EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000010932 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: celf3a
Alias: celf3|etr-1|etr1|tnrc4
Full Name: cugbp%2C Elav-like family member 3a
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 30236 bases
Position: chrCCOE01000891.1:223485-253720
Accession: ZDB-GENE-000501-2
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000014065	RRM_1	PF00076.22	4.2e-55	1	3
ENSACIP00000014065	RRM_1	PF00076.22	4.2e-55	2	3
ENSACIP00000014065	RRM_1	PF00076.22	4.2e-55	3	3

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000014446	-	1365	-	ENSACIP00000014065	454 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000010932	celf3a	58	33.766	ENSACIG00000021116	rbm39b	64	33.766
ENSACIG00000010932	celf3a	57	41.860	ENSACIG00000024190	elavl3	74	41.860
ENSACIG00000010932	celf3a	100	58.297	ENSACIG00000018097	celf4	90	59.477
ENSACIG00000010932	celf3a	59	46.154	ENSACIG00000000511	-	96	45.679
ENSACIG00000010932	celf3a	61	40.741	ENSACIG00000008793	elavl4	72	40.741
ENSACIG00000010932	celf3a	73	32.500	ENSACIG00000021779	rbms2a	69	32.500
ENSACIG00000010932	celf3a	99	35.632	ENSACIG00000010855	ELAVL2	85	41.975
ENSACIG00000010932	celf3a	77	34.884	ENSACIG00000021004	-	75	34.884
ENSACIG00000010932	celf3a	100	85.495	ENSACIG00000007698	celf3b	100	85.495
ENSACIG00000010932	celf3a	99	43.659	ENSACIG00000019405	-	98	44.807
ENSACIG00000010932	celf3a	77	97.619	ENSACIG00000003650	si:dkey-205h23.2	90	97.619
ENSACIG00000010932	celf3a	62	38.636	ENSACIG00000018226	elavl1a	89	45.679
ENSACIG00000010932	celf3a	66	34.091	ENSACIG00000014376	-	67	36.709
ENSACIG00000010932	celf3a	74	33.750	ENSACIG00000021113	RBMS3	70	33.750
ENSACIG00000010932	celf3a	100	65.293	ENSACIG00000015357	celf5a	94	65.293
ENSACIG00000010932	celf3a	99	42.708	ENSACIG00000004318	-	98	44.491
ENSACIG00000010932	celf3a	55	34.444	ENSACIG00000016352	tia1l	71	37.037

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000010932	celf3a	100	77.137	ENSG00000159409	CELF3	100	77.137	Homo_sapiens
ENSACIG00000010932	celf3a	100	76.872	ENSAPOG00000000910	celf3b	100	76.872	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000010932	celf3a	100	94.505	ENSAPOG00000006015	celf3a	100	94.505	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000010932	celf3a	97	75.439	ENSAMEG00000000509	CELF3	97	75.219	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000010932	celf3a	100	94.725	ENSAOCG00000020552	celf3a	100	94.725	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000010932	celf3a	100	77.533	ENSAOCG00000007824	celf3b	100	77.533	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000010932	celf3a	100	94.725	ENSAPEG00000008728	celf3a	100	94.725	Amphiprion_percula
ENSACIG00000010932	celf3a	100	81.099	ENSAPEG00000007642	celf3b	100	81.099	Amphiprion_percula
ENSACIG00000010932	celf3a	100	93.846	ENSATEG00000008884	celf3a	100	81.498	Anabas_testudineus
ENSACIG00000010932	celf3a	100	82.418	ENSATEG00000023560	celf3b	100	82.418	Anabas_testudineus
ENSACIG00000010932	celf3a	98	58.649	ENSACAG00000016959	-	99	58.649	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000010932	celf3a	100	74.304	ENSANAG00000030590	CELF3	100	74.322	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000010932	celf3a	100	85.275	ENSACLG00000020342	celf3b	100	85.275	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000010932	celf3a	91	88.136	ENSACLG00000009631	celf3a	97	88.136	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000010932	celf3a	98	88.918	ENSAMXG00000009926	celf3a	100	88.918	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000010932	celf3a	83	80.000	ENSAMXG00000012489	celf3b	100	79.737	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000010932	celf3a	100	77.586	ENSBTAG00000019131	CELF3	93	86.861	Bos_taurus
ENSACIG00000010932	celf3a	74	61.357	ENSCJAG00000039430	-	68	61.357	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000010932	celf3a	100	76.709	ENSCJAG00000007857	CELF3	100	76.709	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000010932	celf3a	97	77.263	ENSCAFG00000012794	CELF3	83	77.263	Canis_familiaris
