EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000012084 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 14962 bases
Position: chrCCOE01001692.1:27676-42637
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000015589	zf-C2H2	PF00096.26	6.5e-38	1	6
ENSACIP00000015589	zf-C2H2	PF00096.26	6.5e-38	2	6
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ENSACIP00000015589	zf-C2H2	PF00096.26	6.5e-38	4	6
ENSACIP00000015589	zf-C2H2	PF00096.26	6.5e-38	5	6
ENSACIP00000015589	zf-C2H2	PF00096.26	6.5e-38	6	6
ENSACIP00000015570	zf-C2H2	PF00096.26	1.7e-33	1	5
ENSACIP00000015570	zf-C2H2	PF00096.26	1.7e-33	2	5
ENSACIP00000015570	zf-C2H2	PF00096.26	1.7e-33	3	5
ENSACIP00000015570	zf-C2H2	PF00096.26	1.7e-33	4	5
ENSACIP00000015570	zf-C2H2	PF00096.26	1.7e-33	5	5
ENSACIP00000015570	zf-met	PF12874.7	4.5e-14	1	2
ENSACIP00000015570	zf-met	PF12874.7	4.5e-14	2	2
ENSACIP00000015589	zf-met	PF12874.7	9.2e-12	1	2
ENSACIP00000015589	zf-met	PF12874.7	9.2e-12	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000015982	-	582	-	ENSACIP00000015570	193 (aa)	-	-
ENSACIT00000016001	-	708	-	ENSACIP00000015589	235 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000012084	-	99	46.231	ENSACIG00000006806	-	59	46.231
ENSACIG00000012084	-	100	49.309	ENSACIG00000010647	-	99	48.444
ENSACIG00000012084	-	97	43.548	ENSACIG00000002190	gfi1b	76	44.860
ENSACIG00000012084	-	97	49.746	ENSACIG00000010637	-	53	50.898
ENSACIG00000012084	-	97	43.357	ENSACIG00000017653	-	94	43.357
ENSACIG00000012084	-	99	48.649	ENSACIG00000013470	-	64	49.133
ENSACIG00000012084	-	95	56.757	ENSACIG00000016182	-	87	56.757
ENSACIG00000012084	-	93	42.222	ENSACIG00000004641	-	60	42.222
ENSACIG00000012084	-	97	47.475	ENSACIG00000015835	-	70	52.830
ENSACIG00000012084	-	94	36.893	ENSACIG00000009443	-	67	36.893
ENSACIG00000012084	-	95	48.256	ENSACIG00000003720	-	61	48.256
ENSACIG00000012084	-	91	34.375	ENSACIG00000014233	znf407	65	36.538
ENSACIG00000012084	-	89	46.512	ENSACIG00000001369	-	93	38.636
ENSACIG00000012084	-	99	50.365	ENSACIG00000022625	-	82	50.802
ENSACIG00000012084	-	99	51.634	ENSACIG00000022738	-	97	51.634
ENSACIG00000012084	-	95	52.535	ENSACIG00000019102	-	55	52.535
ENSACIG00000012084	-	92	44.262	ENSACIG00000017166	-	59	44.262
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ENSACIG00000012084	-	95	47.826	ENSACIG00000006755	-	73	47.826
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ENSACIG00000012084	-	94	47.541	ENSACIG00000009128	-	85	47.541
ENSACIG00000012084	-	93	45.455	ENSACIG00000019534	-	79	45.455
ENSACIG00000012084	-	100	47.248	ENSACIG00000023212	-	78	49.133
ENSACIG00000012084	-	96	54.194	ENSACIG00000017013	-	53	52.657
ENSACIG00000012084	-	87	55.122	ENSACIG00000016944	-	77	55.122
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ENSACIG00000012084	-	96	45.455	ENSACIG00000016117	-	88	45.455
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ENSACIG00000012084	-	93	50.704	ENSACIG00000007855	-	91	50.704
ENSACIG00000012084	-	93	44.134	ENSACIG00000006377	-	58	44.134
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ENSACIG00000012084	-	99	40.000	ENSACIG00000023313	-	92	41.135
ENSACIG00000012084	-	99	57.000	ENSACIG00000000286	-	70	58.824
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ENSACIG00000012084	-	99	47.716	ENSACIG00000011515	-	74	47.716
ENSACIG00000012084	-	93	38.053	ENSACIG00000011516	-	74	38.053
ENSACIG00000012084	-	95	60.938	ENSACIG00000010660	-	91	60.938
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ENSACIG00000012084	-	99	45.455	ENSACIG00000023049	znf646	95	42.857
ENSACIG00000012084	-	99	64.062	ENSACIG00000006172	-	90	53.219
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ENSACIG00000012084	-	100	50.870	ENSACIG00000011541	-	69	50.870
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ENSACIG00000012084	-	94	46.429	ENSACIG00000021986	-	95	46.429
ENSACIG00000012084	-	94	46.429	ENSACIG00000007034	-	72	46.429
ENSACIG00000012084	-	94	39.130	ENSACIG00000018641	snai2	54	39.252
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ENSACIG00000012084	-	98	44.526	ENSACIG00000020938	zbtb47b	78	43.704
ENSACIG00000012084	-	99	46.341	ENSACIG00000009809	si:dkey-77f5.14	85	46.341
ENSACIG00000012084	-	100	47.619	ENSACIG00000014123	znf236	68	47.619
ENSACIG00000012084	-	98	45.570	ENSACIG00000017892	-	75	45.570
ENSACIG00000012084	-	96	47.531	ENSACIG00000007096	-	88	47.170
ENSACIG00000012084	-	93	41.414	ENSACIG00000016133	-	61	41.414
ENSACIG00000012084	-	95	47.321	ENSACIG00000015429	-	87	47.273
ENSACIG00000012084	-	100	55.000	ENSACIG00000022293	-	95	55.689

Orthologs

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ENSACIG00000012084	-	100	54.082	ENSAPOG00000020864	-	55	57.143	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012084	-	97	53.052	ENSAPOG00000013125	-	72	53.052	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012084	-	98	55.056	ENSAPOG00000007955	-	62	55.056	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012084	-	96	55.738	ENSAPOG00000021690	-	91	57.325	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012084	-	96	52.907	ENSAPOG00000014714	-	68	57.059	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012084	-	97	55.738	ENSAPOG00000001742	-	56	55.738	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012084	-	95	55.000	ENSAPOG00000020368	-	99	56.291	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012084	-	97	55.621	ENSAPOG00000022086	-	99	58.182	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012084	-	95	58.011	ENSAPOG00000013212	-	100	58.011	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012084	-	99	51.685	ENSAPOG00000000503	-	63	51.053	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012084	-	98	54.545	ENSAPOG00000008053	-	50	54.545	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012084	-	89	60.870	ENSAPOG00000019411	-	83	60.870	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012084	-	99	59.302	ENSAPOG00000013065	-	85	59.302	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012084	-	92	57.018	ENSAPOG00000022964	-	98	57.018	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012084	-	95	53.704	ENSAPOG00000023479	-	50	55.455	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012084	-	95	56.934	ENSAPOG00000004878	-	92	56.934	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012084	-	96	51.724	ENSAPOG00000020343	-	81	50.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012084	-	99	53.297	ENSAPOG00000002691	-	59	53.297	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012084	-	99	54.348	ENSAPOG00000005986	-	80	54.348	Acanthochromis_polyacanthus
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