EuRBPDB

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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000010818 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: CRM1|emb
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 12381 bases
Position: chrCCOE01001471.1:75601-87981
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000013946	CRM1_C	PF08767.11	1.8e-134	1	1
ENSACIP00000013946	Xpo1	PF08389.12	2.6e-39	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000014319	-	2823	-	ENSACIP00000013946	940 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000010818	-	100	93.936	ENSACIG00000010259	xpo1a	100	93.936

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000010818	-	100	95.851	ENSG00000082898	XPO1	88	95.851	Homo_sapiens
ENSACIG00000010818	-	100	91.702	ENSAPOG00000002354	xpo1a	100	91.702	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000010818	-	100	99.787	ENSAPOG00000004984	-	93	99.787	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000010818	-	100	96.702	ENSAMEG00000003460	XPO1	88	96.702	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000010818	-	100	93.936	ENSAOCG00000018914	xpo1a	88	93.936	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000010818	-	100	99.894	ENSAOCG00000010121	-	100	97.655	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000010818	-	100	93.936	ENSAPEG00000006583	xpo1a	96	93.936	Amphiprion_percula
ENSACIG00000010818	-	100	99.894	ENSAPEG00000007038	-	99	97.761	Amphiprion_percula
ENSACIG00000010818	-	100	94.255	ENSATEG00000020750	xpo1a	98	94.066	Anabas_testudineus
ENSACIG00000010818	-	100	99.894	ENSATEG00000008816	-	93	99.894	Anabas_testudineus
ENSACIG00000010818	-	100	96.915	ENSAPLG00000004008	XPO1	88	96.915	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000010818	-	100	96.809	ENSACAG00000002501	XPO1	88	96.809	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000010818	-	100	95.851	ENSANAG00000020802	XPO1	88	95.851	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000010818	-	100	99.787	ENSACLG00000015192	-	93	99.787	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000010818	-	100	93.936	ENSACLG00000015669	xpo1a	100	93.936	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000010818	-	100	97.979	ENSAMXG00000012704	xpo1b	100	95.962	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000010818	-	100	95.021	ENSAMXG00000003069	xpo1a	100	95.021	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000010818	-	100	96.702	ENSBTAG00000013254	XPO1	88	96.702	Bos_taurus
ENSACIG00000010818	-	99	53.158	WBGene00002078	xpo-1	91	53.947	Caenorhabditis_elegans
ENSACIG00000010818	-	100	95.851	ENSCJAG00000008877	XPO1	88	95.851	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000010818	-	100	96.702	ENSCAFG00000003050	XPO1	88	96.702	Canis_familiaris
ENSACIG00000010818	-	100	96.702	ENSCAFG00020026910	XPO1	94	96.702	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000010818	-	100	96.702	ENSCHIG00000018132	XPO1	88	96.702	Capra_hircus
ENSACIG00000010818	-	100	96.702	ENSTSYG00000004330	XPO1	88	96.702	Carlito_syrichta
ENSACIG00000010818	-	60	91.312	ENSCAPG00000006454	-	100	91.312	Cavia_aperea
ENSACIG00000010818	-	100	95.106	ENSCPOG00000034053	XPO1	88	95.106	Cavia_porcellus
ENSACIG00000010818	-	100	75.079	ENSCCAG00000037445	XPO1	86	75.290	Cebus_capucinus
ENSACIG00000010818	-	100	95.851	ENSCATG00000032674	XPO1	100	95.851	Cercocebus_atys
ENSACIG00000010818	-	100	96.383	ENSCLAG00000012953	XPO1	88	96.383	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000010818	-	100	95.851	ENSCSAG00000014606	XPO1	88	95.851	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000010818	-	80	98.281	ENSCHOG00000012088	XPO1	71	98.281	Choloepus_hoffmanni
ENSACIG00000010818	-	100	96.915	ENSCPBG00000026239	XPO1	94	96.915	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000010818	-	100	82.784	ENSCING00000024562	-	88	82.784	Ciona_intestinalis
ENSACIG00000010818	-	100	80.777	ENSCSAVG00000005965	-	88	80.777	Ciona_savignyi
ENSACIG00000010818	-	100	91.170	ENSCANG00000028883	XPO1	100	95.213	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000010818	-	100	95.638	ENSCGRG00001000263	Xpo1	88	95.638	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000010818	-	100	95.638	ENSCGRG00000001520	Xpo1	88	95.638	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000010818	-	100	98.191	ENSCSEG00000001693	XPO1	100	98.191	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000010818	-	100	99.574	ENSCVAG00000016788	-	88	99.574	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000010818	-	100	93.085	ENSCVAG00000016558	xpo1a	88	93.085	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000010818	-	100	98.191	ENSDARG00000063229	xpo1b	88	98.191	Danio_rerio
