EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000010966 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 5394 bases
Position: chrCCOE01000049.1:299923-305316
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000014103	zf-C2H2	PF00096.26	3.4e-34	1	8
ENSACIP00000014103	zf-C2H2	PF00096.26	3.4e-34	2	8
ENSACIP00000014103	zf-C2H2	PF00096.26	3.4e-34	3	8
ENSACIP00000014103	zf-C2H2	PF00096.26	3.4e-34	4	8
ENSACIP00000014103	zf-C2H2	PF00096.26	3.4e-34	5	8
ENSACIP00000014103	zf-C2H2	PF00096.26	3.4e-34	6	8
ENSACIP00000014103	zf-C2H2	PF00096.26	3.4e-34	7	8
ENSACIP00000014103	zf-C2H2	PF00096.26	3.4e-34	8	8
ENSACIP00000014103	zf-met	PF12874.7	1.1e-09	1	3
ENSACIP00000014103	zf-met	PF12874.7	1.1e-09	2	3
ENSACIP00000014103	zf-met	PF12874.7	1.1e-09	3	3

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000014484	-	1605	-	ENSACIP00000014103	534 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000010966	-	68	50.958	ENSACIG00000011541	-	94	50.958
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ENSACIG00000010966	-	52	57.709	ENSACIG00000018440	-	96	57.709
ENSACIG00000010966	-	60	52.107	ENSACIG00000010637	-	70	52.107
ENSACIG00000010966	-	51	53.810	ENSACIG00000009780	-	85	51.795
ENSACIG00000010966	-	51	47.059	ENSACIG00000003515	-	88	49.558
ENSACIG00000010966	-	71	45.833	ENSACIG00000022625	-	99	50.435
ENSACIG00000010966	-	74	58.333	ENSACIG00000004041	-	98	61.508
ENSACIG00000010966	-	50	42.017	ENSACIG00000023049	znf646	99	38.235
ENSACIG00000010966	-	69	57.419	ENSACIG00000022645	-	72	57.419
ENSACIG00000010966	-	51	38.318	ENSACIG00000012604	scrt2	50	38.318
ENSACIG00000010966	-	67	50.919	ENSACIG00000003556	-	92	50.919
ENSACIG00000010966	-	67	54.580	ENSACIG00000013604	-	99	55.479
ENSACIG00000010966	-	68	42.636	ENSACIG00000011515	-	97	42.636
ENSACIG00000010966	-	50	63.019	ENSACIG00000000311	-	80	61.644
ENSACIG00000010966	-	50	46.535	ENSACIG00000018404	-	77	45.161
ENSACIG00000010966	-	73	59.450	ENSACIG00000017647	-	97	57.576
ENSACIG00000010966	-	55	41.429	ENSACIG00000017644	-	87	41.429
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ENSACIG00000010966	-	58	42.754	ENSACIG00000006377	-	64	42.754
ENSACIG00000010966	-	61	61.940	ENSACIG00000016944	-	94	61.940
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ENSACIG00000010966	-	53	45.583	ENSACIG00000004626	-	89	45.583
ENSACIG00000010966	-	51	44.444	ENSACIG00000019534	-	83	44.444
ENSACIG00000010966	-	69	56.870	ENSACIG00000004745	-	92	58.712
ENSACIG00000010966	-	73	60.593	ENSACIG00000017050	-	95	65.196
ENSACIG00000010966	-	69	58.865	ENSACIG00000018022	-	79	58.156
ENSACIG00000010966	-	53	53.363	ENSACIG00000012084	-	99	53.363
ENSACIG00000010966	-	50	44.279	ENSACIG00000013163	-	82	44.151
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ENSACIG00000010966	-	54	33.557	ENSACIG00000002944	-	86	33.557
ENSACIG00000010966	-	51	52.023	ENSACIG00000009755	-	76	48.315
ENSACIG00000010966	-	56	47.692	ENSACIG00000015429	-	84	51.370
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ENSACIG00000010966	-	54	54.913	ENSACIG00000022658	-	93	55.431
ENSACIG00000010966	-	56	41.743	ENSACIG00000023313	-	88	41.743
ENSACIG00000010966	-	69	55.844	ENSACIG00000018059	-	79	55.844
ENSACIG00000010966	-	50	40.323	ENSACIG00000000406	prdm5	63	39.841
ENSACIG00000010966	-	50	38.926	ENSACIG00000012263	znf319b	90	39.189
ENSACIG00000010966	-	67	37.313	ENSACIG00000013613	scrt1b	81	37.313
ENSACIG00000010966	-	51	38.843	ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	72	38.843
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ENSACIG00000010966	-	70	52.083	ENSACIG00000007464	-	81	52.083
ENSACIG00000010966	-	53	41.772	ENSACIG00000015411	-	85	41.772
ENSACIG00000010966	-	66	52.047	ENSACIG00000003720	-	83	52.047
ENSACIG00000010966	-	61	50.510	ENSACIG00000023794	-	76	50.510
ENSACIG00000010966	-	69	60.773	ENSACIG00000023162	-	78	60.773
ENSACIG00000010966	-	69	55.714	ENSACIG00000017013	-	79	55.714
ENSACIG00000010966	-	51	43.069	ENSACIG00000009128	-	80	43.478
ENSACIG00000010966	-	50	48.800	ENSACIG00000019815	-	89	48.800
ENSACIG00000010966	-	75	55.605	ENSACIG00000019447	-	94	55.605
ENSACIG00000010966	-	50	53.552	ENSACIG00000022738	-	94	53.552
ENSACIG00000010966	-	56	39.333	ENSACIG00000017166	-	94	39.333
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ENSACIG00000010966	-	75	50.198	ENSACIG00000023212	-	96	50.575
ENSACIG00000010966	-	57	31.692	ENSACIG00000014282	znf526	85	32.308
ENSACIG00000010966	-	52	47.097	ENSACIG00000019804	-	82	47.097
ENSACIG00000010966	-	64	42.319	ENSACIG00000006806	-	82	42.319
ENSACIG00000010966	-	54	42.775	ENSACIG00000021986	-	92	42.775
ENSACIG00000010966	-	60	52.299	ENSACIG00000006755	-	90	52.299
ENSACIG00000010966	-	73	60.360	ENSACIG00000004666	-	99	60.630
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ENSACIG00000010966	-	77	51.977	ENSACIG00000006172	-	99	53.061
ENSACIG00000010966	-	55	55.556	ENSACIG00000022293	-	97	55.556
ENSACIG00000010966	-	69	57.143	ENSACIG00000019102	-	64	53.846
ENSACIG00000010966	-	72	66.834	ENSACIG00000000286	-	83	66.834
ENSACIG00000010966	-	54	34.524	ENSACIG00000004096	PRDM15	54	33.803
