EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000011541 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 5922 bases
Position: chrCCOE01000143.1:726907-732828
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
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ENSACIP00000014842	zf-met	PF12874.7	4.8e-34	5	5

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000015238	-	1614	-	ENSACIP00000014842	537 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000011541	-	75	39.412	ENSACIG00000014282	znf526	84	40.299
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ENSACIG00000011541	-	83	38.060	ENSACIG00000018641	snai2	80	38.060
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ENSACIG00000011541	-	75	43.125	ENSACIG00000002190	gfi1b	64	43.125
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ENSACIG00000011541	-	74	34.074	ENSACIG00000010739	-	93	34.074
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ENSACIG00000011541	-	81	50.000	ENSACIG00000003720	-	95	49.708
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ENSACIG00000011541	-	80	54.315	ENSACIG00000016944	-	96	54.315
ENSACIG00000011541	-	79	46.000	ENSACIG00000019804	-	83	46.000
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ENSACIG00000011541	-	77	44.167	ENSACIG00000003515	-	98	44.167
ENSACIG00000011541	-	67	50.000	ENSACIG00000018440	-	94	50.000
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ENSACIG00000011541	-	78	41.850	ENSACIG00000013750	-	80	41.850
ENSACIG00000011541	-	79	60.455	ENSACIG00000009809	si:dkey-77f5.14	89	58.865
ENSACIG00000011541	-	72	48.201	ENSACIG00000007096	-	90	48.201
ENSACIG00000011541	-	95	49.778	ENSACIG00000024444	-	85	49.778
ENSACIG00000011541	-	86	54.651	ENSACIG00000006755	-	89	54.651
ENSACIG00000011541	-	81	41.322	ENSACIG00000023049	znf646	94	41.322

Orthologs

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ENSACIG00000011541	-	94	80.078	ENSAPOG00000021383	-	89	80.078	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000011541	-	86	37.818	ENSAPOG00000010200	-	70	37.071	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000011541	-	94	50.752	ENSAPOG00000019061	-	91	50.752	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000011541	-	94	53.708	ENSAPOG00000005195	-	84	53.708	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000011541	-	88	49.746	ENSAPOG00000013982	-	94	49.746	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000011541	-	95	51.502	ENSAPOG00000021959	-	82	51.502	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000011541	-	74	53.066	ENSAPOG00000021991	-	89	53.302	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000011541	-	94	51.282	ENSAOCG00000016905	-	92	51.282	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000011541	-	60	45.902	ENSAOCG00000010471	-	98	43.629	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000011541	-	94	44.257	ENSAOCG00000012813	-	92	44.257	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000011541	-	94	56.147	ENSAOCG00000017602	-	89	50.611	Amphiprion_ocellaris
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