EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000009814 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 9321 bases
Position: chrCCOE01000045.1:21767-31087
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000012572	MMR_HSR1	PF01926.23	2.1e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000012925	-	1629	-	ENSACIP00000012572	542 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000009814	-	85	59.787	ENSACIG00000022269	-	80	59.787
ENSACIG00000009814	-	85	37.821	ENSACIG00000002240	-	87	37.821
ENSACIG00000009814	-	86	36.743	ENSACIG00000003888	-	89	36.743
ENSACIG00000009814	-	85	34.461	ENSACIG00000012148	-	86	34.672
ENSACIG00000009814	-	85	35.256	ENSACIG00000014982	-	88	35.256
ENSACIG00000009814	-	87	36.798	ENSACIG00000021449	-	88	36.798
ENSACIG00000009814	-	84	36.403	ENSACIG00000008585	-	90	36.403
ENSACIG00000009814	-	84	37.931	ENSACIG00000021889	-	83	37.931
ENSACIG00000009814	-	87	38.809	ENSACIG00000023726	-	90	38.809
ENSACIG00000009814	-	85	35.181	ENSACIG00000014961	-	85	35.181
ENSACIG00000009814	-	84	33.836	ENSACIG00000008246	-	83	33.766
ENSACIG00000009814	-	85	78.423	ENSACIG00000022228	-	82	78.423
ENSACIG00000009814	-	85	35.593	ENSACIG00000014898	-	85	35.593
ENSACIG00000009814	-	85	39.019	ENSACIG00000001022	-	87	39.019
ENSACIG00000009814	-	85	76.715	ENSACIG00000009923	-	78	77.547
ENSACIG00000009814	-	86	35.892	ENSACIG00000010569	-	89	35.892
ENSACIG00000009814	-	85	35.181	ENSACIG00000014973	-	87	35.181
ENSACIG00000009814	-	85	38.478	ENSACIG00000008256	-	87	38.478
ENSACIG00000009814	-	84	36.966	ENSACIG00000021882	-	87	36.864
ENSACIG00000009814	-	85	38.866	ENSACIG00000003168	-	88	38.866
ENSACIG00000009814	-	63	38.418	ENSACIG00000023712	-	88	38.418

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000009814	-	84	34.335	ENSAPOG00000021040	-	77	34.335	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000009814	-	88	34.350	ENSAPOG00000005749	-	89	34.350	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000009814	-	89	34.940	ENSAPOG00000005726	-	91	34.940	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000009814	-	80	66.446	ENSAPOG00000016636	-	90	67.329	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000009814	-	84	36.774	ENSAPEG00000000062	-	88	36.774	Amphiprion_percula
ENSACIG00000009814	-	82	37.527	ENSATEG00000012558	-	84	37.527	Anabas_testudineus
ENSACIG00000009814	-	79	35.227	ENSATEG00000017635	-	80	35.227	Anabas_testudineus
ENSACIG00000009814	-	82	37.473	ENSATEG00000019965	-	84	37.473	Anabas_testudineus
ENSACIG00000009814	-	84	36.188	ENSATEG00000023346	-	85	36.188	Anabas_testudineus
ENSACIG00000009814	-	85	36.709	ENSACLG00000021761	-	86	36.709	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000009814	-	62	39.031	ENSACLG00000015361	-	86	39.031	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000009814	-	52	40.690	ENSACLG00000006285	-	50	40.690	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000009814	-	85	76.446	ENSACLG00000023468	-	82	77.066	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000009814	-	86	69.684	ENSACLG00000023126	-	91	69.684	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000009814	-	78	44.485	ENSACLG00000017259	-	69	44.485	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000009814	-	50	41.516	ENSACLG00000009330	-	57	41.516	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000009814	-	84	36.842	ENSACLG00000018271	-	86	36.842	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000009814	-	83	35.590	ENSACLG00000006543	-	83	35.345	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000009814	-	81	42.414	ENSACLG00000006538	-	82	42.414	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000009814	-	84	33.906	ENSACLG00000018599	-	88	33.906	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000009814	-	62	75.637	ENSACLG00000023033	-	90	75.637	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000009814	-	88	37.339	ENSACLG00000009261	-	91	37.339	