ENSACIG00000010966	-	51	42.718	ENSACIG00000016117	-	86	43.874
ENSACIG00000010966	-	70	47.399	ENSACIG00000015835	-	92	54.082
ENSACIG00000010966	-	53	49.270	ENSACIG00000009717	-	90	52.569
ENSACIG00000010966	-	68	55.914	ENSACIG00000016182	-	93	55.914
ENSACIG00000010966	-	69	54.310	ENSACIG00000018952	-	84	54.310
ENSACIG00000010966	-	73	57.619	ENSACIG00000000360	si:ch211-241b2.1	99	57.619
ENSACIG00000010966	-	66	64.315	ENSACIG00000016932	-	73	64.315
ENSACIG00000010966	-	50	46.154	ENSACIG00000007855	-	88	46.154
ENSACIG00000010966	-	51	40.594	ENSACIG00000017683	-	77	40.385
ENSACIG00000010966	-	71	51.872	ENSACIG00000011153	-	99	51.872
ENSACIG00000010966	-	52	42.211	ENSACIG00000013750	-	64	42.105
ENSACIG00000010966	-	66	52.362	ENSACIG00000019791	-	93	58.009
ENSACIG00000010966	-	53	46.207	ENSACIG00000002190	gfi1b	63	46.207
ENSACIG00000010966	-	52	40.449	ENSACIG00000014123	znf236	67	40.449

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000010966	-	66	42.781	ENSAPOG00000022234	-	83	55.760	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000010966	-	65	56.410	ENSAPOG00000005986	-	98	56.410	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000010966	-	73	53.628	ENSAPOG00000008053	-	99	53.628	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000010966	-	58	54.167	ENSAPOG00000020343	-	96	54.167	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000010966	-	50	62.162	ENSAPOG00000022964	-	98	62.162	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000010966	-	77	56.051	ENSAPOG00000014378	-	94	56.452	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000010966	-	73	53.448	ENSAPOG00000007528	-	75	53.448	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000010966	-	68	53.869	ENSAPOG00000014714	-	98	53.869	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000010966	-	77	60.674	ENSAPOG00000000503	-	99	56.494	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000010966	-	52	56.818	ENSAPOG00000004878	-	90	56.818	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000010966	-	74	55.507	ENSAPOG00000001742	-	68	55.507	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000010966	-	80	52.000	ENSAPOG00000020864	-	96	56.345	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000010966	-	52	63.953	ENSAPOG00000013065	-	99	63.953	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000010966	-	70	59.777	ENSAPOG00000001725	-	98	57.265	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000010966	-	73	46.009	ENSAPOG00000018127	-	85	46.009	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000010966	-	50	54.680	ENSAPOG00000015096	-	99	54.680	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000010966	-	51	61.739	ENSAPOG00000006282	-	86	61.739	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000010966	-	82	47.132	ENSAPOG00000024332	-	94	53.960	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000010966	-	82	50.000	ENSAPOG00000023479	-	99	50.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000010966	-	82	54.150	ENSAPOG00000013125	-	94	57.708	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000010966	-	50	64.286	ENSAPOG00000022086	-	96	64.286	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000010966	-	77	53.086	ENSAPOG00000002691	-	90	53.086	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000010966	-	51	59.659	ENSAPOG00000005681	-	90	59.659	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000010966	-	58	61.446	ENSAPOG00000007955	-	79	60.714	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000010966	-	63	55.102	ENSAOCG00000016737	-	100	56.170	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000010966	-	72	58.678	ENSAOCG00000011204	-	81	60.697	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000010966	-	72	44.022	ENSAOCG00000009970	-	87	44.022	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000010966	-	78	46.729	ENSAOCG00000014651	-	97	46.729	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000010966	-	72	56.061	ENSAOCG00000016287	-	95	56.061	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000010966	-	72	54.135	ENSAOCG00000002585	-	94	54.887	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000010966	-	59	57.018	ENSAOCG00000024281	-	98	57.018	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000010966	-	77	52.899	ENSAOCG00000022375	-	100	52.899	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000010966	-	84	58.590	ENSAOCG00000018307	-	99	60.177	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000010966	-	67	51.875	ENSAOCG00000006793	-	99	51.875	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000010966	-	54	54.140	ENSAOCG00000016088	-	87	54.140	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000010966	-	75	56.388	ENSAOCG00000018543	-	96	56.388	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000010966	-	72	55.738	ENSAOCG00000015586	-	95	59.766	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000010966	-	51	56.098	ENSAOCG00000000448	-	96	56.098	Amphiprion_ocellaris
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