ENSACIG00000010932	celf3a	100	75.161	ENSCAFG00020009731	CELF3	100	75.161	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000010932	celf3a	100	77.849	ENSCHIG00000025847	CELF3	100	77.849	Capra_hircus
ENSACIG00000010932	celf3a	100	77.538	ENSTSYG00000033066	CELF3	100	77.538	Carlito_syrichta
ENSACIG00000010932	celf3a	100	66.523	ENSCAPG00000015341	CELF3	83	95.238	Cavia_aperea
ENSACIG00000010932	celf3a	100	77.253	ENSCPOG00000003539	CELF3	100	77.253	Cavia_porcellus
ENSACIG00000010932	celf3a	100	76.709	ENSCCAG00000024686	CELF3	100	76.709	Cebus_capucinus
ENSACIG00000010932	celf3a	100	77.137	ENSCATG00000030846	CELF3	100	77.137	Cercocebus_atys
ENSACIG00000010932	celf3a	98	59.956	ENSCATG00000044494	-	91	59.825	Cercocebus_atys
ENSACIG00000010932	celf3a	100	77.849	ENSCLAG00000000586	CELF3	100	77.849	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000010932	celf3a	83	74.490	ENSCSAG00000001812	CELF3	100	74.490	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000010932	celf3a	100	77.243	ENSCPBG00000008870	CELF3	100	77.024	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000010932	celf3a	100	77.302	ENSCANG00000038866	CELF3	100	77.302	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000010932	celf3a	83	56.364	ENSCGRG00001002551	Celf5	89	58.592	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000010932	celf3a	100	74.291	ENSCGRG00001019777	Celf3	100	74.291	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000010932	celf3a	100	74.291	ENSCGRG00000015342	Celf3	100	74.291	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000010932	celf3a	100	93.846	ENSCSEG00000007913	celf3a	100	93.846	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000010932	celf3a	100	84.749	ENSCSEG00000002581	celf3b	100	84.749	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000010932	celf3a	100	94.066	ENSCVAG00000018056	celf3a	100	94.066	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000010932	celf3a	100	84.749	ENSCVAG00000009184	celf3b	100	84.749	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000010932	celf3a	100	78.681	ENSDARG00000006983	celf3b	100	78.242	Danio_rerio
ENSACIG00000010932	celf3a	100	90.769	ENSDARG00000034668	celf3a	100	90.769	Danio_rerio
ENSACIG00000010932	celf3a	100	77.874	ENSDNOG00000041501	CELF3	100	78.308	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000010932	celf3a	100	75.523	ENSDORG00000002488	Celf3	100	75.523	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000010932	celf3a	100	77.137	ENSEASG00005005254	CELF3	100	77.137	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000010932	celf3a	100	74.145	ENSECAG00000020365	CELF3	100	74.490	Equus_caballus
ENSACIG00000010932	celf3a	70	83.333	ENSEEUG00000010622	CELF3	66	83.333	Erinaceus_europaeus
ENSACIG00000010932	celf3a	100	78.452	ENSELUG00000013477	celf3b	100	78.661	Esox_lucius
ENSACIG00000010932	celf3a	100	87.912	ENSELUG00000006121	celf3a	100	87.912	Esox_lucius
ENSACIG00000010932	celf3a	100	77.253	ENSFCAG00000007908	CELF3	100	77.253	Felis_catus
ENSACIG00000010932	celf3a	100	77.039	ENSFDAG00000011452	CELF3	100	77.039	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000010932	celf3a	100	85.055	ENSFHEG00000021947	celf3b	100	85.055	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000010932	celf3a	100	94.714	ENSFHEG00000012530	celf3a	100	94.714	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000010932	celf3a	100	76.872	ENSGMOG00000002937	celf3a	100	76.872	Gadus_morhua
ENSACIG00000010932	celf3a	100	74.781	ENSGMOG00000006107	celf3b	99	74.781	Gadus_morhua
ENSACIG00000010932	celf3a	100	72.516	ENSGALG00000028478	CELF3	100	72.269	Gallus_gallus
ENSACIG00000010932	celf3a	100	93.846	ENSGAFG00000004128	celf3a	100	93.846	Gambusia_affinis
ENSACIG00000010932	celf3a	100	83.660	ENSGAFG00000012731	celf3b	100	83.660	Gambusia_affinis