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000009814	-	87	37.810	ENSACLG00000010007	-	71	38.223	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000009814	-	82	35.217	ENSAMXG00000037920	-	87	35.619	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000009814	-	84	34.534	ENSAMXG00000039672	-	90	34.746	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000009814	-	85	35.967	ENSAMXG00000033407	-	90	36.175	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000009814	-	82	36.134	ENSAMXG00000034407	-	85	36.632	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000009814	-	85	31.501	ENSAMXG00000041770	-	87	31.501	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000009814	-	84	47.046	ENSAMXG00000036353	-	83	47.468	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000009814	-	84	46.328	ENSAMXG00000030535	-	82	46.328	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000009814	-	83	38.559	ENSAMXG00000029346	-	88	38.958	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000009814	-	82	34.927	ENSAMXG00000032695	-	87	34.927	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000009814	-	88	46.774	ENSAMXG00000035937	-	89	46.774	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000009814	-	79	33.185	ENSCVAG00000013384	-	91	34.286	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000009814	-	85	37.447	ENSCVAG00000007831	-	90	37.447	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000009814	-	83	34.205	ENSCVAG00000000224	-	77	34.136	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000009814	-	85	63.368	ENSCVAG00000015205	-	86	63.368	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000009814	-	89	35.031	ENSCVAG00000008134	-	89	35.031	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000009814	-	65	39.945	ENSCVAG00000014791	-	98	39.945	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000009814	-	85	36.998	ENSCVAG00000008127	-	89	36.998	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000009814	-	82	40.305	ENSCVAG00000005819	-	98	40.305	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000009814	-	85	37.209	ENSCVAG00000007269	-	88	37.209	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000009814	-	83	51.948	ENSCVAG00000008633	-	86	52.381	Cyprinodon_variegatus
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ENSACIG00000009814	-	85	51.983	ENSEBUG00000008009	zgc:171695	83	51.983	Eptatretus_burgeri
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ENSACIG00000009814	-	89	34.706	ENSFHEG00000006425	-	95	34.902	Fundulus_heteroclitus
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ENSACIG00000009814	-	86	37.053	ENSFHEG00000006403	-	89	37.053	Fundulus_heteroclitus
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ENSACIG00000009814	-	84	35.914	ENSFHEG00000006430	-	88	35.914	Fundulus_heteroclitus
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ENSACIG00000009814	-	89	34.553	ENSFHEG00000006411	-	89	34.553	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000009814	-	83	34.565	ENSFHEG00000006408	-	88	34.565	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000009814	-	81	34.967	ENSFHEG00000016342	-	88	34.967	Fundulus_heteroclitus
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ENSACIG00000009814	-	84	53.043	ENSGMOG00000011319	-	90	53.043	Gadus_morhua
ENSACIG00000009814	-	84	54.237	ENSGMOG00000019825	-	98	54.873	Gadus_morhua
ENSACIG00000009814	-	85	57.233	ENSGMOG00000017552	-	81	57.233	Gadus_morhua
ENSACIG00000009814	-	85	59.081	ENSGMOG00000005680	-	84	57.631	Gadus_morhua
ENSACIG00000009814	-	85	59.023	ENSGMOG00000019330	-	80	59.023	Gadus_morhua
ENSACIG00000009814	-	66	63.100	ENSGMOG00000019529	-	80	62.500	Gadus_morhua
ENSACIG00000009814	-	84	35.408	ENSGAFG00000005023	-	87	35.408	Gambusia_affinis
ENSACIG00000009814	-	86	36.555	ENSGAFG00000005032	-	87	36.555	Gambusia_affinis
ENSACIG00000009814	-	86	60.373	ENSGACG00000015788	-	81	60.996	Gasterosteus_aculeatus
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