EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000010516 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: rpl9
Alias: ab02c03|fa93a01|mg:ab02c03|wu:fa93a01|zgc:103730
Full Name: ribosomal protein L9
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 3385 bases
Position: chrCCOE01001720.1:511058-514442
Accession: ZDB-GENE-030131-8646
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000013527	Ribosomal_L6	PF00347.23	1.2e-32	1	2
ENSACIP00000013527	Ribosomal_L6	PF00347.23	1.2e-32	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000013896	-	579	-	ENSACIP00000013527	192 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000010516	rpl9	100	86.979	ENSG00000163682	RPL9	100	89.381	Homo_sapiens
ENSACIG00000010516	rpl9	100	94.792	ENSAPOG00000007833	rpl9	98	94.792	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000010516	rpl9	100	86.458	ENSAMEG00000003187	RPL9	100	86.458	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000010516	rpl9	100	72.396	ENSAMEG00000003670	-	100	72.396	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000010516	rpl9	100	63.542	ENSAMEG00000005164	-	100	63.542	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000010516	rpl9	100	94.271	ENSAOCG00000013751	rpl9	100	94.271	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000010516	rpl9	100	94.271	ENSAPEG00000019426	rpl9	100	94.271	Amphiprion_percula
ENSACIG00000010516	rpl9	100	94.792	ENSATEG00000019735	rpl9	100	94.792	Anabas_testudineus
ENSACIG00000010516	rpl9	91	89.143	ENSAPLG00000011712	RPL9	99	89.143	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000010516	rpl9	100	85.938	ENSACAG00000007317	RPL9	100	85.938	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000010516	rpl9	100	86.979	ENSANAG00000027218	RPL9	100	86.979	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000010516	rpl9	83	83.125	ENSANAG00000025368	-	90	82.911	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000010516	rpl9	97	72.043	ENSANAG00000028192	-	98	72.043	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000010516	rpl9	100	80.729	ENSANAG00000023940	-	100	80.729	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000010516	rpl9	85	71.166	ENSANAG00000024659	-	99	71.166	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000010516	rpl9	84	82.099	ENSANAG00000036273	-	90	82.099	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000010516	rpl9	100	97.396	ENSACLG00000015446	rpl9	74	97.396	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000010516	rpl9	99	90.576	ENSAMXG00000041237	rpl9	99	90.576	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000010516	rpl9	100	84.896	ENSBTAG00000045566	-	100	84.896	Bos_taurus
ENSACIG00000010516	rpl9	100	84.896	ENSBTAG00000045678	-	100	84.896	Bos_taurus
ENSACIG00000010516	rpl9	100	86.979	ENSBTAG00000014518	RPL9	100	86.979	Bos_taurus
ENSACIG00000010516	rpl9	100	84.896	ENSBTAG00000048225	-	100	84.896	Bos_taurus
ENSACIG00000010516	rpl9	59	87.611	ENSBTAG00000047946	-	100	87.611	Bos_taurus
ENSACIG00000010516	rpl9	100	85.417	ENSBTAG00000024608	-	100	85.417	Bos_taurus
ENSACIG00000010516	rpl9	100	86.458	ENSBTAG00000030281	-	100	86.458	Bos_taurus
ENSACIG00000010516	rpl9	98	60.106	WBGene00004420	rpl-9	98	60.106	Caenorhabditis_elegans
ENSACIG00000010516	rpl9	87	83.234	ENSCJAG00000022754	-	92	83.234	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000010516	rpl9	100	86.979	ENSCJAG00000000723	RPL9	100	86.979	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000010516	rpl9	100	77.604	ENSCAFG00000000653	-	100	77.604	Canis_familiaris
ENSACIG00000010516	rpl9	100	86.979	ENSCAFG00000016008	RPL9	100	86.979	Canis_familiaris
ENSACIG00000010516	rpl9	100	78.125	ENSCAFG00000015886	-	100	78.125	Canis_familiaris
ENSACIG00000010516	rpl9	100	77.604	ENSCAFG00020002963	-	100	77.604	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000010516	rpl9	100	86.979	ENSCAFG00020002170	RPL9	100	86.979	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000010516	rpl9	85	79.755	ENSCAFG00020013873	-	91	79.755	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000010516	rpl9	100	85.938	ENSCHIG00000011028	-	100	85.938	Capra_hircus
ENSACIG00000010516	rpl9	99	73.822	ENSCHIG00000008212	-	85	73.822	Capra_hircus
ENSACIG00000010516	rpl9	100	85.938	ENSCHIG00000010457	-	100	85.938	Capra_hircus
ENSACIG00000010516	rpl9	100	86.979	ENSCHIG00000011416	-	100	86.979	Capra_hircus
ENSACIG00000010516	rpl9	100	83.854	ENSCHIG00000009159	-	100	83.854	Capra_hircus
ENSACIG00000010516	rpl9	100	73.438	ENSTSYG00000027256	-	99	71.687	Carlito_syrichta
ENSACIG00000010516	rpl9	100	73.958	ENSTSYG00000035529	-	99	72.289	Carlito_syrichta
ENSACIG00000010516	rpl9	100	87.500	ENSTSYG00000033916	-	100	87.500	Carlito_syrichta
ENSACIG00000010516	rpl9	97	82.888	ENSTSYG00000036944	-	97	82.888	Carlito_syrichta
ENSACIG00000010516	rpl9	100	72.396	ENSTSYG00000025699	-	100	72.396	Carlito_syrichta
ENSACIG00000010516	rpl9	100	86.979	ENSCPOG00000004543	RPL9	100	86.979	Cavia_porcellus
ENSACIG00000010516	rpl9	100	84.896	ENSCCAG00000018472	-	100	84.896	Cebus_capucinus
ENSACIG00000010516	rpl9	100	71.354	ENSCCAG00000019338	-	100	71.354	Cebus_capucinus
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ENSACIG00000010516	rpl9	100	83.333	ENSCCAG00000014967	-	100	83.333	Cebus_capucinus
