EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000010914 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: RAB41
Alias: -
Full Name: RAB41%2C member RAS oncogene family
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 7257 bases
Position: chrCCOE01000489.1:708663-715919
Accession: 18293
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000014025	MMR_HSR1	PF01926.23	9.1e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000014405	RAB41-201	636	-	ENSACIP00000014025	211 (aa)	-	UPI0000E3E362

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000010914	RAB41	77	39.766	ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	77	39.766
ENSACIG00000010914	RAB41	79	40.936	ENSACIG00000008102	rab18b	83	40.936
ENSACIG00000010914	RAB41	91	34.021	ENSACIG00000017414	rab25b	94	34.021
ENSACIG00000010914	RAB41	72	45.395	ENSACIG00000003157	-	80	45.395
ENSACIG00000010914	RAB41	83	35.294	ENSACIG00000007739	rab9b	90	35.294
ENSACIG00000010914	RAB41	79	38.235	ENSACIG00000000642	rab36	65	38.235
ENSACIG00000010914	RAB41	78	38.788	ENSACIG00000014012	rab22a	85	38.788
ENSACIG00000010914	RAB41	74	36.306	ENSACIG00000024374	rab11ba	65	36.306
ENSACIG00000010914	RAB41	74	36.306	ENSACIG00000024376	-	72	36.306
ENSACIG00000010914	RAB41	98	81.043	ENSACIG00000014094	rab6bb	99	81.043
ENSACIG00000010914	RAB41	75	33.540	ENSACIG00000004859	rab34b	66	35.185
ENSACIG00000010914	RAB41	82	35.714	ENSACIG00000022208	-	94	35.714
ENSACIG00000010914	RAB41	70	41.176	ENSACIG00000013119	-	76	40.909
ENSACIG00000010914	RAB41	74	32.278	ENSACIG00000000699	hrasb	83	32.278
ENSACIG00000010914	RAB41	92	33.500	ENSACIG00000011024	si:dkey-13a21.4	96	33.500
ENSACIG00000010914	RAB41	66	31.206	ENSACIG00000015128	si:ch73-116o1.2	68	31.206
ENSACIG00000010914	RAB41	88	93.548	ENSACIG00000007154	rab6ba	87	93.548
ENSACIG00000010914	RAB41	70	42.282	ENSACIG00000021459	zgc:101559	65	42.282
ENSACIG00000010914	RAB41	92	36.000	ENSACIG00000013630	RAB7A	96	36.000
ENSACIG00000010914	RAB41	75	44.304	ENSACIG00000008584	rab13	76	44.304
ENSACIG00000010914	RAB41	88	31.088	ENSACIG00000006558	-	95	31.088
ENSACIG00000010914	RAB41	75	44.304	ENSACIG00000010619	rab15	74	44.304
ENSACIG00000010914	RAB41	70	42.282	ENSACIG00000021855	rab33ba	62	42.282
ENSACIG00000010914	RAB41	55	31.933	ENSACIG00000013359	arl4d	59	31.933
ENSACIG00000010914	RAB41	94	32.692	ENSACIG00000000154	RAB39B	98	32.692
ENSACIG00000010914	RAB41	73	33.333	ENSACIG00000000100	kras	50	33.333
ENSACIG00000010914	RAB41	92	35.577	ENSACIG00000009006	zgc:171927	96	35.577
ENSACIG00000010914	RAB41	98	87.923	ENSACIG00000014605	rab6a	99	87.923
ENSACIG00000010914	RAB41	92	36.000	ENSACIG00000022381	-	96	36.000
ENSACIG00000010914	RAB41	86	32.967	ENSACIG00000019803	rab25a	85	32.967
ENSACIG00000010914	RAB41	75	40.881	ENSACIG00000023222	-	69	40.881
ENSACIG00000010914	RAB41	69	36.913	ENSACIG00000008620	rab34a	67	36.913
ENSACIG00000010914	RAB41	92	36.058	ENSACIG00000009306	RAB15	96	36.058
ENSACIG00000010914	RAB41	76	36.025	ENSACIG00000017403	rab11al	75	36.025
ENSACIG00000010914	RAB41	91	33.333	ENSACIG00000018043	rab9a	97	33.333
ENSACIG00000010914	RAB41	79	33.333	ENSACIG00000009617	rab18a	81	33.333
ENSACIG00000010914	RAB41	66	40.000	ENSACIG00000020496	rab23	74	40.132
ENSACIG00000010914	RAB41	74	36.943	ENSACIG00000003092	rab11a	73	36.943
ENSACIG00000010914	RAB41	73	32.692	ENSACIG00000017824	rras	79	32.692
ENSACIG00000010914	RAB41	92	36.410	ENSACIG00000014625	-	95	36.410
ENSACIG00000010914	RAB41	94	34.615	ENSACIG00000023837	-	98	34.615
