EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000010660 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 465 bases
Position: chrCCOE01000306.1:4508-4972
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000013702	zf-C2H2	PF00096.26	9.3e-14	1	2
ENSACIP00000013702	zf-C2H2	PF00096.26	9.3e-14	2	2
ENSACIP00000013702	zf-met	PF12874.7	0.00014	1	2
ENSACIP00000013702	zf-met	PF12874.7	0.00014	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000014072	-	231	-	ENSACIP00000013702	76 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000010660	-	97	52.273	ENSACIG00000017683	-	76	52.273
ENSACIG00000010660	-	99	45.205	ENSACIG00000009755	-	74	45.205
ENSACIG00000010660	-	99	64.286	ENSACIG00000017013	-	53	64.286
ENSACIG00000010660	-	92	59.420	ENSACIG00000016944	-	75	59.420
ENSACIG00000010660	-	96	47.826	ENSACIG00000012263	znf319b	65	47.826
ENSACIG00000010660	-	92	53.846	ENSACIG00000011541	-	67	53.846
ENSACIG00000010660	-	92	50.746	ENSACIG00000019815	-	81	50.746
ENSACIG00000010660	-	99	51.786	ENSACIG00000018404	-	63	51.786
ENSACIG00000010660	-	97	56.452	ENSACIG00000015835	-	67	48.485
ENSACIG00000010660	-	91	59.375	ENSACIG00000003556	-	65	59.375
ENSACIG00000010660	-	97	51.613	ENSACIG00000000406	prdm5	52	51.613
ENSACIG00000010660	-	93	50.769	ENSACIG00000010637	-	51	50.769
ENSACIG00000010660	-	100	46.575	ENSACIG00000009128	-	66	46.575
ENSACIG00000010660	-	91	41.791	ENSACIG00000007034	-	70	42.857
ENSACIG00000010660	-	96	44.776	ENSACIG00000007855	-	84	44.776
ENSACIG00000010660	-	88	45.614	ENSACIG00000007882	-	67	45.614
ENSACIG00000010660	-	99	42.105	ENSACIG00000017653	-	97	42.105
ENSACIG00000010660	-	96	52.381	ENSACIG00000022738	-	91	54.545
ENSACIG00000010660	-	91	50.000	ENSACIG00000006806	-	57	50.000
ENSACIG00000010660	-	91	60.938	ENSACIG00000012084	-	95	60.938
ENSACIG00000010660	-	97	61.290	ENSACIG00000024444	-	61	61.290
ENSACIG00000010660	-	92	59.649	ENSACIG00000008448	-	68	59.649
ENSACIG00000010660	-	99	64.179	ENSACIG00000004745	-	86	62.319
ENSACIG00000010660	-	97	49.296	ENSACIG00000023212	-	74	48.438
ENSACIG00000010660	-	99	52.174	ENSACIG00000016117	-	83	52.174
ENSACIG00000010660	-	92	45.614	ENSACIG00000017644	-	82	45.614
ENSACIG00000010660	-	96	56.250	ENSACIG00000017647	-	84	56.250
ENSACIG00000010660	-	91	57.895	ENSACIG00000000360	si:ch211-241b2.1	84	57.895
ENSACIG00000010660	-	91	62.791	ENSACIG00000004666	-	93	60.870
ENSACIG00000010660	-	93	47.368	ENSACIG00000015411	-	50	47.368
ENSACIG00000010660	-	88	57.143	ENSACIG00000006228	-	59	57.143
ENSACIG00000010660	-	99	63.768	ENSACIG00000018440	-	86	63.768
ENSACIG00000010660	-	99	74.576	ENSACIG00000006172	-	84	74.576
ENSACIG00000010660	-	99	51.562	ENSACIG00000010647	-	96	50.000
