EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000010538 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 1152 bases
Position: chrCCOE01004978.1:1-1152
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000013529	RVT_1	PF00078.27	6.1e-45	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000013898	-	1152	-	ENSACIP00000013529	384 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000010538	-	92	32.033	ENSACIG00000020856	-	75	32.033
ENSACIG00000010538	-	79	31.613	ENSACIG00000020849	-	79	31.613

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000010538	-	72	37.681	ENSAPOG00000014771	-	69	37.681	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000010538	-	99	36.031	ENSAPOG00000001366	-	91	36.031	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000010538	-	71	42.182	ENSAPOG00000015742	-	86	42.182	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000010538	-	91	40.395	ENSAOCG00000019069	-	95	40.395	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000010538	-	95	34.054	ENSAOCG00000014605	-	73	34.054	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000010538	-	75	36.923	ENSAOCG00000006855	-	78	36.923	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000010538	-	98	38.462	ENSAOCG00000012592	-	80	38.462	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000010538	-	79	46.078	ENSAOCG00000000894	-	91	46.078	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000010538	-	73	31.338	ENSATEG00000019721	-	73	31.338	Anabas_testudineus
ENSACIG00000010538	-	69	41.948	ENSACAG00000010816	-	75	41.948	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000010538	-	86	31.437	ENSACLG00000011319	-	86	31.437	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000010538	-	93	41.209	ENSACLG00000012857	-	99	41.209	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000010538	-	96	37.366	ENSACLG00000013571	-	91	37.366	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000010538	-	99	30.311	ENSACLG00000015899	-	51	30.311	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000010538	-	60	46.320	ENSACLG00000010837	-	57	46.320	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000010538	-	68	40.840	ENSAMXG00000041014	-	99	40.840	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000010538	-	70	39.777	ENSAMXG00000040763	-	68	39.777	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000010538	-	82	30.159	ENSAMXG00000038901	-	65	30.159	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000010538	-	87	30.357	ENSAMXG00000035718	-	64	30.357	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000010538	-	53	34.146	ENSCPBG00000017828	-	55	34.146	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000010538	-	87	34.132	ENSCVAG00000020933	-	74	34.132	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000010538	-	95	38.798	ENSCVAG00000018360	-	88	38.798	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000010538	-	80	31.068	ENSELUG00000000386	-	67	30.769	Esox_lucius
ENSACIG00000010538	-	92	31.638	ENSELUG00000014378	-	84	31.638	Esox_lucius
ENSACIG00000010538	-	81	33.333	ENSGAGG00000013921	-	83	33.333	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000010538	-	97	38.992	ENSHBUG00000007736	-	90	38.992	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000010538	-	57	33.182	ENSIPUG00000010242	-	58	33.182	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000010538	-	96	37.568	ENSKMAG00000014393	-	87	37.568	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000010538	-	99	34.805	ENSLBEG00000015758	-	57	34.805	Labrus_bergylta
ENSACIG00000010538	-	74	38.144	ENSLBEG00000004148	-	60	38.144	Labrus_bergylta
ENSACIG00000010538	-	84	53.106	ENSLBEG00000020242	-	88	53.106	Labrus_bergylta
ENSACIG00000010538	-	84	37.152	ENSLBEG00000023714	-	86	37.152	Labrus_bergylta
ENSACIG00000010538	-	96	39.837	ENSMZEG00005011529	-	69	39.837	Maylandia_zebra
ENSACIG00000010538	-	54	49.515	ENSMZEG00005006211	-	51	49.515	Maylandia_zebra
ENSACIG00000010538	-	74	41.404	ENSMZEG00005016362	-	100	41.404	Maylandia_zebra
ENSACIG00000010538	-	96	39.837	ENSMZEG00005017030	-	70	39.837	Maylandia_zebra
ENSACIG00000010538	-	51	40.909	ENSNBRG00000003891	-	98	40.909	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000010538	-	89	36.257	ENSNBRG00000000972	-	84	36.257	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000010538	-	92	30.141	ENSNBRG00000001934	-	75	30.141	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000010538	-	65	58.167	ENSNBRG00000013792	-	73	58.167	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000010538	-	74	30.314	ENSNBRG00000022130	-	68	30.314	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000010538	-	99	36.031	ENSNBRG00000012595	-	87	36.031	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000010538	-	81	39.748	ENSORLG00000028454	-	99	39.748	Oryzias_latipes
ENSACIG00000010538	-	82	39.172	ENSORLG00000024236	-	83	39.172	Oryzias_latipes
