EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000010992 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 10535 bases
Position: chrCCOE01000051.1:34812-45346
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000014176	MMR_HSR1	PF01926.23	8.8e-15	1	2
ENSACIP00000014176	MMR_HSR1	PF01926.23	8.8e-15	2	2
ENSACIP00000014195	MMR_HSR1	PF01926.23	4e-07	1	1
ENSACIP00000014219	MMR_HSR1	PF01926.23	8.8e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000014600	-	705	-	ENSACIP00000014219	234 (aa)	-	-
ENSACIT00000014557	-	2166	-	ENSACIP00000014176	722 (aa)	-	-
ENSACIT00000014576	-	747	-	ENSACIP00000014195	248 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000010992	-	91	59.916	ENSACIG00000023724	-	90	61.404
ENSACIG00000010992	-	91	60.526	ENSACIG00000000621	-	85	60.526
ENSACIG00000010992	-	87	62.844	ENSACIG00000014652	-	96	59.574
ENSACIG00000010992	-	92	57.500	ENSACIG00000008165	-	98	57.874
ENSACIG00000010992	-	93	49.858	ENSACIG00000017561	-	98	49.858
ENSACIG00000010992	-	93	56.466	ENSACIG00000011491	-	97	49.080

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000010992	-	93	40.254	ENSG00000124449	IRGC	99	40.094	Homo_sapiens
ENSACIG00000010992	-	89	62.389	ENSAPOG00000008330	irgf3	96	57.478	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000010992	-	95	44.167	ENSAMEG00000004488	-	88	39.264	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000010992	-	91	45.283	ENSAMEG00000004232	IRGC	97	40.161	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000010992	-	87	36.530	ENSAMEG00000001281	-	86	32.759	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000010992	-	94	43.096	ENSAMEG00000018904	-	88	39.414	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000010992	-	95	46.473	ENSAMEG00000018526	-	88	42.020	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000010992	-	95	44.398	ENSAMEG00000019320	-	89	39.809	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000010992	-	88	45.536	ENSAMEG00000018886	-	89	40.523	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000010992	-	93	58.369	ENSAOCG00000012267	-	88	59.048	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000010992	-	89	60.345	ENSAOCG00000016549	-	98	54.902	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000010992	-	65	60.784	ENSAPEG00000002648	-	85	61.151	Amphiprion_percula
ENSACIG00000010992	-	89	60.345	ENSAPEG00000002637	-	90	53.495	Amphiprion_percula
ENSACIG00000010992	-	88	57.619	ENSATEG00000011733	-	96	50.867	Anabas_testudineus
ENSACIG00000010992	-	86	57.971	ENSATEG00000011621	-	96	51.841	Anabas_testudineus
ENSACIG00000010992	-	87	58.537	ENSATEG00000011805	-	94	50.716	Anabas_testudineus
ENSACIG00000010992	-	91	53.134	ENSATEG00000011665	-	96	52.836	Anabas_testudineus
ENSACIG00000010992	-	95	42.903	ENSACAG00000004461	-	92	42.903	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000010992	-	90	47.111	ENSACAG00000027865	-	76	42.587	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000010992	-	89	38.532	ENSACAG00000027740	-	83	37.671	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000010992	-	79	41.117	ENSACAG00000022806	-	86	38.158	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000010992	-	83	45.024	ENSACAG00000027084	-	80	40.000	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000010992	-	90	46.930	ENSACAG00000005249	-	94	43.413	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000010992	-	86	63.594	ENSACLG00000017575	-	76	63.594	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000010992	-	87	60.185	ENSACLG00000026694	-	87	60.185	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000010992	-	76	62.778	ENSACLG00000017807	-	99	62.778	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000010992	-	79	56.452	ENSACLG00000017734	-	76	51.812	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000010992	-	91	52.838	ENSACLG00000017785	-	98	49.859	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000010992	-	88	58.485	ENSACLG00000017700	-	96	58.716	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000010992	-	86	61.951	ENSACLG00000008069	-	95	62.437	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000010992	-	82	63.265	ENSACLG00000026716	-	73	64.242	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000010992	-	89	52.679	ENSACLG00000017650	-	94	49.371	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000010992	-	79	42.162	ENSAMXG00000001283	-	75	49.650	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000010992	-	88	51.691	ENSAMXG00000025551	-	93	45.361	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000010992	-	84	46.602	ENSAMXG00000018938	-	94	44.074	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000010992	-	88	53.182	ENSAMXG00000041738	-	97	47.853	