EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000010739 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 1947 bases
Position: chrCCOE01000926.1:150935-152881
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000013811	zf-C2H2	PF00096.26	1.7e-42	1	9
ENSACIP00000013811	zf-C2H2	PF00096.26	1.7e-42	2	9
ENSACIP00000013811	zf-C2H2	PF00096.26	1.7e-42	3	9
ENSACIP00000013811	zf-C2H2	PF00096.26	1.7e-42	4	9
ENSACIP00000013811	zf-C2H2	PF00096.26	1.7e-42	5	9
ENSACIP00000013811	zf-C2H2	PF00096.26	1.7e-42	6	9
ENSACIP00000013811	zf-C2H2	PF00096.26	1.7e-42	7	9
ENSACIP00000013811	zf-C2H2	PF00096.26	1.7e-42	8	9
ENSACIP00000013811	zf-C2H2	PF00096.26	1.7e-42	9	9
ENSACIP00000013811	zf-met	PF12874.7	0.00039	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000014181	-	1299	-	ENSACIP00000013811	432 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000010739	-	92	43.961	ENSACIG00000003754	-	87	43.961
ENSACIG00000010739	-	82	38.318	ENSACIG00000004626	-	91	38.318
ENSACIG00000010739	-	99	40.278	ENSACIG00000006172	-	89	43.429
ENSACIG00000010739	-	87	41.317	ENSACIG00000016182	-	94	41.317
ENSACIG00000010739	-	88	39.091	ENSACIG00000004041	-	97	38.924
ENSACIG00000010739	-	84	41.553	ENSACIG00000003556	-	70	41.553
ENSACIG00000010739	-	79	39.521	ENSACIG00000017683	-	77	39.521
ENSACIG00000010739	-	79	40.146	ENSACIG00000013149	-	80	40.146
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ENSACIG00000010739	-	78	45.778	ENSACIG00000019447	-	66	45.778
ENSACIG00000010739	-	84	38.384	ENSACIG00000019815	-	88	38.384
ENSACIG00000010739	-	95	41.958	ENSACIG00000011153	-	88	41.958
ENSACIG00000010739	-	78	31.950	ENSACIG00000007000	-	57	31.950
ENSACIG00000010739	-	79	39.344	ENSACIG00000015835	-	98	44.660
ENSACIG00000010739	-	86	44.670	ENSACIG00000009780	-	95	44.670
ENSACIG00000010739	-	78	40.201	ENSACIG00000009128	-	80	37.668
ENSACIG00000010739	-	78	44.248	ENSACIG00000024444	-	63	44.248
ENSACIG00000010739	-	77	36.170	ENSACIG00000018404	-	82	37.423
ENSACIG00000010739	-	79	39.512	ENSACIG00000022330	-	82	39.512
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ENSACIG00000010739	-	93	34.074	ENSACIG00000011541	-	74	34.074
ENSACIG00000010739	-	79	44.615	ENSACIG00000016133	-	55	44.615
ENSACIG00000010739	-	81	40.698	ENSACIG00000019534	-	82	40.698
ENSACIG00000010739	-	78	43.624	ENSACIG00000007464	-	56	43.624
ENSACIG00000010739	-	80	37.888	ENSACIG00000006377	-	57	36.970
ENSACIG00000010739	-	79	42.793	ENSACIG00000013470	-	64	42.793
ENSACIG00000010739	-	79	41.892	ENSACIG00000006806	-	56	41.892
ENSACIG00000010739	-	80	38.433	ENSACIG00000011515	-	66	38.433
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ENSACIG00000010739	-	79	40.000	ENSACIG00000006755	-	71	40.000
ENSACIG00000010739	-	80	36.239	ENSACIG00000020938	zbtb47b	70	40.741
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ENSACIG00000010739	-	79	45.178	ENSACIG00000019102	-	55	45.178
ENSACIG00000010739	-	88	43.590	ENSACIG00000022738	-	96	44.019
ENSACIG00000010739	-	83	35.931	ENSACIG00000015411	-	85	35.931
ENSACIG00000010739	-	78	43.590	ENSACIG00000009809	si:dkey-77f5.14	95	43.590
ENSACIG00000010739	-	99	38.192	ENSACIG00000017050	-	96	41.148
ENSACIG00000010739	-	82	34.965	ENSACIG00000021986	-	96	34.965
ENSACIG00000010739	-	79	42.105	ENSACIG00000016117	-	83	42.105
ENSACIG00000010739	-	78	45.324	ENSACIG00000000311	-	61	45.324
