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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSACIG00000012060 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: polr2c
Alias: wu:fk48d01
Full Name: polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide C
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 3797 bases
Position: chrCCOE01001472.1:487883-491679
Accession: ZDB-GENE-030131-6609
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000015644	RNA_pol_A_bac	PF01000.26	1.3e-37	1	1
ENSACIP00000015644	RNA_pol_L	PF01193.24	9e-18	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000016056	-	828	-	ENSACIP00000015644	275 (aa)	-	-

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000012060	polr2c	100	90.545	ENSG00000102978	POLR2C	100	90.545	Homo_sapiens
ENSACIG00000012060	polr2c	87	30.714	ENSG00000171453	POLR1C	95	30.714	Homo_sapiens
ENSACIG00000012060	polr2c	100	97.455	ENSAPOG00000011708	polr2c	100	97.455	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012060	polr2c	100	90.909	ENSAMEG00000017026	POLR2C	100	90.909	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000012060	polr2c	100	97.455	ENSAOCG00000015665	polr2c	100	97.455	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000012060	polr2c	89	97.154	ENSAOCG00000018000	-	93	97.154	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000012060	polr2c	100	97.455	ENSAOCG00000010477	-	100	97.455	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000012060	polr2c	100	97.455	ENSAPEG00000007221	polr2c	100	97.455	Amphiprion_percula
ENSACIG00000012060	polr2c	100	97.818	ENSATEG00000007143	polr2c	100	97.818	Anabas_testudineus
ENSACIG00000012060	polr2c	98	86.245	ENSAPLG00000005385	POLR2C	98	86.245	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000012060	polr2c	100	90.545	ENSACAG00000007514	-	100	90.545	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000012060	polr2c	83	70.044	ENSACAG00000011302	-	100	70.044	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000012060	polr2c	100	90.545	ENSANAG00000005302	POLR2C	100	90.545	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000012060	polr2c	100	99.273	ENSACLG00000004854	polr2c	100	99.273	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000012060	polr2c	100	96.364	ENSAMXG00000012805	polr2c	100	96.364	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000012060	polr2c	100	90.909	ENSBTAG00000001856	POLR2C	100	90.909	Bos_taurus
ENSACIG00000012060	polr2c	97	55.435	WBGene00007971	rpb-3	98	55.435	Caenorhabditis_elegans
ENSACIG00000012060	polr2c	100	90.545	ENSCJAG00000012016	POLR2C	100	90.545	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000012060	polr2c	100	90.909	ENSCAFG00000008720	POLR2C	100	90.909	Canis_familiaris
ENSACIG00000012060	polr2c	100	90.909	ENSCAFG00020007660	POLR2C	100	90.909	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000012060	polr2c	100	90.909	ENSCHIG00000012072	POLR2C	100	90.909	Capra_hircus
ENSACIG00000012060	polr2c	100	89.091	ENSTSYG00000011076	POLR2C	100	89.091	Carlito_syrichta
ENSACIG00000012060	polr2c	69	91.053	ENSCAPG00000006608	POLR2C	82	91.053	Cavia_aperea
ENSACIG00000012060	polr2c	100	90.909	ENSCPOG00000004554	POLR2C	100	90.909	Cavia_porcellus
ENSACIG00000012060	polr2c	100	90.545	ENSCCAG00000035768	POLR2C	100	90.545	Cebus_capucinus
ENSACIG00000012060	polr2c	100	90.545	ENSCATG00000040803	POLR2C	100	90.545	Cercocebus_atys
ENSACIG00000012060	polr2c	76	31.839	ENSCATG00000044045	POLR1C	67	31.839	Cercocebus_atys
