EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000012192 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 1217 bases
Position: chrCCOE01000691.1:3833707-3834923
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000015698	MMR_HSR1	PF01926.23	3.7e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000016112	-	543	-	ENSACIP00000015698	180 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000012192	-	93	47.126	ENSACIG00000009110	arl4aa	87	47.126
ENSACIG00000012192	-	84	46.154	ENSACIG00000013244	arl14	76	46.154
ENSACIG00000012192	-	100	92.265	ENSACIG00000016782	-	99	93.642
ENSACIG00000012192	-	74	33.083	ENSACIG00000019827	sar1ab	67	33.083
ENSACIG00000012192	-	94	32.749	ENSACIG00000008614	arl8ba	92	32.749
ENSACIG00000012192	-	96	48.315	ENSACIG00000000312	arl4cb	91	48.315
ENSACIG00000012192	-	96	85.549	ENSACIG00000005843	arf5	96	85.549
ENSACIG00000012192	-	100	92.265	ENSACIG00000022896	arf3b	100	92.265
ENSACIG00000012192	-	94	35.714	ENSACIG00000009740	arfrp1	89	35.714
ENSACIG00000012192	-	99	90.503	ENSACIG00000019050	-	99	90.503
ENSACIG00000012192	-	96	58.382	ENSACIG00000007953	arl1	97	58.382
ENSACIG00000012192	-	88	50.625	ENSACIG00000000612	arl2	86	50.625
ENSACIG00000012192	-	88	43.976	ENSACIG00000018839	-	82	43.976
ENSACIG00000012192	-	90	32.164	ENSACIG00000017582	arl13b	71	32.164
ENSACIG00000012192	-	89	51.220	ENSACIG00000003228	arl5a	94	51.220
ENSACIG00000012192	-	96	47.093	ENSACIG00000016662	arl8	95	47.093
ENSACIG00000012192	-	63	30.081	ENSACIG00000019049	rab1ab	78	30.579
ENSACIG00000012192	-	91	31.429	ENSACIG00000024513	-	88	31.429
ENSACIG00000012192	-	100	92.818	ENSACIG00000012912	arf2b	82	92.818
ENSACIG00000012192	-	97	68.571	ENSACIG00000014610	zgc:110286	97	68.571
ENSACIG00000012192	-	96	47.977	ENSACIG00000008975	arl5c	96	47.977
ENSACIG00000012192	-	92	47.093	ENSACIG00000024420	-	88	47.093
ENSACIG00000012192	-	91	45.732	ENSACIG00000019225	-	94	45.732
ENSACIG00000012192	-	94	42.697	ENSACIG00000022050	ARL6	76	42.697
ENSACIG00000012192	-	92	45.509	ENSACIG00000023231	arl11	95	45.509
ENSACIG00000012192	-	96	32.759	ENSACIG00000009595	arl8bb	94	32.759
ENSACIG00000012192	-	92	31.928	ENSACIG00000000868	arl8a	89	31.928
ENSACIG00000012192	-	97	44.633	ENSACIG00000016407	arl3l2	95	44.633
ENSACIG00000012192	-	98	44.262	ENSACIG00000000949	-	91	44.262
ENSACIG00000012192	-	94	41.341	ENSACIG00000000945	-	98	41.341
ENSACIG00000012192	-	87	44.444	ENSACIG00000013359	arl4d	81	44.444
ENSACIG00000012192	-	96	82.659	ENSACIG00000000467	-	96	82.659

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000012192	-	84	96.689	ENSAOCG00000001275	-	88	96.689	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000012192	-	100	96.667	ENSAPEG00000016909	-	100	96.667	Amphiprion_percula
ENSACIG00000012192	-	100	97.222	ENSATEG00000003174	-	100	97.222	Anabas_testudineus
ENSACIG00000012192	-	100	98.333	ENSACLG00000004123	-	100	98.333	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000012192	-	100	93.923	ENSAMXG00000019845	arf1	100	93.923	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000012192	-	100	96.111	ENSCVAG00000013374	-	100	96.111	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000012192	-	100	93.923	ENSDARG00000009484	arf1	100	93.923	Danio_rerio
ENSACIG00000012192	-	100	94.475	ENSELUG00000022533	arf1	79	94.475	Esox_lucius
