EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000011592 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: rpp38
Alias: fc10d08|wu:fc10d08|zgc:92924
Full Name: ribonuclease P/MRP 38 subunit
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 831 bases
Position: chrCCOE01000370.1:836423-837253
Accession: ZDB-GENE-040718-258
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000014909	Ribosomal_L7Ae	PF01248.26	2.5e-10	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000015308	-	831	-	ENSACIP00000014909	276 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000011592	rpp38	92	42.697	ENSG00000152464	RPP38	86	49.669	Homo_sapiens
ENSACIG00000011592	rpp38	97	70.803	ENSAPOG00000001240	rpp38	95	69.708	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000011592	rpp38	98	42.652	ENSAMEG00000018832	RPP38	88	43.750	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000011592	rpp38	97	68.990	ENSAOCG00000017293	rpp38	96	68.293	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000011592	rpp38	97	72.993	ENSAPEG00000002315	rpp38	95	72.263	Amphiprion_percula
ENSACIG00000011592	rpp38	99	73.913	ENSATEG00000000731	rpp38	94	73.359	Anabas_testudineus
ENSACIG00000011592	rpp38	95	41.045	ENSAPLG00000002054	RPP38	90	39.689	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000011592	rpp38	97	82.022	ENSACLG00000016962	rpp38	96	79.775	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000011592	rpp38	97	82.022	ENSACLG00000016958	rpp38	96	79.775	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000011592	rpp38	97	44.610	ENSAMXG00000025023	rpp38	93	43.866	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000011592	rpp38	97	40.074	ENSBTAG00000007702	RPP38	88	41.732	Bos_taurus
ENSACIG00000011592	rpp38	97	43.116	ENSCAFG00000024373	RPP38	93	42.910	Canis_familiaris
ENSACIG00000011592	rpp38	97	43.116	ENSCAFG00020008008	RPP38	93	42.910	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000011592	rpp38	92	40.541	ENSCHIG00000012484	RPP38	88	40.945	Capra_hircus
ENSACIG00000011592	rpp38	98	43.662	ENSCPOG00000003981	RPP38	93	41.481	Cavia_porcellus
ENSACIG00000011592	rpp38	97	41.463	ENSCLAG00000010194	RPP38	92	41.026	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000011592	rpp38	89	40.959	ENSCSAG00000019055	RPP38	88	43.182	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000011592	rpp38	97	42.509	ENSCHOG00000004335	RPP38	92	40.659	Choloepus_hoffmanni
ENSACIG00000011592	rpp38	92	43.019	ENSCGRG00001001395	Rpp38	87	43.478	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000011592	rpp38	92	43.019	ENSCGRG00000017441	Rpp38	87	43.478	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000011592	rpp38	97	65.809	ENSCSEG00000001721	rpp38	96	63.235	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000011592	rpp38	97	64.493	ENSCVAG00000001676	rpp38	95	64.130	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000011592	rpp38	98	50.000	ENSDARG00000040350	rpp38	94	49.630	Danio_rerio
ENSACIG00000011592	rpp38	92	41.221	ENSDNOG00000040314	RPP38	88	40.467	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000011592	rpp38	92	44.402	ENSDORG00000009783	Rpp38	87	44.488	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000011592	rpp38	98	40.000	ENSETEG00000002839	RPP38	94	39.209	Echinops_telfairi
ENSACIG00000011592	rpp38	98	41.463	ENSEASG00005019783	RPP38	72	45.581	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000011592	rpp38	97	37.993	ENSEEUG00000014677	RPP38	88	40.149	Erinaceus_europaeus
ENSACIG00000011592	rpp38	96	54.483	ENSELUG00000010160	rpp38	96	52.069	Esox_lucius
ENSACIG00000011592	rpp38	97	40.636	ENSFCAG00000022449	RPP38	92	40.493	Felis_catus