ENSACIG00000010818	-	100	95.638	ENSDARG00000078041	xpo1a	88	95.638	Danio_rerio
ENSACIG00000010818	-	100	96.809	ENSDNOG00000005805	XPO1	88	96.809	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000010818	-	90	93.570	ENSDORG00000013050	Xpo1	86	93.570	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000010818	-	100	71.307	FBgn0020497	emb	88	71.307	Drosophila_melanogaster
ENSACIG00000010818	-	93	96.837	ENSETEG00000018045	XPO1	82	96.837	Echinops_telfairi
ENSACIG00000010818	-	100	80.553	ENSEBUG00000012580	-	100	88.273	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000010818	-	100	96.702	ENSEASG00005007223	XPO1	88	96.702	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000010818	-	100	96.702	ENSECAG00000024920	XPO1	94	96.702	Equus_caballus
ENSACIG00000010818	-	91	93.750	ENSEEUG00000009479	XPO1	80	93.750	Erinaceus_europaeus
ENSACIG00000010818	-	99	94.325	ENSELUG00000014306	-	99	94.325	Esox_lucius
ENSACIG00000010818	-	100	96.383	ENSELUG00000012707	xpo1a	100	96.383	Esox_lucius
ENSACIG00000010818	-	100	96.702	ENSFCAG00000002702	XPO1	88	96.702	Felis_catus
ENSACIG00000010818	-	100	96.702	ENSFALG00000010989	XPO1	88	96.702	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000010818	-	99	96.158	ENSFDAG00000014716	XPO1	89	96.158	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000010818	-	100	93.511	ENSFHEG00000002412	xpo1a	88	93.511	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000010818	-	51	99.485	ENSFHEG00000018974	-	98	99.485	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000010818	-	93	98.284	ENSGMOG00000019063	-	82	98.284	Gadus_morhua
ENSACIG00000010818	-	100	95.106	ENSGMOG00000004441	xpo1a	88	95.106	Gadus_morhua
ENSACIG00000010818	-	100	96.915	ENSGALG00000029476	XPO1	88	96.915	Gallus_gallus
ENSACIG00000010818	-	100	93.936	ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	93.936	Gambusia_affinis
ENSACIG00000010818	-	100	99.574	ENSGAFG00000003355	-	95	99.574	Gambusia_affinis
ENSACIG00000010818	-	100	93.617	ENSGACG00000019736	xpo1a	88	93.617	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000010818	-	100	99.043	ENSGACG00000002743	-	88	99.043	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000010818	-	100	96.809	ENSGAGG00000017558	XPO1	88	96.809	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000010818	-	100	95.851	ENSGGOG00000034878	XPO1	88	95.851	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000010818	-	100	99.894	ENSHBUG00000020037	-	93	99.894	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000010818	-	100	93.936	ENSHBUG00000007128	xpo1a	88	93.936	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000010818	-	100	96.277	ENSHGLG00000003115	XPO1	88	96.277	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000010818	-	100	96.277	ENSHGLG00100012227	XPO1	88	96.277	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000010818	-	100	98.298	ENSHCOG00000006949	XPO1	100	98.298	Hippocampus_comes
ENSACIG00000010818	-	100	98.298	ENSIPUG00000012891	Xpo1	88	98.298	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000010818	-	100	96.170	ENSIPUG00000024394	XPO1	88	96.170	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000010818	-	100	96.489	ENSSTOG00000016122	XPO1	88	96.489	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000010818	-	100	96.596	ENSJJAG00000020468	Xpo1	88	96.596	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000010818	-	100	98.936	ENSKMAG00000016218	-	95	98.936	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000010818	-	100	93.830	ENSKMAG00000004830	xpo1a	88	93.830	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000010818	-	100	99.574	ENSLBEG00000005740	-	89	99.466	Labrus_bergylta
ENSACIG00000010818	-	100	91.208	ENSLBEG00000002104	xpo1a	100	91.208	Labrus_bergylta
ENSACIG00000010818	-	100	73.214	ENSLACG00000018213	XPO1	88	73.214	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000010818	-	100	98.298	ENSLOCG00000016095	xpo1b	87	98.298	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000010818	-	100	96.383	ENSLAFG00000014553	XPO1	88	96.383	Loxodonta_africana
ENSACIG00000010818	-	100	95.851	ENSMFAG00000038679	XPO1	88	95.851	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000010818	-	100	95.851	ENSMMUG00000006941	XPO1	88	95.851	Macaca_mulatta
