EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000011153 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 23828 bases
Position: chrCCOE01000310.1:996-24823
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000014395	zf-C2H2	PF00096.26	2.6e-47	1	7
ENSACIP00000014395	zf-C2H2	PF00096.26	2.6e-47	2	7
ENSACIP00000014395	zf-C2H2	PF00096.26	2.6e-47	3	7
ENSACIP00000014395	zf-C2H2	PF00096.26	2.6e-47	4	7
ENSACIP00000014395	zf-C2H2	PF00096.26	2.6e-47	5	7
ENSACIP00000014395	zf-C2H2	PF00096.26	2.6e-47	6	7
ENSACIP00000014395	zf-C2H2	PF00096.26	2.6e-47	7	7
ENSACIP00000014409	zf-C2H2	PF00096.26	1.7e-32	1	4
ENSACIP00000014409	zf-C2H2	PF00096.26	1.7e-32	2	4
ENSACIP00000014409	zf-C2H2	PF00096.26	1.7e-32	3	4
ENSACIP00000014409	zf-C2H2	PF00096.26	1.7e-32	4	4
ENSACIP00000014332	zf-C2H2	PF00096.26	4e-23	1	3
ENSACIP00000014332	zf-C2H2	PF00096.26	4e-23	2	3
ENSACIP00000014332	zf-C2H2	PF00096.26	4e-23	3	3
ENSACIP00000014395	zf-met	PF12874.7	6.1e-15	1	2
ENSACIP00000014395	zf-met	PF12874.7	6.1e-15	2	2
ENSACIP00000014409	zf-met	PF12874.7	4.9e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000014716	-	627	-	ENSACIP00000014332	208 (aa)	-	-
ENSACIT00000014779	-	1104	-	ENSACIP00000014395	367 (aa)	-	-
ENSACIT00000014793	-	1536	-	ENSACIP00000014409	511 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000011153	-	69	80.952	ENSACIG00000010660	-	99	80.952
ENSACIG00000011153	-	80	40.449	ENSACIG00000023313	-	88	49.167
ENSACIG00000011153	-	98	50.000	ENSACIG00000006806	-	82	50.000
ENSACIG00000011153	-	69	49.412	ENSACIG00000007034	-	83	43.902
ENSACIG00000011153	-	78	37.864	ENSACIG00000023049	znf646	99	40.000
ENSACIG00000011153	-	98	52.734	ENSACIG00000004666	-	98	57.031
ENSACIG00000011153	-	70	50.000	ENSACIG00000017892	-	83	48.800
ENSACIG00000011153	-	75	36.965	ENSACIG00000012636	ZNF319	87	46.000
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ENSACIG00000011153	-	96	48.889	ENSACIG00000019102	-	60	44.538
ENSACIG00000011153	-	75	48.819	ENSACIG00000022330	-	86	47.423
ENSACIG00000011153	-	71	52.778	ENSACIG00000019815	-	82	52.778
ENSACIG00000011153	-	87	59.535	ENSACIG00000018952	-	81	59.535
ENSACIG00000011153	-	74	47.674	ENSACIG00000009780	-	78	47.674
ENSACIG00000011153	-	68	41.071	ENSACIG00000016779	patz1	52	36.000
ENSACIG00000011153	-	67	42.373	ENSACIG00000018641	snai2	52	42.373
ENSACIG00000011153	-	68	42.515	ENSACIG00000017683	-	76	41.322
ENSACIG00000011153	-	99	51.872	ENSACIG00000010966	-	71	51.872
ENSACIG00000011153	-	68	37.762	ENSACIG00000013613	scrt1b	51	41.176
ENSACIG00000011153	-	94	54.128	ENSACIG00000016932	-	73	54.128
ENSACIG00000011153	-	69	43.452	ENSACIG00000016354	gfi1ab	51	43.452
ENSACIG00000011153	-	71	42.484	ENSACIG00000018404	-	75	45.763
ENSACIG00000011153	-	73	44.751	ENSACIG00000009755	-	72	49.153
ENSACIG00000011153	-	98	45.149	ENSACIG00000000360	si:ch211-241b2.1	100	45.149
ENSACIG00000011153	-	98	50.655	ENSACIG00000013604	-	99	62.162
ENSACIG00000011153	-	77	45.385	ENSACIG00000003515	-	93	46.847
ENSACIG00000011153	-	73	43.478	ENSACIG00000007192	zbtb7b	55	39.640
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ENSACIG00000011153	-	67	38.571	ENSACIG00000012604	scrt2	50	44.595
ENSACIG00000011153	-	84	48.837	ENSACIG00000022738	-	96	48.677
ENSACIG00000011153	-	72	42.735	ENSACIG00000002180	-	100	44.444
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ENSACIG00000011153	-	96	58.042	ENSACIG00000022625	-	98	58.042
ENSACIG00000011153	-	68	51.408	ENSACIG00000007096	-	73	51.408
ENSACIG00000011153	-	69	56.589	ENSACIG00000019447	-	67	56.589
