EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000010637 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 1530 bases
Position: chrCCOE01000143.1:460336-461865
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000013663	zf-C2H2	PF00096.26	1.1e-42	1	9
ENSACIP00000013663	zf-C2H2	PF00096.26	1.1e-42	2	9
ENSACIP00000013663	zf-C2H2	PF00096.26	1.1e-42	3	9
ENSACIP00000013663	zf-C2H2	PF00096.26	1.1e-42	4	9
ENSACIP00000013663	zf-C2H2	PF00096.26	1.1e-42	5	9
ENSACIP00000013663	zf-C2H2	PF00096.26	1.1e-42	6	9
ENSACIP00000013663	zf-C2H2	PF00096.26	1.1e-42	7	9
ENSACIP00000013663	zf-C2H2	PF00096.26	1.1e-42	8	9
ENSACIP00000013663	zf-C2H2	PF00096.26	1.1e-42	9	9
ENSACIP00000013663	zf-met	PF12874.7	3.6e-16	1	3
ENSACIP00000013663	zf-met	PF12874.7	3.6e-16	2	3
ENSACIP00000013663	zf-met	PF12874.7	3.6e-16	3	3

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000014032	-	1530	-	ENSACIP00000013663	509 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000010637	-	67	48.462	ENSACIG00000019791	-	98	48.462
ENSACIG00000010637	-	92	60.166	ENSACIG00000011541	-	94	60.166
ENSACIG00000010637	-	52	43.534	ENSACIG00000017653	-	96	43.534
ENSACIG00000010637	-	52	45.087	ENSACIG00000022330	-	85	45.087
ENSACIG00000010637	-	74	50.000	ENSACIG00000003720	-	88	50.289
ENSACIG00000010637	-	50	40.726	ENSACIG00000009180	znf652	56	36.765
ENSACIG00000010637	-	53	52.284	ENSACIG00000016944	-	76	52.284
ENSACIG00000010637	-	57	45.540	ENSACIG00000022625	-	85	49.565
ENSACIG00000010637	-	67	63.182	ENSACIG00000009809	si:dkey-77f5.14	86	63.182
ENSACIG00000010637	-	53	47.266	ENSACIG00000017644	-	85	44.444
ENSACIG00000010637	-	51	52.381	ENSACIG00000007034	-	70	52.381
ENSACIG00000010637	-	53	50.588	ENSACIG00000003515	-	95	48.438
ENSACIG00000010637	-	53	37.681	ENSACIG00000001767	zbtb41	66	37.681
ENSACIG00000010637	-	53	53.297	ENSACIG00000022738	-	93	53.297
ENSACIG00000010637	-	57	39.768	ENSACIG00000000406	prdm5	77	41.991
ENSACIG00000010637	-	54	38.281	ENSACIG00000012263	znf319b	88	38.281
ENSACIG00000010637	-	75	37.600	ENSACIG00000019804	-	83	40.458
ENSACIG00000010637	-	53	51.579	ENSACIG00000015835	-	67	51.579
ENSACIG00000010637	-	95	51.890	ENSACIG00000023212	-	99	59.470
ENSACIG00000010637	-	92	58.796	ENSACIG00000010647	-	99	64.835
ENSACIG00000010637	-	53	39.552	ENSACIG00000016133	-	63	39.552
ENSACIG00000010637	-	53	50.222	ENSACIG00000024444	-	62	50.222
ENSACIG00000010637	-	51	51.695	ENSACIG00000018059	-	76	51.695
ENSACIG00000010637	-	67	49.045	ENSACIG00000007096	-	91	49.045
ENSACIG00000010637	-	59	54.040	ENSACIG00000003754	-	97	54.040
ENSACIG00000010637	-	87	44.231	ENSACIG00000014282	znf526	85	35.547
ENSACIG00000010637	-	53	48.246	ENSACIG00000006228	-	60	48.246
ENSACIG00000010637	-	64	47.107	ENSACIG00000013604	-	98	47.107
ENSACIG00000010637	-	53	42.593	ENSACIG00000023313	-	91	42.593
ENSACIG00000010637	-	70	52.107	ENSACIG00000010966	-	60	52.107
ENSACIG00000010637	-	52	43.850	ENSACIG00000009128	-	84	40.991
ENSACIG00000010637	-	65	50.628	ENSACIG00000004626	-	80	49.430
ENSACIG00000010637	-	60	53.175	ENSACIG00000022293	-	99	53.175
ENSACIG00000010637	-	53	50.196	ENSACIG00000016182	-	82	51.795
ENSACIG00000010637	-	53	48.598	ENSACIG00000014123	znf236	64	44.048
ENSACIG00000010637	-	91	47.556	ENSACIG00000017647	-	97	46.316
