EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000009717 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 28906 bases
Position: chrCCOE01001608.1:326467-355372
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

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ENSACIP00000012479	zf-C2H2	PF00096.26	4.4e-29	5	5
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ENSACIP00000012479	zf-met	PF12874.7	3e-20	4	4

Transcripts

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Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000009717	-	92	46.847	ENSACIG00000004745	-	95	46.842
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ENSACIG00000009717	-	89	37.333	ENSACIG00000013508	ZNF384	52	34.524
ENSACIG00000009717	-	83	39.416	ENSACIG00000020938	zbtb47b	86	42.105
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ENSACIG00000009717	-	86	37.705	ENSACIG00000001369	-	90	37.705
ENSACIG00000009717	-	85	47.917	ENSACIG00000019447	-	68	47.917
ENSACIG00000009717	-	99	49.749	ENSACIG00000010647	-	97	58.549
ENSACIG00000009717	-	95	56.183	ENSACIG00000023212	-	93	54.922
ENSACIG00000009717	-	85	43.421	ENSACIG00000018404	-	82	45.251
ENSACIG00000009717	-	86	33.202	ENSACIG00000014233	znf407	66	32.836
ENSACIG00000009717	-	89	46.964	ENSACIG00000024444	-	82	41.584
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Orthologs

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ENSACIG00000009717	-	89	44.828	ENSAPOG00000011470	-	69	45.098	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000009717	-	85	50.296	ENSAPOG00000022174	-	90	47.231	Acanthochromis_polyacanthus
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