EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000009811 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 9218 bases
Position: chrCCOE01000256.1:298740-307957
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000012556	MMR_HSR1	PF01926.23	4.1e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000012909	-	711	-	ENSACIP00000012556	236 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000009811	-	83	36.098	ENSACIG00000008045	-	75	36.098
ENSACIG00000009811	-	80	32.143	ENSACIG00000014634	zgc:113625	80	32.524
ENSACIG00000009811	-	81	35.961	ENSACIG00000023381	-	76	36.453
ENSACIG00000009811	-	78	32.292	ENSACIG00000002950	-	50	32.292
ENSACIG00000009811	-	87	34.722	ENSACIG00000007466	-	63	34.722
ENSACIG00000009811	-	83	33.990	ENSACIG00000014745	-	89	33.990
ENSACIG00000009811	-	83	34.975	ENSACIG00000022366	-	71	34.975
ENSACIG00000009811	-	85	34.300	ENSACIG00000022362	-	72	34.300
ENSACIG00000009811	-	82	33.498	ENSACIG00000012707	-	75	33.498
ENSACIG00000009811	-	86	35.514	ENSACIG00000014662	-	83	35.514
ENSACIG00000009811	-	79	36.082	ENSACIG00000001070	-	68	36.082
ENSACIG00000009811	-	83	33.824	ENSACIG00000014716	-	79	33.824
ENSACIG00000009811	-	73	32.609	ENSACIG00000003050	-	77	32.609
ENSACIG00000009811	-	82	33.166	ENSACIG00000016888	-	64	33.166
ENSACIG00000009811	-	80	31.313	ENSACIG00000020234	-	67	31.313
ENSACIG00000009811	-	69	35.196	ENSACIG00000012204	-	72	35.196
ENSACIG00000009811	-	84	33.981	ENSACIG00000014690	-	78	33.981
ENSACIG00000009811	-	88	30.415	ENSACIG00000007178	-	74	30.415
ENSACIG00000009811	-	81	32.000	ENSACIG00000005223	-	74	32.000
ENSACIG00000009811	-	82	34.123	ENSACIG00000005587	-	71	34.123
ENSACIG00000009811	-	73	36.464	ENSACIG00000007737	-	70	37.368
ENSACIG00000009811	-	79	33.846	ENSACIG00000020244	-	80	33.846
ENSACIG00000009811	-	72	34.659	ENSACIG00000000976	-	86	34.659
ENSACIG00000009811	-	80	33.990	ENSACIG00000005780	-	58	33.990
ENSACIG00000009811	-	86	31.579	ENSACIG00000004040	-	79	31.579
ENSACIG00000009811	-	80	34.694	ENSACIG00000014646	zgc:113625	75	34.694
ENSACIG00000009811	-	75	34.426	ENSACIG00000015088	-	72	34.426
ENSACIG00000009811	-	80	38.119	ENSACIG00000003582	-	63	37.864
ENSACIG00000009811	-	75	30.729	ENSACIG00000012061	-	56	30.729
ENSACIG00000009811	-	78	36.598	ENSACIG00000016635	-	71	36.598
ENSACIG00000009811	-	78	34.171	ENSACIG00000019149	-	57	34.673
ENSACIG00000009811	-	95	32.035	ENSACIG00000007158	-	64	32.035
ENSACIG00000009811	-	71	32.955	ENSACIG00000022374	-	88	32.955
ENSACIG00000009811	-	81	35.859	ENSACIG00000022377	-	70	35.859
ENSACIG00000009811	-	88	34.211	ENSACIG00000022370	-	79	34.199
ENSACIG00000009811	-	70	31.953	ENSACIG00000000631	-	58	31.953
ENSACIG00000009811	-	86	34.135	ENSACIG00000008001	-	82	38.660
ENSACIG00000009811	-	66	34.731	ENSACIG00000012761	-	70	34.731
ENSACIG00000009811	-	81	35.149	ENSACIG00000001455	-	71	35.149
ENSACIG00000009811	-	83	32.512	ENSACIG00000014703	-	81	32.512
ENSACIG00000009811	-	81	31.443	ENSACIG00000020225	-	65	31.443
ENSACIG00000009811	-	78	35.859	ENSACIG00000006484	-	57	35.859
ENSACIG00000009811	-	89	32.143	ENSACIG00000007494	-	69	32.589
ENSACIG00000009811	-	82	42.784	ENSACIG00000007725	-	71	42.784
ENSACIG00000009811	-	81	34.518	ENSACIG00000005573	-	85	34.518
ENSACIG00000009811	-	78	34.375	ENSACIG00000004245	-	68	33.838
ENSACIG00000009811	-	78	35.602	ENSACIG00000022355	-	64	35.602
ENSACIG00000009811	-	80	31.980	ENSACIG00000012714	-	64	31.980
ENSACIG00000009811	-	83	32.843	ENSACIG00000012718	-	83	32.843
ENSACIG00000009811	-	78	35.638	ENSACIG00000019524	-	77	35.638
ENSACIG00000009811	-	86	32.701	ENSACIG00000014655	-	77	32.701