ENSACIG00000010932	celf3a	100	84.683	ENSGACG00000011707	celf3b	99	84.683	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000010932	celf3a	100	89.451	ENSGACG00000003274	celf3a	100	89.451	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000010932	celf3a	100	70.460	ENSGAGG00000019676	CELF3	100	69.365	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000010932	celf3a	83	74.425	ENSGGOG00000023049	-	100	74.425	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000010932	celf3a	98	62.103	ENSGGOG00000041211	CELF5	100	61.951	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000010932	celf3a	100	77.253	ENSGGOG00000021973	-	100	77.253	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000010932	celf3a	100	94.505	ENSHBUG00000001061	celf3a	100	94.505	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000010932	celf3a	100	84.967	ENSHBUG00000003367	celf3b	100	84.967	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000010932	celf3a	100	77.088	ENSHGLG00000006045	CELF3	100	77.088	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000010932	celf3a	100	77.088	ENSHGLG00100008013	CELF3	100	77.088	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000010932	celf3a	98	82.383	ENSHCOG00000000397	celf3b	100	82.383	Hippocampus_comes
ENSACIG00000010932	celf3a	100	79.560	ENSHCOG00000005746	celf3a	100	80.000	Hippocampus_comes
ENSACIG00000010932	celf3a	100	89.890	ENSIPUG00000008218	celf3a	89	89.890	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000010932	celf3a	100	77.088	ENSSTOG00000022934	CELF3	100	77.088	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000010932	celf3a	100	72.892	ENSJJAG00000020104	Celf3	100	73.293	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000010932	celf3a	73	60.534	ENSJJAG00000006902	Celf5	84	60.534	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000010932	celf3a	100	93.407	ENSKMAG00000011999	celf3a	100	93.407	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000010932	celf3a	100	79.780	ENSKMAG00000001269	celf3b	100	79.780	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000010932	celf3a	100	84.802	ENSLBEG00000026140	celf3b	100	84.802	Labrus_bergylta
ENSACIG00000010932	celf3a	100	89.868	ENSLBEG00000026936	celf3a	100	89.868	Labrus_bergylta
ENSACIG00000010932	celf3a	100	80.786	ENSLACG00000002301	CELF3	100	82.533	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000010932	celf3a	98	82.507	ENSLOCG00000006518	celf3b	100	82.507	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000010932	celf3a	100	70.747	ENSLAFG00000030147	CELF3	100	70.954	Loxodonta_africana
ENSACIG00000010932	celf3a	100	76.321	ENSMFAG00000040182	CELF3	100	76.321	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000010932	celf3a	98	62.103	ENSMFAG00000022580	-	100	61.951	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000010932	celf3a	100	73.362	ENSMMUG00000016952	CELF3	100	73.517	Macaca_mulatta
ENSACIG00000010932	celf3a	98	60.827	ENSMMUG00000015513	-	90	60.976	Macaca_mulatta
ENSACIG00000010932	celf3a	74	61.357	ENSMNEG00000001853	-	85	61.357	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000010932	celf3a	100	76.321	ENSMNEG00000044120	CELF3	100	76.321	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000010932	celf3a	100	76.972	ENSMLEG00000028006	CELF3	100	76.972	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000010932	celf3a	100	84.967	ENSMAMG00000015079	celf3b	100	84.967	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000010932	celf3a	100	95.815	ENSMAMG00000001436	celf3a	100	95.815	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000010932	celf3a	100	95.815	ENSMZEG00005026501	celf3a	100	95.815	Maylandia_zebra
ENSACIG00000010932	celf3a	100	85.275	ENSMZEG00005016013	celf3b	100	85.275	Maylandia_zebra
ENSACIG00000010932	celf3a	100	77.634	ENSMAUG00000007850	Celf3	100	77.634	Mesocricetus_auratus
ENSACIG00000010932	celf3a	83	56.104	ENSMAUG00000020336	Celf5	89	58.310	Mesocricetus_auratus
ENSACIG00000010932	celf3a	100	77.302	ENSMICG00000010644	CELF3	100	77.302	Microcebus_murinus
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ENSACIG00000010932	celf3a	100	51.739	ENSXCOG00000009514	-	85	53.478	Xiphophorus_couchianus
ENSACIG00000010932	celf3a	100	94.066	ENSXMAG00000014619	celf3a	100	94.066	Xiphophorus_maculatus
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