EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000010546 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: papolg
Alias: zgc:63762
Full Name: poly(A) polymerase gamma
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 15622 bases
Position: chrCCOE01001471.1:4411-20032
Accession: ZDB-GENE-040426-1256
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000013593	PAP_RNA-bind	PF04926.15	1.1e-28	1	2
ENSACIP00000013593	PAP_RNA-bind	PF04926.15	1.1e-28	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000013962	-	2055	-	ENSACIP00000013593	684 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSACIG00000010546's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSACIG00000010546's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000010546	papolg	99	70.054	ENSG00000115421	PAPOLG	100	87.607	Homo_sapiens
ENSACIG00000010546	papolg	100	89.857	ENSAPOG00000004798	papolg	100	90.143	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000010546	papolg	99	69.116	ENSAMEG00000018227	PAPOLG	99	69.158	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000010546	papolg	99	85.155	ENSAOCG00000010254	papolg	89	84.161	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000010546	papolg	99	85.155	ENSAPEG00000006944	papolg	89	84.161	Amphiprion_percula
ENSACIG00000010546	papolg	99	84.543	ENSATEG00000009007	papolg	97	85.781	Anabas_testudineus
ENSACIG00000010546	papolg	98	65.176	ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	64.682	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000010546	papolg	79	58.638	ENSACAG00000015048	-	100	57.072	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000010546	papolg	99	71.648	ENSANAG00000024627	PAPOLG	100	70.742	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000010546	papolg	99	84.941	ENSACLG00000015592	papolg	89	85.601	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000010546	papolg	99	73.635	ENSAMXG00000004611	papolg	100	73.762	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000010546	papolg	99	69.489	ENSBTAG00000007414	PAPOLG	100	69.118	Bos_taurus
ENSACIG00000010546	papolg	99	69.783	ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	69.335	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000010546	papolg	99	69.189	ENSCAFG00000002975	PAPOLG	91	69.303	Canis_familiaris
ENSACIG00000010546	papolg	99	71.309	ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	71.016	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000010546	papolg	99	69.355	ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	68.850	Capra_hircus
ENSACIG00000010546	papolg	99	68.910	ENSTSYG00000004947	PAPOLG	100	68.598	Carlito_syrichta
ENSACIG00000010546	papolg	56	81.102	ENSCAPG00000014901	-	100	81.102	Cavia_aperea
ENSACIG00000010546	papolg	99	69.542	ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	69.366	Cavia_porcellus
ENSACIG00000010546	papolg	99	71.788	ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	71.608	Cebus_capucinus
ENSACIG00000010546	papolg	89	82.251	ENSCATG00000044395	PAPOLG	100	82.251	Cercocebus_atys
ENSACIG00000010546	papolg	99	69.717	ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	69.407	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000010546	papolg	99	69.648	ENSCSAG00000014408	PAPOLG	100	69.199	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000010546	papolg	88	67.273	ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	66.768	Choloepus_hoffmanni
ENSACIG00000010546	papolg	72	64.300	ENSCING00000024664	-	92	64.300	Ciona_intestinalis
ENSACIG00000010546	papolg	71	64.948	ENSCSAVG00000009085	-	97	64.948	Ciona_savignyi
ENSACIG00000010546	papolg	99	71.788	ENSCANG00000038120	PAPOLG	100	71.329	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000010546	papolg	99	69.986	ENSCGRG00001014951	Papolg	100	70.027	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000010546	papolg	99	69.986	ENSCGRG00000005552	-	100	70.027	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000010546	papolg	100	86.926	ENSCSEG00000000771	papolg	100	86.926	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000010546	papolg	93	94.794	ENSCVAG00000016602	papolg	89	96.600	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000010546	papolg	99	74.834	ENSDARG00000012141	papolg	100	74.301	Danio_rerio
