EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000010569 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 6322 bases
Position: chrCCOE01001617.1:4823-11144
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000013574	MMR_HSR1	PF01926.23	1.1e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000013943	-	1602	-	ENSACIP00000013574	533 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000010569	-	99	62.338	ENSACIG00000014898	-	94	63.447
ENSACIG00000010569	-	95	67.510	ENSACIG00000003888	-	95	67.899
ENSACIG00000010569	-	95	64.797	ENSACIG00000002240	-	96	64.797
ENSACIG00000010569	-	95	64.660	ENSACIG00000014982	-	96	64.660
ENSACIG00000010569	-	73	67.250	ENSACIG00000023712	-	99	67.250
ENSACIG00000010569	-	97	64.231	ENSACIG00000014961	-	94	64.231
ENSACIG00000010569	-	97	64.896	ENSACIG00000001022	-	97	64.896
ENSACIG00000010569	-	94	30.769	ENSACIG00000022269	-	86	30.885
ENSACIG00000010569	-	97	65.000	ENSACIG00000003168	-	99	65.370
ENSACIG00000010569	-	93	65.805	ENSACIG00000021882	-	93	65.675
ENSACIG00000010569	-	97	69.598	ENSACIG00000021889	-	93	69.598
ENSACIG00000010569	-	96	66.730	ENSACIG00000008256	-	96	67.681
ENSACIG00000010569	-	89	35.892	ENSACIG00000009814	-	86	35.892
ENSACIG00000010569	-	85	35.381	ENSACIG00000009923	-	74	35.805
ENSACIG00000010569	-	97	62.453	ENSACIG00000021449	-	96	62.453
ENSACIG00000010569	-	95	67.179	ENSACIG00000023726	-	96	67.370
ENSACIG00000010569	-	86	33.966	ENSACIG00000022228	-	78	33.966
ENSACIG00000010569	-	94	65.686	ENSACIG00000014973	-	95	65.686
ENSACIG00000010569	-	94	62.231	ENSACIG00000008246	-	90	62.231
ENSACIG00000010569	-	94	61.840	ENSACIG00000008585	-	98	61.840
ENSACIG00000010569	-	96	64.829	ENSACIG00000012148	-	95	65.019

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000010569	-	97	58.712	ENSAPOG00000005726	-	96	58.712	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000010569	-	97	60.491	ENSAPOG00000021040	-	87	60.491	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000010569	-	90	31.412	ENSAPOG00000016636	-	97	31.809	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000010569	-	98	55.639	ENSAPOG00000005749	-	93	55.639	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000010569	-	96	59.188	ENSAPEG00000000062	-	96	59.188	Amphiprion_percula
ENSACIG00000010569	-	95	63.056	ENSATEG00000012558	-	94	63.250	Anabas_testudineus
ENSACIG00000010569	-	95	63.830	ENSATEG00000023346	-	94	64.023	Anabas_testudineus
ENSACIG00000010569	-	95	63.495	ENSATEG00000019965	-	94	63.495	Anabas_testudineus
ENSACIG00000010569	-	97	53.788	ENSATEG00000017635	-	95	53.788	Anabas_testudineus
ENSACIG00000010569	-	80	65.049	ENSACLG00000009330	-	86	65.049	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000010569	-	90	33.201	ENSACLG00000023468	-	83	33.201	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000010569	-	92	63.810	ENSACLG00000017259	-	96	63.810	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000010569	-	98	57.565	ENSACLG00000021761	-	98	57.565	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000010569	-	66	36.413	ENSACLG00000023033	-	92	36.413	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000010569	-	91	60.041	ENSACLG00000018599	-	92	60.041	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000010569	-	96	67.906	ENSACLG00000009261	-	97	67.906	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000010569	-	93	32.177	ENSACLG00000023126	-	96	32.495	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000010569	-	95	73.750	ENSACLG00000006538	-	99	73.750	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000010569	-	85	73.418	ENSACLG00000006285	-	98	73.418	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000010569	-	70	57.963	ENSACLG00000015361	-	95	57.963	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000010569	-	94	60.583	ENSACLG00000010007	-	76	60.971	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000010569	-	93	59.363	ENSACLG00000006543	-	92	59.538	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000010569	-	98	55.367	ENSACLG00000018271	-	96	55.367	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000010569	-	93	42.115	ENSAMXG00000029346	-	98	42.991	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000010569	-	92	41.283	ENSAMXG00000033407	-	93	41.283	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000010569	-	96	39.579	ENSAMXG00000037920	-	99	40.727	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000010569	-	99	41.113	ENSAMXG00000034407	-	99	41.113	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000010569	-	93	40.190	ENSAMXG00000032695	-	96	40.190	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000010569	-	96	51.293	ENSAMXG00000030535	-	97	51.293	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000010569	-	90	39.104	ENSAMXG00000039672	-	92	39.228	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000010569	-	93	32.375	ENSAMXG00000035937	-	92	32.375	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000010569	-	93	32.759	ENSAMXG00000036353	-	89	32.759	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000010569	-	96	36.622	ENSAMXG00000041770	-	96	36.622	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000010569	-	95	60.000	ENSCVAG00000007794	-	97	60.000	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000010569	-	97	53.728	ENSCVAG00000000224	-	87	53.728	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000010569	-	95	31.520	ENSCVAG00000011261	-	95	31.520	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000010569	-	91	50.000	ENSCVAG00000013384	-	99	50.201	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000010569	-	96	55.086	ENSCVAG00000008134	-	97	55.086	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000010569	-	94	60.547	ENSCVAG00000004690	-	93	61.523	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000010569	-	50	58.394	ENSCVAG00000022669	-	96	58.394	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000010569	-	89	31.837	ENSCVAG00000008633	-	88	32.041	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000010569	-	97	55.408	ENSCVAG00000008127	-	97	55.408	Cyprinodon_variegatus
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ENSACIG00000010569	-	93	54.150	ENSFHEG00000016342	-	98	54.150	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000010569	-	94	55.273	ENSFHEG00000006425	-	97	56.836	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000010569	-	93	54.043	ENSFHEG00000023034	-	97	54.043	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000010569	-	87	30.917	ENSGMOG00000008232	-	98	30.917	Gadus_morhua
ENSACIG00000010569	-	93	32.816	ENSGMOG00000011319	-	97	32.816	Gadus_morhua
ENSACIG00000010569	-	95	33.647	ENSGMOG00000019330	-	88	33.647	Gadus_morhua
ENSACIG00000010569	-	89	31.919	ENSGMOG00000019825	-	99	31.855	Gadus_morhua
ENSACIG00000010569	-	94	32.580	ENSGMOG00000005680	-	79	33.745	Gadus_morhua
ENSACIG00000010569	-	93	33.902	ENSGMOG00000017552	-	86	33.902	Gadus_morhua
ENSACIG00000010569	-	98	58.459	ENSGAFG00000005032	-	96	58.459	Gambusia_affinis
ENSACIG00000010569	-	94	58.218	ENSGAFG00000005023	-	96	57.529	Gambusia_affinis
ENSACIG00000010569	-	72	58.481	ENSGACG00000015437	-	99	58.481	Gasterosteus_aculeatus
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