ENSACIG00000010914	RAB41	82	42.529	ENSACIG00000010896	rab5c	81	42.529
ENSACIG00000010914	RAB41	92	38.500	ENSACIG00000019049	rab1ab	97	38.500
ENSACIG00000010914	RAB41	63	36.090	ENSACIG00000019631	rab11bb	70	36.090
ENSACIG00000010914	RAB41	75	39.375	ENSACIG00000006949	RAB17	70	39.375
ENSACIG00000010914	RAB41	84	43.503	ENSACIG00000019251	rab5aa	82	43.503
ENSACIG00000010914	RAB41	90	30.882	ENSACIG00000018406	rasl11a	80	30.392
ENSACIG00000010914	RAB41	93	37.745	ENSACIG00000022520	rab33a	89	37.745
ENSACIG00000010914	RAB41	73	39.744	ENSACIG00000020616	rab12	65	38.994
ENSACIG00000010914	RAB41	73	38.217	ENSACIG00000003102	rab42a	72	38.217

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000010914	RAB41	100	100.000	ENSAOCG00000022426	RAB41	100	100.000	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000010914	RAB41	100	93.365	ENSAPEG00000007931	RAB41	100	93.365	Amphiprion_percula
ENSACIG00000010914	RAB41	94	70.707	ENSTSYG00000000768	RAB41	87	70.707	Carlito_syrichta
ENSACIG00000010914	RAB41	93	67.005	ENSCATG00000037380	RAB41	87	67.005	Cercocebus_atys
ENSACIG00000010914	RAB41	100	96.209	ENSCPBG00000014340	RAB41	100	96.209	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000010914	RAB41	100	95.261	ENSFHEG00000015996	RAB41	100	95.261	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000010914	RAB41	100	100.000	ENSHBUG00000014338	RAB41	100	100.000	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000010914	RAB41	100	100.000	ENSLBEG00000008746	RAB41	100	100.000	Labrus_bergylta
ENSACIG00000010914	RAB41	93	68.528	ENSMFAG00000000762	RAB41	87	68.528	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000010914	RAB41	93	68.528	ENSMMUG00000013937	RAB41	87	68.528	Macaca_mulatta
ENSACIG00000010914	RAB41	93	68.020	ENSMNEG00000045569	RAB41	87	68.020	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000010914	RAB41	91	67.358	ENSMLEG00000038149	RAB41	86	67.358	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000010914	RAB41	100	99.528	ENSONIG00000002774	RAB41	100	99.528	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000010914	RAB41	100	99.052	ENSORLG00000027669	RAB41	100	99.052	Oryzias_latipes
ENSACIG00000010914	RAB41	100	92.417	ENSORLG00015010161	RAB41	100	92.417	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000010914	RAB41	100	99.052	ENSOMEG00000017258	RAB41	100	99.052	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000010914	RAB41	93	68.020	ENSPANG00000007317	RAB41	87	68.020	Papio_anubis
ENSACIG00000010914	RAB41	99	94.737	ENSPKIG00000014618	-	99	94.737	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000010914	RAB41	100	100.000	ENSPMGG00000017830	RAB41	100	100.000	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000010914	RAB41	100	100.000	ENSPFOG00000011424	RAB41	100	100.000	Poecilia_formosa
ENSACIG00000010914	RAB41	100	100.000	ENSPREG00000009535	RAB41	100	100.000	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000010914	RAB41	93	68.528	ENSRBIG00000027991	RAB41	87	68.528	Rhinopithecus_bieti
ENSACIG00000010914	RAB41	99	98.565	ENSSFOG00015011268	RAB41	99	98.565	Scleropages_formosus
ENSACIG00000010914	RAB41	100	98.131	ENSTNIG00000016831	RAB41	100	98.131	Tetraodon_nigroviridis
ENSACIG00000010914	RAB41	99	96.172	ENSXETG00000030938	rab41	99	96.172	Xenopus_tropicalis
ENSACIG00000010914	RAB41	100	100.000	ENSXCOG00000015802	RAB41	100	100.000	Xiphophorus_couchianus
ENSACIG00000010914	RAB41	100	100.000	ENSXMAG00000027787	RAB41	100	100.000	Xiphophorus_maculatus