ENSACIG00000010739	-	88	41.844	ENSACIG00000007096	-	89	41.844
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ENSACIG00000010739	-	61	38.889	ENSACIG00000017166	-	59	38.889
ENSACIG00000010739	-	81	40.476	ENSACIG00000017892	-	81	40.476
ENSACIG00000010739	-	83	31.856	ENSACIG00000012636	ZNF319	87	30.547
ENSACIG00000010739	-	79	40.367	ENSACIG00000009717	-	86	41.546
ENSACIG00000010739	-	78	45.833	ENSACIG00000009755	-	84	45.833
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ENSACIG00000010739	-	94	31.119	ENSACIG00000001767	zbtb41	69	30.508
ENSACIG00000010739	-	84	43.946	ENSACIG00000019791	-	92	43.498
ENSACIG00000010739	-	52	36.879	ENSACIG00000012604	scrt2	51	36.879
ENSACIG00000010739	-	77	39.216	ENSACIG00000000360	si:ch211-241b2.1	94	39.216
ENSACIG00000010739	-	99	40.606	ENSACIG00000019710	-	86	42.640
ENSACIG00000010739	-	78	43.850	ENSACIG00000007882	-	74	43.850
ENSACIG00000010739	-	83	44.118	ENSACIG00000022625	-	84	42.105
ENSACIG00000010739	-	82	41.935	ENSACIG00000003515	-	99	41.935
ENSACIG00000010739	-	78	34.859	ENSACIG00000000406	prdm5	83	34.859
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ENSACIG00000010739	-	90	35.519	ENSACIG00000007855	-	95	40.945
ENSACIG00000010739	-	85	39.205	ENSACIG00000013604	-	98	37.681
ENSACIG00000010739	-	86	41.860	ENSACIG00000017644	-	91	41.860
ENSACIG00000010739	-	88	43.379	ENSACIG00000017647	-	93	40.690
ENSACIG00000010739	-	90	32.857	ENSACIG00000014282	znf526	84	30.952
ENSACIG00000010739	-	79	44.643	ENSACIG00000022658	-	91	43.878
ENSACIG00000010739	-	81	42.081	ENSACIG00000018440	-	96	43.333
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ENSACIG00000010739	-	88	41.121	ENSACIG00000014123	znf236	65	41.121
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ENSACIG00000010739	-	50	45.238	ENSACIG00000007034	-	71	45.238
ENSACIG00000010739	-	94	37.135	ENSACIG00000015429	-	82	42.667
ENSACIG00000010739	-	88	39.157	ENSACIG00000002190	gfi1b	69	39.157
ENSACIG00000010739	-	74	43.396	ENSACIG00000013946	-	65	43.396
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ENSACIG00000010739	-	79	40.316	ENSACIG00000023794	-	76	40.316
ENSACIG00000010739	-	95	46.914	ENSACIG00000004666	-	99	39.796
ENSACIG00000010739	-	84	41.026	ENSACIG00000010647	-	99	45.029
ENSACIG00000010739	-	87	36.620	ENSACIG00000004641	-	61	36.620
ENSACIG00000010739	-	79	35.429	ENSACIG00000016779	patz1	52	35.429
ENSACIG00000010739	-	77	40.000	ENSACIG00000008886	znf1164	82	40.000
ENSACIG00000010739	-	79	43.056	ENSACIG00000016944	-	77	43.056
ENSACIG00000010739	-	77	41.739	ENSACIG00000006228	-	60	41.739
ENSACIG00000010739	-	73	40.341	ENSACIG00000003720	-	62	40.341
ENSACIG00000010739	-	84	41.629	ENSACIG00000010637	-	57	41.629
ENSACIG00000010739	-	91	33.333	ENSACIG00000023049	znf646	99	33.333
ENSACIG00000010739	-	83	47.857	ENSACIG00000019804	-	82	47.857
ENSACIG00000010739	-	67	37.589	ENSACIG00000018732	zic1	56	37.589
ENSACIG00000010739	-	91	38.730	ENSACIG00000022293	-	91	38.304
ENSACIG00000010739	-	82	44.706	ENSACIG00000023162	-	57	44.706
ENSACIG00000010739	-	51	38.710	ENSACIG00000011318	snai1a	56	38.710
ENSACIG00000010739	-	83	35.242	ENSACIG00000017653	-	93	35.242
ENSACIG00000010739	-	92	39.259	ENSACIG00000013613	scrt1b	77	39.259