ENSACIG00000010660	-	100	65.625	ENSACIG00000019710	-	71	65.625
ENSACIG00000010660	-	89	45.000	ENSACIG00000002180	-	94	45.000
ENSACIG00000010660	-	93	55.224	ENSACIG00000000311	-	58	55.224
ENSACIG00000010660	-	91	54.839	ENSACIG00000003754	-	82	54.839
ENSACIG00000010660	-	96	53.731	ENSACIG00000011515	-	67	53.731
ENSACIG00000010660	-	99	60.870	ENSACIG00000017050	-	92	60.870
ENSACIG00000010660	-	96	52.542	ENSACIG00000009809	si:dkey-77f5.14	77	52.542
ENSACIG00000010660	-	100	74.324	ENSACIG00000019791	-	87	72.973
ENSACIG00000010660	-	99	49.254	ENSACIG00000013163	-	78	49.254
ENSACIG00000010660	-	99	47.727	ENSACIG00000023313	-	87	47.727
ENSACIG00000010660	-	97	47.761	ENSACIG00000009717	-	85	47.761
ENSACIG00000010660	-	95	50.877	ENSACIG00000012636	ZNF319	63	50.877
ENSACIG00000010660	-	91	47.826	ENSACIG00000007096	-	71	47.826
ENSACIG00000010660	-	96	58.929	ENSACIG00000022625	-	76	58.929
ENSACIG00000010660	-	100	46.575	ENSACIG00000003515	-	79	45.455
ENSACIG00000010660	-	96	47.059	ENSACIG00000016133	-	53	47.059
ENSACIG00000010660	-	99	59.420	ENSACIG00000022293	-	91	59.420
ENSACIG00000010660	-	95	52.174	ENSACIG00000006755	-	65	52.174
ENSACIG00000010660	-	97	51.562	ENSACIG00000015429	-	69	51.562
ENSACIG00000010660	-	99	55.224	ENSACIG00000004041	-	92	54.412
ENSACIG00000010660	-	93	54.098	ENSACIG00000004626	-	77	54.098
ENSACIG00000010660	-	96	59.701	ENSACIG00000023162	-	50	59.701
ENSACIG00000010660	-	96	50.725	ENSACIG00000017892	-	61	50.725
ENSACIG00000010660	-	92	47.692	ENSACIG00000019534	-	72	47.692
ENSACIG00000010660	-	91	63.636	ENSACIG00000016182	-	79	60.870
ENSACIG00000010660	-	96	43.056	ENSACIG00000008886	znf1164	74	43.056
ENSACIG00000010660	-	96	49.254	ENSACIG00000019804	-	50	49.254
ENSACIG00000010660	-	91	44.231	ENSACIG00000023049	znf646	53	45.098
ENSACIG00000010660	-	96	53.731	ENSACIG00000019447	-	64	53.731
ENSACIG00000010660	-	91	44.928	ENSACIG00000021986	-	85	44.928
ENSACIG00000010660	-	91	54.412	ENSACIG00000000286	-	68	54.412
ENSACIG00000010660	-	99	46.774	ENSACIG00000002190	gfi1b	53	46.774
ENSACIG00000010660	-	99	60.000	ENSACIG00000003720	-	60	60.000
ENSACIG00000010660	-	91	46.269	ENSACIG00000009780	-	68	46.774
ENSACIG00000010660	-	92	42.857	ENSACIG00000001369	-	78	42.857
ENSACIG00000010660	-	96	65.672	ENSACIG00000022658	-	93	65.672
ENSACIG00000010660	-	95	51.613	ENSACIG00000013470	-	58	51.613
ENSACIG00000010660	-	100	71.014	ENSACIG00000013604	-	90	71.014
ENSACIG00000010660	-	91	59.375	ENSACIG00000022330	-	69	59.375
ENSACIG00000010660	-	99	80.952	ENSACIG00000011153	-	69	80.952
ENSACIG00000010660	-	100	51.667	ENSACIG00000013149	-	66	51.667

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000010660	-	92	61.538	ENSPNYG00000023848	-	68	61.538	Pundamilia_nyererei