EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000012148 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 5800 bases
Position: chrCCOE01001816.1:12851-18650
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000015645	MMR_HSR1	PF01926.23	1.5e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000016057	-	1578	-	ENSACIP00000015645	525 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000012148	-	95	65.019	ENSACIG00000010569	-	96	64.829
ENSACIG00000012148	-	84	33.817	ENSACIG00000022228	-	78	33.056
ENSACIG00000012148	-	94	66.795	ENSACIG00000003168	-	95	66.795
ENSACIG00000012148	-	94	67.573	ENSACIG00000023726	-	95	67.767
ENSACIG00000012148	-	88	33.725	ENSACIG00000009923	-	79	33.399
ENSACIG00000012148	-	93	63.922	ENSACIG00000014898	-	93	63.813
ENSACIG00000012148	-	94	65.226	ENSACIG00000008585	-	98	64.637
ENSACIG00000012148	-	74	69.309	ENSACIG00000023712	-	96	69.054
ENSACIG00000012148	-	92	68.072	ENSACIG00000021882	-	93	67.735
ENSACIG00000012148	-	94	61.554	ENSACIG00000008246	-	91	61.355
ENSACIG00000012148	-	93	31.068	ENSACIG00000022269	-	86	31.650
ENSACIG00000012148	-	94	65.686	ENSACIG00000014961	-	92	65.294
ENSACIG00000012148	-	94	65.558	ENSACIG00000021449	-	94	64.971
ENSACIG00000012148	-	86	34.672	ENSACIG00000009814	-	85	34.461
ENSACIG00000012148	-	94	63.938	ENSACIG00000014982	-	96	63.743
ENSACIG00000012148	-	94	69.141	ENSACIG00000021889	-	92	69.141
ENSACIG00000012148	-	94	68.155	ENSACIG00000008256	-	95	67.961
ENSACIG00000012148	-	94	67.387	ENSACIG00000003888	-	95	67.583
ENSACIG00000012148	-	94	65.157	ENSACIG00000002240	-	95	64.961
ENSACIG00000012148	-	93	64.158	ENSACIG00000014973	-	95	64.158
ENSACIG00000012148	-	94	69.488	ENSACIG00000001022	-	94	69.291

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000012148	-	93	61.067	ENSAPOG00000005749	-	92	60.870	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012148	-	94	60.196	ENSAPOG00000021040	-	84	59.216	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012148	-	83	34.120	ENSAPOG00000016636	-	91	33.906	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012148	-	94	62.008	ENSAPOG00000005726	-	93	61.417	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012148	-	94	60.314	ENSAPEG00000000062	-	94	60.118	Amphiprion_percula
ENSACIG00000012148	-	94	55.686	ENSATEG00000017635	-	93	55.490	Anabas_testudineus
ENSACIG00000012148	-	92	65.261	ENSATEG00000019965	-	92	65.060	Anabas_testudineus
ENSACIG00000012148	-	94	65.564	ENSATEG00000023346	-	94	65.370	Anabas_testudineus
ENSACIG00000012148	-	92	64.200	ENSATEG00000012558	-	92	64.200	Anabas_testudineus
ENSACIG00000012148	-	94	58.824	ENSACLG00000018271	-	93	58.627	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000012148	-	90	62.729	ENSACLG00000021761	-	90	62.118	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000012148	-	86	74.390	ENSACLG00000017259	-	90	74.390	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000012148	-	94	33.270	ENSACLG00000023126	-	96	33.333	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000012148	-	69	36.436	ENSACLG00000023033	-	92	36.170	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000012148	-	94	68.493	ENSACLG00000009261	-	97	68.493	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000012148	-	92	61.885	ENSACLG00000018599	-	95	61.507	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000012148	-	96	58.745	ENSACLG00000010007	-	78	58.745	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000012148	-	87	62.647	ENSACLG00000009330	-	79	68.601	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000012148	-	91	70.652	ENSACLG00000006538	-	94	85.075	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000012148	-	80	70.652	ENSACLG00000006285	-	95	83.099	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000012148	-	73	63.990	ENSACLG00000015361	-	94	63.472	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000012148	-	88	34.476	ENSACLG00000023468	-	83	34.476	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000012148	-	90	63.789	ENSACLG00000006543	-	90	63.380	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000012148	-	93	50.000	ENSAMXG00000030535	-	94	50.000	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000012148	-	92	39.962	ENSAMXG00000032695	-	95	39.583	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000012148	-	87	41.922	ENSAMXG00000029346	-	92	43.200	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000012148	-	89	39.184	ENSAMXG00000039672	-	93	38.618	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000012148	-	91	41.046	ENSAMXG00000033407	-	94	41.000	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000012148	-	94	40.713	ENSAMXG00000034407	-	95	40.338	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000012148	-	92	31.931	ENSAMXG00000036353	-	89	32.514	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000012148	-	95	37.403	ENSAMXG00000041770	-	96	37.209	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000012148	-	96	40.525	ENSAMXG00000037920	-	98	41.600	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000012148	-	91	33.206	ENSAMXG00000035937	-	91	33.270	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000012148	-	86	59.402	ENSCVAG00000005819	-	99	59.188	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000012148	-	70	65.591	ENSCVAG00000014791	-	100	65.054	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000012148	-	94	60.040	ENSCVAG00000008146	-	96	59.841	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000012148	-	95	59.381	ENSCVAG00000004690	-	95	59.381	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000012148	-	91	61.245	ENSCVAG00000007269	-	92	61.044	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000012148	-	64	60.819	ENSCVAG00000022676	-	99	60.526	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000012148	-	94	57.485	ENSCVAG00000008134	-	96	57.485	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000012148	-	92	33.460	ENSCVAG00000015205	-	91	32.258	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000012148	-	89	63.580	ENSCVAG00000007831	-	99	60.777	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000012148	-	87	33.061	ENSCVAG00000011261	-	88	33.061	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000012148	-	94	61.935	ENSCVAG00000007794	-	96	61.935	Cyprinodon_variegatus
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ENSACIG00000012148	-	94	58.431	ENSFHEG00000006403	-	95	58.431	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000012148	-	96	58.462	ENSFHEG00000006408	-	99	58.462	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000012148	-	89	33.803	ENSGMOG00000019330	-	82	32.863	Gadus_morhua
ENSACIG00000012148	-	87	33.947	ENSGMOG00000017552	-	80	32.172	Gadus_morhua
ENSACIG00000012148	-	85	31.144	ENSGMOG00000008232	-	98	30.720	Gadus_morhua
ENSACIG00000012148	-	92	31.890	ENSGMOG00000011319	-	96	31.755	Gadus_morhua
ENSACIG00000012148	-	85	32.573	ENSGMOG00000005680	-	79	31.535	Gadus_morhua
ENSACIG00000012148	-	94	59.192	ENSGAFG00000005023	-	96	58.449	Gambusia_affinis
ENSACIG00000012148	-	94	58.708	ENSGAFG00000005032	-	93	58.513	Gambusia_affinis
ENSACIG00000012148	-	74	60.622	ENSGACG00000005035	-	96	60.622	Gasterosteus_aculeatus
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