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000010739	-	82	38.589	ENSAPOG00000013511	-	58	38.589	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000010739	-	94	35.277	ENSAPOG00000004328	-	99	35.277	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000010739	-	79	35.439	ENSAOCG00000007045	-	84	35.882	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000010739	-	82	39.834	ENSAPEG00000016483	-	64	36.082	Amphiprion_percula
ENSACIG00000010739	-	79	36.593	ENSAPEG00000001596	-	75	36.593	Amphiprion_percula
ENSACIG00000010739	-	94	35.484	ENSATEG00000006085	-	99	35.928	Anabas_testudineus
ENSACIG00000010739	-	79	38.596	ENSACAG00000000082	-	99	38.596	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000010739	-	75	39.062	ENSACAG00000025537	-	98	39.062	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000010739	-	79	43.439	ENSAMXG00000026143	-	95	43.439	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000010739	-	84	44.749	ENSAMXG00000036257	-	98	44.749	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000010739	-	79	44.130	ENSAMXG00000035949	-	74	41.250	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000010739	-	79	41.667	ENSAMXG00000035145	-	64	41.667	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000010739	-	81	41.880	ENSAMXG00000032237	-	94	41.880	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000010739	-	82	45.876	ENSAMXG00000033013	-	85	45.876	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000010739	-	79	44.737	ENSAMXG00000012873	-	96	43.182	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000010739	-	82	39.577	ENSAMXG00000017199	-	52	36.465	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000010739	-	95	35.088	ENSCVAG00000011235	-	89	36.656	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000010739	-	93	34.878	ENSELUG00000013357	-	90	34.878	Esox_lucius
ENSACIG00000010739	-	90	40.000	ENSELUG00000021287	-	83	40.000	Esox_lucius
ENSACIG00000010739	-	79	37.578	ENSELUG00000013844	-	93	32.727	Esox_lucius
ENSACIG00000010739	-	87	39.080	ENSFHEG00000019915	-	86	39.080	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000010739	-	84	37.387	ENSGMOG00000003238	-	100	37.795	Gadus_morhua
ENSACIG00000010739	-	90	37.931	ENSGAFG00000003150	-	100	38.333	Gambusia_affinis
ENSACIG00000010739	-	94	36.646	ENSGAFG00000012977	-	96	36.646	Gambusia_affinis
ENSACIG00000010739	-	78	46.465	ENSIPUG00000021556	-	88	46.465	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000010739	-	91	42.640	ENSIPUG00000004428	-	88	42.640	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000010739	-	98	41.228	ENSIPUG00000006916	-	88	41.228	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000010739	-	93	35.277	ENSKMAG00000004988	-	98	36.533	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000010739	-	82	43.439	ENSLOCG00000014144	-	99	43.439	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000010739	-	79	43.939	ENSLOCG00000014366	-	98	42.466	Lepisosteus_oculatus
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ENSACIG00000010739	-	90	41.919	ENSMALG00000005554	-	96	41.919	Monopterus_albus
ENSACIG00000010739	-	86	43.750	ENSOCUG00000005876	-	100	41.781	Oryctolagus_cuniculus
ENSACIG00000010739	-	80	37.419	ENSPKIG00000006616	-	58	37.419	Paramormyrops_kingsleyae
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ENSACIG00000010739	-	84	37.389	ENSSFOG00015006108	-	59	37.389	Scleropages_formosus
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