EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000011515 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1350 bases
Position: chrCCOE01000143.1:687345-688694
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000014821	zf-C2H2	PF00096.26	6.1e-54	1	9
ENSACIP00000014821	zf-C2H2	PF00096.26	6.1e-54	2	9
ENSACIP00000014821	zf-C2H2	PF00096.26	6.1e-54	3	9
ENSACIP00000014821	zf-C2H2	PF00096.26	6.1e-54	4	9
ENSACIP00000014821	zf-C2H2	PF00096.26	6.1e-54	5	9
ENSACIP00000014821	zf-C2H2	PF00096.26	6.1e-54	6	9
ENSACIP00000014821	zf-C2H2	PF00096.26	6.1e-54	7	9
ENSACIP00000014821	zf-C2H2	PF00096.26	6.1e-54	8	9
ENSACIP00000014821	zf-C2H2	PF00096.26	6.1e-54	9	9
ENSACIP00000014821	zf-met	PF12874.7	6.2e-17	1	3
ENSACIP00000014821	zf-met	PF12874.7	6.2e-17	2	3
ENSACIP00000014821	zf-met	PF12874.7	6.2e-17	3	3

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000015217	-	1197	-	ENSACIP00000014821	398 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000011515	-	65	45.625	ENSACIG00000016354	gfi1ab	50	45.625
ENSACIG00000011515	-	70	43.318	ENSACIG00000018404	-	82	43.318
ENSACIG00000011515	-	69	40.310	ENSACIG00000013149	-	82	40.310
ENSACIG00000011515	-	74	47.716	ENSACIG00000012084	-	99	47.716
ENSACIG00000011515	-	91	43.697	ENSACIG00000006826	-	82	43.697
ENSACIG00000011515	-	65	43.363	ENSACIG00000008886	znf1164	80	43.363
ENSACIG00000011515	-	97	44.558	ENSACIG00000019710	-	89	46.923
ENSACIG00000011515	-	73	63.077	ENSACIG00000009809	si:dkey-77f5.14	92	63.077
ENSACIG00000011515	-	75	38.806	ENSACIG00000018641	snai2	68	38.806
ENSACIG00000011515	-	98	52.137	ENSACIG00000007464	-	80	52.137
ENSACIG00000011515	-	66	45.000	ENSACIG00000000406	prdm5	71	45.000
ENSACIG00000011515	-	65	49.462	ENSACIG00000000360	si:ch211-241b2.1	89	49.462
ENSACIG00000011515	-	98	52.535	ENSACIG00000008448	-	96	48.521
ENSACIG00000011515	-	56	55.670	ENSACIG00000016944	-	74	55.670
ENSACIG00000011515	-	97	44.366	ENSACIG00000011153	-	96	47.701
ENSACIG00000011515	-	77	36.090	ENSACIG00000006586	-	65	36.090
ENSACIG00000011515	-	99	51.462	ENSACIG00000017013	-	83	51.462
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ENSACIG00000011515	-	90	39.259	ENSACIG00000016133	-	94	39.259
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ENSACIG00000011515	-	96	53.175	ENSACIG00000004666	-	99	53.516
ENSACIG00000011515	-	75	42.342	ENSACIG00000014282	znf526	84	33.080
ENSACIG00000011515	-	71	48.438	ENSACIG00000006228	-	86	48.438
ENSACIG00000011515	-	64	60.773	ENSACIG00000000311	-	58	60.773
ENSACIG00000011515	-	73	58.286	ENSACIG00000009755	-	83	58.286
ENSACIG00000011515	-	64	41.481	ENSACIG00000002180	-	93	41.481
ENSACIG00000011515	-	97	48.246	ENSACIG00000004745	-	97	49.776
ENSACIG00000011515	-	62	48.958	ENSACIG00000013946	-	60	48.958
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ENSACIG00000011515	-	97	50.893	ENSACIG00000016182	-	98	47.431
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ENSACIG00000011515	-	97	51.765	ENSACIG00000017647	-	93	54.118
ENSACIG00000011515	-	96	38.583	ENSACIG00000024444	-	82	38.583
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ENSACIG00000011515	-	67	48.450	ENSACIG00000019447	-	71	48.450
ENSACIG00000011515	-	88	44.689	ENSACIG00000004626	-	90	46.122
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ENSACIG00000011515	-	66	43.500	ENSACIG00000016117	-	83	43.500
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ENSACIG00000011515	-	66	38.528	ENSACIG00000017683	-	77	38.528
