	79.512	Scleropages_formosus
ENSACIG00000009617	rab18a	93	92.899	ENSSMAG00000002969	rab18a	100	92.818	Scophthalmus_maximus
ENSACIG00000009617	rab18a	93	95.833	ENSSDUG00000003823	rab18a	100	95.556	Seriola_dumerili
ENSACIG00000009617	rab18a	93	95.833	ENSSLDG00000006977	rab18a	100	95.556	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACIG00000009617	rab18a	92	77.249	ENSSPUG00000017677	-	100	75.728	Sphenodon_punctatus
ENSACIG00000009617	rab18a	100	82.353	ENSTRUG00000004984	rab18a	100	82.353	Takifugu_rubripes
ENSACIG00000009617	rab18a	100	75.728	ENSUMAG00000015574	-	100	75.728	Ursus_maritimus
ENSACIG00000009617	rab18a	100	75.728	ENSXETG00000004556	rab18	100	76.214	Xenopus_tropicalis
ENSACIG00000009617	rab18a	93	85.340	ENSXMAG00000024122	rab18a	100	84.804	Xiphophorus_maculatus