ENSACIG00000010546	papolg	99	67.116	ENSDNOG00000011326	PAPOLG	100	66.667	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000010546	papolg	63	86.247	ENSDORG00000016228	Papolg	100	86.247	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000010546	papolg	99	55.393	ENSETEG00000011815	PAPOLG	80	66.547	Echinops_telfairi
ENSACIG00000010546	papolg	64	72.917	ENSEBUG00000004020	papolg	89	72.917	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000010546	papolg	67	59.170	ENSEBUG00000005042	-	78	59.170	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000010546	papolg	99	69.044	ENSEASG00005002038	PAPOLG	100	69.003	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000010546	papolg	99	69.044	ENSECAG00000009859	PAPOLG	98	68.886	Equus_caballus
ENSACIG00000010546	papolg	99	61.808	ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	61.404	Erinaceus_europaeus
ENSACIG00000010546	papolg	100	81.343	ENSELUG00000014497	papolg	95	81.325	Esox_lucius
ENSACIG00000010546	papolg	99	69.583	ENSFCAG00000026126	PAPOLG	100	69.137	Felis_catus
ENSACIG00000010546	papolg	78	73.496	ENSFALG00000011079	PAPOLG	70	73.221	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000010546	papolg	99	69.892	ENSFDAG00000010662	PAPOLG	97	69.448	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000010546	papolg	64	74.950	ENSFHEG00000019080	papolg	90	75.904	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000010546	papolg	89	93.716	ENSGMOG00000018772	papolg	94	93.716	Gadus_morhua
ENSACIG00000010546	papolg	99	80.106	ENSGAFG00000003263	papolg	89	79.443	Gambusia_affinis
ENSACIG00000010546	papolg	99	82.638	ENSGACG00000002718	papolg	100	83.311	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000010546	papolg	99	71.648	ENSGGOG00000006083	PAPOLG	100	71.469	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000010546	papolg	99	84.941	ENSHBUG00000004882	papolg	89	85.601	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000010546	papolg	99	70.068	ENSHGLG00000019610	PAPOLG	99	69.619	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000010546	papolg	99	70.175	ENSHGLG00100010429	PAPOLG	99	69.730	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000010546	papolg	99	83.676	ENSHCOG00000006782	papolg	89	83.446	Hippocampus_comes
ENSACIG00000010546	papolg	99	76.210	ENSIPUG00000021642	papolg	100	76.111	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000010546	papolg	99	69.448	ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	69.003	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000010546	papolg	63	86.480	ENSJJAG00000015601	Papolg	100	86.480	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000010546	papolg	99	87.661	ENSKMAG00000016439	papolg	97	87.088	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000010546	papolg	93	97.133	ENSLBEG00000023218	papolg	89	80.387	Labrus_bergylta
ENSACIG00000010546	papolg	99	64.065	ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	63.661	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000010546	papolg	99	74.312	ENSLOCG00000016130	papolg	100	74.181	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000010546	papolg	99	70.027	ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	86.247	Loxodonta_africana
ENSACIG00000010546	papolg	99	69.512	ENSMFAG00000042450	PAPOLG	100	69.471	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000010546	papolg	99	69.512	ENSMMUG00000000498	PAPOLG	100	69.471	Macaca_mulatta