ENSACIG00000010516	rpl9	86	76.970	ENSCATG00000031517	-	100	76.970	Cercocebus_atys
ENSACIG00000010516	rpl9	97	77.005	ENSCATG00000034132	-	92	77.005	Cercocebus_atys
ENSACIG00000010516	rpl9	100	86.979	ENSCATG00000031890	RPL9	100	86.979	Cercocebus_atys
ENSACIG00000010516	rpl9	98	81.481	ENSCATG00000035764	-	100	81.481	Cercocebus_atys
ENSACIG00000010516	rpl9	100	73.958	ENSCATG00000034300	-	100	73.958	Cercocebus_atys
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ENSACIG00000010516	rpl9	100	86.979	ENSCLAG00000001418	-	100	86.979	Chinchilla_lanigera
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ENSACIG00000010516	rpl9	100	86.979	ENSCPBG00000013796	RPL9	100	86.979	Chrysemys_picta_bellii
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ENSACIG00000010516	rpl9	100	82.812	ENSCANG00000008940	-	100	82.812	Colobus_angolensis_palliatus
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ENSACIG00000010516	rpl9	100	86.979	ENSCANG00000004355	-	100	86.979	Colobus_angolensis_palliatus
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ENSACIG00000010516	rpl9	87	70.060	ENSCGRG00000018121	-	100	70.060	Cricetulus_griseus_crigri
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ENSACIG00000010516	rpl9	100	72.396	ENSCGRG00000013050	-	100	72.396	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000010516	rpl9	99	92.105	ENSCSEG00000004845	rpl9	99	92.105	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000010516	rpl9	100	95.312	ENSCVAG00000007241	rpl9	100	95.312	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000010516	rpl9	99	93.194	ENSDARG00000037350	rpl9	99	93.194	Danio_rerio
ENSACIG00000010516	rpl9	100	85.938	ENSDNOG00000007411	-	96	85.938	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000010516	rpl9	100	67.708	ENSDNOG00000012581	-	96	67.708	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000010516	rpl9	67	59.375	ENSDNOG00000032325	-	91	59.375	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000010516	rpl9	90	59.195	ENSDNOG00000004245	-	100	55.155	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000010516	rpl9	100	84.896	ENSDNOG00000045361	-	96	84.896	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000010516	rpl9	97	60.847	ENSDNOG00000035065	-	100	64.162	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000010516	rpl9	100	59.391	ENSDORG00000028406	-	100	59.391	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000010516	rpl9	100	86.458	ENSDORG00000001088	-	100	86.458	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000010516	rpl9	100	61.856	ENSDORG00000026634	-	100	61.856	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000010516	rpl9	100	62.500	FBgn0015756	RpL9	100	62.500	Drosophila_melanogaster
ENSACIG00000010516	rpl9	95	54.098	ENSETEG00000002415	-	96	54.098	Echinops_telfairi
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ENSACIG00000010516	rpl9	93	56.983	ENSETEG00000009761	-	97	56.983	Echinops_telfairi
ENSACIG00000010516	rpl9	100	84.456	ENSETEG00000019049	-	100	84.456	Echinops_telfairi
ENSACIG00000010516	rpl9	100	60.938	ENSETEG00000007167	-	100	60.938	Echinops_telfairi
ENSACIG00000010516	rpl9	97	65.426	ENSEBUG00000007378	rpl9	98	65.426	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000010516	rpl9	100	86.979	ENSEASG00005008233	RPL9	100	86.979	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000010516	rpl9	56	72.222	ENSECAG00000029016	-	95	72.222	Equus_caballus
ENSACIG00000010516	rpl9	100	86.979	ENSECAG00000016489	RPL9	100	86.979	Equus_caballus
ENSACIG00000010516	rpl9	65	74.400	ENSEEUG00000000368	-	100	74.400	Erinaceus_europaeus
ENSACIG00000010516	rpl9	82	85.987	ENSEEUG00000004394	RPL9	100	85.987	Erinaceus_europaeus
ENSACIG00000010516	rpl9	99	89.529	ENSELUG00000007202	rpl9	99	89.529	Esox_lucius
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ENSACIG00000010516	rpl9	100	68.750	ENSFDAG00000020084	-	100	68.750	Fukomys_damarensis
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ENSACIG00000010516	rpl9	100	59.694	ENSFDAG00000015251	-	100	59.694	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000010516	rpl9	100	95.312	ENSFHEG00000008785	rpl9	100	95.312	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000010516	rpl9	98	90.476	ENSGMOG00000001002	rpl9	100	90.476	Gadus_morhua
ENSACIG00000010516	rpl9	100	86.979	ENSGALG00000000150	RPL9	100	86.979	Gallus_gallus
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ENSACIG00000010516	rpl9	100	92.188	ENSGACG00000016153	rpl9	100	92.188	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000010516	rpl9	100	85.938	ENSGAGG00000011775	RPL9	100	85.938	Gopherus_agassizii
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ENSACIG00000010516	rpl9	100	73.438	ENSGGOG00000024529	-	93	78.344	Gorilla_gorilla
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ENSACIG00000010516	rpl9	99	93.194	ENSIPUG00000003557	rpl9	99	93.194	Ictalurus_punctatus
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ENSACIG00000010516	rpl9	99	90.576	ENSLACG00000006034	RPL9	98	90.576	Latimeria_chalumnae
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ENSACIG00000010516	rpl9	54	78.846	MGP_SPRETEiJ_G0017725	-	54	78.846	Mus_spretus
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