ENSACIG00000010818	-	100	95.851	ENSMNEG00000030909	XPO1	88	95.851	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000010818	-	100	93.856	ENSMLEG00000032004	XPO1	88	93.856	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000010818	-	100	99.574	ENSMAMG00000010568	-	99	99.361	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000010818	-	100	93.936	ENSMAMG00000023037	xpo1a	93	93.936	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000010818	-	100	99.787	ENSMZEG00005018158	-	95	99.787	Maylandia_zebra
ENSACIG00000010818	-	100	93.936	ENSMZEG00005005105	xpo1a	88	93.936	Maylandia_zebra
ENSACIG00000010818	-	77	96.419	ENSMGAG00000001496	-	100	96.419	Meleagris_gallopavo
ENSACIG00000010818	-	100	95.638	ENSMAUG00000006769	Xpo1	92	95.638	Mesocricetus_auratus
ENSACIG00000010818	-	100	96.702	ENSMICG00000027770	XPO1	88	96.702	Microcebus_murinus
ENSACIG00000010818	-	100	95.851	ENSMOCG00000012169	Xpo1	88	95.851	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000010818	-	100	94.149	ENSMMOG00000018767	xpo1a	100	94.149	Mola_mola
ENSACIG00000010818	-	99	98.826	ENSMMOG00000008001	-	99	98.826	Mola_mola
ENSACIG00000010818	-	100	95.638	ENSMODG00000002831	XPO1	88	95.638	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000010818	-	100	99.574	ENSMALG00000007085	-	96	99.466	Monopterus_albus
ENSACIG00000010818	-	100	93.092	ENSMALG00000008617	xpo1a	100	93.092	Monopterus_albus
ENSACIG00000010818	-	100	95.851	MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	88	95.851	Mus_caroli
ENSACIG00000010818	-	100	95.745	ENSMUSG00000020290	Xpo1	88	95.745	Mus_musculus
ENSACIG00000010818	-	100	95.638	MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	88	95.638	Mus_pahari
ENSACIG00000010818	-	100	95.745	MGP_SPRETEiJ_G0016979	Xpo1	88	95.745	Mus_spretus
ENSACIG00000010818	-	100	96.702	ENSMPUG00000005560	XPO1	88	96.702	Mustela_putorius_furo
ENSACIG00000010818	-	100	96.596	ENSMLUG00000010670	XPO1	88	96.596	Myotis_lucifugus
ENSACIG00000010818	-	100	96.702	ENSNGAG00000022158	Xpo1	88	96.702	Nannospalax_galili
ENSACIG00000010818	-	100	99.894	ENSNBRG00000012229	-	100	99.894	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000010818	-	100	93.936	ENSNBRG00000003776	xpo1a	88	93.936	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000010818	-	100	91.632	ENSNLEG00000009680	XPO1	88	91.632	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000010818	-	58	97.778	ENSMEUG00000013277	-	52	97.778	Notamacropus_eugenii
ENSACIG00000010818	-	100	96.489	ENSOPRG00000012615	XPO1	88	96.489	Ochotona_princeps
ENSACIG00000010818	-	99	96.463	ENSODEG00000012632	XPO1	88	96.064	Octodon_degus
ENSACIG00000010818	-	100	99.894	ENSONIG00000002969	-	94	99.894	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000010818	-	100	89.692	ENSONIG00000000019	xpo1a	88	89.692	Oreochromis_niloticus
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ENSACIG00000010818	-	100	96.702	ENSOCUG00000004986	XPO1	88	96.702	Oryctolagus_cuniculus
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ENSACIG00000010818	-	100	93.085	ENSORLG00020015852	xpo1a	88	93.085	Oryzias_latipes_hni
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ENSACIG00000010818	-	100	99.043	ENSORLG00015008640	-	95	99.043	Oryzias_latipes_hsok
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ENSACIG00000010818	-	100	95.957	ENSPEMG00000010103	Xpo1	88	95.957	Peromyscus_maniculatus_bairdii
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ENSACIG00000010818	-	100	93.723	ENSPREG00000020796	xpo1a	88	93.723	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000010818	-	100	99.681	ENSPREG00000010135	-	95	99.681	Poecilia_reticulata
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ENSACIG00000010818	-	100	96.383	ENSPNAG00000014209	xpo1a	100	91.064	Pygocentrus_nattereri
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ENSACIG00000010818	-	100	95.745	ENSRNOG00000009935	Xpo1	88	95.745	Rattus_norvegicus
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ENSACIG00000010818	-	100	99.574	ENSSMAG00000015718	-	93	99.574	Scophthalmus_maximus
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ENSACIG00000010818	-	100	99.574	ENSSPAG00000008738	-	100	94.894	Stegastes_partitus
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ENSACIG00000010818	-	100	96.170	ENSXETG00000002224	xpo1	88	96.170	Xenopus_tropicalis
ENSACIG00000010818	-	89	99.323	ENSXCOG00000006625	-	97	99.323	Xiphophorus_couchianus
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ENSACIG00000010818	-	100	93.723	ENSXMAG00000005790	xpo1a	88	93.723	Xiphophorus_maculatus
ENSACIG00000010818	-	100	99.574	ENSXMAG00000007353	-	93	99.574	Xiphophorus_maculatus