ENSACIG00000010546	papolg	99	61.777	ENSMNEG00000035939	PAPOLG	100	61.995	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000010546	papolg	99	71.089	ENSMLEG00000039462	PAPOLG	100	71.329	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000010546	papolg	100	87.977	ENSMAMG00000010667	papolg	100	88.402	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000010546	papolg	99	92.980	ENSMZEG00005018140	papolg	100	92.980	Maylandia_zebra
ENSACIG00000010546	papolg	99	61.611	ENSMGAG00000001741	PAPOLG	100	61.104	Meleagris_gallopavo
ENSACIG00000010546	papolg	99	70.828	ENSMAUG00000009088	Papolg	99	70.340	Mesocricetus_auratus
ENSACIG00000010546	papolg	99	71.528	ENSMICG00000010042	PAPOLG	100	70.793	Microcebus_murinus
ENSACIG00000010546	papolg	99	70.310	ENSMOCG00000006857	Papolg	100	69.946	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000010546	papolg	100	84.032	ENSMMOG00000008020	papolg	100	83.715	Mola_mola
ENSACIG00000010546	papolg	98	68.048	ENSMODG00000002160	PAPOLG	99	67.978	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000010546	papolg	99	82.819	ENSMALG00000007012	papolg	89	83.266	Monopterus_albus
ENSACIG00000010546	papolg	99	70.715	MGP_CAROLIEiJ_G0016144	Papolg	99	87.089	Mus_caroli
ENSACIG00000010546	papolg	99	70.850	ENSMUSG00000020273	Papolg	99	87.089	Mus_musculus
ENSACIG00000010546	papolg	99	70.699	MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	70.350	Mus_pahari
ENSACIG00000010546	papolg	99	70.580	MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	87.089	Mus_spretus
ENSACIG00000010546	papolg	99	69.231	ENSMPUG00000005165	PAPOLG	90	68.733	Mustela_putorius_furo
ENSACIG00000010546	papolg	99	69.672	ENSMLUG00000009853	PAPOLG	99	67.426	Myotis_lucifugus
ENSACIG00000010546	papolg	99	69.363	ENSNGAG00000001120	Papolg	100	69.786	Nannospalax_galili
ENSACIG00000010546	papolg	100	76.841	ENSNBRG00000011943	papolg	100	77.108	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000010546	papolg	63	86.014	ENSNLEG00000009507	-	100	86.014	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000010546	papolg	68	68.923	ENSMEUG00000013605	-	68	68.923	Notamacropus_eugenii
ENSACIG00000010546	papolg	99	69.044	ENSOPRG00000009630	PAPOLG	100	68.868	Ochotona_princeps
ENSACIG00000010546	papolg	62	83.452	ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	83.452	Octodon_degus
ENSACIG00000010546	papolg	99	79.645	ENSONIG00000002985	papolg	100	79.645	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000010546	papolg	98	67.150	ENSOANG00000012403	PAPOLG	99	68.286	Ornithorhynchus_anatinus
ENSACIG00000010546	papolg	99	69.583	ENSOCUG00000004962	PAPOLG	100	69.137	Oryctolagus_cuniculus
ENSACIG00000010546	papolg	99	79.338	ENSORLG00000001577	papolg	89	81.402	Oryzias_latipes
ENSACIG00000010546	papolg	99	79.416	ENSORLG00020002482	papolg	89	81.486	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000010546	papolg	99	79.338	ENSORLG00015008836	papolg	89	81.402	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000010546	papolg	99	81.989	ENSOMEG00000001406	papolg	89	81.183	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000010546	papolg	54	59.756	ENSOGAG00000003145	PAPOLG	100	59.169	Otolemur_garnettii
ENSACIG00000010546	papolg	99	69.355	ENSOARG00000001563	PAPOLG	91	68.850	Ovis_aries
ENSACIG00000010546	papolg	99	71.927	ENSPPAG00000019917	PAPOLG	100	71.748	Pan_paniscus
ENSACIG00000010546	papolg	99	69.448	ENSPPRG00000023250	PAPOLG	100	69.137	Panthera_pardus
ENSACIG00000010546	papolg	99	69.314	ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	69.003	Panthera_tigris_altaica
ENSACIG00000010546	papolg	99	71.927	ENSPTRG00000011948	PAPOLG	100	71.748	Pan_troglodytes
ENSACIG00000010546	papolg	99	65.676	ENSPANG00000014543	PAPOLG	100	65.900	Papio_anubis
ENSACIG00000010546	papolg	99	73.706	ENSPKIG00000003313	papolg	100	74.689	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000010546	papolg	97	76.225	ENSPKIG00000006027	PAPOLG	96	75.758	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000010546	papolg	98	65.508	ENSPSIG00000013663	PAPOLG	98	65.107	Pelodiscus_sinensis