ENSACIG00000011515	-	85	58.824	ENSACIG00000000286	-	86	58.824
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ENSACIG00000011515	-	97	54.867	ENSACIG00000017050	-	98	55.652
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ENSACIG00000011515	-	95	47.414	ENSACIG00000018952	-	80	47.414
ENSACIG00000011515	-	80	35.780	ENSACIG00000013613	scrt1b	78	35.780
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ENSACIG00000011515	-	65	41.135	ENSACIG00000019534	-	76	41.135
ENSACIG00000011515	-	96	55.446	ENSACIG00000010647	-	96	61.143
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ENSACIG00000011515	-	66	38.433	ENSACIG00000010739	-	80	38.433
ENSACIG00000011515	-	95	47.748	ENSACIG00000014123	znf236	73	47.748
ENSACIG00000011515	-	68	38.938	ENSACIG00000012636	ZNF319	91	38.938
ENSACIG00000011515	-	97	49.206	ENSACIG00000023162	-	81	49.206
ENSACIG00000011515	-	76	37.895	ENSACIG00000001767	zbtb41	71	37.895
ENSACIG00000011515	-	99	53.125	ENSACIG00000004041	-	99	53.125
ENSACIG00000011515	-	78	35.268	ENSACIG00000006377	-	70	35.268
ENSACIG00000011515	-	84	41.018	ENSACIG00000019815	-	99	43.537
ENSACIG00000011515	-	96	48.627	ENSACIG00000006172	-	98	48.627
ENSACIG00000011515	-	66	35.503	ENSACIG00000023049	znf646	98	35.503
ENSACIG00000011515	-	63	34.146	ENSACIG00000014233	znf407	66	34.146
ENSACIG00000011515	-	90	58.462	ENSACIG00000004641	-	71	58.462
ENSACIG00000011515	-	80	48.810	ENSACIG00000003515	-	94	44.048
ENSACIG00000011515	-	88	51.429	ENSACIG00000003720	-	96	51.429
ENSACIG00000011515	-	97	42.636	ENSACIG00000010966	-	68	42.636
ENSACIG00000011515	-	70	32.231	ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	72	32.377

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000011515	-	97	52.632	ENSAPOG00000020125	-	90	49.804	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000011515	-	97	50.000	ENSAPOG00000022267	-	85	50.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000011515	-	99	43.096	ENSAPOG00000021997	-	96	43.096	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000011515	-	94	57.333	ENSAPOG00000021367	-	82	57.333	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000011515	-	99	51.079	ENSAPOG00000022007	-	88	51.559	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000011515	-	97	51.534	ENSAPOG00000022273	-	76	49.693	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000011515	-	96	46.809	ENSAPOG00000018490	-	67	46.479	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000011515	-	65	46.185	ENSAPOG00000003193	znf1056	88	46.185	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000011515	-	98	51.534	ENSAOCG00000007146	-	76	49.693	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000011515	-	95	44.386	ENSAOCG00000012829	-	68	44.386	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000011515	-	69	45.382	ENSAOCG00000003494	si:dkey-7i4.5	90	45.382	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000011515	-	99	50.952	ENSAOCG00000010498	-	87	51.429	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000011515	-	99	42.678	ENSAOCG00000000655	-	89	43.096	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000011515	-	95	58.000	ENSAOCG00000017588	-	78	58.000	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000011515	-	98	56.150	ENSAPEG00000012963	-	94	56.150	Amphiprion_percula
ENSACIG00000011515	-	99	56.863	ENSAPEG00000013113	-	89	54.802	Amphiprion_percula
ENSACIG00000011515	-	84	52.193	ENSAPEG00000012243	-	99	53.612	Amphiprion_percula
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