ENSACIG00000011153	-	74	41.333	ENSACIG00000008886	znf1164	90	44.554
ENSACIG00000011153	-	70	45.726	ENSACIG00000017653	-	93	49.383
ENSACIG00000011153	-	68	47.706	ENSACIG00000005841	wt1a	51	47.706
ENSACIG00000011153	-	73	45.217	ENSACIG00000016133	-	61	45.217
ENSACIG00000011153	-	78	43.151	ENSACIG00000016117	-	83	50.000
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ENSACIG00000011153	-	89	42.063	ENSACIG00000001767	zbtb41	74	42.063
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ENSACIG00000011153	-	92	44.248	ENSACIG00000014282	znf526	87	33.333
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ENSACIG00000011153	-	74	41.129	ENSACIG00000013508	ZNF384	51	41.129
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ENSACIG00000011153	-	73	47.273	ENSACIG00000009809	si:dkey-77f5.14	84	46.512
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ENSACIG00000011153	-	64	45.946	ENSACIG00000009180	znf652	52	36.527
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ENSACIG00000011153	-	84	37.097	ENSACIG00000002944	-	80	36.641
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ENSACIG00000011153	-	61	42.697	ENSACIG00000011318	snai1a	73	43.023
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ENSACIG00000011153	-	84	39.252	ENSACIG00000006826	-	68	39.252
ENSACIG00000011153	-	83	39.899	ENSACIG00000013750	-	81	39.899
ENSACIG00000011153	-	92	45.294	ENSACIG00000009717	-	94	45.294
ENSACIG00000011153	-	78	47.761	ENSACIG00000007882	-	84	37.759
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ENSACIG00000011153	-	97	52.239	ENSACIG00000018022	-	79	52.212
ENSACIG00000011153	-	69	39.865	ENSACIG00000017166	-	88	41.573
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ENSACIG00000011153	-	75	40.994	ENSACIG00000015411	-	84	41.611
ENSACIG00000011153	-	73	49.123	ENSACIG00000006228	-	67	45.918
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ENSACIG00000011153	-	76	46.154	ENSACIG00000021986	-	95	43.529
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ENSACIG00000011153	-	77	34.437	ENSACIG00000020982	znf710b	50	44.828
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ENSACIG00000011153	-	92	58.140	ENSACIG00000017647	-	99	53.968
ENSACIG00000011153	-	85	50.292	ENSACIG00000006755	-	98	50.292
ENSACIG00000011153	-	82	40.972	ENSACIG00000007000	-	67	34.426
ENSACIG00000011153	-	78	40.625	ENSACIG00000014233	znf407	68	36.634
ENSACIG00000011153	-	96	54.688	ENSACIG00000017050	-	99	54.688
ENSACIG00000011153	-	98	50.685	ENSACIG00000024444	-	88	53.846
ENSACIG00000011153	-	99	49.412	ENSACIG00000011541	-	96	49.412
ENSACIG00000011153	-	98	59.633	ENSACIG00000022645	-	73	59.633

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000011153	-	75	53.333	ENSANAG00000032414	-	89	48.691	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000011153	-	97	57.143	ENSACLG00000020474	-	88	71.250	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000011153	-	64	56.098	ENSACLG00000001507	-	76	56.098	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000011153	-	69	48.252	ENSACLG00000017329	-	81	52.308	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000011153	-	74	45.333	ENSACLG00000022499	-	89	45.333	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000011153	-	69	44.393	ENSACLG00000014167	-	67	44.393	Astatotilapia_calliptera
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ENSACIG00000011153	-	73	52.273	ENSAMXG00000039770	-	80	52.273	Astyanax_mexicanus
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