ENSACIG00000009811	-	87	37.089	ENSACIG00000014680	-	90	37.089
ENSACIG00000009811	-	81	33.000	ENSACIG00000022222	-	62	33.000
ENSACIG00000009811	-	75	33.696	ENSACIG00000008666	-	86	33.696
ENSACIG00000009811	-	81	36.041	ENSACIG00000006503	-	60	36.041
ENSACIG00000009811	-	80	36.041	ENSACIG00000002263	-	69	36.548
ENSACIG00000009811	-	83	33.168	ENSACIG00000016502	-	85	33.168
ENSACIG00000009811	-	83	38.384	ENSACIG00000000893	-	79	38.384
ENSACIG00000009811	-	80	36.548	ENSACIG00000006478	-	72	36.548
ENSACIG00000009811	-	77	36.126	ENSACIG00000012648	-	62	36.126
ENSACIG00000009811	-	79	35.638	ENSACIG00000001596	-	74	35.638
ENSACIG00000009811	-	79	31.122	ENSACIG00000007191	-	53	31.122

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000009811	-	77	40.659	ENSAOCG00000003425	-	68	40.659	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000009811	-	80	41.935	ENSAOCG00000004579	-	77	41.899	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000009811	-	90	40.659	ENSAPEG00000001491	-	60	40.659	Amphiprion_percula
ENSACIG00000009811	-	78	41.935	ENSAPEG00000014403	-	61	41.935	Amphiprion_percula
ENSACIG00000009811	-	79	43.085	ENSATEG00000015654	-	66	43.085	Anabas_testudineus
ENSACIG00000009811	-	86	41.748	ENSATEG00000023053	-	88	41.748	Anabas_testudineus
ENSACIG00000009811	-	86	41.451	ENSACLG00000014795	-	68	41.451	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000009811	-	80	47.283	ENSAMXG00000021387	-	61	47.283	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000009811	-	84	39.801	ENSAMXG00000019109	-	84	39.801	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000009811	-	83	44.898	ENSAMXG00000006064	-	73	44.898	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000009811	-	80	42.162	ENSAMXG00000033117	-	81	34.921	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000009811	-	85	35.407	ENSAMXG00000026085	-	76	35.514	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000009811	-	75	34.807	ENSAMXG00000009216	-	86	34.807	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000009811	-	84	46.486	ENSAMXG00000030744	-	78	46.486	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000009811	-	88	39.604	ENSCSEG00000021519	-	75	46.078	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000009811	-	77	42.308	ENSCVAG00000003054	-	63	42.308	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000009811	-	87	36.792	ENSCVAG00000005778	-	74	36.792	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000009811	-	85	37.981	ENSCVAG00000012268	-	67	37.981	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000009811	-	82	37.245	ENSDARG00000102683	CR626941.1	74	37.245	Danio_rerio
ENSACIG00000009811	-	88	44.041	ENSDARG00000063481	si:ch211-214j24.15	61	42.584	Danio_rerio
ENSACIG00000009811	-	86	30.392	ENSELUG00000003217	-	85	30.392	Esox_lucius
ENSACIG00000009811	-	81	34.375	ENSELUG00000018709	-	58	34.555	Esox_lucius
ENSACIG00000009811	-	80	49.206	ENSELUG00000018192	-	90	49.206	Esox_lucius
ENSACIG00000009811	-	78	50.270	ENSELUG00000024502	-	68	50.270	Esox_lucius
ENSACIG00000009811	-	77	45.055	ENSFHEG00000023334	-	71	45.055	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000009811	-	76	37.853	ENSFHEG00000020783	-	80	37.853	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000009811	-	76	45.556	ENSGMOG00000001626	-	100	45.556	Gadus_morhua
ENSACIG00000009811	-	83	34.831	ENSGAFG00000020826	-	86	34.831	Gambusia_affinis