ENSACIG00000010637	-	93	50.581	ENSACIG00000023162	-	79	50.581
ENSACIG00000010637	-	74	53.846	ENSACIG00000007464	-	59	53.846
ENSACIG00000010637	-	73	55.612	ENSACIG00000009780	-	93	52.284
ENSACIG00000010637	-	56	39.655	ENSACIG00000020982	znf710b	53	39.655
ENSACIG00000010637	-	54	35.577	ENSACIG00000014233	znf407	68	35.838
ENSACIG00000010637	-	52	41.860	ENSACIG00000020938	zbtb47b	74	41.860
ENSACIG00000010637	-	53	46.000	ENSACIG00000008886	znf1164	81	46.000
ENSACIG00000010637	-	52	47.849	ENSACIG00000018404	-	77	47.849
ENSACIG00000010637	-	53	47.368	ENSACIG00000013750	-	81	47.368
ENSACIG00000010637	-	60	45.255	ENSACIG00000002190	gfi1b	69	45.255
ENSACIG00000010637	-	56	40.316	ENSACIG00000012636	ZNF319	88	40.316
ENSACIG00000010637	-	70	57.143	ENSACIG00000009755	-	83	57.143
ENSACIG00000010637	-	52	44.681	ENSACIG00000017892	-	76	44.681
ENSACIG00000010637	-	50	37.864	ENSACIG00000009443	-	55	37.864
ENSACIG00000010637	-	53	45.714	ENSACIG00000013149	-	79	45.714
ENSACIG00000010637	-	53	50.000	ENSACIG00000015429	-	90	49.315
ENSACIG00000010637	-	51	50.769	ENSACIG00000010660	-	93	50.769
ENSACIG00000010637	-	53	53.942	ENSACIG00000003556	-	71	53.942
ENSACIG00000010637	-	68	51.799	ENSACIG00000016932	-	61	51.799
ENSACIG00000010637	-	83	56.502	ENSACIG00000006806	-	78	56.502
ENSACIG00000010637	-	55	41.071	ENSACIG00000011318	snai1a	55	41.071
ENSACIG00000010637	-	92	48.954	ENSACIG00000011153	-	70	52.344
ENSACIG00000010637	-	58	39.286	ENSACIG00000013613	scrt1b	55	39.286
ENSACIG00000010637	-	58	51.181	ENSACIG00000000360	si:ch211-241b2.1	89	51.181
ENSACIG00000010637	-	64	38.542	ENSACIG00000023049	znf646	99	38.542
ENSACIG00000010637	-	53	49.580	ENSACIG00000018952	-	62	49.580
ENSACIG00000010637	-	53	42.604	ENSACIG00000019534	-	78	42.604
ENSACIG00000010637	-	54	44.048	ENSACIG00000016354	gfi1ab	78	44.048
ENSACIG00000010637	-	53	49.171	ENSACIG00000023794	-	75	49.171
ENSACIG00000010637	-	69	53.785	ENSACIG00000004666	-	99	53.030
ENSACIG00000010637	-	53	37.054	ENSACIG00000007000	-	59	37.054
ENSACIG00000010637	-	50	44.444	ENSACIG00000017166	-	61	44.444
ENSACIG00000010637	-	53	51.121	ENSACIG00000004745	-	91	51.121
ENSACIG00000010637	-	92	51.908	ENSACIG00000017050	-	97	54.237
ENSACIG00000010637	-	53	44.361	ENSACIG00000013163	-	79	44.402
ENSACIG00000010637	-	53	51.142	ENSACIG00000019447	-	68	51.142
ENSACIG00000010637	-	54	56.364	ENSACIG00000000311	-	66	56.364
ENSACIG00000010637	-	66	49.807	ENSACIG00000019815	-	94	50.224
ENSACIG00000010637	-	55	45.833	ENSACIG00000021986	-	91	45.374
ENSACIG00000010637	-	96	58.373	ENSACIG00000013470	-	97	58.373
ENSACIG00000010637	-	53	41.353	ENSACIG00000006377	-	56	41.353
ENSACIG00000010637	-	55	34.234	ENSACIG00000011516	-	82	34.234
ENSACIG00000010637	-	88	50.000	ENSACIG00000011515	-	99	50.000
ENSACIG00000010637	-	53	38.679	ENSACIG00000015411	-	83	38.679
ENSACIG00000010637	-	57	53.750	ENSACIG00000007855	-	95	53.750
ENSACIG00000010637	-	53	43.796	ENSACIG00000002180	-	94	43.796
ENSACIG00000010637	-	62	50.289	ENSACIG00000022658	-	92	50.575
ENSACIG00000010637	-	57	41.629	ENSACIG00000010739	-	84	41.629
ENSACIG00000010637	-	50	36.047	ENSACIG00000016779	patz1	52	36.047
ENSACIG00000010637	-	51	40.299	ENSACIG00000018641	snai2	51	40.299