ENSACIG00000010546	papolg	99	69.986	ENSPEMG00000008960	-	100	69.891	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACIG00000010546	papolg	98	52.886	ENSPMAG00000002961	papolg	99	52.941	Petromyzon_marinus
ENSACIG00000010546	papolg	73	64.414	ENSPMAG00000004864	-	99	64.414	Petromyzon_marinus
ENSACIG00000010546	papolg	96	71.635	ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	67.325	Phascolarctos_cinereus
ENSACIG00000010546	papolg	99	80.397	ENSPFOG00000012909	papolg	99	79.283	Poecilia_formosa
ENSACIG00000010546	papolg	99	80.371	ENSPLAG00000018445	papolg	89	79.420	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000010546	papolg	99	80.291	ENSPMEG00000003961	papolg	89	79.392	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000010546	papolg	94	96.050	ENSPREG00000010358	papolg	89	78.760	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000010546	papolg	99	69.377	ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	69.471	Pongo_abelii
ENSACIG00000010546	papolg	99	61.601	ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	60.734	Procavia_capensis
ENSACIG00000010546	papolg	99	68.188	ENSPCOG00000027306	PAPOLG	100	67.857	Propithecus_coquereli
ENSACIG00000010546	papolg	87	82.162	ENSPVAG00000013541	PAPOLG	81	82.162	Pteropus_vampyrus
ENSACIG00000010546	papolg	100	90.767	ENSPNYG00000006729	papolg	100	90.767	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000010546	papolg	99	75.169	ENSPNAG00000015521	papolg	100	75.169	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000010546	papolg	99	70.580	ENSRNOG00000006261	Papolg	100	69.880	Rattus_norvegicus
ENSACIG00000010546	papolg	99	65.176	ENSRBIG00000040086	PAPOLG	100	64.738	Rhinopithecus_bieti
ENSACIG00000010546	papolg	99	72.067	ENSRROG00000035954	PAPOLG	100	71.567	Rhinopithecus_roxellana
ENSACIG00000010546	papolg	99	71.648	ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	71.469	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSACIG00000010546	papolg	93	68.201	ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	67.376	Sarcophilus_harrisii
ENSACIG00000010546	papolg	99	68.567	ENSSFOG00015011874	papolg	100	68.245	Scleropages_formosus
ENSACIG00000010546	papolg	99	75.070	ENSSFOG00015002383	papolg	100	74.895	Scleropages_formosus
ENSACIG00000010546	papolg	96	97.148	ENSSMAG00000015598	papolg	95	77.891	Scophthalmus_maximus
ENSACIG00000010546	papolg	100	91.014	ENSSDUG00000000912	papolg	100	91.304	Seriola_dumerili
ENSACIG00000010546	papolg	99	85.306	ENSSLDG00000001217	papolg	100	84.540	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACIG00000010546	papolg	99	68.169	ENSSPUG00000007491	PAPOLG	100	68.169	Sphenodon_punctatus
ENSACIG00000010546	papolg	100	91.066	ENSSPAG00000009004	papolg	100	91.739	Stegastes_partitus
ENSACIG00000010546	papolg	99	71.547	ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	70.954	Sus_scrofa
ENSACIG00000010546	papolg	78	73.120	ENSTGUG00000006762	PAPOLG	98	73.120	Taeniopygia_guttata
ENSACIG00000010546	papolg	100	85.315	ENSTRUG00000006410	papolg	100	84.895	Takifugu_rubripes
ENSACIG00000010546	papolg	99	75.234	ENSTNIG00000017106	papolg	100	75.439	Tetraodon_nigroviridis
ENSACIG00000010546	papolg	99	64.586	ENSTBEG00000002609	PAPOLG	100	64.130	Tupaia_belangeri
ENSACIG00000010546	papolg	99	65.141	ENSTTRG00000006237	PAPOLG	100	64.960	Tursiops_truncatus
ENSACIG00000010546	papolg	99	71.349	ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	71.389	Ursus_americanus
ENSACIG00000010546	papolg	99	69.168	ENSUMAG00000019081	PAPOLG	90	69.210	Ursus_maritimus
ENSACIG00000010546	papolg	99	65.668	ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	65.182	Vicugna_pacos
ENSACIG00000010546	papolg	99	71.053	ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	69.437	Vulpes_vulpes
ENSACIG00000010546	papolg	99	66.446	ENSXETG00000002208	papolg	100	66.313	Xenopus_tropicalis
ENSACIG00000010546	papolg	73	96.593	ENSXCOG00000006611	papolg	73	96.593	Xiphophorus_couchianus
ENSACIG00000010546	papolg	93	97.222	ENSXMAG00000007383	papolg	89	97.222	Xiphophorus_maculatus