ENSACIG00000012060	polr2c	100	90.909	ENSCLAG00000013676	POLR2C	100	90.909	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000012060	polr2c	100	90.545	ENSCSAG00000004901	POLR2C	100	90.545	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000012060	polr2c	100	83.273	ENSCHOG00000002986	POLR2C	100	83.273	Choloepus_hoffmanni
ENSACIG00000012060	polr2c	89	91.463	ENSCPBG00000022758	POLR2C	93	91.463	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000012060	polr2c	54	66.887	ENSCING00000009812	-	100	66.887	Ciona_intestinalis
ENSACIG00000012060	polr2c	95	62.898	ENSCING00000021895	-	99	62.898	Ciona_intestinalis
ENSACIG00000012060	polr2c	68	33.166	ENSCING00000003563	-	55	33.166	Ciona_intestinalis
ENSACIG00000012060	polr2c	100	66.787	ENSCSAVG00000002167	-	100	66.787	Ciona_savignyi
ENSACIG00000012060	polr2c	100	90.545	ENSCANG00000034876	POLR2C	100	90.545	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000012060	polr2c	100	90.545	ENSCGRG00001019477	Polr2c	100	90.545	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000012060	polr2c	100	90.545	ENSCGRG00000013273	Polr2c	100	90.545	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000012060	polr2c	100	97.091	ENSCSEG00000001719	polr2c	100	97.091	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000012060	polr2c	74	99.015	ENSCVAG00000017931	polr2c	82	99.015	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000012060	polr2c	100	97.455	ENSCVAG00000004718	-	100	97.455	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000012060	polr2c	100	94.909	ENSDARG00000033596	polr2c	100	94.909	Danio_rerio
ENSACIG00000012060	polr2c	94	57.634	ENSDNOG00000036028	-	99	57.634	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000012060	polr2c	100	91.273	ENSDNOG00000030752	-	81	91.273	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000012060	polr2c	100	90.909	ENSDORG00000000081	Polr2c	100	90.909	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000012060	polr2c	99	68.364	FBgn0026373	RpII33	100	68.364	Drosophila_melanogaster
ENSACIG00000012060	polr2c	100	74.909	ENSETEG00000004185	POLR2C	100	74.909	Echinops_telfairi
ENSACIG00000012060	polr2c	100	76.000	ENSEBUG00000016262	polr2c	100	76.000	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000012060	polr2c	100	90.545	ENSEASG00005005406	POLR2C	100	90.545	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000012060	polr2c	100	90.909	ENSECAG00000015818	POLR2C	100	90.909	Equus_caballus
ENSACIG00000012060	polr2c	100	76.364	ENSEEUG00000003658	POLR2C	100	76.364	Erinaceus_europaeus
ENSACIG00000012060	polr2c	100	94.909	ENSELUG00000012259	polr2c	100	94.909	Esox_lucius
ENSACIG00000012060	polr2c	100	90.909	ENSFCAG00000034622	POLR2C	100	90.909	Felis_catus
ENSACIG00000012060	polr2c	100	90.909	ENSFALG00000006931	POLR2C	100	90.909	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000012060	polr2c	100	88.000	ENSFDAG00000008641	POLR2C	100	88.000	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000012060	polr2c	100	98.182	ENSFHEG00000020739	polr2c	100	98.182	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000012060	polr2c	100	95.636	ENSGMOG00000004203	polr2c	100	95.636	Gadus_morhua
ENSACIG00000012060	polr2c	100	90.909	ENSGALG00000001168	POLR2C	100	90.909	Gallus_gallus
ENSACIG00000012060	polr2c	100	98.182	ENSGAFG00000021951	polr2c	100	98.182	Gambusia_affinis