ENSACIG00000009811	-	78	40.331	ENSHBUG00000008326	-	87	40.331	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000009811	-	98	73.593	ENSHBUG00000001242	-	59	79.808	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000009811	-	81	41.753	ENSHBUG00000016284	-	90	41.753	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000009811	-	80	35.025	ENSIPUG00000013342	-	63	35.025	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000009811	-	87	70.388	ENSKMAG00000014605	-	67	70.388	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000009811	-	75	45.946	ENSKMAG00000014764	-	76	45.946	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000009811	-	83	41.270	ENSKMAG00000004774	-	66	43.386	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000009811	-	77	42.308	ENSKMAG00000009600	-	71	40.000	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000009811	-	78	40.541	ENSLBEG00000019652	-	64	42.703	Labrus_bergylta
ENSACIG00000009811	-	80	43.915	ENSLOCG00000000517	-	59	43.684	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000009811	-	80	44.737	ENSLOCG00000000385	-	62	44.503	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000009811	-	78	47.027	ENSLOCG00000012075	-	84	47.027	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000009811	-	78	44.865	ENSLOCG00000016496	-	53	44.865	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000009811	-	80	43.684	ENSLOCG00000000082	-	71	43.455	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000009811	-	75	46.961	ENSLOCG00000017852	-	67	46.961	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000009811	-	80	46.316	ENSLOCG00000018072	-	77	46.316	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000009811	-	85	41.429	ENSMAMG00000015600	-	70	41.429	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000009811	-	86	37.745	ENSMAMG00000021970	-	89	37.745	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000009811	-	75	45.810	ENSMAMG00000021969	-	51	45.810	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000009811	-	76	46.995	ENSMMOG00000012876	-	57	46.995	Mola_mola
ENSACIG00000009811	-	77	38.830	ENSMMOG00000016864	-	71	39.894	Mola_mola
ENSACIG00000009811	-	98	31.064	ENSMMOG00000016860	-	72	31.064	Mola_mola
ENSACIG00000009811	-	80	41.270	ENSNBRG00000002136	-	65	41.270	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000009811	-	78	45.652	ENSORLG00000002031	-	57	45.652	Oryzias_latipes
ENSACIG00000009811	-	81	42.308	ENSORLG00000002537	-	58	42.308	Oryzias_latipes
ENSACIG00000009811	-	87	39.378	ENSORLG00020011284	-	78	39.378	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000009811	-	88	45.652	ENSORLG00020008286	-	75	45.652	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000009811	-	75	34.637	ENSORLG00020017387	-	77	34.637	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000009811	-	78	45.652	ENSORLG00020008323	-	57	45.652	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000009811	-	81	42.308	ENSORLG00015004110	-	58	42.308	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000009811	-	78	45.109	ENSORLG00015004522	-	55	45.109	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000009811	-	80	33.333	ENSORLG00015023234	-	95	33.333	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000009811	-	92	44.086	ENSOMEG00000010594	-	83	44.134	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000009811	-	90	42.857	ENSOMEG00000020433	-	77	42.857	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000009811	-	80	51.053	ENSPKIG00000017193	-	82	51.053	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000009811	-	83	48.241	ENSPKIG00000017688	-	71	48.241	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000009811	-	80	39.378	ENSPMGG00000017993	-	77	39.378	Periophthalmus_magnuspinnatus
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