ENSACIG00000012192	-	100	96.111	ENSFHEG00000005859	-	100	96.111	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000012192	-	96	90.805	ENSGMOG00000000429	arf1	95	90.805	Gadus_morhua
ENSACIG00000012192	-	100	96.111	ENSGAFG00000018151	-	100	96.111	Gambusia_affinis
ENSACIG00000012192	-	100	86.111	ENSGACG00000014195	-	97	86.111	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000012192	-	100	98.333	ENSHBUG00000002636	-	100	98.333	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000012192	-	100	93.370	ENSIPUG00000006311	arf1	100	93.370	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000012192	-	100	94.444	ENSKMAG00000018315	-	100	94.444	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000012192	-	99	89.326	ENSLBEG00000023263	-	98	89.326	Labrus_bergylta
ENSACIG00000012192	-	99	89.944	ENSLBEG00000001998	arf1	99	89.944	Labrus_bergylta
ENSACIG00000012192	-	100	96.667	ENSMAMG00000001553	-	100	96.667	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000012192	-	100	98.333	ENSMZEG00005022594	-	100	98.333	Maylandia_zebra
ENSACIG00000012192	-	100	98.333	ENSMALG00000004269	-	100	98.333	Monopterus_albus
ENSACIG00000012192	-	100	98.333	ENSNBRG00000016455	-	100	98.333	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000012192	-	100	98.333	ENSONIG00000001286	-	100	98.333	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000012192	-	100	96.667	ENSORLG00000023270	-	100	96.667	Oryzias_latipes
ENSACIG00000012192	-	100	96.111	ENSORLG00020006712	-	100	96.111	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000012192	-	100	96.667	ENSORLG00015019836	-	100	96.667	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000012192	-	100	96.667	ENSOMEG00000023784	-	100	96.667	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000012192	-	100	90.608	ENSPMGG00000014174	arf1	100	90.608	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000012192	-	100	92.778	ENSPMAG00000002035	arf1	100	92.778	Petromyzon_marinus
ENSACIG00000012192	-	100	96.111	ENSPFOG00000014787	-	100	96.111	Poecilia_formosa
ENSACIG00000012192	-	100	96.111	ENSPLAG00000001041	-	100	96.111	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000012192	-	100	96.111	ENSPMEG00000024077	-	100	96.111	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000012192	-	100	96.111	ENSPREG00000009009	-	100	96.111	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000012192	-	100	98.333	ENSPNYG00000009472	-	100	98.333	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000012192	-	94	95.858	ENSPNAG00000000098	arf1	93	95.858	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000012192	-	99	77.654	YDL137W	-	99	77.654	Saccharomyces_cerevisiae
ENSACIG00000012192	-	99	78.333	YDL192W	-	99	78.333	Saccharomyces_cerevisiae
ENSACIG00000012192	-	100	90.556	ENSSMAG00000006125	-	100	90.556	Scophthalmus_maximus
ENSACIG00000012192	-	100	96.667	ENSSDUG00000017356	-	100	96.667	Seriola_dumerili
ENSACIG00000012192	-	100	96.667	ENSSLDG00000008504	-	100	96.667	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACIG00000012192	-	100	97.778	ENSSPAG00000011431	-	100	97.778	Stegastes_partitus
ENSACIG00000012192	-	100	95.000	ENSTRUG00000019870	-	100	95.000	Takifugu_rubripes
ENSACIG00000012192	-	100	93.333	ENSTNIG00000011685	-	100	93.333	Tetraodon_nigroviridis
ENSACIG00000012192	-	100	96.111	ENSXCOG00000016687	-	98	96.111	Xiphophorus_couchianus
ENSACIG00000012192	-	100	96.111	ENSXMAG00000009193	-	100	96.111	Xiphophorus_maculatus