ENSACIG00000012060	polr2c	100	96.727	ENSGACG00000002194	polr2c	100	96.727	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000012060	polr2c	89	91.463	ENSGAGG00000016942	POLR2C	88	91.463	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000012060	polr2c	100	90.545	ENSGGOG00000012415	POLR2C	100	90.545	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000012060	polr2c	76	31.390	ENSGGOG00000010903	POLR1C	64	31.390	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000012060	polr2c	100	99.273	ENSHBUG00000023040	polr2c	100	99.273	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000012060	polr2c	100	90.909	ENSHGLG00000013465	POLR2C	100	90.909	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000012060	polr2c	100	90.909	ENSHGLG00100011949	POLR2C	100	90.909	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000012060	polr2c	100	93.091	ENSHCOG00000007066	polr2c	100	93.091	Hippocampus_comes
ENSACIG00000012060	polr2c	90	30.584	ENSHCOG00000002179	polr1c	82	30.584	Hippocampus_comes
ENSACIG00000012060	polr2c	100	96.364	ENSIPUG00000009231	polr2c	100	96.364	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000012060	polr2c	100	90.909	ENSSTOG00000015150	-	100	90.909	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000012060	polr2c	100	76.727	ENSSTOG00000031354	-	100	76.727	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000012060	polr2c	100	90.545	ENSJJAG00000023057	Polr2c	100	90.545	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000012060	polr2c	100	98.545	ENSKMAG00000016196	polr2c	100	98.545	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000012060	polr2c	100	94.545	ENSLBEG00000007369	polr2c	100	94.545	Labrus_bergylta
ENSACIG00000012060	polr2c	100	75.155	ENSLACG00000003703	POLR2C	99	75.155	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000012060	polr2c	75	30.222	ENSLOCG00000016710	polr1c	56	30.222	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000012060	polr2c	100	96.364	ENSLOCG00000003215	polr2c	100	96.364	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000012060	polr2c	100	90.182	ENSLAFG00000027230	POLR2C	100	90.182	Loxodonta_africana
ENSACIG00000012060	polr2c	100	90.545	ENSMFAG00000016861	POLR2C	100	90.545	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000012060	polr2c	76	31.839	ENSMFAG00000046295	POLR1C	67	31.839	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000012060	polr2c	100	90.545	ENSMMUG00000020474	POLR2C	100	90.545	Macaca_mulatta
ENSACIG00000012060	polr2c	76	31.839	ENSMMUG00000015192	POLR1C	67	31.839	Macaca_mulatta
ENSACIG00000012060	polr2c	100	90.545	ENSMNEG00000033565	POLR2C	100	90.545	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000012060	polr2c	76	31.839	ENSMNEG00000028073	POLR1C	67	31.839	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000012060	polr2c	76	31.839	ENSMLEG00000034818	POLR1C	67	31.839	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000012060	polr2c	100	90.545	ENSMLEG00000032412	POLR2C	100	90.545	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000012060	polr2c	100	98.545	ENSMAMG00000013205	polr2c	100	98.545	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000012060	polr2c	100	99.273	ENSMZEG00005015329	polr2c	100	99.273	Maylandia_zebra
ENSACIG00000012060	polr2c	97	75.373	ENSMAUG00000019031	-	100	75.373	Mesocricetus_auratus
ENSACIG00000012060	polr2c	100	81.818	ENSMAUG00000000779	-	100	81.818	Mesocricetus_auratus
ENSACIG00000012060	polr2c	100	90.545	ENSMICG00000045178	POLR2C	100	90.545	Microcebus_murinus
ENSACIG00000012060	polr2c	67	31.282	ENSMICG00000005027	POLR1C	62	31.282	Microcebus_murinus
ENSACIG00000012060	polr2c	100	89.091	ENSMOCG00000013652	Polr2c	100	89.091	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000012060	polr2c	100	96.727	ENSMMOG00000010560	polr2c	100	96.727	Mola_mola
