EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000011516 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 6625 bases
Position: chrCCOE01000758.1:709162-715786
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000014831	zf-C2H2	PF00096.26	1.3e-20	1	3
ENSACIP00000014831	zf-C2H2	PF00096.26	1.3e-20	2	3
ENSACIP00000014831	zf-C2H2	PF00096.26	1.3e-20	3	3
ENSACIP00000014831	zf-met	PF12874.7	1e-10	1	3
ENSACIP00000014831	zf-met	PF12874.7	1e-10	2	3
ENSACIP00000014831	zf-met	PF12874.7	1e-10	3	3

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000015227	-	1014	-	ENSACIP00000014831	337 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000011516	-	83	32.000	ENSACIG00000016779	patz1	54	32.000
ENSACIG00000011516	-	79	34.320	ENSACIG00000002180	-	99	34.320
ENSACIG00000011516	-	72	35.135	ENSACIG00000018641	snai2	52	35.135
ENSACIG00000011516	-	77	33.166	ENSACIG00000017892	-	72	35.714
ENSACIG00000011516	-	80	31.278	ENSACIG00000001369	-	83	31.278
ENSACIG00000011516	-	80	33.673	ENSACIG00000007855	-	96	33.673
ENSACIG00000011516	-	79	42.308	ENSACIG00000007464	-	53	42.308
ENSACIG00000011516	-	84	37.234	ENSACIG00000009780	-	82	37.234
ENSACIG00000011516	-	79	34.188	ENSACIG00000018952	-	51	34.188
ENSACIG00000011516	-	82	32.812	ENSACIG00000019447	-	71	32.812
ENSACIG00000011516	-	78	34.184	ENSACIG00000007000	-	59	34.184
ENSACIG00000011516	-	81	37.288	ENSACIG00000019534	-	72	37.288
ENSACIG00000011516	-	93	30.851	ENSACIG00000000360	si:ch211-241b2.1	94	30.851
ENSACIG00000011516	-	97	36.066	ENSACIG00000019791	-	93	36.066
ENSACIG00000011516	-	82	37.113	ENSACIG00000017653	-	92	37.113
ENSACIG00000011516	-	77	30.144	ENSACIG00000023794	-	57	30.144
ENSACIG00000011516	-	82	38.743	ENSACIG00000009809	si:dkey-77f5.14	86	38.743
ENSACIG00000011516	-	87	35.106	ENSACIG00000012263	znf319b	88	30.534
ENSACIG00000011516	-	91	33.482	ENSACIG00000023212	-	81	33.482
ENSACIG00000011516	-	82	36.242	ENSACIG00000000286	-	71	36.242
ENSACIG00000011516	-	95	31.325	ENSACIG00000017683	-	87	31.579
ENSACIG00000011516	-	91	40.000	ENSACIG00000004745	-	89	40.000
ENSACIG00000011516	-	86	31.868	ENSACIG00000023313	-	88	31.868
ENSACIG00000011516	-	82	34.862	ENSACIG00000013750	-	83	34.862
ENSACIG00000011516	-	78	30.769	ENSACIG00000013149	-	78	32.959
ENSACIG00000011516	-	93	34.899	ENSACIG00000004666	-	99	35.537
ENSACIG00000011516	-	85	33.621	ENSACIG00000007882	-	74	33.621
ENSACIG00000011516	-	82	43.636	ENSACIG00000017013	-	54	43.636
ENSACIG00000011516	-	80	33.884	ENSACIG00000024444	-	63	33.884
ENSACIG00000011516	-	80	33.086	ENSACIG00000013470	-	59	32.609
ENSACIG00000011516	-	74	38.053	ENSACIG00000012084	-	93	38.053
ENSACIG00000011516	-	74	35.088	ENSACIG00000018059	-	62	34.211
ENSACIG00000011516	-	86	33.871	ENSACIG00000011153	-	79	32.298
ENSACIG00000011516	-	72	35.780	ENSACIG00000017166	-	54	35.780
ENSACIG00000011516	-	86	36.885	ENSACIG00000019710	-	72	36.885
ENSACIG00000011516	-	79	33.929	ENSACIG00000006755	-	73	33.929
ENSACIG00000011516	-	77	31.636	ENSACIG00000012636	ZNF319	87	31.636
ENSACIG00000011516	-	83	32.203	ENSACIG00000009128	-	82	32.203
ENSACIG00000011516	-	89	34.201	ENSACIG00000010647	-	99	36.842
ENSACIG00000011516	-	77	35.814	ENSACIG00000008448	-	68	35.814
ENSACIG00000011516	-	82	50.000	ENSACIG00000015835	-	73	31.429
ENSACIG00000011516	-	50	32.222	ENSACIG00000007034	-	73	36.000
ENSACIG00000011516	-	93	30.723	ENSACIG00000021986	-	92	30.723
ENSACIG00000011516	-	80	34.821	ENSACIG00000003515	-	92	34.821