ENSACIG00000010637	-	53	55.263	ENSACIG00000000286	-	71	55.263
ENSACIG00000010637	-	51	51.773	ENSACIG00000018022	-	55	49.677
ENSACIG00000010637	-	53	53.299	ENSACIG00000008448	-	69	53.299
ENSACIG00000010637	-	72	50.000	ENSACIG00000009717	-	96	53.506
ENSACIG00000010637	-	65	37.716	ENSACIG00000016117	-	88	40.000
ENSACIG00000010637	-	70	50.595	ENSACIG00000006755	-	77	50.595
ENSACIG00000010637	-	52	52.157	ENSACIG00000018440	-	96	52.157
ENSACIG00000010637	-	97	52.308	ENSACIG00000004041	-	92	53.435
ENSACIG00000010637	-	99	46.207	ENSACIG00000019710	-	98	46.863
ENSACIG00000010637	-	53	50.898	ENSACIG00000012084	-	97	49.746
ENSACIG00000010637	-	91	48.315	ENSACIG00000006172	-	87	50.228
ENSACIG00000010637	-	91	51.497	ENSACIG00000017013	-	53	51.497
ENSACIG00000010637	-	53	42.222	ENSACIG00000017683	-	77	39.827
ENSACIG00000010637	-	55	45.122	ENSACIG00000007882	-	76	45.122

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000010637	-	61	48.085	ENSAPOG00000003193	znf1056	90	48.085	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000010637	-	98	60.697	ENSAPOG00000021367	-	93	60.697	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000010637	-	92	52.857	ENSAPOG00000022273	-	76	52.857	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000010637	-	96	56.054	ENSAPOG00000018490	-	67	56.054	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000010637	-	93	51.255	ENSAPOG00000022007	-	93	49.407	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000010637	-	99	57.595	ENSAPOG00000020125	-	96	57.595	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000010637	-	98	49.119	ENSAPOG00000021997	-	99	49.802	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000010637	-	98	61.692	ENSAOCG00000017588	-	94	61.692	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000010637	-	96	56.054	ENSAOCG00000012829	-	75	56.054	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000010637	-	93	50.826	ENSAOCG00000010498	-	93	50.826	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000010637	-	96	52.857	ENSAOCG00000007146	-	82	52.857	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000010637	-	61	47.436	ENSAOCG00000003494	si:dkey-7i4.5	92	47.436	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000010637	-	98	49.023	ENSAOCG00000000655	-	94	49.609	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000010637	-	97	55.897	ENSAPEG00000013113	-	94	54.229	Amphiprion_percula
ENSACIG00000010637	-	96	56.054	ENSAPEG00000018316	-	75	56.054	Amphiprion_percula
ENSACIG00000010637	-	98	61.692	ENSAPEG00000012437	-	94	61.692	Amphiprion_percula
ENSACIG00000010637	-	98	49.023	ENSAPEG00000013105	-	94	49.609	Amphiprion_percula
ENSACIG00000010637	-	65	47.436	ENSAPEG00000004427	si:ch73-144d13.7	91	47.436	Amphiprion_percula
ENSACIG00000010637	-	67	49.226	ENSAPEG00000013088	-	94	47.661	Amphiprion_percula
ENSACIG00000010637	-	96	56.054	ENSAPEG00000018332	-	75	56.054	Amphiprion_percula
ENSACIG00000010637	-	98	58.140	ENSAPEG00000012963	-	95	58.621	Amphiprion_percula
ENSACIG00000010637	-	50	54.601	ENSAPEG00000011646	-	54	54.601	Amphiprion_percula
ENSACIG00000010637	-	83	58.333	ENSAPEG00000012243	-	99	58.228	Amphiprion_percula
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