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000010992	-	89	49.115	ENSAMXG00000003370	-	95	49.045	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000010992	-	85	49.774	ENSAMXG00000025169	-	98	44.948	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000010992	-	80	47.525	ENSAMXG00000037767	-	98	41.091	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000010992	-	81	52.451	ENSAMXG00000041276	-	87	44.689	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000010992	-	82	49.029	ENSAMXG00000043797	-	81	52.564	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000010992	-	85	49.302	ENSAMXG00000026039	irge4	93	39.296	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000010992	-	86	51.613	ENSAMXG00000003336	-	93	47.678	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000010992	-	87	42.105	ENSAMXG00000003353	-	93	36.486	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000010992	-	71	38.889	ENSAMXG00000033649	-	89	34.733	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000010992	-	85	47.442	ENSAMXG00000031909	-	93	40.922	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000010992	-	92	42.553	ENSBTAG00000013766	IRGC	90	34.442	Bos_taurus
ENSACIG00000010992	-	83	42.714	ENSBTAG00000015727	IFI47	91	36.246	Bos_taurus
ENSACIG00000010992	-	92	39.316	ENSCJAG00000013464	IRGC	83	38.136	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000010992	-	92	49.268	ENSCAFG00000000498	-	90	39.032	Canis_familiaris
ENSACIG00000010992	-	89	35.874	ENSCAFG00000028829	-	88	32.673	Canis_familiaris
ENSACIG00000010992	-	90	44.934	ENSCAFG00000000502	IFGGC1	88	41.259	Canis_familiaris
ENSACIG00000010992	-	94	43.933	ENSCAFG00000012657	-	85	39.809	Canis_familiaris
ENSACIG00000010992	-	93	45.333	ENSCAFG00000004727	IRGC	92	45.033	Canis_familiaris
ENSACIG00000010992	-	89	35.714	ENSCAFG00020002229	-	96	32.673	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000010992	-	90	44.934	ENSCAFG00020002398	-	88	41.259	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000010992	-	95	44.813	ENSCAFG00020002399	-	88	38.854	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000010992	-	94	43.933	ENSCAFG00020002248	-	85	39.809	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000010992	-	91	43.636	ENSCAFG00020013248	IRGC	82	39.144	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000010992	-	92	42.128	ENSCHIG00000007797	IRGC	87	34.804	Capra_hircus
ENSACIG00000010992	-	92	40.000	ENSCHIG00000006767	-	88	35.517	Capra_hircus
ENSACIG00000010992	-	85	41.379	ENSCHIG00000013605	-	75	41.837	Capra_hircus
ENSACIG00000010992	-	84	35.377	ENSCAPG00000016904	-	79	40.278	Cavia_aperea
ENSACIG00000010992	-	93	40.708	ENSCAPG00000012775	IRGC	83	37.006	Cavia_aperea
ENSACIG00000010992	-	89	45.575	ENSCAPG00000016931	-	88	39.344	Cavia_aperea
ENSACIG00000010992	-	89	43.363	ENSCPOG00000023450	-	89	39.721	Cavia_porcellus
ENSACIG00000010992	-	90	45.909	ENSCPOG00000034856	-	72	48.087	Cavia_porcellus
ENSACIG00000010992	-	96	42.213	ENSCPOG00000037314	-	90	39.344	Cavia_porcellus
ENSACIG00000010992	-	93	40.708	ENSCPOG00000000918	IRGC	83	37.006	Cavia_porcellus
ENSACIG00000010992	-	99	45.833	ENSCPOG00000036108	-	88	40.317	Cavia_porcellus
ENSACIG00000010992	-	96	43.852	ENSCPOG00000039847	-	88	40.000	Cavia_porcellus
ENSACIG00000010992	-	96	40.164	ENSCPOG00000038985	-	88	38.614	Cavia_porcellus
ENSACIG00000010992	-	90	44.053	ENSCPOG00000034918	-	89	38.033	Cavia_porcellus
ENSACIG00000010992	-	90	44.934	ENSCPOG00000037647	-	89	40.203	Cavia_porcellus
ENSACIG00000010992	-	90	44.053	ENSCPOG00000037129	-	89	38.033	Cavia_porcellus
ENSACIG00000010992	-	91	42.273	ENSCATG00000016103	IRGC	87	35.062	Cercocebus_atys
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ENSACIG00000010992	-	90	44.934	ENSCLAG00000017791	-	70	40.000	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000010992	-	96	41.736	ENSCLAG00000011265	-	82	40.615	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000010992	-	93	41.593	ENSCLAG00000017638	IRGC	83	37.571	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000010992	-	98	41.129	ENSCLAG00000017811	-	88	38.284	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000010992	-	94	43.038	ENSCLAG00000010051	-	84	40.924	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000010992	-	91	42.727	ENSCSAG00000019621	IRGC	87	34.815	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000010992	-	79	44.279	ENSCHOG00000005921	-	100	42.727	Choloepus_hoffmanni
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ENSACIG00000010992	-	73	51.149	ENSCPBG00000021472	-	90	42.759	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000010992	-	82	43.434	ENSCPBG00000021470	-	68	41.935	Chrysemys_picta_bellii
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