ENSACIG00000011516	-	81	37.333	ENSACIG00000003754	-	88	37.333
ENSACIG00000011516	-	82	42.105	ENSACIG00000016182	-	76	42.105
ENSACIG00000011516	-	79	35.780	ENSACIG00000014282	znf526	60	31.847
ENSACIG00000011516	-	83	32.178	ENSACIG00000006806	-	66	32.178
ENSACIG00000011516	-	85	33.684	ENSACIG00000017644	-	87	34.667
ENSACIG00000011516	-	93	36.279	ENSACIG00000017647	-	91	34.454
ENSACIG00000011516	-	91	32.000	ENSACIG00000020938	zbtb47b	81	32.000
ENSACIG00000011516	-	79	36.283	ENSACIG00000016133	-	60	36.283
ENSACIG00000011516	-	79	30.137	ENSACIG00000023049	znf646	95	30.137
ENSACIG00000011516	-	88	30.222	ENSACIG00000019804	-	90	30.222
ENSACIG00000011516	-	82	34.884	ENSACIG00000022293	-	94	35.349
ENSACIG00000011516	-	88	35.455	ENSACIG00000022738	-	89	38.710
ENSACIG00000011516	-	81	31.618	ENSACIG00000015411	-	82	31.618
ENSACIG00000011516	-	78	31.928	ENSACIG00000018404	-	75	30.693
ENSACIG00000011516	-	96	39.362	ENSACIG00000018440	-	95	39.362
ENSACIG00000011516	-	82	32.975	ENSACIG00000015429	-	78	32.975
ENSACIG00000011516	-	55	33.607	ENSACIG00000009443	-	56	33.333
ENSACIG00000011516	-	64	34.783	ENSACIG00000006228	-	63	34.783
ENSACIG00000011516	-	94	33.333	ENSACIG00000013604	-	97	33.333
ENSACIG00000011516	-	84	33.514	ENSACIG00000007096	-	89	34.848
ENSACIG00000011516	-	65	35.135	ENSACIG00000016944	-	74	35.135
ENSACIG00000011516	-	82	36.508	ENSACIG00000022625	-	83	30.797
ENSACIG00000011516	-	77	34.234	ENSACIG00000004641	-	58	34.234
ENSACIG00000011516	-	82	32.275	ENSACIG00000003720	-	67	32.275
ENSACIG00000011516	-	84	35.099	ENSACIG00000009717	-	91	35.099
ENSACIG00000011516	-	88	37.864	ENSACIG00000017050	-	98	37.297
ENSACIG00000011516	-	79	34.109	ENSACIG00000002190	gfi1b	57	32.323
ENSACIG00000011516	-	83	34.615	ENSACIG00000011541	-	69	34.615
ENSACIG00000011516	-	82	31.034	ENSACIG00000020982	znf710b	55	30.450
ENSACIG00000011516	-	86	30.806	ENSACIG00000004626	-	85	33.505
ENSACIG00000011516	-	83	34.586	ENSACIG00000016117	-	83	32.394
ENSACIG00000011516	-	60	32.558	ENSACIG00000002944	-	77	32.558
ENSACIG00000011516	-	79	36.842	ENSACIG00000023162	-	53	36.842
ENSACIG00000011516	-	80	35.593	ENSACIG00000008886	znf1164	95	35.593
ENSACIG00000011516	-	85	33.333	ENSACIG00000019102	-	50	33.333
ENSACIG00000011516	-	82	32.342	ENSACIG00000003556	-	72	32.342
ENSACIG00000011516	-	82	38.053	ENSACIG00000022658	-	92	34.058
ENSACIG00000011516	-	82	34.234	ENSACIG00000010637	-	55	34.234
ENSACIG00000011516	-	83	33.816	ENSACIG00000011515	-	73	33.080
ENSACIG00000011516	-	78	36.508	ENSACIG00000018022	-	51	36.364
ENSACIG00000011516	-	82	36.250	ENSACIG00000014123	znf236	64	36.250
ENSACIG00000011516	-	82	38.710	ENSACIG00000006172	-	87	35.897
ENSACIG00000011516	-	81	47.170	ENSACIG00000019815	-	81	47.170
ENSACIG00000011516	-	91	36.667	ENSACIG00000009755	-	83	36.667
ENSACIG00000011516	-	94	35.326	ENSACIG00000004041	-	93	35.714
ENSACIG00000011516	-	77	34.314	ENSACIG00000000311	-	58	34.314

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000011516	-	85	45.283	ENSAPEG00000009826	-	94	43.333	Amphiprion_percula
ENSACIG00000011516	-	79	31.061	ENSCING00000024379	-	80	31.061	Ciona_intestinalis
ENSACIG00000011516	-	88	62.426	ENSCSEG00000018571	-	58	63.300	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000011516	-	82	35.484	ENSOPRG00000011038	ZNF771	92	34.518	Ochotona_princeps
ENSACIG00000011516	-	66	42.697	ENSTBEG00000017192	ZNF771	68	41.509	Tupaia_belangeri
ENSACIG00000011516	-	91	57.391	ENSXCOG00000003001	-	97	56.169	Xiphophorus_couchianus