EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSACIG00000010259 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: xpo1a
Alias: im:7151655
Full Name: exportin 1 (CRM1 homolog%2C yeast) a
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 13122 bases
Position: chrCCOE01000048.1:95159-108280
Accession: ZDB-GENE-050309-201
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000013214	CRM1_C	PF08767.11	1.1e-131	1	1
ENSACIP00000013214	Xpo1	PF08389.12	1.8e-39	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000013578	-	2808	-	ENSACIP00000013214	935 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	93.936	ENSACIG00000010818	-	100	93.936

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	92.128	ENSG00000082898	XPO1	88	92.128	Homo_sapiens
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	93.830	ENSAPOG00000004984	-	93	93.830	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	97.005	ENSAPOG00000002354	xpo1a	100	97.005	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	92.872	ENSAMEG00000003460	XPO1	88	92.872	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	93.936	ENSAOCG00000010121	-	100	91.684	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	99.251	ENSAOCG00000018914	xpo1a	88	99.251	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	93.936	ENSAPEG00000007038	-	99	91.791	Amphiprion_percula
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	99.251	ENSAPEG00000006583	xpo1a	96	99.251	Amphiprion_percula
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	98.824	ENSATEG00000020750	xpo1a	98	98.785	Anabas_testudineus
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	93.936	ENSATEG00000008816	-	93	93.936	Anabas_testudineus
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	93.085	ENSAPLG00000004008	XPO1	88	93.085	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	93.085	ENSACAG00000002501	XPO1	88	93.085	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	92.128	ENSANAG00000020802	XPO1	88	92.128	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	93.936	ENSACLG00000015192	-	93	93.936	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	99.465	ENSACLG00000015669	xpo1a	100	99.465	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	93.830	ENSAMXG00000012704	xpo1b	100	91.817	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	93.750	ENSAMXG00000003069	xpo1a	100	93.750	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	92.872	ENSBTAG00000013254	XPO1	88	92.872	Bos_taurus
ENSACIG00000010259	xpo1a	99	52.898	WBGene00002078	xpo-1	91	52.632	Caenorhabditis_elegans
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	92.128	ENSCJAG00000008877	XPO1	88	92.128	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	92.872	ENSCAFG00000003050	XPO1	88	92.872	Canis_familiaris
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	92.872	ENSCAFG00020026910	XPO1	94	92.872	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	92.872	ENSCHIG00000018132	XPO1	88	92.872	Capra_hircus
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	92.872	ENSTSYG00000004330	XPO1	88	92.872	Carlito_syrichta
ENSACIG00000010259	xpo1a	60	88.475	ENSCAPG00000006454	-	100	88.475	Cavia_aperea
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	91.383	ENSCPOG00000034053	XPO1	88	91.383	Cavia_porcellus
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	72.650	ENSCCAG00000037445	XPO1	86	72.862	Cebus_capucinus
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	92.128	ENSCATG00000032674	XPO1	100	92.128	Cercocebus_atys
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	92.660	ENSCLAG00000012953	XPO1	88	92.660	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	92.128	ENSCSAG00000014606	XPO1	88	92.128	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000010259	xpo1a	80	95.000	ENSCHOG00000012088	XPO1	71	95.000	Choloepus_hoffmanni
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	93.085	ENSCPBG00000026239	XPO1	94	93.085	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	81.596	ENSCING00000024562	-	88	81.596	Ciona_intestinalis
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	79.768	ENSCSAVG00000005965	-	88	79.768	Ciona_savignyi
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	87.660	ENSCANG00000028883	XPO1	100	91.844	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	91.915	ENSCGRG00001000263	Xpo1	88	91.915	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	91.915	ENSCGRG00000001520	Xpo1	88	91.915	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	92.553	ENSCSEG00000001693	XPO1	100	92.553	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	93.617	ENSCVAG00000016788	-	88	93.617	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	97.647	ENSCVAG00000016558	xpo1a	88	97.647	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	94.362	ENSDARG00000078041	xpo1a	88	94.362	Danio_rerio
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	94.149	ENSDARG00000063229	xpo1b	88	94.149	Danio_rerio
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	92.979	ENSDNOG00000005805	XPO1	88	92.979	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000010259	xpo1a	90	89.764	ENSDORG00000013050	Xpo1	86	89.764	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	69.477	FBgn0020497	emb	88	69.477	Drosophila_melanogaster
ENSACIG00000010259	xpo1a	93	92.944	ENSETEG00000018045	XPO1	82	92.944	Echinops_telfairi
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	79.065	ENSEBUG00000012580	-	100	86.598	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	92.872	ENSEASG00005007223	XPO1	88	92.872	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	92.872	ENSECAG00000024920	XPO1	94	92.872	Equus_caballus
ENSACIG00000010259	xpo1a	91	93.750	ENSEEUG00000009479	XPO1	80	93.750	Erinaceus_europaeus
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	95.426	ENSELUG00000012707	xpo1a	100	95.426	Esox_lucius
ENSACIG00000010259	xpo1a	99	90.364	ENSELUG00000014306	-	99	90.364	Esox_lucius
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	92.872	ENSFCAG00000002702	XPO1	88	92.872	Felis_catus
