EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000009780 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 17977 bases
Position: chrCCOE01001608.1:375961-393937
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000012539	zf-C2H2	PF00096.26	1.1e-32	1	6
ENSACIP00000012539	zf-C2H2	PF00096.26	1.1e-32	2	6
ENSACIP00000012539	zf-C2H2	PF00096.26	1.1e-32	3	6
ENSACIP00000012539	zf-C2H2	PF00096.26	1.1e-32	4	6
ENSACIP00000012539	zf-C2H2	PF00096.26	1.1e-32	5	6
ENSACIP00000012539	zf-C2H2	PF00096.26	1.1e-32	6	6
ENSACIP00000012539	zf-met	PF12874.7	1.1e-14	1	3
ENSACIP00000012539	zf-met	PF12874.7	1.1e-14	2	3
ENSACIP00000012539	zf-met	PF12874.7	1.1e-14	3	3

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000012891	-	858	-	ENSACIP00000012539	285 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000009780	-	87	35.821	ENSACIG00000018641	snai2	62	35.849
ENSACIG00000009780	-	92	53.535	ENSACIG00000003754	-	82	53.535
ENSACIG00000009780	-	91	47.236	ENSACIG00000019710	-	76	47.236
ENSACIG00000009780	-	71	54.070	ENSACIG00000018440	-	96	54.070
ENSACIG00000009780	-	99	56.561	ENSACIG00000010647	-	99	56.561
ENSACIG00000009780	-	87	44.015	ENSACIG00000016944	-	90	45.833
ENSACIG00000009780	-	96	45.178	ENSACIG00000019791	-	94	47.179
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ENSACIG00000009780	-	73	35.323	ENSACIG00000014233	znf407	66	35.323
ENSACIG00000009780	-	89	51.515	ENSACIG00000004041	-	96	51.020
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ENSACIG00000009780	-	94	55.385	ENSACIG00000017050	-	98	55.556
ENSACIG00000009780	-	71	43.137	ENSACIG00000015411	-	82	43.137
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ENSACIG00000009780	-	90	54.945	ENSACIG00000017647	-	90	53.535
ENSACIG00000009780	-	71	44.809	ENSACIG00000017644	-	88	44.809
ENSACIG00000009780	-	85	40.580	ENSACIG00000016117	-	88	40.580
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ENSACIG00000009780	-	85	48.500	ENSACIG00000004626	-	91	48.990
ENSACIG00000009780	-	85	51.795	ENSACIG00000010966	-	51	53.810
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ENSACIG00000009780	-	95	46.789	ENSACIG00000006172	-	90	48.980
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ENSACIG00000009780	-	73	45.882	ENSACIG00000007034	-	79	45.882
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ENSACIG00000009780	-	86	47.809	ENSACIG00000006806	-	60	48.548
ENSACIG00000009780	-	71	38.095	ENSACIG00000009443	-	65	38.095
ENSACIG00000009780	-	73	47.191	ENSACIG00000012084	-	99	50.588
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ENSACIG00000009780	-	89	44.531	ENSACIG00000009128	-	80	44.531
ENSACIG00000009780	-	61	46.774	ENSACIG00000008886	znf1164	80	46.774
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ENSACIG00000009780	-	77	42.169	ENSACIG00000012263	znf319b	88	40.000
ENSACIG00000009780	-	74	42.941	ENSACIG00000017683	-	77	41.781
ENSACIG00000009780	-	71	44.828	ENSACIG00000001369	-	82	36.574
ENSACIG00000009780	-	74	46.328	ENSACIG00000017013	-	52	46.328
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ENSACIG00000009780	-	68	46.774	ENSACIG00000010660	-	91	46.269
ENSACIG00000009780	-	95	47.727	ENSACIG00000023794	-	72	48.691
ENSACIG00000009780	-	83	57.806	ENSACIG00000009809	si:dkey-77f5.14	78	57.806
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ENSACIG00000009780	-	94	50.510	ENSACIG00000022293	-	97	50.510
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ENSACIG00000009780	-	90	37.818	ENSACIG00000022625	-	87	46.154
ENSACIG00000009780	-	91	47.368	ENSACIG00000016932	-	62	47.368
ENSACIG00000009780	-	93	55.102	ENSACIG00000019102	-	50	55.102
ENSACIG00000009780	-	92	49.296	ENSACIG00000023162	-	75	49.296
ENSACIG00000009780	-	75	43.220	ENSACIG00000023313	-	91	43.220
ENSACIG00000009780	-	93	48.639	ENSACIG00000011515	-	76	54.872
ENSACIG00000009780	-	82	37.234	ENSACIG00000011516	-	84	37.234
ENSACIG00000009780	-	92	55.147	ENSACIG00000008448	-	89	55.147
ENSACIG00000009780	-	73	42.012	ENSACIG00000000406	prdm5	70	42.012
ENSACIG00000009780	-	85	42.081	ENSACIG00000015429	-	90	57.143

Orthologs

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ENSACIG00000009780	-	80	53.191	ENSAPOG00000022273	-	55	53.191	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000009780	-	94	50.831	ENSAPOG00000022007	-	63	50.498	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000009780	-	91	49.180	ENSAPOG00000018490	-	50	50.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000009780	-	74	51.515	ENSAPOG00000022267	-	65	49.333	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000009780	-	83	49.367	ENSAPOG00000021367	-	61	48.897	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000009780	-	75	45.960	ENSAPOG00000003193	znf1056	88	45.960	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000009780	-	93	54.412	ENSAPOG00000021997	-	76	54.412	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000009780	-	83	50.833	ENSAOCG00000017588	-	59	49.815	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000009780	-	75	45.960	ENSAOCG00000003494	si:dkey-7i4.5	92	45.960	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000009780	-	94	55.621	ENSAOCG00000010498	-	69	55.621	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000009780	-	94	44.245	ENSAOCG00000012829	-	56	49.268	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000009780	-	82	53.191	ENSAOCG00000007146	-	59	53.191	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000009780	-	93	53.922	ENSAOCG00000000655	-	71	53.922	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000009780	-	94	44.245	ENSAPEG00000018332	-	56	49.268	Amphiprion_percula
ENSACIG00000009780	-	90	53.237	ENSAPEG00000011646	-	59	53.237	Amphiprion_percula
ENSACIG00000009780	-	94	56.566	ENSAPEG00000012243	-	89	57.143	Amphiprion_percula
ENSACIG00000009780	-	94	55.000	ENSAPEG00000013113	-	66	55.000	Amphiprion_percula
ENSACIG00000009780	-	94	44.245	ENSAPEG00000018316	-	56	49.268	Amphiprion_percula
ENSACIG00000009780	-	97	52.475	ENSAPEG00000012963	-	78	55.102	Amphiprion_percula
ENSACIG00000009780	-	85	51.741	ENSAPEG00000013088	-	92	51.485	Amphiprion_percula
ENSACIG00000009780	-	75	45.960	ENSAPEG00000004427	si:ch73-144d13.7	91	45.960	Amphiprion_percula
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