ENSACIG00000011592	rpp38	95	42.593	ENSFALG00000014804	RPP38	90	42.804	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000011592	rpp38	97	40.925	ENSFDAG00000018669	RPP38	92	39.777	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000011592	rpp38	97	67.509	ENSFHEG00000013741	rpp38	96	66.426	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000011592	rpp38	95	42.125	ENSGALG00000008794	RPP38	86	41.667	Gallus_gallus
ENSACIG00000011592	rpp38	59	79.012	ENSGACG00000009258	rpp38	99	79.012	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000011592	rpp38	97	81.648	ENSHBUG00000010937	rpp38	96	79.401	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000011592	rpp38	97	40.484	ENSHGLG00000012144	RPP38	92	40.449	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000011592	rpp38	97	45.693	ENSIPUG00000022879	rpp38	95	47.015	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000011592	rpp38	98	41.812	ENSSTOG00000025699	RPP38	92	40.433	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000011592	rpp38	92	44.161	ENSJJAG00000007523	Rpp38	88	43.820	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000011592	rpp38	93	70.270	ENSKMAG00000003986	rpp38	90	69.884	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000011592	rpp38	99	76.812	ENSLBEG00000006853	rpp38	96	76.030	Labrus_bergylta
ENSACIG00000011592	rpp38	91	44.853	ENSLACG00000006502	RPP38	66	50.244	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000011592	rpp38	99	46.454	ENSLOCG00000018347	rpp38	93	47.445	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000011592	rpp38	98	42.123	ENSLAFG00000000509	RPP38	88	40.541	Loxodonta_africana
ENSACIG00000011592	rpp38	89	40.590	ENSMMUG00000007679	RPP38	88	42.803	Macaca_mulatta
ENSACIG00000011592	rpp38	99	72.527	ENSMAMG00000012774	rpp38	95	72.285	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000011592	rpp38	97	82.022	ENSMZEG00005003200	rpp38	96	79.775	Maylandia_zebra
ENSACIG00000011592	rpp38	97	82.772	ENSMZEG00005003189	rpp38	96	80.524	Maylandia_zebra
ENSACIG00000011592	rpp38	95	41.971	ENSMGAG00000008217	RPP38	86	39.711	Meleagris_gallopavo
ENSACIG00000011592	rpp38	92	43.726	ENSMAUG00000003644	Rpp38	87	42.636	Mesocricetus_auratus
ENSACIG00000011592	rpp38	92	41.887	ENSMOCG00000007020	Rpp38	88	41.569	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000011592	rpp38	99	67.273	ENSMMOG00000003446	rpp38	96	69.288	Mola_mola
ENSACIG00000011592	rpp38	96	43.590	ENSMODG00000024091	RPP38	94	43.590	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000011592	rpp38	96	71.014	ENSMALG00000002356	rpp38	93	71.269	Monopterus_albus
ENSACIG00000011592	rpp38	92	44.569	MGP_CAROLIEiJ_G0023133	Rpp38	88	45.736	Mus_caroli
ENSACIG00000011592	rpp38	92	44.195	ENSMUSG00000049950	Rpp38	88	44.444	Mus_musculus
ENSACIG00000011592	rpp38	92	44.906	MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	88	45.211	Mus_pahari
ENSACIG00000011592	rpp38	92	43.820	MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	88	44.061	Mus_spretus
ENSACIG00000011592	rpp38	99	42.160	ENSMPUG00000018523	RPP38	93	41.264	Mustela_putorius_furo
ENSACIG00000011592	rpp38	94	40.000	ENSMLUG00000002153	RPP38	92	40.569	Myotis_lucifugus
ENSACIG00000011592	rpp38	92	43.866	ENSNGAG00000011066	Rpp38	88	44.141	Nannospalax_galili
ENSACIG00000011592	rpp38	97	83.521	ENSNBRG00000006994	rpp38	97	84.270	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000011592	rpp38	97	82.397	ENSONIG00000020467	rpp38	95	83.146	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000011592	rpp38	95	40.214	ENSOCUG00000024367	-	87	42.636	Oryctolagus_cuniculus
ENSACIG00000011592	rpp38	95	39.858	ENSOCUG00000022768	-	87	42.248	Oryctolagus_cuniculus
ENSACIG00000011592	rpp38	97	71.642	ENSORLG00000009219	rpp38	95	70.522	Oryzias_latipes