ENSACIG00000010538	-	87	42.136	ENSORLG00000023713	-	86	42.136	Oryzias_latipes
ENSACIG00000010538	-	70	43.116	ENSORLG00000028706	-	55	43.116	Oryzias_latipes
ENSACIG00000010538	-	92	34.366	ENSORLG00000024464	-	63	34.366	Oryzias_latipes
ENSACIG00000010538	-	60	40.948	ENSORLG00000028976	-	61	40.948	Oryzias_latipes
ENSACIG00000010538	-	62	42.917	ENSORLG00020022004	-	82	42.917	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000010538	-	64	44.980	ENSORLG00020007779	-	66	44.980	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000010538	-	75	44.251	ENSORLG00020004063	-	82	44.251	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000010538	-	94	38.781	ENSORLG00020014626	-	67	38.781	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000010538	-	64	45.306	ENSORLG00020018629	-	65	45.306	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000010538	-	65	44.314	ENSORLG00020007002	-	98	44.314	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000010538	-	82	39.490	ENSORLG00020014149	-	98	39.490	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000010538	-	77	52.013	ENSORLG00015021848	-	98	52.013	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000010538	-	84	37.615	ENSORLG00015000419	-	92	37.615	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000010538	-	77	56.040	ENSORLG00015008227	-	83	56.040	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000010538	-	64	45.306	ENSORLG00015007703	-	63	45.306	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000010538	-	99	34.456	ENSORLG00015021206	-	73	34.456	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000010538	-	97	55.467	ENSORLG00015020895	-	100	55.467	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000010538	-	78	39.333	ENSORLG00015022393	-	99	39.333	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000010538	-	98	37.076	ENSOMEG00000013211	-	87	37.076	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000010538	-	60	42.424	ENSPKIG00000013511	-	79	42.424	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000010538	-	71	40.000	ENSPKIG00000024018	-	96	40.000	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000010538	-	64	35.156	ENSPMGG00000014421	-	62	35.156	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000010538	-	86	31.928	ENSPLAG00000015080	-	79	31.928	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000010538	-	53	30.144	ENSPMEG00000004673	-	52	30.144	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000010538	-	86	30.655	ENSPREG00000004933	-	83	30.655	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000010538	-	92	32.022	ENSPREG00000010319	-	84	32.022	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000010538	-	92	47.324	ENSPREG00000001352	-	99	47.324	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000010538	-	95	34.521	ENSPREG00000006501	-	64	34.521	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000010538	-	78	54.485	ENSPNYG00000002466	-	100	54.485	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000010538	-	79	51.645	ENSPNYG00000023697	-	71	51.645	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000010538	-	59	37.113	ENSPNAG00000010780	-	59	37.113	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000010538	-	95	30.811	ENSPNAG00000024211	-	77	30.811	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000010538	-	70	41.852	ENSPNAG00000014375	-	66	41.852	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000010538	-	78	32.107	ENSPNAG00000010342	-	96	32.107	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000010538	-	92	39.155	ENSPNAG00000002786	-	86	39.155	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000010538	-	96	49.322	ENSPNAG00000024749	-	86	49.322	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000010538	-	98	32.181	ENSSMAG00000014015	-	76	32.181	Scophthalmus_maximus
ENSACIG00000010538	-	86	34.639	ENSSDUG00000015364	-	71	34.639	Seriola_dumerili
ENSACIG00000010538	-	77	38.591	ENSSDUG00000021791	-	99	38.591	Seriola_dumerili
ENSACIG00000010538	-	63	34.008	ENSSDUG00000017945	-	68	34.008	Seriola_dumerili
ENSACIG00000010538	-	97	34.409	ENSSLDG00000006955	-	89	34.409	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACIG00000010538	-	98	39.523	ENSSPUG00000015446	-	84	39.523	Sphenodon_punctatus
ENSACIG00000010538	-	85	39.091	ENSSPAG00000000151	-	72	39.091	Stegastes_partitus
ENSACIG00000010538	-	90	34.393	ENSSPAG00000012089	-	94	34.393	Stegastes_partitus
ENSACIG00000010538	-	90	30.145	ENSSPAG00000009351	-	59	31.014	Stegastes_partitus
ENSACIG00000010538	-	99	36.623	ENSXETG00000034134	-	52	36.623	Xenopus_tropicalis
ENSACIG00000010538	-	76	49.141	ENSXCOG00000016894	-	86	49.141	Xiphophorus_couchianus
ENSACIG00000010538	-	86	34.320	ENSXMAG00000023211	-	73	34.320	Xiphophorus_maculatus
ENSACIG00000010538	-	74	38.462	ENSXMAG00000026184	-	96	38.462	Xiphophorus_maculatus