ENSACIG00000012060	polr2c	100	90.909	ENSMODG00000013540	POLR2C	100	90.909	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000012060	polr2c	100	98.545	ENSMALG00000004581	polr2c	100	98.545	Monopterus_albus
ENSACIG00000012060	polr2c	100	90.545	MGP_CAROLIEiJ_G0031409	Polr2c	100	90.545	Mus_caroli
ENSACIG00000012060	polr2c	100	90.545	ENSMUSG00000031783	Polr2c	100	90.545	Mus_musculus
ENSACIG00000012060	polr2c	100	90.545	MGP_PahariEiJ_G0023007	Polr2c	100	90.545	Mus_pahari
ENSACIG00000012060	polr2c	100	90.545	MGP_SPRETEiJ_G0032528	Polr2c	100	90.545	Mus_spretus
ENSACIG00000012060	polr2c	100	90.909	ENSMPUG00000004483	POLR2C	100	90.909	Mustela_putorius_furo
ENSACIG00000012060	polr2c	100	90.545	ENSMLUG00000025422	-	100	90.545	Myotis_lucifugus
ENSACIG00000012060	polr2c	100	90.545	ENSMLUG00000015833	-	100	90.545	Myotis_lucifugus
ENSACIG00000012060	polr2c	100	88.364	ENSMLUG00000029495	-	100	88.364	Myotis_lucifugus
ENSACIG00000012060	polr2c	71	88.660	ENSMLUG00000023530	-	100	88.660	Myotis_lucifugus
ENSACIG00000012060	polr2c	87	30.000	ENSNGAG00000023487	Polr1c	95	30.000	Nannospalax_galili
ENSACIG00000012060	polr2c	100	90.909	ENSNGAG00000012249	-	100	90.909	Nannospalax_galili
ENSACIG00000012060	polr2c	100	67.273	ENSNGAG00000010540	-	100	67.273	Nannospalax_galili
ENSACIG00000012060	polr2c	66	100.000	ENSNBRG00000003952	polr2c	94	100.000	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000012060	polr2c	76	31.390	ENSNLEG00000004035	POLR1C	64	31.390	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000012060	polr2c	100	77.818	ENSNLEG00000003034	POLR2C	100	77.818	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000012060	polr2c	100	84.364	ENSMEUG00000014741	POLR2C	100	84.364	Notamacropus_eugenii
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ENSACIG00000012060	polr2c	100	98.182	ENSORLG00015003751	polr2c	100	98.182	Oryzias_latipes_hsok
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ENSACIG00000012060	polr2c	75	95.610	ENSPMGG00000021249	polr2c	84	95.610	Periophthalmus_magnuspinnatus
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ENSACIG00000012060	polr2c	100	90.545	ENSRROG00000045745	POLR2C	100	90.545	Rhinopithecus_roxellana
ENSACIG00000012060	polr2c	92	30.556	YPR110C	RPC40	86	30.556	Saccharomyces_cerevisiae
ENSACIG00000012060	polr2c	96	44.815	YIL021W	RPB3	83	44.815	Saccharomyces_cerevisiae
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ENSACIG00000012060	polr2c	57	65.385	ENSSARG00000001565	-	100	65.385	Sorex_araneus
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ENSACIG00000012060	polr2c	100	97.455	ENSSPAG00000005108	polr2c	100	97.455	Stegastes_partitus
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ENSACIG00000012060	polr2c	100	94.909	ENSTRUG00000004676	polr2c	100	94.909	Takifugu_rubripes
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ENSACIG00000012060	polr2c	100	90.909	ENSUAMG00000014170	POLR2C	100	90.909	Ursus_americanus
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ENSACIG00000012060	polr2c	67	84.239	ENSVPAG00000007590	POLR2C	100	84.239	Vicugna_pacos
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ENSACIG00000012060	polr2c	52	91.608	ENSVVUG00000003058	-	93	91.608	Vulpes_vulpes
ENSACIG00000012060	polr2c	100	78.623	ENSXETG00000013784	polr2c	100	78.623	Xenopus_tropicalis
ENSACIG00000012060	polr2c	100	98.182	ENSXCOG00000020734	polr2c	100	98.182	Xiphophorus_couchianus
ENSACIG00000012060	polr2c	100	98.182	ENSXMAG00000015984	polr2c	100	98.182	Xiphophorus_maculatus