ENSACIG00000011592	rpp38	97	71.375	ENSORLG00020011503	rpp38	92	72.119	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000011592	rpp38	94	71.154	ENSORLG00015017702	rpp38	89	73.077	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000011592	rpp38	97	69.742	ENSOMEG00000005414	rpp38	95	70.111	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000011592	rpp38	92	44.238	ENSOGAG00000008059	RPP38	88	44.151	Otolemur_garnettii
ENSACIG00000011592	rpp38	92	42.424	ENSOARG00000004534	RPP38	88	42.308	Ovis_aries
ENSACIG00000011592	rpp38	92	43.446	ENSPPAG00000041577	RPP38	80	43.284	Pan_paniscus
ENSACIG00000011592	rpp38	97	40.845	ENSPPRG00000015329	RPP38	92	40.141	Panthera_pardus
ENSACIG00000011592	rpp38	97	40.989	ENSPTIG00000007188	RPP38	92	40.141	Panthera_tigris_altaica
ENSACIG00000011592	rpp38	92	43.446	ENSPTRG00000002318	RPP38	80	43.284	Pan_troglodytes
ENSACIG00000011592	rpp38	92	47.037	ENSPKIG00000025652	rpp38	93	47.331	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000011592	rpp38	97	42.086	ENSPSIG00000001527	RPP38	93	39.706	Pelodiscus_sinensis
ENSACIG00000011592	rpp38	92	43.182	ENSPEMG00000008375	Rpp38	88	43.307	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACIG00000011592	rpp38	98	46.043	ENSPCIG00000009096	RPP38	89	45.620	Phascolarctos_cinereus
ENSACIG00000011592	rpp38	76	63.507	ENSPFOG00000016823	rpp38	95	61.881	Poecilia_formosa
ENSACIG00000011592	rpp38	100	60.993	ENSPLAG00000007626	rpp38	96	60.440	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000011592	rpp38	97	54.579	ENSPMEG00000020392	rpp38	96	53.480	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000011592	rpp38	94	64.151	ENSPREG00000017744	rpp38	92	62.891	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000011592	rpp38	92	43.071	ENSPPYG00000002113	RPP38	88	42.751	Pongo_abelii
ENSACIG00000011592	rpp38	94	41.026	ENSPVAG00000007155	RPP38	92	40.647	Pteropus_vampyrus
ENSACIG00000011592	rpp38	97	82.397	ENSPNYG00000004293	rpp38	96	80.150	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000011592	rpp38	91	45.276	ENSPNAG00000010633	rpp38	94	45.185	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000011592	rpp38	92	47.471	ENSRNOG00000038025	Rpp38	88	45.600	Rattus_norvegicus
ENSACIG00000011592	rpp38	98	42.086	ENSSHAG00000015529	RPP38	94	42.857	Sarcophilus_harrisii
ENSACIG00000011592	rpp38	96	72.075	ENSSMAG00000018276	rpp38	91	70.817	Scophthalmus_maximus
ENSACIG00000011592	rpp38	96	75.655	ENSSDUG00000001651	rpp38	96	73.034	Seriola_dumerili
ENSACIG00000011592	rpp38	96	75.655	ENSSLDG00000014355	rpp38	96	73.034	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACIG00000011592	rpp38	98	38.267	ENSSARG00000012099	RPP38	93	37.132	Sorex_araneus
ENSACIG00000011592	rpp38	98	44.097	ENSSPUG00000018363	-	95	43.214	Sphenodon_punctatus
ENSACIG00000011592	rpp38	97	43.929	ENSSPUG00000005237	-	92	44.118	Sphenodon_punctatus
ENSACIG00000011592	rpp38	93	40.000	ENSSPUG00000008560	-	90	41.065	Sphenodon_punctatus
ENSACIG00000011592	rpp38	97	68.914	ENSSPAG00000020387	rpp38	95	67.416	Stegastes_partitus
ENSACIG00000011592	rpp38	92	44.118	ENSSSCG00000027110	RPP38	88	41.825	Sus_scrofa
ENSACIG00000011592	rpp38	95	43.590	ENSTGUG00000001366	RPP38	93	42.909	Taeniopygia_guttata
ENSACIG00000011592	rpp38	99	65.455	ENSTNIG00000001334	rpp38	97	65.918	Tetraodon_nigroviridis
ENSACIG00000011592	rpp38	92	43.071	ENSTTRG00000004420	RPP38	88	42.748	Tursiops_truncatus
ENSACIG00000011592	rpp38	97	43.728	ENSUAMG00000002618	RPP38	92	42.963	Ursus_americanus
ENSACIG00000011592	rpp38	97	44.043	ENSUMAG00000012382	RPP38	92	43.382	Ursus_maritimus
ENSACIG00000011592	rpp38	97	42.754	ENSVVUG00000005272	RPP38	92	42.435	Vulpes_vulpes
ENSACIG00000011592	rpp38	90	39.689	ENSXETG00000003419	rpp38	89	40.856	Xenopus_tropicalis