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	92.872	ENSFALG00000010989	XPO1	88	92.872	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000010259	xpo1a	99	92.423	ENSFDAG00000014716	XPO1	89	92.423	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000010259	xpo1a	56	94.072	ENSFHEG00000018974	-	100	94.072	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	97.968	ENSFHEG00000002412	xpo1a	88	97.968	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000010259	xpo1a	93	93.135	ENSGMOG00000019063	-	82	93.135	Gadus_morhua
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	94.866	ENSGMOG00000004441	xpo1a	88	94.866	Gadus_morhua
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	93.085	ENSGALG00000029476	XPO1	88	93.085	Gallus_gallus
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	93.723	ENSGAFG00000003355	-	95	93.723	Gambusia_affinis
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	97.968	ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	97.968	Gambusia_affinis
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	93.936	ENSGACG00000002743	-	88	93.936	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	98.075	ENSGACG00000019736	xpo1a	88	98.075	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	92.979	ENSGAGG00000017558	XPO1	88	92.979	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	92.128	ENSGGOG00000034878	XPO1	88	92.128	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	99.465	ENSHBUG00000007128	xpo1a	88	99.465	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	94.043	ENSHBUG00000020037	-	93	94.043	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	92.553	ENSHGLG00000003115	XPO1	88	92.553	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	92.553	ENSHGLG00100012227	XPO1	88	92.553	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	92.766	ENSHCOG00000006949	XPO1	100	92.766	Hippocampus_comes
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	94.149	ENSIPUG00000012891	Xpo1	88	94.149	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	94.787	ENSIPUG00000024394	XPO1	88	94.787	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	92.660	ENSSTOG00000016122	XPO1	88	92.660	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	92.660	ENSJJAG00000020468	Xpo1	88	92.660	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	98.396	ENSKMAG00000004830	xpo1a	88	98.396	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	93.723	ENSKMAG00000016218	-	95	93.723	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	95.527	ENSLBEG00000002104	xpo1a	100	95.527	Labrus_bergylta
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	93.936	ENSLBEG00000005740	-	89	93.810	Labrus_bergylta
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	69.916	ENSLACG00000018213	XPO1	88	69.916	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	93.936	ENSLOCG00000016095	xpo1b	87	93.936	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	92.553	ENSLAFG00000014553	XPO1	88	92.553	Loxodonta_africana
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	92.128	ENSMFAG00000038679	XPO1	88	92.128	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	92.128	ENSMMUG00000006941	XPO1	88	92.128	Macaca_mulatta
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	92.128	ENSMNEG00000030909	XPO1	88	92.128	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	90.148	ENSMLEG00000032004	XPO1	88	90.148	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	98.610	ENSMAMG00000023037	xpo1a	93	98.610	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	93.936	ENSMAMG00000010568	-	99	93.717	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	99.465	ENSMZEG00005005105	xpo1a	88	99.465	Maylandia_zebra
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	93.936	ENSMZEG00005018158	-	95	93.936	Maylandia_zebra
ENSACIG00000010259	xpo1a	77	92.149	ENSMGAG00000001496	-	100	92.149	Meleagris_gallopavo
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	91.915	ENSMAUG00000006769	Xpo1	92	91.915	Mesocricetus_auratus
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	92.872	ENSMICG00000027770	XPO1	88	92.872	Microcebus_murinus
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	91.915	ENSMOCG00000012169	Xpo1	88	91.915	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	98.824	ENSMMOG00000018767	xpo1a	100	98.824	Mola_mola
ENSACIG00000010259	xpo1a	99	93.703	ENSMMOG00000008001	-	99	93.703	Mola_mola
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	91.809	ENSMODG00000002831	XPO1	88	91.809	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	97.024	ENSMALG00000008617	xpo1a	100	97.024	Monopterus_albus
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	93.830	ENSMALG00000007085	-	96	93.703	Monopterus_albus
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	91.915	MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	81.227	Mus_caroli
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	91.915	ENSMUSG00000020290	Xpo1	99	81.227	Mus_musculus
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	91.809	MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	81.227	Mus_pahari
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	91.915	MGP_SPRETEiJ_G0016979	Xpo1	100	81.227	Mus_spretus
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	92.872	ENSMPUG00000005560	XPO1	88	92.872	Mustela_putorius_furo
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	92.766	ENSMLUG00000010670	XPO1	88	92.766	Myotis_lucifugus
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	92.766	ENSNGAG00000022158	Xpo1	88	92.766	Nannospalax_galili
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	99.465	ENSNBRG00000003776	xpo1a	88	99.465	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	94.043	ENSNBRG00000012229	-	100	94.043	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000010259	xpo1a	100	88.017	ENSNLEG00000009680	XPO1	88	88.017	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000010259	xpo1a	58	95.556	ENSMEUG00000013277	-	52	95.556	Notamacropus_eugenii
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ENSACIG00000010259	xpo1a	100	91.860	ENSPSIG00000014457	XPO1	100	92.810	Pelodiscus_sinensis
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ENSACIG00000010259	xpo1a	100	92.234	ENSXETG00000002224	xpo1	88	92.234	Xenopus_tropicalis
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ENSACIG00000010259	xpo1a	100	97.861	ENSXCOG00000011889	XPO1	100	97.861	Xiphophorus_couchianus
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ENSACIG00000010259	xpo1a	100	97.754	ENSXMAG00000005790	xpo1a	88	97.754	Xiphophorus_maculatus